More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2327 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_2327  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
496 aa  1009    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.940747  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1672  AMP-dependent synthetase and ligase  74.54 
 
 
491 aa  736    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0961293 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  43.48 
 
 
499 aa  386  1e-106  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0415  AMP-dependent synthetase and ligase  41.49 
 
 
515 aa  358  9.999999999999999e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.866195  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4613  AMP-dependent synthetase and ligase  40.24 
 
 
512 aa  348  2e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.499912 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0367  AMP-dependent synthetase and ligase  40.12 
 
 
513 aa  337  1.9999999999999998e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.379931 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4902  AMP-dependent synthetase and ligase  40.08 
 
 
501 aa  336  5e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2447  AMP-dependent synthetase and ligase  39.56 
 
 
505 aa  329  9e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5453  AMP-dependent synthetase and ligase  39.11 
 
 
554 aa  321  1.9999999999999998e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.400076 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1789  acyl-CoA synthetase  34.6 
 
 
496 aa  309  6.999999999999999e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0554946  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1928  acyl-CoA synthetase  34.6 
 
 
496 aa  309  6.999999999999999e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.132163  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1964  acyl-CoA synthetase  34.4 
 
 
496 aa  307  3e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000141031 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  37.87 
 
 
503 aa  306  6e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1746  acyl-CoA synthetase  34.4 
 
 
496 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0814  AMP-dependent synthetase and ligase  37.45 
 
 
508 aa  297  3e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3808  AMP-dependent synthetase and ligase  36.35 
 
 
508 aa  296  4e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.762435  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4072  AMP-dependent synthetase and ligase  36.18 
 
 
508 aa  295  2e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0415  AMP-dependent synthetase and ligase  40.16 
 
 
620 aa  290  4e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.784497  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0667  putative O-succinylbenzoate--CoA ligase  33.91 
 
 
516 aa  278  1e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.604577  normal  0.0579833 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1614  AMP-dependent synthetase and ligase  36.93 
 
 
509 aa  278  2e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3819  O-succinylbenzoate-CoA ligase  33.33 
 
 
529 aa  276  6e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0311  AMP-dependent synthetase and ligase  36.62 
 
 
501 aa  270  4e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0140314 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2524  AMP-dependent synthetase and ligase  35.4 
 
 
520 aa  269  8.999999999999999e-71  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.82155 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4616  AMP-dependent synthetase and ligase  33.98 
 
 
518 aa  268  1e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.892742  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3215  O-succinylbenzoate-CoA ligase  33.92 
 
 
517 aa  267  4e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0554015  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3204  O-succinylbenzoate-CoA ligase  33.92 
 
 
517 aa  267  4e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.716175  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3266  O-succinylbenzoate-CoA ligase  33.92 
 
 
517 aa  267  4e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.10141  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  33.91 
 
 
520 aa  266  7e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  35.21 
 
 
525 aa  266  8e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  34.64 
 
 
520 aa  264  3e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1605  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 
526 aa  258  2e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.66 
 
 
514 aa  257  3e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2323  AMP-dependent synthetase and ligase  33.99 
 
 
511 aa  256  8e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3565  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.58 
 
 
526 aa  256  9e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.011282  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.27 
 
 
510 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1019  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.27 
 
 
510 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1091  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.27 
 
 
510 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0135  AMP-dependent synthetase and ligase  35.06 
 
 
533 aa  255  1.0000000000000001e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.27 
 
 
510 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4481  AMP-dependent synthetase and ligase  34.74 
 
 
506 aa  255  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1003  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.27 
 
 
510 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.27 
 
 
510 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1169  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.27 
 
 
510 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.27 
 
 
510 aa  254  3e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2525  AMP-dependent synthetase and ligase  33.4 
 
 
516 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.695888 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1123  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.07 
 
 
510 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1070  AMP-dependent synthetase and ligase  34.64 
 
 
565 aa  253  5.000000000000001e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0635723  normal  0.557335 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04628  acyl-CoA synthetase  35.36 
 
 
490 aa  253  6e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0861  AMP-dependent synthetase and ligase  33.08 
 
 
514 aa  251  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1008  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.68 
 
 
510 aa  250  4e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3859  AMP-dependent synthetase and ligase  33.73 
 
 
504 aa  250  5e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.447607  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2963  AMP-dependent synthetase and ligase  33.95 
 
 
551 aa  250  5e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000191926  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1159  O-succinylbenzoate-CoA ligase  34.48 
 
 
486 aa  249  6e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498459  hitchhiker  0.000208098 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4810  AMP-dependent synthetase and ligase  34.54 
 
 
528 aa  248  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.672528  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5309  AMP-dependent synthetase and ligase  34.84 
 
 
517 aa  247  3e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4080  AMP-dependent synthetase and ligase  35.63 
 
 
518 aa  247  3e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.656205  normal  0.161644 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0047  AMP-dependent synthetase and ligase  35.77 
 
 
517 aa  247  3e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3296  AMP-dependent synthetase and ligase  35.06 
 
 
502 aa  247  4e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0486472  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1666  AMP-dependent synthetase and ligase  32.3 
 
 
518 aa  246  6.999999999999999e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.144653  normal  0.373713 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3550  AMP-dependent synthetase and ligase  35.16 
 
 
520 aa  246  6.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1585  AMP-dependent synthetase and ligase  36.64 
 
 
520 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.459173  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0119  AMP-dependent synthetase and ligase  35.12 
 
 
506 aa  245  9.999999999999999e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.976048  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  30.45 
 
 
518 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3455  AMP-dependent synthetase and ligase  34.1 
 
 
583 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08640  acyl-CoA synthetase  33.73 
 
 
516 aa  244  1.9999999999999999e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.310549  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0559  AMP-dependent synthetase and ligase  32.67 
 
 
507 aa  245  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1488  AMP-dependent synthetase and ligase  32.94 
 
 
525 aa  244  3e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0982209  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3514  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.66 
 
 
525 aa  243  5e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270509  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3890  AMP-dependent synthetase and ligase  34.38 
 
 
517 aa  243  6e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0529507  normal  0.227811 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1389  AMP-binding domain protein  31.64 
 
 
549 aa  243  6e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000722424  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0102  AMP-dependent synthetase and ligase  34.93 
 
 
520 aa  243  7e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2485  AMP-dependent synthetase and ligase  33.53 
 
 
534 aa  243  7.999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0116  AMP-dependent synthetase and ligase  34.19 
 
 
502 aa  242  1e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0224  AMP-dependent synthetase and ligase  30.83 
 
 
501 aa  241  2e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5944  AMP-dependent synthetase and ligase  34.71 
 
 
532 aa  241  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420174  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0218  AMP-dependent synthetase and ligase  30.83 
 
 
501 aa  241  2e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.95 
 
 
512 aa  241  2e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3299  feruloyl-CoA synthetase  34.5 
 
 
564 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1367  AMP-dependent synthetase and ligase  34.69 
 
 
502 aa  240  4e-62  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.439129  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1133  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 
518 aa  240  4e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.508244  normal  0.50206 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4982  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  31.99 
 
 
482 aa  239  8e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2693  AMP-dependent synthetase and ligase  32.45 
 
 
562 aa  239  9e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0042  AMP-binding domain protein  32.47 
 
 
576 aa  238  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4900  AMP-dependent synthetase and ligase  33.75 
 
 
527 aa  239  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.309388  normal  0.552445 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1025  AMP-dependent synthetase and ligase  32.63 
 
 
528 aa  238  2e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3975  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.2 
 
 
530 aa  238  2e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.251646  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1597  AMP-dependent synthetase and ligase  34.76 
 
 
549 aa  238  2e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000318079  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0610  AMP-binding domain protein  33.97 
 
 
570 aa  238  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.920315  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5827  AMP-dependent synthetase and ligase  33.86 
 
 
518 aa  238  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.671788  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3720  AMP-dependent synthetase and ligase  33.92 
 
 
518 aa  238  3e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.189603  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0503  AMP-dependent synthetase and ligase  34.26 
 
 
492 aa  237  3e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3747  AMP-dependent synthetase and ligase  34.72 
 
 
514 aa  238  3e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3600  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.4 
 
 
525 aa  237  3e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.887287  normal  0.975846 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2242  AMP-dependent synthetase and ligase  34.69 
 
 
519 aa  237  3e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.109106  normal  0.89285 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0827  AMP-dependent synthetase and ligase  32.84 
 
 
566 aa  237  3e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3993  AMP-dependent synthetase and ligase  33.74 
 
 
524 aa  237  4e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.968795  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0163  long-chain fatty-acid-CoA ligase  34.11 
 
 
515 aa  237  4e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1229  O-succinylbenzoate-CoA ligase  30.77 
 
 
500 aa  237  4e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2939  AMP-dependent synthetase and ligase  34.06 
 
 
502 aa  237  4e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.572456  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0116  AMP-dependent synthetase and ligase  34.06 
 
 
502 aa  237  4e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>