More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0315 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0315  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 510 aa  1049    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  40.24 
 
 		 518 aa  385  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2283  AMP-dependent synthetase and ligase  40.24 
 
 		 513 aa  377  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0171  AMP-dependent synthetase and ligase  37.5 
 
 		 630 aa  329  7e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1442  AMP-binding domain protein  38.17 
 
 		 550 aa  323  6e-87  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.684137  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1650  AMP-binding domain protein  37.64 
 
 		 549 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1585  AMP-binding domain protein  37.9 
 
 		 549 aa  322  9.999999999999999e-87  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2821  AMP-binding domain protein  37.19 
 
 		 552 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.187557 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2563  AMP-binding domain protein  37.83 
 
 		 549 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45341e-16 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1573  AMP-binding domain protein  38.06 
 
 		 552 aa  317  3e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116566  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0327  AMP-binding domain protein  37.33 
 
 		 549 aa  317  3e-85  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.347146  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1041  AMP-binding domain protein  38.29 
 
 		 549 aa  317  3e-85  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1103  AMP-binding domain protein  37.2 
 
 		 552 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2692  AMP-binding domain protein  36.59 
 
 		 552 aa  313  4.999999999999999e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.262026  normal  0.421392 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1963  AMP-binding domain protein  36.67 
 
 		 560 aa  311  2e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.17114  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0663  AMP-binding domain protein  36.45 
 
 		 547 aa  311  2e-83  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.390649  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1389  AMP-binding domain protein  36.53 
 
 		 549 aa  311  2.9999999999999997e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000722424  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  34.32 
 
 		 553 aa  309  9e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0154  AMP-dependent synthetase and ligase  35.32 
 
 		 566 aa  301  2e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3458  acyl-CoA synthetase  34.92 
 
 		 562 aa  296  4e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.220235 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3066  AMP-dependent synthetase and ligase  36.99 
 
 		 558 aa  295  1e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.479156  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0473  AMP-binding domain protein  35.1 
 
 		 568 aa  295  1e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2083  AMP-dependent synthetase and ligase  34.97 
 
 		 544 aa  295  1e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0403  AMP-binding domain protein  34.08 
 
 		 550 aa  293  5e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.493287  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2311  acyl-CoA synthetase  34.54 
 
 		 557 aa  293  5e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.462118  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4723  AMP-binding domain protein  34.66 
 
 		 560 aa  291  2e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.712671  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2479  acyl-CoA synthetase  34.03 
 
 		 557 aa  291  3e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.282098  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3316  AMP-dependent synthetase and ligase  35.88 
 
 		 541 aa  291  3e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0610  AMP-binding domain protein  35.71 
 
 		 570 aa  290  5.0000000000000004e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.920315  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1086  AMP-dependent synthetase and ligase  33.71 
 
 		 566 aa  289  8e-77  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2768  AMP-dependent synthetase and ligase  36.27 
 
 		 558 aa  288  1e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000354199 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2440  AMP-binding domain protein  35.8 
 
 		 544 aa  289  1e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0557  AMP-binding domain protein  35.38 
 
 		 549 aa  288  1e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0404  hypothetical protein  34.31 
 
 		 605 aa  288  1e-76  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.737872  normal  0.0168695 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2014  AMP-dependent synthetase and ligase  34.61 
 
 		 542 aa  289  1e-76  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.534696  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4878  AMP-dependent synthetase and ligase  35.6 
 
 		 530 aa  288  1e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0148671 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3025  AMP-binding domain protein  36.04 
 
 		 576 aa  288  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2941  acyl-CoA synthetase  33.59 
 
 		 557 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.581775  normal  0.0544542 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1627  AMP-dependent synthetase and ligase  33.46 
 
 		 571 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1563  AMP-binding domain protein  35.55 
 
 		 538 aa  287  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716975 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0099  AMP-binding domain protein  34.98 
 
 		 575 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2947  AMP-binding domain protein  35.22 
 
 		 575 aa  286  9e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.768033  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0108  AMP-binding domain protein  35.22 
 
 		 575 aa  286  9e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.969616  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1667  AMP-binding domain protein  33.77 
 
 		 549 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.327549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1032  AMP-dependent synthetase and ligase  32.9 
 
 		 566 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0234  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 843 aa  285  1.0000000000000001e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000591284  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3290  AMP-binding domain protein  34.98 
 
 		 575 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0124  AMP-binding domain protein  35.03 
 
 		 575 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2693  AMP-dependent synthetase and ligase  34.81 
 
 		 562 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01449  AMP-binding domain protein  34.25 
 
 		 579 aa  283  4.0000000000000003e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.300352  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4872  AMP-binding domain protein  35.35 
 
 		 549 aa  283  7.000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1904  AMP-binding domain protein  34.51 
 
 		 573 aa  283  7.000000000000001e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0770  AMP-dependent synthetase and ligase  34.1 
 
 		 566 aa  282  9e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.404945  normal  0.888891 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0108  AMP-binding domain protein  34.92 
 
 		 575 aa  281  2e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4867  AMP-binding domain protein  35.81 
 
 		 538 aa  281  2e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.223701  normal  0.186874 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2593  AMP-binding domain protein  34.02 
 
 		 574 aa  281  2e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0870  AMP-binding domain protein  34.14 
 
 		 548 aa  281  2e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1818  AMP-dependent synthetase and ligase  34.86 
 
 		 563 aa  280  4e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.122494  normal  0.361334 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4160  AMP-dependent synthetase and ligase  37.61 
 
 		 499 aa  280  4e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.365856  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4008  AMP-dependent synthetase and ligase  34.74 
 
 		 1043 aa  280  4e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0312  AMP-binding domain protein  34.94 
 
 		 550 aa  280  4e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4437  AMP-binding domain protein  36.01 
 
 		 540 aa  280  6e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4524  AMP-binding domain protein  36.01 
 
 		 540 aa  280  6e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17630  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  34.17 
 
 		 592 aa  279  7e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.100128  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3103  AMP-dependent synthetase and ligase  33.52 
 
 		 550 aa  279  7e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0752  AMP-binding domain protein  35.98 
 
 		 576 aa  279  8e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0470  AMP-binding domain protein  35.53 
 
 		 579 aa  279  8e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.500012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0108  AMP-binding domain protein  34.98 
 
 		 575 aa  278  1e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.480818  normal  0.901201 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3969  AMP-dependent synthetase and ligase  35.65 
 
 		 500 aa  279  1e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.130763  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1778  AMP-binding domain protein  32.66 
 
 		 560 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0198659 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4818  AMP-binding domain protein  35.42 
 
 		 540 aa  278  2e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12527  AMP-binding domain protein  35.05 
 
 		 547 aa  277  3e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0503764 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34080  AMP-binding domain protein  34.25 
 
 		 552 aa  277  3e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.448325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3009  AMP-binding domain protein  33.65 
 
 		 546 aa  277  3e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4372  AMP-dependent synthetase and ligase  34.25 
 
 		 539 aa  277  3e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17150  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  33.33 
 
 		 828 aa  276  4e-73  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.488876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3661  AMP-binding domain protein  33.03 
 
 		 560 aa  276  5e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000288335 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0042  AMP-binding domain protein  34.03 
 
 		 576 aa  276  8e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3966  AMP-binding domain protein  34.54 
 
 		 576 aa  276  9e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4063  AMP-binding domain protein  32.84 
 
 		 560 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365849  normal  0.0336017 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4037  AMP-dependent synthetase and ligase  33.08 
 
 		 558 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0518356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4040  AMP-binding domain protein  34.54 
 
 		 576 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0288  AMP-binding domain protein  33.97 
 
 		 564 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0229323  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3892  AMP-binding domain protein  34.58 
 
 		 576 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.239396  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2959  AMP-binding domain protein  34.54 
 
 		 576 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3108  AMP-binding domain protein  32.95 
 
 		 546 aa  275  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.580008  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3833  AMP-binding domain protein  34.88 
 
 		 601 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3018  AMP-binding domain protein  34.54 
 
 		 576 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0807  AMP-dependent synthetase and ligase  33.72 
 
 		 551 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.472076  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3353  AMP-binding domain protein  34.54 
 
 		 576 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1584  AMP-binding domain protein  34.54 
 
 		 570 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0176  AMP-binding domain protein  34.35 
 
 		 576 aa  274  3e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.970705  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31470  AMP-binding domain protein  33.46 
 
 		 564 aa  274  3e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0028776  hitchhiker  0.0000000416298 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2679  AMP-binding domain protein  33.6 
 
 		 561 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180976  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0344  AMP-binding domain protein  36.06 
 
 		 562 aa  274  4.0000000000000004e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.100012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3655  AMP-binding domain protein  33.59 
 
 		 565 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0315072 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3209  AMP-binding domain protein  32.76 
 
 		 546 aa  273  5.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.609491  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3306  AMP-binding domain protein  33.78 
 
 		 576 aa  271  2e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63972  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4161  AMP-binding domain protein  35.94 
 
 		 577 aa  271  2e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  34.75 
 
 		 506 aa  271  2e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>