More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3798 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 499 aa  1031    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0814  AMP-dependent synthetase and ligase  47.26 
 
 		 508 aa  464  1e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4072  AMP-dependent synthetase and ligase  47.07 
 
 		 508 aa  463  1e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4613  AMP-dependent synthetase and ligase  48.04 
 
 		 512 aa  460  9.999999999999999e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499912 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2447  AMP-dependent synthetase and ligase  46.76 
 
 		 505 aa  456  1e-127  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0415  AMP-dependent synthetase and ligase  46.38 
 
 		 515 aa  452  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.866195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3808  AMP-dependent synthetase and ligase  46.06 
 
 		 508 aa  451  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.762435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0367  AMP-dependent synthetase and ligase  45.17 
 
 		 513 aa  439  9.999999999999999e-123  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.379931 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0667  putative O-succinylbenzoate--CoA ligase  43.66 
 
 		 516 aa  435  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.604577  normal  0.0579833 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1614  AMP-dependent synthetase and ligase  46.4 
 
 		 509 aa  428  1e-118  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4616  AMP-dependent synthetase and ligase  43.5 
 
 		 518 aa  426  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.892742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4902  AMP-dependent synthetase and ligase  46.59 
 
 		 501 aa  427  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5453  AMP-dependent synthetase and ligase  44.17 
 
 		 554 aa  426  1e-118  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.400076 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3215  O-succinylbenzoate-CoA ligase  45.08 
 
 		 517 aa  419  1e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0554015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3204  O-succinylbenzoate-CoA ligase  45.08 
 
 		 517 aa  419  1e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.716175  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3266  O-succinylbenzoate-CoA ligase  45.08 
 
 		 517 aa  419  1e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.10141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  44.11 
 
 		 503 aa  418  9.999999999999999e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1789  acyl-CoA synthetase  41.58 
 
 		 496 aa  409  1e-113  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0554946  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1964  acyl-CoA synthetase  41.58 
 
 		 496 aa  411  1e-113  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000141031 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1746  acyl-CoA synthetase  41.78 
 
 		 496 aa  411  1e-113  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1928  acyl-CoA synthetase  41.58 
 
 		 496 aa  409  1e-113  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.132163  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0415  AMP-dependent synthetase and ligase  44.18 
 
 		 620 aa  397  1e-109  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.784497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  42.83 
 
 		 520 aa  389  1e-107  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2327  AMP-dependent synthetase and ligase  43.48 
 
 		 496 aa  386  1e-106  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.940747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1672  AMP-dependent synthetase and ligase  44.47 
 
 		 491 aa  381  1e-104  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0961293 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3819  O-succinylbenzoate-CoA ligase  41.15 
 
 		 529 aa  381  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2524  AMP-dependent synthetase and ligase  41.39 
 
 		 520 aa  377  1e-103  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.82155 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0047  AMP-dependent synthetase and ligase  39 
 
 		 517 aa  363  4e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.19 
 
 		 514 aa  362  6e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0311  AMP-dependent synthetase and ligase  41.07 
 
 		 501 aa  356  6.999999999999999e-97  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0140314 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1003  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.54 
 
 		 510 aa  343  4e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.54 
 
 		 510 aa  343  5e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1019  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.54 
 
 		 510 aa  343  5e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1091  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.54 
 
 		 510 aa  343  5e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.54 
 
 		 510 aa  343  5e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1123  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.54 
 
 		 510 aa  343  5.999999999999999e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  40.2 
 
 		 520 aa  342  7e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.54 
 
 		 510 aa  342  9e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1169  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.34 
 
 		 510 aa  342  1e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.34 
 
 		 510 aa  341  2e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1008  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.54 
 
 		 510 aa  340  4e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.48 
 
 		 512 aa  340  4e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1225  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.5 
 
 		 519 aa  339  8e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.399435  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5944  AMP-dependent synthetase and ligase  38.6 
 
 		 532 aa  338  9e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420174  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4900  AMP-dependent synthetase and ligase  41.44 
 
 		 527 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.309388  normal  0.552445 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1488  AMP-dependent synthetase and ligase  40.08 
 
 		 525 aa  337  3.9999999999999995e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0982209  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0411  acyl-CoA synthetase  38.68 
 
 		 522 aa  336  5e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  39.54 
 
 		 525 aa  335  1e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  37.95 
 
 		 521 aa  335  1e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4008  AMP-dependent synthetase and ligase  39.72 
 
 		 1043 aa  333  4e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0642  acyl-CoA synthetase  37.18 
 
 		 529 aa  333  4e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.95301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1135  AMP-dependent synthetase and ligase  38.73 
 
 		 517 aa  331  2e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.755647  hitchhiker  0.000174804 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4810  AMP-dependent synthetase and ligase  40.37 
 
 		 528 aa  331  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.672528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  38.04 
 
 		 512 aa  331  2e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1884  AMP-dependent synthetase and ligase  39.64 
 
 		 495 aa  331  2e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5827  AMP-dependent synthetase and ligase  38.06 
 
 		 518 aa  328  9e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.671788  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2406  AMP-dependent synthetase and ligase  37.92 
 
 		 509 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0466191 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0571  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  38.18 
 
 		 490 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4684  AMP-dependent synthetase and ligase  40.82 
 
 		 526 aa  328  2.0000000000000001e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0714  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.49 
 
 		 579 aa  327  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13106  fatty-acid-CoA ligase fadD13  36.67 
 
 		 503 aa  327  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4758  AMP-dependent synthetase and ligase  38.37 
 
 		 518 aa  326  8.000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4379  AMP-dependent synthetase and ligase  41.85 
 
 		 506 aa  325  1e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.177409 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0105  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.68 
 
 		 556 aa  325  1e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.356608  normal  0.265858 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0115  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.68 
 
 		 556 aa  324  2e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1660  AMP-dependent synthetase and ligase  37.58 
 
 		 523 aa  324  2e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104845  normal  0.559317 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0124  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.68 
 
 		 556 aa  324  2e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.514213  normal  0.109541 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2377  AMP-dependent synthetase and ligase  38.48 
 
 		 530 aa  324  2e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.581612  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0843  acyl-CoA synthetase  38.91 
 
 		 513 aa  323  3e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.333452  normal  0.193709 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4826  AMP-dependent synthetase and ligase  39.01 
 
 		 520 aa  324  3e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0178748  normal  0.551416 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2105  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.02 
 
 		 524 aa  323  6e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5438  AMP-dependent synthetase and ligase  37.84 
 
 		 515 aa  322  9.000000000000001e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2089  AMP-dependent synthetase and ligase  38.25 
 
 		 530 aa  322  9.999999999999999e-87  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1159  O-succinylbenzoate-CoA ligase  38.23 
 
 		 486 aa  322  9.999999999999999e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498459  hitchhiker  0.000208098 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1133  AMP-dependent synthetase and ligase  39.55 
 
 		 518 aa  320  5e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.508244  normal  0.50206 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2032  AMP-dependent synthetase and ligase  38.87 
 
 		 551 aa  320  5e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.367958 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3158  AMP-dependent synthetase and ligase  37.62 
 
 		 515 aa  320  5e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6878  AMP-dependent synthetase and ligase  37.62 
 
 		 509 aa  319  7e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2407  AMP-dependent synthetase and ligase  37.55 
 
 		 498 aa  319  7.999999999999999e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.676828  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3490  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  37.94 
 
 		 481 aa  318  1e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1605  AMP-dependent synthetase and ligase  38.83 
 
 		 526 aa  318  2e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0224  AMP-dependent synthetase and ligase  36.8 
 
 		 501 aa  318  2e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0840  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.27 
 
 		 510 aa  318  2e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0218  AMP-dependent synthetase and ligase  36.8 
 
 		 501 aa  318  2e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4993  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  36.71 
 
 		 481 aa  315  8e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3704  AMP-dependent synthetase and ligase  36.65 
 
 		 515 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0990866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1261  AMP-dependent synthetase and ligase  38.61 
 
 		 546 aa  315  9.999999999999999e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0532703  hitchhiker  0.000000308481 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2796  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  36.38 
 
 		 492 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00173359  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2038  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  37.27 
 
 		 565 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3514  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.6 
 
 		 525 aa  315  1.9999999999999998e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270509  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5012  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  36.51 
 
 		 481 aa  314  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1595  AMP-dependent synthetase and ligase  38.52 
 
 		 519 aa  314  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2351  acyl-CoA synthetase  36.44 
 
 		 517 aa  313  4.999999999999999e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.197387  normal  0.399216 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0027  AMP-dependent synthetase and ligase  38.91 
 
 		 509 aa  313  4.999999999999999e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.141316  normal  0.236103 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4607  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  36.51 
 
 		 482 aa  313  6.999999999999999e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1666  AMP-dependent synthetase and ligase  38.35 
 
 		 518 aa  312  7.999999999999999e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.144653  normal  0.373713 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4694  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  36.79 
 
 		 481 aa  312  7.999999999999999e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2525  AMP-dependent synthetase and ligase  36.08 
 
 		 516 aa  312  9e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.695888 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4982  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  36.31 
 
 		 482 aa  311  1e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0131  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.96 
 
 		 570 aa  311  1e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>