More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2702 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1041  malonyl-CoA synthase  98 
 
 		 501 aa  977    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.200492  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3408  malonyl-CoA synthase  62.82 
 
 		 504 aa  655    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.787784 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2702  malonyl-CoA synthase  100 
 
 		 501 aa  998    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0670195 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3834  malonyl-CoA synthase  64.61 
 
 		 504 aa  642    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.610168  normal  0.151644 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2999  malonyl-CoA synthase  66 
 
 		 506 aa  657    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3566  malonyl-CoA synthase  64.21 
 
 		 503 aa  619  1e-176  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.676985  normal  0.895128 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0574  malonyl-CoA synthase  59.96 
 
 		 504 aa  599  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0616  malonyl-CoA synthase  60.44 
 
 		 504 aa  598  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.562715  normal  0.268093 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5371  malonyl-CoA synthase  59.13 
 
 		 504 aa  594  1e-168  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132829  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0876  malonyl-CoA synthase  60.94 
 
 		 510 aa  588  1e-167  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0768548 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0836  malonyl-CoA synthase  60.94 
 
 		 510 aa  590  1e-167  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.141452  normal  0.0577882 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5138  malonyl-CoA synthase  59.21 
 
 		 510 aa  583  1.0000000000000001e-165  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.809655  normal  0.695279 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1719  malonyl-CoA synthase  59.56 
 
 		 503 aa  580  1e-164  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.982236 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0226  malonyl-CoA synthase  56.83 
 
 		 508 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0526846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0802  malonyl-CoA synthase  59.38 
 
 		 510 aa  568  1e-161  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.756606  normal  0.0286315 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6034  malonyl-CoA synthase  60.28 
 
 		 507 aa  569  1e-161  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.224104  normal  0.165563 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7251  malonyl-CoA synthase  61.45 
 
 		 507 aa  568  1e-161  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1586  malonyl-CoA synthase  56.37 
 
 		 506 aa  555  1e-157  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0329  malonyl-CoA synthase  57.95 
 
 		 511 aa  552  1e-156  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0483  malonyl-CoA synthase  59.4 
 
 		 503 aa  551  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1480  malonyl-CoA synthase  59.06 
 
 		 509 aa  546  1e-154  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000189244 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0220  malonyl-CoA synthase  55.18 
 
 		 503 aa  545  1e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.601636  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0518  malonyl-CoA synthase  59.13 
 
 		 509 aa  543  1e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0245  malonyl-CoA synthase  55.86 
 
 		 504 aa  541  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0395238 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3600  malonyl-CoA synthase  53.78 
 
 		 505 aa  536  1e-151  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2492  malonyl-CoA synthase  57.94 
 
 		 504 aa  531  1e-150  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.318474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2797  malonyl-CoA synthase  54.38 
 
 		 518 aa  527  1e-148  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.676577 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2771  malonyl-CoA synthase  57.08 
 
 		 536 aa  522  1e-147  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.594073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0422  malonyl-CoA synthase  58.19 
 
 		 526 aa  519  1e-146  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.149212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0770  AMP-dependent synthetase and ligase  55.62 
 
 		 501 aa  518  1e-146  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0996  malonyl-CoA synthase  55.46 
 
 		 519 aa  517  1.0000000000000001e-145  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2094  malonyl-CoA synthase  53.09 
 
 		 506 aa  515  1.0000000000000001e-145  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0754737  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2538  malonyl-CoA synthase  57.29 
 
 		 511 aa  516  1.0000000000000001e-145  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2794  malonyl-CoA synthase  51.85 
 
 		 517 aa  514  1e-144  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.71549  normal  0.398408 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2870  malonyl-CoA synthase  55.44 
 
 		 506 aa  512  1e-144  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.689672  normal  0.236454 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1080  malonyl-CoA synthase  55.25 
 
 		 519 aa  513  1e-144  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.261639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3119  malonyl-CoA synthase  59.73 
 
 		 485 aa  511  1e-143  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.646837  normal  0.278949 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0648  malonyl-CoA synthase  52.5 
 
 		 517 aa  494  9.999999999999999e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2790  malonyl-CoA synthase  53.31 
 
 		 512 aa  494  9.999999999999999e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000139685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1515  malonyl-CoA synthase  55.25 
 
 		 539 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.624521  normal  0.177064 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0631  malonyl-CoA synthase  50.21 
 
 		 507 aa  486  1e-136  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1925  malonyl-CoA synthase  54.78 
 
 		 500 aa  479  1e-134  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1293  malonyl-CoA synthase  54.47 
 
 		 510 aa  466  9.999999999999999e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112545 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2752  malonyl-CoA synthase  51.68 
 
 		 547 aa  461  9.999999999999999e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0433908 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1101  malonyl-CoA synthase  50.78 
 
 		 530 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3859  AMP-dependent synthetase and ligase  47.01 
 
 		 504 aa  365  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.447607  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0559  AMP-dependent synthetase and ligase  44.38 
 
 		 507 aa  367  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  44.35 
 
 		 502 aa  342  7e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.597037  normal  0.34641 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  37.19 
 
 		 525 aa  305  9.000000000000001e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0079  AMP-dependent synthetase and ligase  42.47 
 
 		 553 aa  301  1e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.737985 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0108  AMP-dependent synthetase and ligase  37.38 
 
 		 569 aa  293  5e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.824706  normal  0.320607 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  38.73 
 
 		 520 aa  289  9e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1592  AMP-dependent synthetase and ligase  37.17 
 
 		 561 aa  287  2e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185317  normal  0.745369 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4160  AMP-dependent synthetase and ligase  38.36 
 
 		 499 aa  286  7e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.365856  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0827  AMP-dependent synthetase and ligase  35.51 
 
 		 566 aa  284  3.0000000000000004e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.04 
 
 		 514 aa  282  1e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1867  AMP-dependent synthetase and ligase  37.89 
 
 		 507 aa  280  3e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21680  acyl-CoA synthetase  42.98 
 
 		 480 aa  280  6e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.656623 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  40.47 
 
 		 506 aa  275  1.0000000000000001e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1593  AMP-dependent synthetase and ligase  36.01 
 
 		 559 aa  274  3e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0495218 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  35.23 
 
 		 539 aa  272  9e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.98 
 
 		 512 aa  271  2.9999999999999997e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3969  AMP-dependent synthetase and ligase  37.01 
 
 		 500 aa  266  5e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.130763  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  34.01 
 
 		 521 aa  266  5e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2629  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 557 aa  266  8e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0494506  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0321  AMP-dependent synthetase and ligase  36.97 
 
 		 503 aa  265  1e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.289675  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1070  AMP-dependent synthetase and ligase  34.79 
 
 		 565 aa  264  3e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0635723  normal  0.557335 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.17 
 
 		 510 aa  262  1e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4261  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.57 
 
 		 563 aa  261  1e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1003  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.97 
 
 		 510 aa  261  2e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4273  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.57 
 
 		 563 aa  261  2e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.17 
 
 		 510 aa  261  2e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4653  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.57 
 
 		 561 aa  261  3e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.97 
 
 		 510 aa  261  3e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2858  AMP-dependent synthetase and ligase  38.92 
 
 		 485 aa  260  3e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1019  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.97 
 
 		 510 aa  260  4e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1091  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.97 
 
 		 510 aa  260  4e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3506  AMP-dependent synthetase and ligase  39.47 
 
 		 505 aa  260  4e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0661851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0286  AMP-dependent synthetase and ligase  37.34 
 
 		 511 aa  260  4e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4335  AMP-dependent synthetase and ligase  36.55 
 
 		 521 aa  260  4e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.153441  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.97 
 
 		 510 aa  260  4e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4638  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.57 
 
 		 582 aa  260  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4422  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.57 
 
 		 563 aa  259  6e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841946  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.57 
 
 		 563 aa  259  6e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491645  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0601  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.03 
 
 		 561 aa  259  7e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4634  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.57 
 
 		 582 aa  259  7e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1169  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.97 
 
 		 510 aa  259  7e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1008  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.76 
 
 		 510 aa  259  8e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4072  AMP-dependent synthetase and ligase  34.98 
 
 		 508 aa  259  1e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4654  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.37 
 
 		 561 aa  259  1e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1123  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.56 
 
 		 510 aa  258  2e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1998  putative acyl-CoA synthetase, long-chain fatty acid:CoA ligase  36.96 
 
 		 508 aa  258  2e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.222529  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0136  AMP-dependent synthetase and ligase  35.32 
 
 		 520 aa  258  2e-67  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0839  AMP-dependent synthetase and ligase  32.35 
 
 		 577 aa  258  2e-67  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1423  AMP-dependent synthetase and ligase  38.83 
 
 		 510 aa  257  3e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2335  AMP-dependent synthetase and ligase  38.96 
 
 		 509 aa  257  4e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3226  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.96 
 
 		 561 aa  257  4e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1980  AMP-dependent synthetase and ligase  35.6 
 
 		 532 aa  256  6e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0106234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1330  AMP-dependent synthetase and ligase  34.93 
 
 		 502 aa  256  6e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.982491 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3808  AMP-dependent synthetase and ligase  36.14 
 
 		 508 aa  256  9e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.762435  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>