More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C6175 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007336  Reut_C6175  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 537 aa  1101    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2461  AMP-dependent synthetase and ligase  49.9 
 
 		 504 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3284  AMP-dependent synthetase and ligase  49.51 
 
 		 510 aa  456  1e-127  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2687  putative long-chain-fatty-acid CoA ligase  49.21 
 
 		 503 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.714201 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3317  AMP-dependent synthetase and ligase  48.81 
 
 		 508 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3955  AMP-dependent synthetase and ligase  48.52 
 
 		 508 aa  444  1e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132635  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0632  AMP-dependent synthetase and ligase  48.1 
 
 		 532 aa  436  1e-121  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0700  AMP-dependent synthetase and ligase  47.13 
 
 		 505 aa  437  1e-121  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.232219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0653  AMP-dependent synthetase and ligase  48.65 
 
 		 524 aa  438  1e-121  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2102  AMP-dependent synthetase and ligase  48.42 
 
 		 508 aa  434  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0103698  hitchhiker  0.00738947 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4412  AMP-dependent synthetase and ligase  46.06 
 
 		 494 aa  421  1e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4499  AMP-dependent synthetase and ligase  46.06 
 
 		 494 aa  421  1e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.927408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3271  AMP-dependent synthetase and ligase  47.72 
 
 		 508 aa  417  9.999999999999999e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22250  AMP-dependent synthetase and ligase protein  47.73 
 
 		 502 aa  418  9.999999999999999e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.219282  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4793  AMP-dependent synthetase and ligase  45.94 
 
 		 494 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.178954 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1782  AMP-dependent synthetase and ligase  46.31 
 
 		 493 aa  409  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0876128  normal  0.689181 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4968  AMP-dependent synthetase and ligase  44.18 
 
 		 489 aa  395  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3708  AMP-dependent synthetase and ligase  44.69 
 
 		 551 aa  386  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4820  acyl-CoA synthetase  36.63 
 
 		 533 aa  308  2.0000000000000002e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.755365  normal  0.560915 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1488  AMP-dependent synthetase and ligase  39.12 
 
 		 525 aa  304  3.0000000000000004e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0982209  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2371  acyl-CoA synthetase  37.13 
 
 		 532 aa  303  4.0000000000000003e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5364  acyl-CoA synthetase  36.07 
 
 		 536 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.868662  normal  0.0358165 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5669  acyl-CoA synthetase  36.62 
 
 		 529 aa  292  1e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1724  AMP-dependent synthetase and ligase  36.4 
 
 		 515 aa  290  3e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0701995  normal  0.167784 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2806  acyl-CoA synthetase  34.87 
 
 		 556 aa  290  4e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.688057 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3076  acyl-CoA synthetase  35.63 
 
 		 545 aa  289  9e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1438  acyl-CoA synthetase  34.23 
 
 		 549 aa  288  2e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.603543  decreased coverage  0.00000173613 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4921  acyl-CoA synthetase  35.74 
 
 		 531 aa  288  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  35.01 
 
 		 520 aa  288  2e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3008  acyl-CoA synthetase  36.47 
 
 		 545 aa  286  7e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.311019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6078  acyl-CoA synthetase  34.73 
 
 		 536 aa  286  8e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6078  acyl-CoA synthetase  34.29 
 
 		 542 aa  282  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2038  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  34.62 
 
 		 565 aa  280  7e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3704  AMP-dependent synthetase and ligase  34.36 
 
 		 515 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0990866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2525  AMP-dependent synthetase and ligase  36.64 
 
 		 516 aa  277  4e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.695888 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4389  acyl-CoA synthetase  34.29 
 
 		 533 aa  277  4e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0682495  normal  0.0388697 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1865  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.86 
 
 		 519 aa  276  6e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.975513  normal  0.637576 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  34.62 
 
 		 525 aa  276  7e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3158  AMP-dependent synthetase and ligase  34.81 
 
 		 515 aa  276  9e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.38 
 
 		 514 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1515  AMP-dependent synthetase and ligase  37.67 
 
 		 515 aa  270  4e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00288915  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1538  AMP-dependent synthetase and ligase  37.67 
 
 		 515 aa  270  4e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5438  AMP-dependent synthetase and ligase  36.42 
 
 		 515 aa  270  5e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1597  AMP-dependent synthetase and ligase  35.25 
 
 		 549 aa  269  1e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000318079  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6162  AMP-dependent synthetase and ligase  38.79 
 
 		 487 aa  268  2e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0115  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.5 
 
 		 556 aa  266  7e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0105  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.5 
 
 		 556 aa  266  7e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.356608  normal  0.265858 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0124  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.5 
 
 		 556 aa  266  7e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.514213  normal  0.109541 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  34.24 
 
 		 503 aa  264  3e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1498  AMP-dependent synthetase and ligase  34.45 
 
 		 531 aa  263  6e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5309  AMP-dependent synthetase and ligase  35.76 
 
 		 517 aa  263  6.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  35.48 
 
 		 520 aa  262  1e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6878  AMP-dependent synthetase and ligase  34.5 
 
 		 509 aa  261  3e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2675  AMP-dependent synthetase and ligase  35.91 
 
 		 501 aa  261  3e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.493637  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1225  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.46 
 
 		 519 aa  260  5.0000000000000005e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.399435  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1367  AMP-dependent synthetase and ligase  38.96 
 
 		 502 aa  259  6e-68  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.439129  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1133  AMP-dependent synthetase and ligase  35.7 
 
 		 518 aa  259  6e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.508244  normal  0.50206 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3747  AMP-dependent synthetase and ligase  36.84 
 
 		 514 aa  259  8e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4653  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.51 
 
 		 561 aa  258  1e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3859  AMP-dependent synthetase and ligase  36.63 
 
 		 504 aa  258  2e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.447607  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0601  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.62 
 
 		 561 aa  258  2e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4826  AMP-dependent synthetase and ligase  35.14 
 
 		 520 aa  257  3e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0178748  normal  0.551416 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.54 
 
 		 512 aa  256  6e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4654  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.33 
 
 		 561 aa  256  6e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3611  AMP-dependent synthetase and ligase  34.43 
 
 		 532 aa  256  7e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0778531  normal  0.0346233 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2438  AMP-dependent synthetase and ligase  35.42 
 
 		 512 aa  256  8e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0851  acyl-CoA synthetase  35.74 
 
 		 504 aa  256  9e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0227528 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3129  AMP-dependent synthetase and ligase  35.17 
 
 		 534 aa  256  1.0000000000000001e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0682  AMP-dependent synthetase and ligase  32.9 
 
 		 530 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0943  AMP-dependent synthetase and ligase  36.8 
 
 		 511 aa  255  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3514  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.79 
 
 		 525 aa  255  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270509  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  33.66 
 
 		 490 aa  254  3e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4261  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.81 
 
 		 563 aa  254  3e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4634  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.99 
 
 		 582 aa  254  3e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4273  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.99 
 
 		 563 aa  254  3e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0559  AMP-dependent synthetase and ligase  35.22 
 
 		 507 aa  254  3e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4008  AMP-dependent synthetase and ligase  34.97 
 
 		 1043 aa  254  3e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2819  acyl-CoA synthetase  33.84 
 
 		 529 aa  254  4.0000000000000004e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.427573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4354  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.22 
 
 		 561 aa  253  7e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4691  AMP-dependent synthetase and ligase  37.47 
 
 		 502 aa  253  8.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4080  AMP-dependent synthetase and ligase  36.66 
 
 		 518 aa  252  1e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.656205  normal  0.161644 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0812  AMP-dependent synthetase and ligase  36.27 
 
 		 508 aa  251  2e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0154  AMP-dependent synthetase and ligase  35.55 
 
 		 520 aa  250  4e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2105  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.58 
 
 		 524 aa  250  5e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4422  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.81 
 
 		 563 aa  249  8e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841946  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.81 
 
 		 563 aa  249  8e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491645  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4638  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.81 
 
 		 582 aa  249  8e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3975  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.03 
 
 		 530 aa  249  9e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.251646  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2485  AMP-dependent synthetase and ligase  35.55 
 
 		 534 aa  249  1e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0714  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.76 
 
 		 579 aa  248  1e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2999  malonyl-CoA synthase  35.7 
 
 		 506 aa  248  2e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3226  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.33 
 
 		 561 aa  248  2e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1595  AMP-dependent synthetase and ligase  35.33 
 
 		 519 aa  248  2e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1123  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.39 
 
 		 510 aa  248  2e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0131  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.84 
 
 		 570 aa  248  2e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3993  AMP-dependent synthetase and ligase  35.7 
 
 		 524 aa  248  2e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.968795  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2629  AMP-dependent synthetase and ligase  33.58 
 
 		 557 aa  247  3e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0494506  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3720  AMP-dependent synthetase and ligase  36.73 
 
 		 518 aa  248  3e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.189603  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1605  AMP-dependent synthetase and ligase  34.25 
 
 		 526 aa  247  4e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4949  acyl-CoA synthetase  33.21 
 
 		 521 aa  247  4.9999999999999997e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131807  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>