More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2105 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003909  BCE_0965  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  59.34 
 
 		 518 aa  685    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0965  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  58.56 
 
 		 518 aa  663    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0832  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  58.75 
 
 		 518 aa  662    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0778  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  58.75 
 
 		 518 aa  663    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1052  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  59.14 
 
 		 518 aa  685    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0779  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  58.75 
 
 		 518 aa  663    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4403  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  58.7 
 
 		 518 aa  689    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000650953 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0876  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  58.75 
 
 		 518 aa  662    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0927  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  59.34 
 
 		 518 aa  692    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2105  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  100 
 
 		 524 aa  1084    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0707  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  61.67 
 
 		 518 aa  696    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.413153  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1225  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  79.3 
 
 		 519 aa  886    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.399435  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0779  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  59.53 
 
 		 518 aa  681    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.746675  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2089  AMP-dependent synthetase and ligase  50 
 
 		 530 aa  498  1e-139  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4325  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  46.69 
 
 		 534 aa  457  1e-127  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0641194 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3917  AMP-dependent synthetase and ligase  39.54 
 
 		 521 aa  367  1e-100  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.287192  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4891  AMP-dependent synthetase and ligase  38.02 
 
 		 520 aa  345  1e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.862065  normal  0.74496 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1604  AMP-dependent synthetase and ligase  40.7 
 
 		 540 aa  340  4e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5944  AMP-dependent synthetase and ligase  41.76 
 
 		 532 aa  335  1e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420174  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4202  acyl-CoA synthetase  41.17 
 
 		 534 aa  330  4e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.269622  hitchhiker  0.00584314 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4616  AMP-dependent synthetase and ligase  37.55 
 
 		 518 aa  327  3e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.892742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  38.6 
 
 		 520 aa  327  4.0000000000000003e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2323  AMP-dependent synthetase and ligase  39.5 
 
 		 511 aa  325  2e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2377  AMP-dependent synthetase and ligase  39.73 
 
 		 530 aa  323  5e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.581612  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  37.02 
 
 		 499 aa  323  6e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0814  AMP-dependent synthetase and ligase  38.22 
 
 		 508 aa  319  7.999999999999999e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3808  AMP-dependent synthetase and ligase  38.39 
 
 		 508 aa  318  2e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.762435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.93 
 
 		 514 aa  318  2e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1614  AMP-dependent synthetase and ligase  39.29 
 
 		 509 aa  317  4e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2250  AMP-dependent synthetase and ligase  36.6 
 
 		 538 aa  317  4e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1488  AMP-dependent synthetase and ligase  39.76 
 
 		 525 aa  316  5e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0982209  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4072  AMP-dependent synthetase and ligase  38.12 
 
 		 508 aa  316  7e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0309  acyl-CoA synthetase  39 
 
 		 537 aa  316  7e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0300  acyl-CoA synthetase  39 
 
 		 537 aa  316  7e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0319  acyl-CoA synthetase  39 
 
 		 537 aa  316  7e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.43856 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13106  fatty-acid-CoA ligase fadD13  36.82 
 
 		 503 aa  314  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0411  acyl-CoA synthetase  37.04 
 
 		 522 aa  312  9e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3204  O-succinylbenzoate-CoA ligase  36.81 
 
 		 517 aa  312  1e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.716175  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3215  O-succinylbenzoate-CoA ligase  36.81 
 
 		 517 aa  312  1e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0554015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3266  O-succinylbenzoate-CoA ligase  36.81 
 
 		 517 aa  312  1e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.10141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4559  acyl-CoA synthetase  38.05 
 
 		 529 aa  311  2e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.134713  normal  0.114816 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0667  putative O-succinylbenzoate--CoA ligase  37.69 
 
 		 516 aa  311  2e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.604577  normal  0.0579833 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1724  AMP-dependent synthetase and ligase  38.1 
 
 		 515 aa  310  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0701995  normal  0.167784 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2351  acyl-CoA synthetase  35.89 
 
 		 517 aa  309  9e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.197387  normal  0.399216 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2434  AMP-dependent synthetase and ligase  36.99 
 
 		 534 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.097494  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  37.32 
 
 		 520 aa  307  2.0000000000000002e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2882  acyl-CoA synthetase  38.88 
 
 		 557 aa  308  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3261  AMP-dependent synthetase and ligase  35.74 
 
 		 534 aa  307  3e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0894  acyl-CoA synthetase  38.39 
 
 		 520 aa  307  3e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.493906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0109  AMP-dependent synthetase and ligase  37.48 
 
 		 528 aa  304  3.0000000000000004e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0116  AMP-dependent synthetase and ligase  37.28 
 
 		 528 aa  303  4.0000000000000003e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2406  AMP-dependent synthetase and ligase  36.75 
 
 		 509 aa  302  1e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0466191 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1027  AMP-dependent synthetase and ligase  36.19 
 
 		 539 aa  302  1e-80  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0505944  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2440  AMP-binding domain protein  35.7 
 
 		 544 aa  300  4e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  37.73 
 
 		 503 aa  300  5e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3818  AMP-dependent synthetase and ligase  36.96 
 
 		 501 aa  299  7e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3299  feruloyl-CoA synthetase  35.93 
 
 		 564 aa  299  8e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.52 
 
 		 512 aa  299  9e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  35.03 
 
 		 518 aa  298  1e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1103  AMP-binding domain protein  33.64 
 
 		 552 aa  298  2e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0130  AMP-dependent synthetase and ligase  38.22 
 
 		 502 aa  298  2e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.963028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  36.63 
 
 		 490 aa  298  2e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0843  acyl-CoA synthetase  38.11 
 
 		 513 aa  297  3e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.333452  normal  0.193709 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  36.47 
 
 		 525 aa  297  4e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7494  acyl-CoA synthetase  39.12 
 
 		 521 aa  297  4e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.489378  normal  0.204527 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4008  AMP-dependent synthetase and ligase  36.9 
 
 		 1043 aa  296  7e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  35.42 
 
 		 662 aa  296  7e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3296  AMP-dependent synthetase and ligase  36.87 
 
 		 502 aa  296  7e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0486472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1650  AMP-binding domain protein  35.06 
 
 		 549 aa  295  1e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0116  AMP-dependent synthetase and ligase  37.45 
 
 		 502 aa  294  2e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08640  acyl-CoA synthetase  35.7 
 
 		 516 aa  295  2e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.310549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6878  AMP-dependent synthetase and ligase  35.52 
 
 		 509 aa  294  3e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2939  AMP-dependent synthetase and ligase  38.03 
 
 		 502 aa  293  4e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.572456  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0116  AMP-dependent synthetase and ligase  38.03 
 
 		 502 aa  293  4e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2203  AMP-dependent synthetase and ligase  34.22 
 
 		 534 aa  293  8e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.334168  normal  0.340753 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2692  AMP-binding domain protein  33.94 
 
 		 552 aa  292  1e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.262026  normal  0.421392 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  34.17 
 
 		 512 aa  291  1e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2563  AMP-binding domain protein  34.57 
 
 		 549 aa  291  2e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45341e-16 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0642  acyl-CoA synthetase  35.98 
 
 		 529 aa  291  2e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.95301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2283  AMP-dependent synthetase and ligase  32.83 
 
 		 513 aa  290  3e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4181  AMP-dependent synthetase and ligase  37.13 
 
 		 527 aa  290  5.0000000000000004e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2967  feruloyl-CoA synthetase  35.61 
 
 		 515 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3956  feruloyl-CoA synthetase  35.61 
 
 		 515 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1574  feruloyl-CoA synthetase  35.61 
 
 		 515 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4030  feruloyl-CoA synthetase  35.61 
 
 		 515 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3343  feruloyl-CoA synthetase  35.61 
 
 		 515 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3028  feruloyl-CoA synthetase  35.61 
 
 		 515 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3975  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.54 
 
 		 530 aa  289  7e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.251646  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3129  AMP-dependent synthetase and ligase  35.47 
 
 		 534 aa  289  7e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0770  AMP-dependent synthetase and ligase  35.34 
 
 		 566 aa  289  8e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.404945  normal  0.888891 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0415  AMP-dependent synthetase and ligase  36.56 
 
 		 620 aa  289  9e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.784497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0714  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.64 
 
 		 579 aa  289  9e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3993  AMP-dependent synthetase and ligase  36.29 
 
 		 524 aa  289  9e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.968795  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  33.09 
 
 		 553 aa  289  9e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1498  AMP-dependent synthetase and ligase  34.29 
 
 		 531 aa  289  1e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2083  AMP-dependent synthetase and ligase  35.18 
 
 		 544 aa  288  1e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0163  long-chain fatty-acid-CoA ligase  35.61 
 
 		 515 aa  288  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1133  AMP-dependent synthetase and ligase  37.5 
 
 		 518 aa  288  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.508244  normal  0.50206 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5438  AMP-dependent synthetase and ligase  36.59 
 
 		 515 aa  288  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427259  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0682  AMP-dependent synthetase and ligase  34.29 
 
 		 530 aa  287  2.9999999999999996e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>