More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4325 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4325  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  100 
 
 		 534 aa  1087    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0641194 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2105  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  46.69 
 
 		 524 aa  457  1e-127  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1225  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.52 
 
 		 519 aa  457  1e-127  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.399435  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0927  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.29 
 
 		 518 aa  449  1e-125  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0965  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.1 
 
 		 518 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4403  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.91 
 
 		 518 aa  443  1e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000650953 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1052  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.1 
 
 		 518 aa  443  1e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0779  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.1 
 
 		 518 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.746675  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0778  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.1 
 
 		 518 aa  436  1e-121  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0707  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.91 
 
 		 518 aa  438  1e-121  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.413153  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0832  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.1 
 
 		 518 aa  434  1e-120  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0965  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.1 
 
 		 518 aa  435  1e-120  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0779  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.1 
 
 		 518 aa  435  1e-120  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0876  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.1 
 
 		 518 aa  434  1e-120  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2089  AMP-dependent synthetase and ligase  43.21 
 
 		 530 aa  389  1e-107  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  36.48 
 
 		 503 aa  297  2e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3917  AMP-dependent synthetase and ligase  36.76 
 
 		 521 aa  292  1e-77  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.287192  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3296  AMP-dependent synthetase and ligase  39.06 
 
 		 502 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0486472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13106  fatty-acid-CoA ligase fadD13  37.55 
 
 		 503 aa  281  2e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0321  AMP-dependent synthetase and ligase  39.2 
 
 		 503 aa  281  3e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.289675  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4891  AMP-dependent synthetase and ligase  36.8 
 
 		 520 aa  281  3e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.862065  normal  0.74496 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0116  AMP-dependent synthetase and ligase  38.4 
 
 		 502 aa  280  5e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4902  AMP-dependent synthetase and ligase  38.13 
 
 		 501 aa  279  9e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3808  AMP-dependent synthetase and ligase  37.4 
 
 		 508 aa  278  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.762435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0411  acyl-CoA synthetase  36.96 
 
 		 522 aa  278  2e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3299  feruloyl-CoA synthetase  39.06 
 
 		 564 aa  277  3e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2323  AMP-dependent synthetase and ligase  35.66 
 
 		 511 aa  276  5e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  34.13 
 
 		 490 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1614  AMP-dependent synthetase and ligase  36.45 
 
 		 509 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3818  AMP-dependent synthetase and ligase  36.25 
 
 		 501 aa  273  7e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0130  AMP-dependent synthetase and ligase  38.02 
 
 		 502 aa  270  5e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.963028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5944  AMP-dependent synthetase and ligase  35.99 
 
 		 532 aa  270  5e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420174  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  34.47 
 
 		 499 aa  269  8e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2351  acyl-CoA synthetase  35.46 
 
 		 517 aa  269  8.999999999999999e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.197387  normal  0.399216 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.59 
 
 		 514 aa  268  1e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4072  AMP-dependent synthetase and ligase  36.43 
 
 		 508 aa  269  1e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0814  AMP-dependent synthetase and ligase  36.12 
 
 		 508 aa  267  4e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2939  AMP-dependent synthetase and ligase  38.02 
 
 		 502 aa  267  4e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.572456  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0116  AMP-dependent synthetase and ligase  38.02 
 
 		 502 aa  267  4e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2967  feruloyl-CoA synthetase  38.01 
 
 		 515 aa  266  5e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3028  feruloyl-CoA synthetase  38.01 
 
 		 515 aa  266  5e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4030  feruloyl-CoA synthetase  38.01 
 
 		 515 aa  266  5e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0119  AMP-dependent synthetase and ligase  37.18 
 
 		 506 aa  266  5e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.976048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3956  feruloyl-CoA synthetase  38.01 
 
 		 515 aa  266  5e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1574  feruloyl-CoA synthetase  38.01 
 
 		 515 aa  266  5e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3343  feruloyl-CoA synthetase  38.01 
 
 		 515 aa  266  5e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4238  AMP-dependent synthetase and ligase  36.16 
 
 		 527 aa  266  8.999999999999999e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2447  AMP-dependent synthetase and ligase  37.43 
 
 		 505 aa  265  1e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0163  long-chain fatty-acid-CoA ligase  37.82 
 
 		 515 aa  263  4e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3819  O-succinylbenzoate-CoA ligase  35.38 
 
 		 529 aa  264  4e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4616  AMP-dependent synthetase and ligase  36.65 
 
 		 518 aa  263  8e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.892742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2407  AMP-dependent synthetase and ligase  34.3 
 
 		 498 aa  263  8e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.676828  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2371  acyl-CoA synthetase  36.1 
 
 		 532 aa  262  1e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3514  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.49 
 
 		 525 aa  262  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270509  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1605  AMP-dependent synthetase and ligase  33.58 
 
 		 526 aa  261  2e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  33.71 
 
 		 512 aa  261  2e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08640  acyl-CoA synthetase  36.17 
 
 		 516 aa  259  8e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.310549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6078  acyl-CoA synthetase  35.48 
 
 		 536 aa  258  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  34.28 
 
 		 521 aa  259  1e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2806  acyl-CoA synthetase  35.51 
 
 		 556 aa  258  2e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.688057 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2377  AMP-dependent synthetase and ligase  35.78 
 
 		 530 aa  256  8e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.581612  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2406  AMP-dependent synthetase and ligase  35.75 
 
 		 509 aa  256  8e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0466191 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  33.85 
 
 		 662 aa  255  1.0000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0503  AMP-dependent synthetase and ligase  34.13 
 
 		 492 aa  255  1.0000000000000001e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1488  AMP-dependent synthetase and ligase  34.78 
 
 		 525 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0982209  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1438  acyl-CoA synthetase  33.08 
 
 		 549 aa  255  1.0000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.603543  decreased coverage  0.00000173613 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0367  AMP-dependent synthetase and ligase  35.4 
 
 		 513 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.379931 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19550  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  36.04 
 
 		 533 aa  254  2.0000000000000002e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.26 
 
 		 512 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4181  acyl-CoA synthetase  34.44 
 
 		 522 aa  254  3e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.273498 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0714  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.52 
 
 		 579 aa  254  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1402  AMP-dependent synthetase and ligase  34.82 
 
 		 532 aa  253  4.0000000000000004e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3076  acyl-CoA synthetase  33.46 
 
 		 545 aa  253  8.000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1763  AMP-dependent synthetase and ligase  36.16 
 
 		 521 aa  253  8.000000000000001e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.494407 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0115  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35 
 
 		 556 aa  251  2e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0124  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35 
 
 		 556 aa  251  2e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.514213  normal  0.109541 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0105  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35 
 
 		 556 aa  251  2e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.356608  normal  0.265858 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4389  acyl-CoA synthetase  33.92 
 
 		 533 aa  251  3e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0682495  normal  0.0388697 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3008  acyl-CoA synthetase  34.4 
 
 		 545 aa  250  4e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.311019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0894  acyl-CoA synthetase  35.09 
 
 		 520 aa  250  4e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.493906  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1604  AMP-dependent synthetase and ligase  34.46 
 
 		 540 aa  250  4e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4202  acyl-CoA synthetase  37.05 
 
 		 534 aa  250  5e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.269622  hitchhiker  0.00584314 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5438  AMP-dependent synthetase and ligase  35.63 
 
 		 515 aa  250  5e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4820  acyl-CoA synthetase  34.46 
 
 		 533 aa  250  5e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.755365  normal  0.560915 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0851  acyl-CoA synthetase  34.77 
 
 		 504 aa  249  7e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0227528 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3215  O-succinylbenzoate-CoA ligase  36.07 
 
 		 517 aa  249  7e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0554015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3204  O-succinylbenzoate-CoA ligase  36.07 
 
 		 517 aa  249  7e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.716175  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3266  O-succinylbenzoate-CoA ligase  36.07 
 
 		 517 aa  249  7e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.10141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  35.34 
 
 		 520 aa  249  1e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0057  AMP-dependent synthetase and ligase  36.35 
 
 		 487 aa  248  1e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1724  AMP-dependent synthetase and ligase  34.34 
 
 		 515 aa  248  2e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0701995  normal  0.167784 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1367  AMP-dependent synthetase and ligase  36.78 
 
 		 502 aa  248  2e-64  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.439129  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5364  acyl-CoA synthetase  34.41 
 
 		 536 aa  247  3e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.868662  normal  0.0358165 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0131  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.46 
 
 		 570 aa  247  3e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1027  AMP-dependent synthetase and ligase  33.96 
 
 		 539 aa  248  3e-64  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0505944  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3975  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.1 
 
 		 530 aa  247  4e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.251646  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0311  AMP-dependent synthetase and ligase  36.14 
 
 		 501 aa  246  6.999999999999999e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0140314 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0309  acyl-CoA synthetase  34.15 
 
 		 537 aa  246  8e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0319  acyl-CoA synthetase  34.15 
 
 		 537 aa  246  8e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.43856 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0300  acyl-CoA synthetase  34.15 
 
 		 537 aa  246  8e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>