More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_I3299 on replicon NC_007651
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA2967  feruloyl-CoA synthetase  93.01 
 
 
515 aa  900    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4030  feruloyl-CoA synthetase  93.01 
 
 
515 aa  900    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0163  long-chain fatty-acid-CoA ligase  92.82 
 
 
515 aa  897    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3296  AMP-dependent synthetase and ligase  70.98 
 
 
502 aa  709    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0486472  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3299  feruloyl-CoA synthetase  100 
 
 
564 aa  1131    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3343  feruloyl-CoA synthetase  93.01 
 
 
515 aa  900    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3028  feruloyl-CoA synthetase  93.01 
 
 
515 aa  900    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0130  AMP-dependent synthetase and ligase  69.47 
 
 
502 aa  698    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.963028  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2939  AMP-dependent synthetase and ligase  70.25 
 
 
502 aa  702    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.572456  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1574  feruloyl-CoA synthetase  93.01 
 
 
515 aa  900    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0116  AMP-dependent synthetase and ligase  70.39 
 
 
502 aa  709    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3956  feruloyl-CoA synthetase  93.01 
 
 
515 aa  900    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0116  AMP-dependent synthetase and ligase  70.25 
 
 
502 aa  702    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0119  AMP-dependent synthetase and ligase  63.14 
 
 
506 aa  615  1e-175  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.976048  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3818  AMP-dependent synthetase and ligase  60.12 
 
 
501 aa  597  1e-169  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2323  AMP-dependent synthetase and ligase  40.12 
 
 
511 aa  343  4e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1225  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.16 
 
 
519 aa  309  9e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.399435  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2105  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.93 
 
 
524 aa  301  3e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1488  AMP-dependent synthetase and ligase  36.68 
 
 
525 aa  295  1e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0982209  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.1 
 
 
514 aa  293  8e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13106  fatty-acid-CoA ligase fadD13  37.47 
 
 
503 aa  291  2e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  35.89 
 
 
525 aa  287  4e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2525  AMP-dependent synthetase and ligase  34.86 
 
 
516 aa  285  2.0000000000000002e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.695888 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0814  AMP-dependent synthetase and ligase  37.22 
 
 
508 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  36.49 
 
 
499 aa  283  4.0000000000000003e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0965  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.3 
 
 
518 aa  283  7.000000000000001e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  35.45 
 
 
520 aa  283  9e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1052  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.91 
 
 
518 aa  282  1e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0779  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.92 
 
 
518 aa  281  2e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.746675  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  34.56 
 
 
662 aa  281  3e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0415  AMP-dependent synthetase and ligase  38.33 
 
 
620 aa  280  4e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.784497  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3808  AMP-dependent synthetase and ligase  36.84 
 
 
508 aa  280  5e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.762435  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6878  AMP-dependent synthetase and ligase  34.75 
 
 
509 aa  280  7e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615245  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2434  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 
534 aa  279  8e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.097494  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0894  acyl-CoA synthetase  36.84 
 
 
520 aa  279  1e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.493906  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0927  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.33 
 
 
518 aa  278  2e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4325  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.06 
 
 
534 aa  278  2e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0641194 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0309  acyl-CoA synthetase  36.82 
 
 
537 aa  278  2e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0300  acyl-CoA synthetase  36.82 
 
 
537 aa  278  2e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0707  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.46 
 
 
518 aa  278  2e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.413153  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0319  acyl-CoA synthetase  36.82 
 
 
537 aa  278  2e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.43856 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  36.69 
 
 
503 aa  278  2e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1614  AMP-dependent synthetase and ligase  38.46 
 
 
509 aa  277  3e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0102  AMP-dependent synthetase and ligase  35.95 
 
 
520 aa  277  3e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4072  AMP-dependent synthetase and ligase  36.54 
 
 
508 aa  277  4e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0411  acyl-CoA synthetase  36.21 
 
 
522 aa  276  5e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2203  AMP-dependent synthetase and ligase  33.92 
 
 
534 aa  276  5e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.334168  normal  0.340753 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0943  AMP-dependent synthetase and ligase  37.94 
 
 
511 aa  276  5e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193061  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4403  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.94 
 
 
518 aa  276  7e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000650953 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1604  AMP-dependent synthetase and ligase  36.59 
 
 
540 aa  276  9e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0642  acyl-CoA synthetase  36.26 
 
 
529 aa  275  2.0000000000000002e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.95301  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2406  AMP-dependent synthetase and ligase  36.96 
 
 
509 aa  274  3e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0466191 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5827  AMP-dependent synthetase and ligase  36.19 
 
 
518 aa  273  5.000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.671788  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2329  AMP-dependent synthetase and ligase  39.06 
 
 
521 aa  272  2e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.247287  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  35.44 
 
 
521 aa  270  5e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0027  AMP-dependent synthetase and ligase  36.38 
 
 
509 aa  270  7e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.141316  normal  0.236103 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3261  AMP-dependent synthetase and ligase  33.14 
 
 
534 aa  270  7e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4902  AMP-dependent synthetase and ligase  38.51 
 
 
501 aa  268  1e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0779  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.66 
 
 
518 aa  268  2e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4684  AMP-dependent synthetase and ligase  36.04 
 
 
526 aa  268  2e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1884  AMP-dependent synthetase and ligase  35.03 
 
 
495 aa  268  2e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0109  AMP-dependent synthetase and ligase  36.23 
 
 
528 aa  267  5e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  35.53 
 
 
520 aa  266  5.999999999999999e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0778  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.66 
 
 
518 aa  266  7e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19550  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  37.55 
 
 
533 aa  266  7e-70  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0116  AMP-dependent synthetase and ligase  36.02 
 
 
528 aa  266  8.999999999999999e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08640  acyl-CoA synthetase  36.09 
 
 
516 aa  265  1e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.310549  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0965  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.46 
 
 
518 aa  266  1e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4096  AMP-dependent synthetase and ligase  34.58 
 
 
508 aa  265  1e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0377217  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0832  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.66 
 
 
518 aa  265  2e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0105  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.99 
 
 
556 aa  265  2e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.356608  normal  0.265858 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0876  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.66 
 
 
518 aa  265  2e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0115  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.99 
 
 
556 aa  265  2e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0124  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.99 
 
 
556 aa  265  2e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.514213  normal  0.109541 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2474  AMP-dependent synthetase and ligase  35.06 
 
 
522 aa  263  6e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1660  AMP-dependent synthetase and ligase  35.14 
 
 
523 aa  262  1e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104845  normal  0.559317 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2924  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.08 
 
 
526 aa  261  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.42655 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4559  acyl-CoA synthetase  35.21 
 
 
529 aa  261  2e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.134713  normal  0.114816 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4202  acyl-CoA synthetase  36.15 
 
 
534 aa  261  3e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.269622  hitchhiker  0.00584314 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3819  O-succinylbenzoate-CoA ligase  35.29 
 
 
529 aa  261  3e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3993  AMP-dependent synthetase and ligase  35.86 
 
 
524 aa  260  4e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.968795  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4758  AMP-dependent synthetase and ligase  35.44 
 
 
518 aa  260  4e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4181  acyl-CoA synthetase  37.25 
 
 
522 aa  260  4e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.273498 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2351  acyl-CoA synthetase  34.58 
 
 
517 aa  260  5.0000000000000005e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.197387  normal  0.399216 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5944  AMP-dependent synthetase and ligase  36.94 
 
 
532 aa  260  6e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420174  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0674  putative fatty-acid--CoA ligase  33.07 
 
 
533 aa  259  1e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.11643 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.23 
 
 
512 aa  258  2e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4379  AMP-dependent synthetase and ligase  35.61 
 
 
506 aa  258  2e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.177409 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3747  AMP-dependent synthetase and ligase  37.84 
 
 
514 aa  258  3e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2407  AMP-dependent synthetase and ligase  33.01 
 
 
498 aa  258  3e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.676828  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0851  acyl-CoA synthetase  34.92 
 
 
504 aa  258  3e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0227528 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.45 
 
 
513 aa  257  3e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2089  AMP-dependent synthetase and ligase  37.1 
 
 
530 aa  257  3e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6618  AMP-dependent synthetase and ligase  36.79 
 
 
493 aa  257  4e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2447  AMP-dependent synthetase and ligase  34.84 
 
 
505 aa  257  4e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2377  AMP-dependent synthetase and ligase  35.65 
 
 
530 aa  256  7e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.581612  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4616  AMP-dependent synthetase and ligase  36.31 
 
 
518 aa  256  8e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.892742  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0311  AMP-dependent synthetase and ligase  33.4 
 
 
501 aa  256  8e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0140314 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4826  AMP-dependent synthetase and ligase  35.56 
 
 
520 aa  256  9e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0178748  normal  0.551416 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1964  acyl-CoA synthetase  30.74 
 
 
496 aa  256  9e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000141031 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>