More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A3296 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006348  BMA2967  feruloyl-CoA synthetase  69.73 
 
 		 515 aa  691    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3956  feruloyl-CoA synthetase  69.73 
 
 		 515 aa  691    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0119  AMP-dependent synthetase and ligase  67.99 
 
 		 506 aa  668    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.976048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0163  long-chain fatty-acid-CoA ligase  69.53 
 
 		 515 aa  687    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3296  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 502 aa  1016    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0486472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0116  AMP-dependent synthetase and ligase  94.62 
 
 		 502 aa  952    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3299  feruloyl-CoA synthetase  70.98 
 
 		 564 aa  710    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0130  AMP-dependent synthetase and ligase  94 
 
 		 502 aa  922    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.963028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3028  feruloyl-CoA synthetase  69.73 
 
 		 515 aa  691    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4030  feruloyl-CoA synthetase  69.73 
 
 		 515 aa  691    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3818  AMP-dependent synthetase and ligase  63.65 
 
 		 501 aa  639    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1574  feruloyl-CoA synthetase  69.73 
 
 		 515 aa  691    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2939  AMP-dependent synthetase and ligase  94.6 
 
 		 502 aa  926    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.572456  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0116  AMP-dependent synthetase and ligase  94.6 
 
 		 502 aa  926    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3343  feruloyl-CoA synthetase  69.73 
 
 		 515 aa  691    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2323  AMP-dependent synthetase and ligase  43.06 
 
 		 511 aa  375  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1225  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.74 
 
 		 519 aa  322  9.000000000000001e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.399435  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1614  AMP-dependent synthetase and ligase  40.47 
 
 		 509 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.75 
 
 		 514 aa  303  4.0000000000000003e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2105  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.87 
 
 		 524 aa  303  6.000000000000001e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0814  AMP-dependent synthetase and ligase  39.22 
 
 		 508 aa  298  1e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0965  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.82 
 
 		 518 aa  298  2e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  38.29 
 
 		 499 aa  295  1e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4902  AMP-dependent synthetase and ligase  39.55 
 
 		 501 aa  293  7e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1052  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.43 
 
 		 518 aa  292  9e-78  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4325  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.06 
 
 		 534 aa  291  2e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0641194 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0927  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.37 
 
 		 518 aa  291  2e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0102  AMP-dependent synthetase and ligase  37.23 
 
 		 520 aa  291  2e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2525  AMP-dependent synthetase and ligase  34.76 
 
 		 516 aa  290  3e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.695888 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4403  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.05 
 
 		 518 aa  288  2e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000650953 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  36.63 
 
 		 520 aa  288  2e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  36.74 
 
 		 525 aa  287  2.9999999999999996e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13106  fatty-acid-CoA ligase fadD13  38.1 
 
 		 503 aa  287  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0779  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.56 
 
 		 518 aa  287  4e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.746675  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  37.17 
 
 		 503 aa  285  1.0000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0707  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.36 
 
 		 518 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.413153  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2377  AMP-dependent synthetase and ligase  38.89 
 
 		 530 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.581612  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1488  AMP-dependent synthetase and ligase  37.75 
 
 		 525 aa  284  3.0000000000000004e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0982209  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0965  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.62 
 
 		 518 aa  283  5.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3808  AMP-dependent synthetase and ligase  36.53 
 
 		 508 aa  282  8.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.762435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7494  acyl-CoA synthetase  38.17 
 
 		 521 aa  282  9e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.489378  normal  0.204527 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0832  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.62 
 
 		 518 aa  282  1e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0411  acyl-CoA synthetase  37.35 
 
 		 522 aa  282  1e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0778  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.43 
 
 		 518 aa  282  1e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0876  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.62 
 
 		 518 aa  282  1e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.24 
 
 		 513 aa  281  1e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0300  acyl-CoA synthetase  37.1 
 
 		 537 aa  281  2e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0415  AMP-dependent synthetase and ligase  38.49 
 
 		 620 aa  281  2e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.784497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0309  acyl-CoA synthetase  37.1 
 
 		 537 aa  281  2e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0319  acyl-CoA synthetase  37.1 
 
 		 537 aa  281  2e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.43856 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0779  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.43 
 
 		 518 aa  280  3e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1660  AMP-dependent synthetase and ligase  36.57 
 
 		 523 aa  280  4e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104845  normal  0.559317 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0894  acyl-CoA synthetase  36.63 
 
 		 520 aa  280  5e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.493906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4072  AMP-dependent synthetase and ligase  37.63 
 
 		 508 aa  280  5e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6878  AMP-dependent synthetase and ligase  33.53 
 
 		 509 aa  279  9e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0027  AMP-dependent synthetase and ligase  37.8 
 
 		 509 aa  278  1e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.141316  normal  0.236103 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0943  AMP-dependent synthetase and ligase  37.4 
 
 		 511 aa  278  2e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6618  AMP-dependent synthetase and ligase  38.74 
 
 		 493 aa  276  5e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  34.26 
 
 		 662 aa  276  7e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0851  acyl-CoA synthetase  36.38 
 
 		 504 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0227528 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1604  AMP-dependent synthetase and ligase  36.63 
 
 		 540 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0843  acyl-CoA synthetase  36.93 
 
 		 513 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.333452  normal  0.193709 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  35.4 
 
 		 536 aa  274  3e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000011697 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  36.52 
 
 		 521 aa  273  5.000000000000001e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0642  acyl-CoA synthetase  36.54 
 
 		 529 aa  272  1e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.95301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4202  acyl-CoA synthetase  39.1 
 
 		 534 aa  271  2e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.269622  hitchhiker  0.00584314 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1884  AMP-dependent synthetase and ligase  34.77 
 
 		 495 aa  271  2e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  37.79 
 
 		 506 aa  271  2e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2329  AMP-dependent synthetase and ligase  38.27 
 
 		 521 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.247287  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2434  AMP-dependent synthetase and ligase  34.13 
 
 		 534 aa  269  8e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.097494  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.59 
 
 		 512 aa  268  2e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2432  AMP-dependent synthetase and ligase  34.62 
 
 		 508 aa  268  2e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4559  acyl-CoA synthetase  35.31 
 
 		 529 aa  267  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.134713  normal  0.114816 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2351  acyl-CoA synthetase  35.21 
 
 		 517 aa  266  5e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.197387  normal  0.399216 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4008  AMP-dependent synthetase and ligase  37.13 
 
 		 1043 aa  266  5e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1538  AMP-dependent synthetase and ligase  37.09 
 
 		 515 aa  265  1e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3261  AMP-dependent synthetase and ligase  34.13 
 
 		 534 aa  265  1e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1515  AMP-dependent synthetase and ligase  37.09 
 
 		 515 aa  265  1e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00288915  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2089  AMP-dependent synthetase and ligase  35.92 
 
 		 530 aa  265  2e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19550  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  35.46 
 
 		 533 aa  265  2e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4075  AMP-dependent synthetase and ligase  37.6 
 
 		 521 aa  265  2e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5827  AMP-dependent synthetase and ligase  35.09 
 
 		 518 aa  265  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.671788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2882  acyl-CoA synthetase  34.8 
 
 		 557 aa  264  2e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  35.5 
 
 		 512 aa  263  4e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1006  AMP-dependent synthetase and ligase  38.97 
 
 		 585 aa  264  4e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2203  AMP-dependent synthetase and ligase  33.73 
 
 		 534 aa  262  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.334168  normal  0.340753 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4758  AMP-dependent synthetase and ligase  34.51 
 
 		 518 aa  261  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0667  putative O-succinylbenzoate--CoA ligase  35.47 
 
 		 516 aa  261  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.604577  normal  0.0579833 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3993  AMP-dependent synthetase and ligase  34.86 
 
 		 524 aa  261  2e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.968795  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4096  AMP-dependent synthetase and ligase  34.4 
 
 		 508 aa  261  2e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0377217  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5944  AMP-dependent synthetase and ligase  37.08 
 
 		 532 aa  261  3e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420174  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2447  AMP-dependent synthetase and ligase  36.07 
 
 		 505 aa  260  5.0000000000000005e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2406  AMP-dependent synthetase and ligase  36.87 
 
 		 509 aa  259  9e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0466191 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3565  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.41 
 
 		 526 aa  258  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.011282  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0558  AMP-dependent synthetase and ligase  33.4 
 
 		 584 aa  258  2e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  34.73 
 
 		 520 aa  258  2e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4826  AMP-dependent synthetase and ligase  34.83 
 
 		 520 aa  257  3e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0178748  normal  0.551416 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4900  AMP-dependent synthetase and ligase  37.2 
 
 		 527 aa  257  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.309388  normal  0.552445 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4810  AMP-dependent synthetase and ligase  38.28 
 
 		 528 aa  257  4e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.672528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3747  AMP-dependent synthetase and ligase  36.54 
 
 		 514 aa  257  4e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>