More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2819 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_2819  acyl-CoA synthetase  100 
 
 
529 aa  1073    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.427573  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2625  acyl-CoA synthetase  44.85 
 
 
521 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.425719  normal  0.937702 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3788  acyl-CoA synthetase  43.69 
 
 
523 aa  438  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2862  acyl-CoA synthetase  45.24 
 
 
528 aa  436  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2662  acyl-CoA synthetase  44.38 
 
 
521 aa  430  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0929684  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2990  acyl-CoA synthetase  44.08 
 
 
521 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.475631  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4949  acyl-CoA synthetase  45.38 
 
 
521 aa  419  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131807  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2729  acyl-CoA synthetase  43.23 
 
 
559 aa  417  9.999999999999999e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.181341  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3976  AMP-dependent synthetase and ligase  43.99 
 
 
546 aa  414  1e-114  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4674  acyl-CoA synthetase  42.61 
 
 
531 aa  403  1e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10561  acyl-CoA synthetase  43.75 
 
 
571 aa  402  1e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0256349 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0953  acyl-CoA synthetase  41.89 
 
 
532 aa  394  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0733  acyl-CoA synthetase  40.68 
 
 
532 aa  387  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.747882  normal  0.385866 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0739  acyl-CoA synthetase  40.68 
 
 
532 aa  387  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0753  acyl-CoA synthetase  40.68 
 
 
532 aa  387  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.627426  normal  0.23017 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4178  acyl-CoA synthetase  41.49 
 
 
520 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0015  acyl-CoA synthetase  40.61 
 
 
547 aa  382  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.268165  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1869  acyl-CoA synthetase  41.58 
 
 
520 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.895381  normal  0.153581 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0972  acyl-CoA synthetase  41.04 
 
 
502 aa  365  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.534904 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1909  acyl-CoA synthetase  41.63 
 
 
521 aa  363  5.0000000000000005e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1133  AMP-dependent synthetase and ligase  38.95 
 
 
518 aa  293  7e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.508244  normal  0.50206 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3499  AMP-dependent synthetase and ligase  37.4 
 
 
715 aa  293  8e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0487317 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2525  AMP-dependent synthetase and ligase  35.41 
 
 
516 aa  290  4e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.695888 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4080  AMP-dependent synthetase and ligase  37.43 
 
 
518 aa  288  2e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.656205  normal  0.161644 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3720  AMP-dependent synthetase and ligase  37.3 
 
 
518 aa  286  8e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.189603  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5309  AMP-dependent synthetase and ligase  35.33 
 
 
517 aa  285  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3890  AMP-dependent synthetase and ligase  34.75 
 
 
517 aa  283  8.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0529507  normal  0.227811 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3816  AMP-dependent synthetase and ligase  36.19 
 
 
518 aa  281  3e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0163789  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5942  AMP-dependent synthetase and ligase  35.23 
 
 
516 aa  281  3e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.050377 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5827  AMP-dependent synthetase and ligase  36.9 
 
 
518 aa  280  4e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.671788  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2532  AMP-dependent synthetase and ligase  36.26 
 
 
521 aa  280  4e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.07 
 
 
514 aa  280  5e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2245  AMP-dependent synthetase and ligase  34.69 
 
 
519 aa  280  5e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00923204  normal  0.0183444 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1367  AMP-dependent synthetase and ligase  38.52 
 
 
502 aa  280  6e-74  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.439129  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4758  AMP-dependent synthetase and ligase  37.43 
 
 
518 aa  279  7e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1595  AMP-dependent synthetase and ligase  36.85 
 
 
519 aa  279  8e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2485  AMP-dependent synthetase and ligase  34.04 
 
 
534 aa  279  1e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  35.24 
 
 
525 aa  273  6e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5381  AMP-dependent synthetase and ligase  34.61 
 
 
510 aa  273  6e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  34.75 
 
 
520 aa  271  2e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  34.84 
 
 
534 aa  271  2e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.55948  normal  0.800046 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  35.42 
 
 
499 aa  269  8e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5134  acyl-CoA synthetase / AMP-dependent synthetase and ligase  34.61 
 
 
517 aa  269  8.999999999999999e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.93936 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3993  AMP-dependent synthetase and ligase  36 
 
 
524 aa  268  2e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.968795  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3611  AMP-dependent synthetase and ligase  35.53 
 
 
532 aa  267  4e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0778531  normal  0.0346233 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6878  AMP-dependent synthetase and ligase  34.45 
 
 
509 aa  266  5e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615245  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1123  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.21 
 
 
510 aa  267  5e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.08 
 
 
512 aa  266  5e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5438  AMP-dependent synthetase and ligase  33.72 
 
 
515 aa  266  8.999999999999999e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427259  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.21 
 
 
510 aa  266  1e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.21 
 
 
510 aa  266  1e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1003  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.21 
 
 
510 aa  265  1e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.21 
 
 
510 aa  265  1e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.21 
 
 
510 aa  265  1e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1019  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.21 
 
 
510 aa  265  2e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1091  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.21 
 
 
510 aa  265  2e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1169  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.21 
 
 
510 aa  264  2e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1008  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.22 
 
 
510 aa  264  3e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2038  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  31.61 
 
 
565 aa  262  1e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1605  AMP-dependent synthetase and ligase  33.65 
 
 
526 aa  262  1e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2246  AMP-dependent synthetase and ligase  34.11 
 
 
517 aa  261  2e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000334479  hitchhiker  6.92492e-16 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2207  AMP-dependent synthetase and ligase  33.27 
 
 
512 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.77359  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2438  AMP-dependent synthetase and ligase  32.88 
 
 
512 aa  260  3e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4826  AMP-dependent synthetase and ligase  33.46 
 
 
520 aa  260  5.0000000000000005e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0178748  normal  0.551416 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  33.33 
 
 
503 aa  259  1e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3158  AMP-dependent synthetase and ligase  31.91 
 
 
515 aa  259  1e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1597  AMP-dependent synthetase and ligase  33.57 
 
 
549 aa  258  2e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000318079  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3455  AMP-dependent synthetase and ligase  33.15 
 
 
583 aa  258  2e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2745  AMP-dependent synthetase and ligase  33.46 
 
 
519 aa  257  4e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000193004  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1196  AMP-dependent synthetase and ligase  33.94 
 
 
515 aa  256  5e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.952184  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  33.93 
 
 
539 aa  257  5e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3704  AMP-dependent synthetase and ligase  31.63 
 
 
515 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0990866  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0102  AMP-dependent synthetase and ligase  34.76 
 
 
520 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  34.83 
 
 
520 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6175  AMP-dependent synthetase and ligase  34.03 
 
 
537 aa  254  3e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4822  AMP-dependent synthetase and ligase  36.4 
 
 
504 aa  253  4.0000000000000004e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1095  AMP-dependent synthetase and ligase  33.8 
 
 
518 aa  254  4.0000000000000004e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.997125 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0154  AMP-dependent synthetase and ligase  35.74 
 
 
520 aa  252  1e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0177  putative ligase  31.82 
 
 
514 aa  252  1e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.709782 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  32.81 
 
 
512 aa  251  2e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0108  AMP-dependent synthetase and ligase  33.02 
 
 
569 aa  251  2e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.824706  normal  0.320607 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4353  AMP-dependent synthetase and ligase  31.65 
 
 
517 aa  251  3e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0503  AMP-dependent synthetase and ligase  34.26 
 
 
492 aa  251  3e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2963  AMP-dependent synthetase and ligase  31.28 
 
 
551 aa  250  4e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000191926  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  33.2 
 
 
662 aa  250  6e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4968  AMP-dependent synthetase and ligase  34.2 
 
 
489 aa  249  1e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2629  AMP-dependent synthetase and ligase  31.41 
 
 
557 aa  248  2e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0494506  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1724  AMP-dependent synthetase and ligase  31.98 
 
 
515 aa  248  3e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0701995  normal  0.167784 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1837  AMP-dependent synthetase and ligase  33.01 
 
 
518 aa  247  4e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.963932  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0840  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.07 
 
 
510 aa  247  4e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6078  acyl-CoA synthetase  31.56 
 
 
542 aa  247  4.9999999999999997e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4691  AMP-dependent synthetase and ligase  35.52 
 
 
502 aa  247  4.9999999999999997e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1515  AMP-dependent synthetase and ligase  35.96 
 
 
515 aa  246  6e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00288915  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1538  AMP-dependent synthetase and ligase  35.96 
 
 
515 aa  246  6e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4902  AMP-dependent synthetase and ligase  36.49 
 
 
501 aa  246  6.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  32.95 
 
 
519 aa  246  6.999999999999999e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5034  AMP-dependent synthetase and ligase  31.07 
 
 
517 aa  246  8e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5826  AMP-dependent synthetase and ligase  31.07 
 
 
517 aa  246  8e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0943  AMP-dependent synthetase and ligase  36.36 
 
 
511 aa  246  9e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193061  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3708  AMP-dependent synthetase and ligase  35.95 
 
 
551 aa  246  9e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>