More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1672 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1672  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 608 aa  1258    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.47643  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4181  AMP-dependent synthetase and ligase  33.04 
 
 		 527 aa  273  6e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4080  AMP-dependent synthetase and ligase  31.95 
 
 		 518 aa  263  8.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.656205  normal  0.161644 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3816  AMP-dependent synthetase and ligase  32.75 
 
 		 518 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0163789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1025  AMP-dependent synthetase and ligase  31.22 
 
 		 528 aa  260  6e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0661  AMP-binding enzyme family protein  30.63 
 
 		 520 aa  259  9e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3720  AMP-dependent synthetase and ligase  32.47 
 
 		 518 aa  259  9e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.189603  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5438  AMP-dependent synthetase and ligase  30.4 
 
 		 515 aa  250  5e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4238  AMP-dependent synthetase and ligase  30.43 
 
 		 527 aa  247  4e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4691  AMP-dependent synthetase and ligase  31.72 
 
 		 502 aa  243  5e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1488  AMP-dependent synthetase and ligase  32.52 
 
 		 525 aa  242  1e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0982209  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2032  AMP-dependent synthetase and ligase  29.28 
 
 		 551 aa  235  2.0000000000000002e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.367958 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0861  AMP-dependent synthetase and ligase  28.89 
 
 		 514 aa  228  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3565  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.1 
 
 		 526 aa  227  6e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.011282  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1984  AMP-dependent synthetase and ligase  28.18 
 
 		 552 aa  223  9.999999999999999e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1666  AMP-dependent synthetase and ligase  29.5 
 
 		 518 aa  221  1.9999999999999999e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.144653  normal  0.373713 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5944  AMP-dependent synthetase and ligase  39.22 
 
 		 532 aa  221  3e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420174  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1211  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.24 
 
 		 527 aa  221  3e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0102  AMP-dependent synthetase and ligase  29.45 
 
 		 520 aa  220  7e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0411  acyl-CoA synthetase  28.6 
 
 		 522 aa  219  1e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2710  AMP-dependent synthetase and ligase  29.62 
 
 		 507 aa  218  2e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0406608  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0310  AMP-dependent synthetase and ligase  29.13 
 
 		 533 aa  219  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.280778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3475  AMP-dependent synthetase and ligase  27.75 
 
 		 524 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.440115  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.15 
 
 		 510 aa  216  9e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  37.42 
 
 		 520 aa  216  9e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.15 
 
 		 510 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1498  AMP-dependent synthetase and ligase  30.18 
 
 		 531 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5763  AMP-dependent synthetase and ligase  28.75 
 
 		 500 aa  214  4.9999999999999996e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2654  AMP-dependent synthetase and ligase  28.9 
 
 		 587 aa  214  4.9999999999999996e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6078  AMP-dependent synthetase and ligase  29.12 
 
 		 553 aa  213  7e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.225727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0775  AMP-dependent synthetase and ligase  30.77 
 
 		 583 aa  213  1e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4902  AMP-dependent synthetase and ligase  29.02 
 
 		 501 aa  213  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3198  AMP-dependent synthetase and ligase  28.79 
 
 		 525 aa  212  1e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2927  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.97 
 
 		 509 aa  212  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.686689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0108  AMP-dependent synthetase and ligase  27.84 
 
 		 569 aa  211  3e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.824706  normal  0.320607 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3115  AMP-dependent synthetase and ligase  29.44 
 
 		 584 aa  211  4e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5158  putative o-succinylbenzoate-CoA ligase  30.41 
 
 		 527 aa  210  5e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.20469 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2377  AMP-dependent synthetase and ligase  39.54 
 
 		 530 aa  209  9e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.581612  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2206  acyl-CoA synthetase  29.34 
 
 		 536 aa  209  2e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0886048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3345  AMP-dependent synthetase and ligase  28.72 
 
 		 577 aa  208  2e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.305311  hitchhiker  0.00000703503 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2563  AMP-binding domain protein  27.21 
 
 		 549 aa  208  3e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45341e-16 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0119  AMP-dependent synthetase and ligase  29.66 
 
 		 506 aa  207  5e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.976048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8762  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.62 
 
 		 510 aa  207  6e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.225168 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1584  AMP-binding domain protein  27.42 
 
 		 570 aa  206  8e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2959  AMP-binding domain protein  27.42 
 
 		 576 aa  206  1e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3018  AMP-binding domain protein  27.42 
 
 		 576 aa  206  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3747  AMP-dependent synthetase and ligase  37.54 
 
 		 514 aa  206  1e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3353  AMP-binding domain protein  27.42 
 
 		 576 aa  206  1e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4040  AMP-binding domain protein  27.56 
 
 		 576 aa  205  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0176  AMP-binding domain protein  27.56 
 
 		 576 aa  205  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.970705  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4009  AMP-dependent synthetase and ligase  28.77 
 
 		 540 aa  205  2e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3966  AMP-binding domain protein  27.56 
 
 		 576 aa  205  2e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1592  AMP-dependent synthetase and ligase  27.52 
 
 		 561 aa  205  2e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185317  normal  0.745369 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0843  acyl-CoA synthetase  37.62 
 
 		 513 aa  204  3e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.333452  normal  0.193709 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2963  AMP-dependent synthetase and ligase  29.62 
 
 		 551 aa  204  3e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000191926  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  27.91 
 
 		 518 aa  204  3e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  36.09 
 
 		 512 aa  204  4e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0322  AMP-dependent synthetase and ligase  27.44 
 
 		 531 aa  204  4e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0839  AMP-dependent synthetase and ligase  27.9 
 
 		 577 aa  202  9.999999999999999e-51  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0610  AMP-binding domain protein  28.47 
 
 		 570 aa  202  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.920315  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3611  AMP-dependent synthetase and ligase  28.92 
 
 		 532 aa  202  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0778531  normal  0.0346233 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5298  acyl-CoA synthetase  29.08 
 
 		 536 aa  202  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  36.63 
 
 		 521 aa  201  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3772  putative O-succinylbenzoate--CoA ligase  28.72 
 
 		 531 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.910601 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0663  AMP-binding domain protein  28.55 
 
 		 547 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.390649  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1871  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.04 
 
 		 524 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.394568  normal  0.852293 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3818  AMP-dependent synthetase and ligase  27.49 
 
 		 501 aa  202  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1604  AMP-dependent synthetase and ligase  39.09 
 
 		 540 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3066  AMP-dependent synthetase and ligase  28.09 
 
 		 558 aa  202  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.479156  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0154  AMP-dependent synthetase and ligase  36.25 
 
 		 520 aa  201  3e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2246  AMP-dependent synthetase and ligase  27.74 
 
 		 517 aa  201  3e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000334479  hitchhiker  6.92492e-16 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3708  AMP-dependent synthetase and ligase  28.57 
 
 		 551 aa  200  5e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4559  acyl-CoA synthetase  38.31 
 
 		 529 aa  200  7e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.134713  normal  0.114816 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1967  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.54 
 
 		 514 aa  199  9e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.595404  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5356  AMP-dependent synthetase and ligase  28.57 
 
 		 523 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3890  AMP-dependent synthetase and ligase  28.2 
 
 		 517 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0529507  normal  0.227811 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0894  acyl-CoA synthetase  36.04 
 
 		 520 aa  197  3e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.493906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4684  AMP-dependent synthetase and ligase  39.01 
 
 		 526 aa  198  3e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1660  AMP-dependent synthetase and ligase  36.21 
 
 		 523 aa  197  4.0000000000000005e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104845  normal  0.559317 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3839  AMP-dependent synthetase and ligase  29.39 
 
 		 508 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3855  AMP-dependent synthetase and ligase  27.87 
 
 		 523 aa  197  5.000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.713722 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4107  AMP-dependent synthetase and ligase  28.81 
 
 		 519 aa  197  6e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.102419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3993  AMP-dependent synthetase and ligase  37.46 
 
 		 524 aa  197  6e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.968795  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1759  acyl-CoA synthetase  29.39 
 
 		 536 aa  197  6e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0729 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  34.55 
 
 		 503 aa  197  6e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2158  putative long-chain-fatty-acid-CoA ligase  27.79 
 
 		 515 aa  196  7e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08640  acyl-CoA synthetase  36.77 
 
 		 516 aa  197  7e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.310549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6823  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase I  36.07 
 
 		 492 aa  196  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2406  AMP-dependent synthetase and ligase  35.08 
 
 		 509 aa  196  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0466191 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3226  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.45 
 
 		 561 aa  196  1e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0337  AMP-dependent synthetase and ligase  28.35 
 
 		 577 aa  196  1e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.238028  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5309  AMP-dependent synthetase and ligase  28.87 
 
 		 517 aa  195  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1821  AMP-binding protein  26.88 
 
 		 500 aa  195  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.133341 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4612  AMP-dependent synthetase and ligase  27.56 
 
 		 511 aa  195  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2525  AMP-dependent synthetase and ligase  35.83 
 
 		 516 aa  195  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.695888 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2174  acyl-CoA synthetase  28.65 
 
 		 540 aa  195  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.264892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3453  AMP-binding protein  26.54 
 
 		 500 aa  194  3e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3127  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.76 
 
 		 500 aa  194  3e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4181  acyl-CoA synthetase  33.22 
 
 		 522 aa  194  4e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.273498 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0558  AMP-dependent synthetase and ligase  28.55 
 
 		 584 aa  194  4e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>