More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5298 on replicon NC_010333
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2206  acyl-CoA synthetase  70.9 
 
 		 536 aa  819    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0886048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1759  acyl-CoA synthetase  73.69 
 
 		 536 aa  834    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0729 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5298  acyl-CoA synthetase  100 
 
 		 536 aa  1102    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1563  acyl-CoA synthetase  46.6 
 
 		 531 aa  438  1e-121  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.701309  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1531  acyl-CoA synthetase  43.84 
 
 		 531 aa  395  1e-108  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1543  acyl-CoA synthetase  40.86 
 
 		 549 aa  361  2e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5009  acyl-CoA synthetase  39.85 
 
 		 549 aa  355  8.999999999999999e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.138056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4627  acyl-CoA synthetase  38.92 
 
 		 549 aa  350  2e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4715  acyl-CoA synthetase  38.92 
 
 		 549 aa  350  2e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3496  AMP-dependent synthetase and ligase  39.02 
 
 		 544 aa  346  7e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.38244  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5215  acyl-CoA synthetase  39.71 
 
 		 549 aa  345  2e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.240289 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13548  acyl-CoA synthetase  38.88 
 
 		 548 aa  341  2e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.89294e-46  hitchhiker  0.000000367112 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2174  acyl-CoA synthetase  38.08 
 
 		 540 aa  339  8e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.264892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3980  AMP-dependent synthetase and ligase  38.29 
 
 		 526 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3959  AMP-dependent synthetase and ligase  37.91 
 
 		 547 aa  330  4e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.511333  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0888  AMP-dependent synthetase and ligase  38.33 
 
 		 545 aa  330  5.0000000000000004e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2836  acyl-CoA synthetase  39.32 
 
 		 539 aa  328  2.0000000000000001e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.395619 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2725  acyl-CoA synthetase  37.15 
 
 		 548 aa  325  1e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.105793  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4748  AMP-dependent synthetase and ligase  38 
 
 		 528 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2639  acyl-CoA synthetase  38.76 
 
 		 540 aa  315  1.9999999999999998e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.981359  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0691  AMP-dependent synthetase and ligase  35.87 
 
 		 553 aa  306  5.0000000000000004e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2248  acyl-CoA synthetase  36.01 
 
 		 550 aa  302  1e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1786  acyl-CoA synthetase  34.31 
 
 		 549 aa  299  7e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1833  acyl-CoA synthetase  34.31 
 
 		 549 aa  299  7e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.936288  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2118  AMP-dependent synthetase and ligase  35.87 
 
 		 545 aa  297  3e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.172383  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1485  CoA synthetase, long-chain fatty acid:CoA ligase  36.01 
 
 		 528 aa  296  7e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2891  acyl-CoA synthetase  34.66 
 
 		 558 aa  295  2e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2921  acyl-CoA synthetase  34.66 
 
 		 558 aa  295  2e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.250918 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2935  acyl-CoA synthetase  34.66 
 
 		 558 aa  295  2e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.444954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2010  acyl-CoA synthetase  35.17 
 
 		 550 aa  293  5e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.324541 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1767  acyl-CoA synthetase  34.86 
 
 		 549 aa  291  2e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.848326  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0290  AMP-dependent synthetase and ligase  34.67 
 
 		 605 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000671199  hitchhiker  0.000133038 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4335  acyl-CoA synthetase  35.1 
 
 		 550 aa  283  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0901424  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0608  AMP-dependent synthetase and ligase  35.46 
 
 		 557 aa  283  7.000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.597937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1756  acyl-CoA synthetase  33.09 
 
 		 542 aa  247  4e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.317816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1775  acyl-CoA synthetase  32.85 
 
 		 542 aa  247  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1822  acyl-CoA synthetase  32.85 
 
 		 542 aa  247  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.591345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4349  acyl-CoA synthetase  33.83 
 
 		 541 aa  243  7e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1995  acyl-CoA synthetase  33.21 
 
 		 541 aa  243  7e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1806  AMP-dependent synthetase and ligase  32.23 
 
 		 526 aa  227  5.0000000000000005e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1672  AMP-dependent synthetase and ligase  29.08 
 
 		 608 aa  202  1.9999999999999998e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.47643  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4096  AMP-dependent synthetase and ligase  31.38 
 
 		 508 aa  192  9e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0377217  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1438  acyl-CoA synthetase  28.26 
 
 		 549 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.603543  decreased coverage  0.00000173613 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3076  acyl-CoA synthetase  29.45 
 
 		 545 aa  180  7e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5827  AMP-dependent synthetase and ligase  30.96 
 
 		 518 aa  177  6e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.671788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0102  AMP-dependent synthetase and ligase  30.11 
 
 		 520 aa  176  7e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  28.87 
 
 		 520 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2806  acyl-CoA synthetase  28.02 
 
 		 556 aa  174  5e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.688057 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1666  AMP-dependent synthetase and ligase  28.68 
 
 		 518 aa  173  5.999999999999999e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.144653  normal  0.373713 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3704  AMP-dependent synthetase and ligase  27.93 
 
 		 515 aa  170  7e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0990866  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2038  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  27.93 
 
 		 565 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2246  AMP-dependent synthetase and ligase  28.76 
 
 		 517 aa  168  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000334479  hitchhiker  6.92492e-16 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0177  putative ligase  28.92 
 
 		 514 aa  169  2e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.709782 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1871  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.63 
 
 		 524 aa  168  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.394568  normal  0.852293 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3008  acyl-CoA synthetase  28.01 
 
 		 545 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.311019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1515  AMP-dependent synthetase and ligase  29.77 
 
 		 515 aa  167  5e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00288915  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1538  AMP-dependent synthetase and ligase  29.77 
 
 		 515 aa  167  5e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1862  AMP-dependent synthetase and ligase  27.89 
 
 		 554 aa  167  5.9999999999999996e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000194856  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  27.25 
 
 		 525 aa  167  5.9999999999999996e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2692  AMP-binding domain protein  26.67 
 
 		 552 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.262026  normal  0.421392 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  26.58 
 
 		 553 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1724  AMP-dependent synthetase and ligase  27.14 
 
 		 515 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0701995  normal  0.167784 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6618  AMP-dependent synthetase and ligase  28.96 
 
 		 493 aa  165  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4758  AMP-dependent synthetase and ligase  29.71 
 
 		 518 aa  164  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5438  AMP-dependent synthetase and ligase  27.68 
 
 		 515 aa  164  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427259  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5669  acyl-CoA synthetase  29.09 
 
 		 529 aa  164  4.0000000000000004e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2821  AMP-binding domain protein  27.47 
 
 		 552 aa  163  7e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.187557 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3975  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.56 
 
 		 530 aa  163  8.000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.251646  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4921  acyl-CoA synthetase  27.54 
 
 		 531 aa  162  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2371  acyl-CoA synthetase  28.33 
 
 		 532 aa  162  2e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  27.95 
 
 		 506 aa  161  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0734  AMP-dependent synthetase and ligase  28.41 
 
 		 511 aa  161  3e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0327  AMP-binding domain protein  27.81 
 
 		 549 aa  160  4e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.347146  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0027  AMP-dependent synthetase and ligase  30.49 
 
 		 509 aa  161  4e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.141316  normal  0.236103 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1041  AMP-binding domain protein  27.62 
 
 		 549 aa  160  4e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3597  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.78 
 
 		 543 aa  160  5e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3993  AMP-dependent synthetase and ligase  28.07 
 
 		 524 aa  160  6e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.968795  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1585  AMP-binding domain protein  27.97 
 
 		 549 aa  160  7e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13440  acyl-CoA synthetase  30 
 
 		 539 aa  159  9e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4107  AMP-dependent synthetase and ligase  28 
 
 		 519 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.102419  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1103  AMP-binding domain protein  25.88 
 
 		 552 aa  159  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13546  fatty-acid-CoA ligase fadD18  53.29 
 
 		 218 aa  158  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.46199e-133  hitchhiker  0.000000428617 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3514  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.51 
 
 		 525 aa  158  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270509  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0394  AMP-dependent synthetase and ligase  26.74 
 
 		 549 aa  158  2e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1650  AMP-binding domain protein  26.98 
 
 		 549 aa  159  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0943  AMP-dependent synthetase and ligase  29.94 
 
 		 511 aa  159  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4595  AMP-dependent synthetase and ligase  25.95 
 
 		 525 aa  158  3e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3158  AMP-dependent synthetase and ligase  27.94 
 
 		 515 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6078  acyl-CoA synthetase  27.06 
 
 		 542 aa  157  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1180  hypothetical protein  26.74 
 
 		 544 aa  157  5.0000000000000005e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  27.5 
 
 		 520 aa  157  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1967  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.71 
 
 		 514 aa  157  6e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.595404  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0154  AMP-dependent synthetase and ligase  28.21 
 
 		 520 aa  157  6e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2525  AMP-dependent synthetase and ligase  28.4 
 
 		 516 aa  157  6e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.695888 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3872  AMP-dependent synthetase and ligase  27.91 
 
 		 502 aa  156  8e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0626194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2714  AMP-dependent synthetase and ligase  29.98 
 
 		 546 aa  156  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0473  AMP-binding domain protein  26.69 
 
 		 568 aa  156  1e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1389  AMP-binding domain protein  25.7 
 
 		 549 aa  155  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000722424  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0851  acyl-CoA synthetase  27.36 
 
 		 504 aa  155  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0227528 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.73 
 
 		 512 aa  155  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>