More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2206 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2206  acyl-CoA synthetase  100 
 
 		 536 aa  1101    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0886048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5298  acyl-CoA synthetase  70.9 
 
 		 536 aa  819    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1759  acyl-CoA synthetase  73.13 
 
 		 536 aa  830    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0729 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1563  acyl-CoA synthetase  44.61 
 
 		 531 aa  427  1e-118  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.701309  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1531  acyl-CoA synthetase  42.12 
 
 		 531 aa  381  1e-104  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5009  acyl-CoA synthetase  40.15 
 
 		 549 aa  360  3e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.138056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5215  acyl-CoA synthetase  40.48 
 
 		 549 aa  359  6e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.240289 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1543  acyl-CoA synthetase  39.25 
 
 		 549 aa  357  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4627  acyl-CoA synthetase  39.22 
 
 		 549 aa  357  3.9999999999999996e-97  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4715  acyl-CoA synthetase  39.22 
 
 		 549 aa  357  3.9999999999999996e-97  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3980  AMP-dependent synthetase and ligase  37.97 
 
 		 526 aa  345  2e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0888  AMP-dependent synthetase and ligase  38.24 
 
 		 545 aa  338  1.9999999999999998e-91  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13548  acyl-CoA synthetase  38.43 
 
 		 548 aa  338  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.89294e-46  hitchhiker  0.000000367112 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2725  acyl-CoA synthetase  38.19 
 
 		 548 aa  336  5.999999999999999e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.105793  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0691  AMP-dependent synthetase and ligase  37.89 
 
 		 553 aa  335  1e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2174  acyl-CoA synthetase  37.2 
 
 		 540 aa  331  2e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.264892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3496  AMP-dependent synthetase and ligase  37.34 
 
 		 544 aa  330  4e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.38244  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1786  acyl-CoA synthetase  36.36 
 
 		 549 aa  317  2e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1833  acyl-CoA synthetase  36.36 
 
 		 549 aa  317  2e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.936288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2836  acyl-CoA synthetase  37.79 
 
 		 539 aa  316  5e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.395619 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4748  AMP-dependent synthetase and ligase  37.28 
 
 		 528 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1485  CoA synthetase, long-chain fatty acid:CoA ligase  37.11 
 
 		 528 aa  312  1e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3959  AMP-dependent synthetase and ligase  35.87 
 
 		 547 aa  312  1e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.511333  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2248  acyl-CoA synthetase  36.97 
 
 		 550 aa  311  2.9999999999999997e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2639  acyl-CoA synthetase  35.88 
 
 		 540 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.981359  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1767  acyl-CoA synthetase  36.43 
 
 		 549 aa  305  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.848326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4335  acyl-CoA synthetase  35.55 
 
 		 550 aa  302  1e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0901424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2010  acyl-CoA synthetase  35.55 
 
 		 550 aa  301  2e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.324541 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2921  acyl-CoA synthetase  33.64 
 
 		 558 aa  293  7e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.250918 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2891  acyl-CoA synthetase  33.64 
 
 		 558 aa  293  7e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2935  acyl-CoA synthetase  33.64 
 
 		 558 aa  293  7e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.444954  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0608  AMP-dependent synthetase and ligase  35.56 
 
 		 557 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.597937  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2118  AMP-dependent synthetase and ligase  34.43 
 
 		 545 aa  279  9e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.172383  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0290  AMP-dependent synthetase and ligase  32.2 
 
 		 605 aa  272  1e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000671199  hitchhiker  0.000133038 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4349  acyl-CoA synthetase  35.24 
 
 		 541 aa  264  3e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1995  acyl-CoA synthetase  34 
 
 		 541 aa  257  4e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1756  acyl-CoA synthetase  34.75 
 
 		 542 aa  256  5e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.317816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1775  acyl-CoA synthetase  34.3 
 
 		 542 aa  256  9e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1822  acyl-CoA synthetase  34.3 
 
 		 542 aa  256  9e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.591345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1806  AMP-dependent synthetase and ligase  31.13 
 
 		 526 aa  231  4e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1672  AMP-dependent synthetase and ligase  29.34 
 
 		 608 aa  209  1e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.47643  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4096  AMP-dependent synthetase and ligase  30.48 
 
 		 508 aa  202  9.999999999999999e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0377217  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4595  AMP-dependent synthetase and ligase  26.73 
 
 		 525 aa  191  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1438  acyl-CoA synthetase  27.16 
 
 		 549 aa  181  4e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.603543  decreased coverage  0.00000173613 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3124  AMP-dependent synthetase and ligase  29.33 
 
 		 545 aa  179  1e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6618  AMP-dependent synthetase and ligase  31.24 
 
 		 493 aa  178  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1724  AMP-dependent synthetase and ligase  27.32 
 
 		 515 aa  177  4e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0701995  normal  0.167784 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1180  hypothetical protein  29.31 
 
 		 544 aa  177  5e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5669  acyl-CoA synthetase  28.82 
 
 		 529 aa  174  3.9999999999999995e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5827  AMP-dependent synthetase and ligase  29.7 
 
 		 518 aa  172  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.671788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3704  AMP-dependent synthetase and ligase  27.63 
 
 		 515 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0990866  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2038  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  27.63 
 
 		 565 aa  171  4e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4107  AMP-dependent synthetase and ligase  27.59 
 
 		 519 aa  170  7e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.102419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2246  AMP-dependent synthetase and ligase  28.24 
 
 		 517 aa  169  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000334479  hitchhiker  6.92492e-16 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  28.28 
 
 		 525 aa  168  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4723  AMP-binding domain protein  26.4 
 
 		 560 aa  168  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.712671  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3076  acyl-CoA synthetase  27.72 
 
 		 545 aa  166  8e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2485  AMP-dependent synthetase and ligase  28.85 
 
 		 534 aa  166  8e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1660  AMP-dependent synthetase and ligase  28.74 
 
 		 523 aa  166  8e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104845  normal  0.559317 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2806  acyl-CoA synthetase  26.97 
 
 		 556 aa  166  9e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.688057 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3158  AMP-dependent synthetase and ligase  27.83 
 
 		 515 aa  166  9e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1605  AMP-dependent synthetase and ligase  27.24 
 
 		 526 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1666  AMP-dependent synthetase and ligase  29.32 
 
 		 518 aa  165  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.144653  normal  0.373713 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0102  AMP-dependent synthetase and ligase  27.73 
 
 		 520 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3008  acyl-CoA synthetase  27.84 
 
 		 545 aa  164  3e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.311019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1515  AMP-dependent synthetase and ligase  29.3 
 
 		 515 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00288915  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5942  AMP-dependent synthetase and ligase  28.76 
 
 		 516 aa  164  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.050377 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1538  AMP-dependent synthetase and ligase  29.3 
 
 		 515 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5309  AMP-dependent synthetase and ligase  28.33 
 
 		 517 aa  163  8.000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0851  acyl-CoA synthetase  27.87 
 
 		 504 aa  163  8.000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0227528 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0470  AMP-binding domain protein  26.44 
 
 		 579 aa  162  1e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.500012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4867  AMP-binding domain protein  25.14 
 
 		 538 aa  162  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.223701  normal  0.186874 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3937  AMP-binding domain protein  27.02 
 
 		 539 aa  162  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.104158  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2692  AMP-binding domain protein  26.52 
 
 		 552 aa  160  4e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.262026  normal  0.421392 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1025  AMP-dependent synthetase and ligase  27.47 
 
 		 528 aa  160  4e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2371  acyl-CoA synthetase  27.22 
 
 		 532 aa  160  6e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3993  AMP-dependent synthetase and ligase  28.4 
 
 		 524 aa  159  9e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.968795  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  26.33 
 
 		 520 aa  159  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6878  AMP-dependent synthetase and ligase  26.97 
 
 		 509 aa  159  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2068  AMP-binding domain protein  25.49 
 
 		 596 aa  158  2e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  29.9 
 
 		 503 aa  159  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4921  acyl-CoA synthetase  27.17 
 
 		 531 aa  159  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0286  putative AMP-dependent synthetase and ligase  27.88 
 
 		 530 aa  158  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.102918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2089  AMP-dependent synthetase and ligase  27.76 
 
 		 530 aa  158  3e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4758  AMP-dependent synthetase and ligase  28.26 
 
 		 518 aa  157  4e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0177  putative ligase  27.76 
 
 		 514 aa  157  4e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.709782 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2525  AMP-dependent synthetase and ligase  27.18 
 
 		 516 aa  157  4e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.695888 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  28.27 
 
 		 506 aa  157  4e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3872  AMP-dependent synthetase and ligase  27.4 
 
 		 502 aa  157  6e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0626194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5438  AMP-dependent synthetase and ligase  27.95 
 
 		 515 aa  157  6e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2384  long chain acyl-CoA synthetase  28.36 
 
 		 522 aa  157  6e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.838987  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1862  AMP-dependent synthetase and ligase  28.8 
 
 		 554 aa  156  7e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000194856  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3103  AMP-dependent synthetase and ligase  27.99 
 
 		 550 aa  156  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0943  AMP-dependent synthetase and ligase  29.69 
 
 		 511 aa  156  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6078  acyl-CoA synthetase  27.53 
 
 		 542 aa  155  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1563  AMP-binding domain protein  24.71 
 
 		 538 aa  155  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716975 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1435  AMP-dependent synthetase and ligase  27.84 
 
 		 503 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.097494  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1837  AMP-dependent synthetase and ligase  27.22 
 
 		 518 aa  154  2.9999999999999998e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.963932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0582  AMP-binding domain protein  25.22 
 
 		 587 aa  154  2.9999999999999998e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.44238  normal  0.647319 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13546  fatty-acid-CoA ligase fadD18  48.84 
 
 		 218 aa  154  4e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.46199e-133  hitchhiker  0.000000428617 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>