More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1759 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010333  Caul_5298  acyl-CoA synthetase  73.69 
 
 		 536 aa  855    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1759  acyl-CoA synthetase  100 
 
 		 536 aa  1098    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0729 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2206  acyl-CoA synthetase  73.13 
 
 		 536 aa  850    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0886048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1563  acyl-CoA synthetase  44.05 
 
 		 531 aa  424  1e-117  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.701309  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1531  acyl-CoA synthetase  42.01 
 
 		 531 aa  380  1e-104  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5215  acyl-CoA synthetase  40.74 
 
 		 549 aa  362  8e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.240289 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1543  acyl-CoA synthetase  39.52 
 
 		 549 aa  359  6e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13548  acyl-CoA synthetase  39.59 
 
 		 548 aa  350  3e-95  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.89294e-46  hitchhiker  0.000000367112 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4627  acyl-CoA synthetase  39.37 
 
 		 549 aa  349  7e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4715  acyl-CoA synthetase  39.37 
 
 		 549 aa  349  7e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5009  acyl-CoA synthetase  39.15 
 
 		 549 aa  347  3e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.138056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2174  acyl-CoA synthetase  38.11 
 
 		 540 aa  344  2e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.264892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3980  AMP-dependent synthetase and ligase  38.32 
 
 		 526 aa  345  2e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3496  AMP-dependent synthetase and ligase  38.46 
 
 		 544 aa  342  8e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.38244  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3959  AMP-dependent synthetase and ligase  37.59 
 
 		 547 aa  339  5.9999999999999996e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.511333  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0888  AMP-dependent synthetase and ligase  38.07 
 
 		 545 aa  323  4e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2836  acyl-CoA synthetase  37.87 
 
 		 539 aa  316  5e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.395619 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1485  CoA synthetase, long-chain fatty acid:CoA ligase  37.11 
 
 		 528 aa  316  7e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0691  AMP-dependent synthetase and ligase  35.44 
 
 		 553 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2725  acyl-CoA synthetase  36.45 
 
 		 548 aa  313  5.999999999999999e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.105793  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4748  AMP-dependent synthetase and ligase  37.45 
 
 		 528 aa  311  2e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2639  acyl-CoA synthetase  37.13 
 
 		 540 aa  308  2.0000000000000002e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.981359  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2248  acyl-CoA synthetase  35.09 
 
 		 550 aa  298  1e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1786  acyl-CoA synthetase  34.55 
 
 		 549 aa  298  1e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1833  acyl-CoA synthetase  34.55 
 
 		 549 aa  298  1e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.936288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2921  acyl-CoA synthetase  34.6 
 
 		 558 aa  293  7e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.250918 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2891  acyl-CoA synthetase  34.6 
 
 		 558 aa  293  7e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2935  acyl-CoA synthetase  34.6 
 
 		 558 aa  293  7e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.444954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1767  acyl-CoA synthetase  35.24 
 
 		 549 aa  291  2e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.848326  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0608  AMP-dependent synthetase and ligase  35.15 
 
 		 557 aa  288  2e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.597937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2010  acyl-CoA synthetase  35.25 
 
 		 550 aa  287  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.324541 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2118  AMP-dependent synthetase and ligase  35.17 
 
 		 545 aa  281  2e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.172383  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4335  acyl-CoA synthetase  34.72 
 
 		 550 aa  281  3e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0901424  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0290  AMP-dependent synthetase and ligase  31.42 
 
 		 605 aa  279  1e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000671199  hitchhiker  0.000133038 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1756  acyl-CoA synthetase  32.41 
 
 		 542 aa  242  1e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.317816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1775  acyl-CoA synthetase  32.41 
 
 		 542 aa  240  5e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1822  acyl-CoA synthetase  32.41 
 
 		 542 aa  240  5e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.591345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1995  acyl-CoA synthetase  32.78 
 
 		 541 aa  236  7e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4349  acyl-CoA synthetase  33.03 
 
 		 541 aa  236  9e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1806  AMP-dependent synthetase and ligase  30.96 
 
 		 526 aa  230  5e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1672  AMP-dependent synthetase and ligase  29.39 
 
 		 608 aa  203  5e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.47643  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4096  AMP-dependent synthetase and ligase  30.1 
 
 		 508 aa  190  5.999999999999999e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0377217  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  29.35 
 
 		 520 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.79 
 
 		 512 aa  178  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1438  acyl-CoA synthetase  27.59 
 
 		 549 aa  174  3.9999999999999995e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.603543  decreased coverage  0.00000173613 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3076  acyl-CoA synthetase  28.49 
 
 		 545 aa  173  5.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  28.28 
 
 		 525 aa  169  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1515  AMP-dependent synthetase and ligase  29.8 
 
 		 515 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00288915  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1538  AMP-dependent synthetase and ligase  29.8 
 
 		 515 aa  169  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  28.12 
 
 		 506 aa  168  2e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5669  acyl-CoA synthetase  29.14 
 
 		 529 aa  168  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2714  AMP-dependent synthetase and ligase  29.73 
 
 		 546 aa  168  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4595  AMP-dependent synthetase and ligase  27.7 
 
 		 525 aa  167  4e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1905  AMP-dependent synthetase and ligase  27.99 
 
 		 512 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.97218  normal  0.26016 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2384  long chain acyl-CoA synthetase  28.54 
 
 		 522 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.838987  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3704  AMP-dependent synthetase and ligase  26.91 
 
 		 515 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0990866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0102  AMP-dependent synthetase and ligase  28.25 
 
 		 520 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3124  AMP-dependent synthetase and ligase  27.81 
 
 		 545 aa  164  4.0000000000000004e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3266  AMP-dependent synthetase and ligase  28.32 
 
 		 511 aa  164  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3993  AMP-dependent synthetase and ligase  28.1 
 
 		 524 aa  164  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.968795  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2038  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  27.12 
 
 		 565 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0642  acyl-CoA synthetase  28.87 
 
 		 529 aa  161  3e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.95301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13546  fatty-acid-CoA ligase fadD18  55.17 
 
 		 218 aa  161  3e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.46199e-133  hitchhiker  0.000000428617 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0473  AMP-binding domain protein  28.05 
 
 		 568 aa  161  3e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2371  acyl-CoA synthetase  28.44 
 
 		 532 aa  160  5e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3605  acyl-CoA synthetase  27.7 
 
 		 514 aa  159  8e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.133038  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2692  AMP-binding domain protein  26.31 
 
 		 552 aa  159  8e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.262026  normal  0.421392 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6618  AMP-dependent synthetase and ligase  28.54 
 
 		 493 aa  160  8e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4758  AMP-dependent synthetase and ligase  28.63 
 
 		 518 aa  159  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1180  hypothetical protein  26.1 
 
 		 544 aa  159  1e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1650  AMP-binding domain protein  27.27 
 
 		 549 aa  159  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2563  AMP-binding domain protein  27.51 
 
 		 549 aa  158  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45341e-16 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.38 
 
 		 513 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2695  AMP-dependent synthetase and ligase  28.43 
 
 		 516 aa  157  4e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1389  AMP-binding domain protein  27 
 
 		 549 aa  157  4e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000722424  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1660  AMP-dependent synthetase and ligase  27.33 
 
 		 523 aa  157  5.0000000000000005e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104845  normal  0.559317 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5827  AMP-dependent synthetase and ligase  28.12 
 
 		 518 aa  157  5.0000000000000005e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.671788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0027  AMP-dependent synthetase and ligase  29.5 
 
 		 509 aa  157  6e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.141316  normal  0.236103 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2246  AMP-dependent synthetase and ligase  28.65 
 
 		 517 aa  156  7e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000334479  hitchhiker  6.92492e-16 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5438  AMP-dependent synthetase and ligase  26.6 
 
 		 515 aa  157  7e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427259  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0661  AMP-binding enzyme family protein  27.94 
 
 		 520 aa  156  8e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3008  acyl-CoA synthetase  28.07 
 
 		 545 aa  156  8e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.311019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3612  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.61 
 
 		 514 aa  156  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  24.69 
 
 		 553 aa  155  1e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2089  AMP-dependent synthetase and ligase  27.7 
 
 		 530 aa  155  1e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1605  AMP-dependent synthetase and ligase  27.95 
 
 		 526 aa  156  1e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1244  AMP-dependent synthetase and ligase  28.84 
 
 		 502 aa  155  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.248207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1724  AMP-dependent synthetase and ligase  27.03 
 
 		 515 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0701995  normal  0.167784 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1442  AMP-binding domain protein  28.29 
 
 		 550 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.684137  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1025  AMP-dependent synthetase and ligase  28.07 
 
 		 528 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1681  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.01 
 
 		 514 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1614  AMP-dependent synthetase and ligase  28.89 
 
 		 509 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0737  AMP-dependent synthetase and ligase  29.3 
 
 		 522 aa  154  4e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188702  normal  0.517642 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1862  AMP-dependent synthetase and ligase  26.56 
 
 		 554 aa  154  4e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000194856  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2377  AMP-dependent synthetase and ligase  29.67 
 
 		 530 aa  153  8.999999999999999e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.581612  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1103  AMP-binding domain protein  26.85 
 
 		 552 aa  152  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4921  acyl-CoA synthetase  27.86 
 
 		 531 aa  152  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1666  AMP-dependent synthetase and ligase  27.82 
 
 		 518 aa  152  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.144653  normal  0.373713 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0154  AMP-dependent synthetase and ligase  27.36 
 
 		 520 aa  152  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0177  putative ligase  26.45 
 
 		 514 aa  152  2e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.709782 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>