More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2695 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2695  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 516 aa  1052    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2714  AMP-dependent synthetase and ligase  62.55 
 
 		 546 aa  648    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0015  acyl-CoA synthetase  54.51 
 
 		 511 aa  542  1e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323665 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5032  acyl-CoA synthetase  55.91 
 
 		 501 aa  541  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.672582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4649  acyl-CoA synthetase  55.71 
 
 		 501 aa  540  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4737  acyl-CoA synthetase  55.71 
 
 		 501 aa  540  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.987006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2397  AMP-dependent synthetase and ligase  50.87 
 
 		 516 aa  531  1e-150  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.264456  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0848  AMP-dependent synthetase and ligase  48.26 
 
 		 517 aa  518  1e-146  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0912  AMP-dependent synthetase and ligase  51.95 
 
 		 515 aa  520  1e-146  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.881726 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1905  AMP-dependent synthetase and ligase  50.1 
 
 		 512 aa  520  1e-146  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.97218  normal  0.26016 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3266  AMP-dependent synthetase and ligase  50.29 
 
 		 511 aa  506  9.999999999999999e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2738  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  51.57 
 
 		 522 aa  504  1e-141  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3605  acyl-CoA synthetase  48.72 
 
 		 514 aa  496  1e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.133038  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2936  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  51.75 
 
 		 536 aa  491  1e-137  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.098527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3399  AMP-dependent synthetase and ligase  50.1 
 
 		 522 aa  488  1e-137  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1124  AMP-dependent synthetase and ligase  50.2 
 
 		 509 aa  487  1e-136  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.719867  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1347  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.94 
 
 		 512 aa  482  1e-135  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1902  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.44 
 
 		 518 aa  481  1e-134  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.889055  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1681  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.76 
 
 		 514 aa  476  1e-133  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3161  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  49.22 
 
 		 516 aa  476  1e-133  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0449  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.83 
 
 		 516 aa  478  1e-133  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.93416 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0166  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  49.8 
 
 		 506 aa  474  1e-132  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.74 
 
 		 513 aa  473  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0221  AMP-dependent synthetase and ligase  49.32 
 
 		 510 aa  473  1e-132  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0177  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  49.6 
 
 		 506 aa  472  1e-132  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.761031  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0186  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  49.6 
 
 		 506 aa  472  1e-132  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0230763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3612  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  46.78 
 
 		 514 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7124  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.36 
 
 		 512 aa  466  9.999999999999999e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.100628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0218  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.05 
 
 		 516 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0925378 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5310  acyl-CoA synthetase  48.26 
 
 		 516 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4161  acyl-CoA synthetase  48.71 
 
 		 517 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  49.02 
 
 		 512 aa  457  1e-127  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4410  acyl-CoA synthetase  46.46 
 
 		 516 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.648302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10216  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.8 
 
 		 537 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0681  acyl-CoA synthetase  46.11 
 
 		 520 aa  451  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.457647 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4700  acyl-CoA synthetase  47.6 
 
 		 516 aa  451  1e-125  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1502  acyl-CoA synthetase  43.84 
 
 		 515 aa  432  1e-120  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1502  acyl-CoA synthetase  44.03 
 
 		 515 aa  434  1e-120  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1525  acyl-CoA synthetase  44.03 
 
 		 515 aa  434  1e-120  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5158  putative o-succinylbenzoate-CoA ligase  45.29 
 
 		 527 aa  424  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.20469 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2641  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.61 
 
 		 516 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.517138  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2838  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.31 
 
 		 515 aa  396  1e-109  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.153198 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1465  acyl-CoA synthetase  44.73 
 
 		 487 aa  391  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.845905  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0104  AMP-dependent synthetase and ligase  43.65 
 
 		 524 aa  383  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.256556 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3984  AMP-dependent synthetase and ligase  41.6 
 
 		 521 aa  382  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.446284  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0696  AMP-dependent synthetase and ligase  44.23 
 
 		 521 aa  376  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6056  AMP-dependent synthetase and ligase  41.67 
 
 		 515 aa  372  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0121  AMP-dependent synthetase and ligase  44.9 
 
 		 522 aa  373  1e-102  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3089  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.78 
 
 		 522 aa  366  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.196285  normal  0.363977 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6823  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase I  42.08 
 
 		 492 aa  362  7.0000000000000005e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2707  AMP-dependent synthetase and ligase  42.66 
 
 		 519 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0621527  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2787  AMP-dependent synthetase and ligase  42.39 
 
 		 518 aa  352  8e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.296837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1871  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.93 
 
 		 524 aa  352  1e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.394568  normal  0.852293 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1481  AMP-dependent synthetase and ligase  40.46 
 
 		 525 aa  350  4e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3597  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.14 
 
 		 543 aa  349  7e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0570  AMP-dependent synthetase and ligase  39.58 
 
 		 525 aa  347  3e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.356446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3874  AMP-dependent synthetase and ligase  42 
 
 		 510 aa  341  2e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0918503 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1967  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.92 
 
 		 514 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.595404  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2927  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.48 
 
 		 509 aa  331  2e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.686689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0282  AMP-dependent synthetase and ligase  43.01 
 
 		 492 aa  330  3e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.376129  normal  0.234171 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3839  AMP-dependent synthetase and ligase  41.51 
 
 		 508 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3057  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.01 
 
 		 499 aa  322  9.999999999999999e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.847241  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0423  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.39 
 
 		 509 aa  322  9.999999999999999e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3166  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.08 
 
 		 501 aa  321  1.9999999999999998e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130976  hitchhiker  0.0000354644 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3215  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.9 
 
 		 500 aa  320  3.9999999999999996e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4093  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.48 
 
 		 497 aa  312  6.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0327517  normal  0.151728 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3980  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.48 
 
 		 497 aa  312  6.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.310048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0804  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.68 
 
 		 516 aa  302  9e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.48042 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1368  AMP-dependent synthetase and ligase  37.98 
 
 		 515 aa  301  3e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.663143  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6480  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.28 
 
 		 513 aa  290  5.0000000000000004e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5528  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.21 
 
 		 509 aa  280  6e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4604  AMP-dependent synthetase and ligase  37.91 
 
 		 492 aa  272  1e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.37521 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6878  AMP-dependent synthetase and ligase  35.59 
 
 		 509 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3247  AMP-dependent synthetase and ligase  36.5 
 
 		 497 aa  264  3e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.640388 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1034  AMP-dependent synthetase and ligase  36.05 
 
 		 495 aa  263  4.999999999999999e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01193  acyl-CoA synthase  34.44 
 
 		 544 aa  257  3e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0176178  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1666  AMP-dependent synthetase and ligase  34.24 
 
 		 518 aa  250  4e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.144653  normal  0.373713 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1029  AMP-dependent synthetase and ligase  33.66 
 
 		 499 aa  249  6e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  34.23 
 
 		 520 aa  244  3e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1112  putative acyl-CoA ligase  34.56 
 
 		 504 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.29648 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3855  AMP-dependent synthetase and ligase  35.66 
 
 		 523 aa  240  5e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.713722 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1660  AMP-dependent synthetase and ligase  32.14 
 
 		 523 aa  238  2e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104845  normal  0.559317 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1025  AMP-dependent synthetase and ligase  35.09 
 
 		 498 aa  238  2e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1600  AMP-dependent synthetase and ligase  33.53 
 
 		 496 aa  236  7e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1095  AMP-dependent synthetase and ligase  34.19 
 
 		 518 aa  233  5e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.997125 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0223  AMP-dependent synthetase and ligase  35.42 
 
 		 491 aa  233  5e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.803967  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0233  AMP-dependent synthetase and ligase  35.42 
 
 		 491 aa  233  5e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.318189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6739  AMP-dependent synthetase and ligase  33.68 
 
 		 532 aa  233  6e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0799452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4238  AMP-dependent synthetase and ligase  31.92 
 
 		 527 aa  233  9e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0419  AMP-dependent synthetase and ligase  34.31 
 
 		 492 aa  232  1e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0725647  normal  0.0451868 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4096  AMP-dependent synthetase and ligase  34.13 
 
 		 508 aa  231  2e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0377217  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1605  AMP-dependent synthetase and ligase  31.94 
 
 		 526 aa  232  2e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1599  AMP-dependent synthetase and ligase  33.27 
 
 		 484 aa  231  3e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0351  AMP-dependent synthetase and ligase  35.88 
 
 		 507 aa  229  6e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0213  AMP-dependent synthetase and ligase  34.77 
 
 		 491 aa  228  1e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.65945 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1868  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.15 
 
 		 525 aa  228  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.205754 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5309  AMP-dependent synthetase and ligase  33.46 
 
 		 517 aa  228  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13440  acyl-CoA synthetase  33.61 
 
 		 539 aa  226  8e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3600  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.33 
 
 		 525 aa  226  9e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.887287  normal  0.975846 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5942  AMP-dependent synthetase and ligase  34.76 
 
 		 516 aa  226  9e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.050377 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>