More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0223 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_0419  AMP-dependent synthetase and ligase  78.51 
 
 		 492 aa  754    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0725647  normal  0.0451868 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0223  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 491 aa  980    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.803967  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0213  AMP-dependent synthetase and ligase  97.76 
 
 		 491 aa  938    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.65945 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0233  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 491 aa  980    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.318189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0252  AMP-dependent synthetase and ligase  79.09 
 
 		 484 aa  744    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.122402 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1029  AMP-dependent synthetase and ligase  46.36 
 
 		 499 aa  421  1e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1600  AMP-dependent synthetase and ligase  46.63 
 
 		 496 aa  409  1e-113  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3247  AMP-dependent synthetase and ligase  44.99 
 
 		 497 aa  399  9.999999999999999e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.640388 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1034  AMP-dependent synthetase and ligase  43.97 
 
 		 495 aa  394  1e-108  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4604  AMP-dependent synthetase and ligase  45.95 
 
 		 492 aa  389  1e-107  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.37521 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1599  AMP-dependent synthetase and ligase  44.58 
 
 		 484 aa  375  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1112  putative acyl-CoA ligase  44.37 
 
 		 504 aa  358  9.999999999999999e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.29648 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1025  AMP-dependent synthetase and ligase  42.08 
 
 		 498 aa  343  5e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0351  AMP-dependent synthetase and ligase  40.24 
 
 		 507 aa  320  3e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0614  AMP-dependent synthetase and ligase  37.94 
 
 		 502 aa  269  8.999999999999999e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3099  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 513 aa  268  1e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000841335 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4026  AMP-dependent synthetase and ligase  38.54 
 
 		 487 aa  254  4.0000000000000004e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.863411  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0282  AMP-dependent synthetase and ligase  37.8 
 
 		 492 aa  248  2e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.376129  normal  0.234171 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0912  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 515 aa  247  4e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.881726 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0804  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.22 
 
 		 516 aa  245  9.999999999999999e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.48042 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3874  AMP-dependent synthetase and ligase  34.27 
 
 		 510 aa  244  3e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0918503 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1871  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.74 
 
 		 524 aa  243  7.999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.394568  normal  0.852293 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1967  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.2 
 
 		 514 aa  240  5e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.595404  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3597  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.13 
 
 		 543 aa  239  9e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2695  AMP-dependent synthetase and ligase  35.42 
 
 		 516 aa  238  1e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2714  AMP-dependent synthetase and ligase  35.8 
 
 		 546 aa  239  1e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2641  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.65 
 
 		 516 aa  238  1e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.517138  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1902  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.94 
 
 		 518 aa  236  7e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.889055  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2927  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.23 
 
 		 509 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.686689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1347  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.93 
 
 		 512 aa  235  2.0000000000000002e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3266  AMP-dependent synthetase and ligase  33.46 
 
 		 511 aa  234  3e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1465  acyl-CoA synthetase  35.37 
 
 		 487 aa  233  4.0000000000000004e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.845905  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2838  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.89 
 
 		 515 aa  233  5e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.153198 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3612  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.89 
 
 		 514 aa  233  8.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1905  AMP-dependent synthetase and ligase  32.36 
 
 		 512 aa  232  1e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.97218  normal  0.26016 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5310  acyl-CoA synthetase  32.28 
 
 		 516 aa  232  1e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1681  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.11 
 
 		 514 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3605  acyl-CoA synthetase  33.13 
 
 		 514 aa  228  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.133038  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7124  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.97 
 
 		 512 aa  227  4e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.100628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3839  AMP-dependent synthetase and ligase  34.3 
 
 		 508 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2738  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.87 
 
 		 522 aa  226  7e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6823  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase I  34.64 
 
 		 492 aa  226  7e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4410  acyl-CoA synthetase  31.29 
 
 		 516 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.648302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0423  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.51 
 
 		 509 aa  224  3e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0848  AMP-dependent synthetase and ligase  31.34 
 
 		 517 aa  224  4e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3215  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.98 
 
 		 500 aa  223  4e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0166  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.35 
 
 		 506 aa  223  9e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4700  acyl-CoA synthetase  31.09 
 
 		 516 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1502  acyl-CoA synthetase  30.88 
 
 		 515 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1525  acyl-CoA synthetase  30.88 
 
 		 515 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0218  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.92 
 
 		 516 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0925378 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0177  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.16 
 
 		 506 aa  220  5e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.761031  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0186  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.16 
 
 		 506 aa  220  5e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0230763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1502  acyl-CoA synthetase  30.68 
 
 		 515 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3166  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.2 
 
 		 501 aa  218  1e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130976  hitchhiker  0.0000354644 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0015  acyl-CoA synthetase  32.79 
 
 		 511 aa  218  2e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323665 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.4 
 
 		 512 aa  216  5.9999999999999996e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.66 
 
 		 513 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1368  AMP-dependent synthetase and ligase  30.99 
 
 		 515 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.663143  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5528  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.86 
 
 		 509 aa  213  5.999999999999999e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0681  acyl-CoA synthetase  31.42 
 
 		 520 aa  213  7.999999999999999e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.457647 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4161  acyl-CoA synthetase  31.52 
 
 		 517 aa  213  7.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5032  acyl-CoA synthetase  32.73 
 
 		 501 aa  213  7.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.672582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2397  AMP-dependent synthetase and ligase  32.61 
 
 		 516 aa  212  1e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.264456  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4649  acyl-CoA synthetase  32.73 
 
 		 501 aa  212  1e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4737  acyl-CoA synthetase  32.73 
 
 		 501 aa  212  1e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.987006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10216  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.72 
 
 		 537 aa  211  2e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3161  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.49 
 
 		 516 aa  211  2e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0449  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.07 
 
 		 516 aa  211  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.93416 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13440  acyl-CoA synthetase  33.13 
 
 		 539 aa  209  7e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3089  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.76 
 
 		 522 aa  209  9e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.196285  normal  0.363977 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5158  putative o-succinylbenzoate-CoA ligase  32.61 
 
 		 527 aa  207  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.20469 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3057  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.05 
 
 		 499 aa  207  4e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.847241  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0221  AMP-dependent synthetase and ligase  31.68 
 
 		 510 aa  206  9e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10274  acyl-CoA synthetase  31.49 
 
 		 560 aa  203  6e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0406036 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1124  AMP-dependent synthetase and ligase  34 
 
 		 509 aa  203  7e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.719867  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1133  AMP-dependent synthetase and ligase  31.24 
 
 		 518 aa  202  8e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.508244  normal  0.50206 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3984  AMP-dependent synthetase and ligase  31.64 
 
 		 521 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.446284  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6480  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.71 
 
 		 513 aa  199  6e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01193  acyl-CoA synthase  30.83 
 
 		 544 aa  199  1.0000000000000001e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0176178  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6056  AMP-dependent synthetase and ligase  32.99 
 
 		 515 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2707  AMP-dependent synthetase and ligase  34.32 
 
 		 519 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0621527  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0570  AMP-dependent synthetase and ligase  32.53 
 
 		 525 aa  199  1.0000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.356446  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4093  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.05 
 
 		 497 aa  197  3e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0327517  normal  0.151728 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3980  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.05 
 
 		 497 aa  197  3e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.310048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0350  acyl-CoA synthetase  32.19 
 
 		 574 aa  197  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1595  AMP-dependent synthetase and ligase  30.91 
 
 		 519 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0361  acyl-CoA synthetase  32.19 
 
 		 577 aa  197  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.171367  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0371  acyl-CoA synthetase  32.19 
 
 		 577 aa  197  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6739  AMP-dependent synthetase and ligase  31.64 
 
 		 532 aa  194  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0799452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3399  AMP-dependent synthetase and ligase  31.6 
 
 		 522 aa  193  5e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0861  AMP-dependent synthetase and ligase  30.26 
 
 		 514 aa  193  6e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1676  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.97 
 
 		 526 aa  193  6e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.591328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3855  AMP-dependent synthetase and ligase  32.46 
 
 		 523 aa  193  7e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.713722 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0341  acyl-CoA synthetase  31.46 
 
 		 569 aa  193  7e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0397  acyl-CoA synthetase  32.33 
 
 		 564 aa  192  8e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.835434  normal  0.950858 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2787  AMP-dependent synthetase and ligase  31.65 
 
 		 518 aa  192  1e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.296837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  31.5 
 
 		 499 aa  191  2.9999999999999997e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0131  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.93 
 
 		 570 aa  191  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0696  AMP-dependent synthetase and ligase  31.36 
 
 		 521 aa  191  4e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>