More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1599 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1599  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 484 aa  987    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1029  AMP-dependent synthetase and ligase  57.38 
 
 		 499 aa  559  1e-158  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1034  AMP-dependent synthetase and ligase  56.61 
 
 		 495 aa  553  1e-156  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1600  AMP-dependent synthetase and ligase  55.49 
 
 		 496 aa  544  1e-153  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3247  AMP-dependent synthetase and ligase  55.67 
 
 		 497 aa  532  1e-150  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.640388 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4604  AMP-dependent synthetase and ligase  56.22 
 
 		 492 aa  530  1e-149  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.37521 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1112  putative acyl-CoA ligase  50.1 
 
 		 504 aa  440  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.29648 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1025  AMP-dependent synthetase and ligase  47.23 
 
 		 498 aa  418  9.999999999999999e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0351  AMP-dependent synthetase and ligase  45.3 
 
 		 507 aa  399  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0419  AMP-dependent synthetase and ligase  44.82 
 
 		 492 aa  374  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0725647  normal  0.0451868 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0252  AMP-dependent synthetase and ligase  45.75 
 
 		 484 aa  369  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.122402 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0223  AMP-dependent synthetase and ligase  44.58 
 
 		 491 aa  363  4e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.803967  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0233  AMP-dependent synthetase and ligase  44.58 
 
 		 491 aa  363  4e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.318189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0213  AMP-dependent synthetase and ligase  44.86 
 
 		 491 aa  362  7.0000000000000005e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.65945 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0614  AMP-dependent synthetase and ligase  38.96 
 
 		 502 aa  282  8.000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3099  AMP-dependent synthetase and ligase  37.1 
 
 		 513 aa  282  9e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000841335 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6823  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase I  36.65 
 
 		 492 aa  274  3e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4026  AMP-dependent synthetase and ligase  38.86 
 
 		 487 aa  262  1e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.863411  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3161  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.66 
 
 		 516 aa  258  2e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0166  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.02 
 
 		 506 aa  254  3e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0912  AMP-dependent synthetase and ligase  36.17 
 
 		 515 aa  253  4.0000000000000004e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.881726 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0177  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.02 
 
 		 506 aa  252  1e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.761031  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0186  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.02 
 
 		 506 aa  252  1e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0230763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1347  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.06 
 
 		 512 aa  249  9e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.7 
 
 		 512 aa  248  2e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0218  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.85 
 
 		 516 aa  248  2e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0925378 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0449  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.78 
 
 		 516 aa  246  9e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.93416 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1465  acyl-CoA synthetase  37.53 
 
 		 487 aa  244  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.845905  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0221  AMP-dependent synthetase and ligase  33.2 
 
 		 510 aa  244  3e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2714  AMP-dependent synthetase and ligase  34.83 
 
 		 546 aa  243  7e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1502  acyl-CoA synthetase  33.07 
 
 		 515 aa  243  7e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1502  acyl-CoA synthetase  32.87 
 
 		 515 aa  241  2e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1525  acyl-CoA synthetase  32.87 
 
 		 515 aa  241  2e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10216  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.14 
 
 		 537 aa  240  4e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3266  AMP-dependent synthetase and ligase  34.4 
 
 		 511 aa  239  9e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2738  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.12 
 
 		 522 aa  238  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0848  AMP-dependent synthetase and ligase  32.74 
 
 		 517 aa  237  3e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0015  acyl-CoA synthetase  34.78 
 
 		 511 aa  236  9e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323665 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1905  AMP-dependent synthetase and ligase  33.6 
 
 		 512 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.97218  normal  0.26016 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1871  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.76 
 
 		 524 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.394568  normal  0.852293 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5158  putative o-succinylbenzoate-CoA ligase  33.91 
 
 		 527 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.20469 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1681  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.79 
 
 		 514 aa  234  3e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0104  AMP-dependent synthetase and ligase  34.84 
 
 		 524 aa  233  4.0000000000000004e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.256556 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3612  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33 
 
 		 514 aa  233  8.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5032  acyl-CoA synthetase  34.72 
 
 		 501 aa  232  9e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.672582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4649  acyl-CoA synthetase  34.72 
 
 		 501 aa  232  9e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4737  acyl-CoA synthetase  34.72 
 
 		 501 aa  232  9e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.987006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4161  acyl-CoA synthetase  34.72 
 
 		 517 aa  232  1e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3839  AMP-dependent synthetase and ligase  35.15 
 
 		 508 aa  231  2e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0570  AMP-dependent synthetase and ligase  32.74 
 
 		 525 aa  231  2e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.356446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0696  AMP-dependent synthetase and ligase  35.5 
 
 		 521 aa  231  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2695  AMP-dependent synthetase and ligase  33.27 
 
 		 516 aa  231  3e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3166  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.47 
 
 		 501 aa  231  3e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130976  hitchhiker  0.0000354644 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3605  acyl-CoA synthetase  32.6 
 
 		 514 aa  230  4e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.133038  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3984  AMP-dependent synthetase and ligase  32.56 
 
 		 521 aa  229  7e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.446284  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3597  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.29 
 
 		 543 aa  229  1e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2641  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.07 
 
 		 516 aa  228  2e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.517138  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7124  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.48 
 
 		 512 aa  228  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.100628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0121  AMP-dependent synthetase and ligase  35.67 
 
 		 522 aa  228  2e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3980  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.08 
 
 		 497 aa  227  3e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.310048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.54 
 
 		 513 aa  228  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4093  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.08 
 
 		 497 aa  227  3e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0327517  normal  0.151728 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1967  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.07 
 
 		 514 aa  225  1e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.595404  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1902  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.5 
 
 		 518 aa  225  1e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.889055  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3399  AMP-dependent synthetase and ligase  35.48 
 
 		 522 aa  224  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2927  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32 
 
 		 509 aa  225  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.686689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2838  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.87 
 
 		 515 aa  224  4e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.153198 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2397  AMP-dependent synthetase and ligase  33.54 
 
 		 516 aa  223  4.9999999999999996e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.264456  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2936  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.81 
 
 		 536 aa  223  4.9999999999999996e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.098527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3874  AMP-dependent synthetase and ligase  33.2 
 
 		 510 aa  223  4.9999999999999996e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0918503 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0681  acyl-CoA synthetase  32.62 
 
 		 520 aa  223  6e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.457647 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5310  acyl-CoA synthetase  32.78 
 
 		 516 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1124  AMP-dependent synthetase and ligase  35.06 
 
 		 509 aa  221  1.9999999999999999e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.719867  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4700  acyl-CoA synthetase  31.82 
 
 		 516 aa  219  7.999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6056  AMP-dependent synthetase and ligase  32.61 
 
 		 515 aa  219  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01193  acyl-CoA synthase  31.1 
 
 		 544 aa  219  1e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0176178  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4410  acyl-CoA synthetase  32.22 
 
 		 516 aa  218  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.648302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0423  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.38 
 
 		 509 aa  218  2e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5528  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.74 
 
 		 509 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1368  AMP-dependent synthetase and ligase  31.91 
 
 		 515 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.663143  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3057  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.44 
 
 		 499 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.847241  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3215  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.14 
 
 		 500 aa  212  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0282  AMP-dependent synthetase and ligase  33.4 
 
 		 492 aa  206  7e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.376129  normal  0.234171 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3089  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.88 
 
 		 522 aa  206  9e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.196285  normal  0.363977 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1481  AMP-dependent synthetase and ligase  31.23 
 
 		 525 aa  202  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2323  AMP-dependent synthetase and ligase  31.01 
 
 		 511 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0804  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.54 
 
 		 516 aa  199  7e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.48042 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2707  AMP-dependent synthetase and ligase  31.74 
 
 		 519 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0621527  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6480  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.25 
 
 		 513 aa  194  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1025  AMP-dependent synthetase and ligase  29.84 
 
 		 528 aa  192  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0851  acyl-CoA synthetase  30.43 
 
 		 504 aa  191  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0227528 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3975  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.77 
 
 		 530 aa  187  5e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.251646  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0142  AMP-dependent synthetase and ligase  31.7 
 
 		 508 aa  186  8e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13440  acyl-CoA synthetase  29.66 
 
 		 539 aa  186  8e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0861  AMP-dependent synthetase and ligase  30.12 
 
 		 514 aa  184  3e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4902  AMP-dependent synthetase and ligase  32.47 
 
 		 501 aa  184  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0027  AMP-dependent synthetase and ligase  31.58 
 
 		 509 aa  184  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.141316  normal  0.236103 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2105  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31 
 
 		 524 aa  181  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2787  AMP-dependent synthetase and ligase  31.2 
 
 		 518 aa  182  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.296837  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1614  AMP-dependent synthetase and ligase  31.56 
 
 		 509 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>