More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_0166 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_4161  acyl-CoA synthetase  71.2 
 
 
517 aa  732    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10216  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  76.48 
 
 
537 aa  811    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0449  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  88.18 
 
 
516 aa  948    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.93416 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0166  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  100 
 
 
506 aa  1041    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0177  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  99.41 
 
 
506 aa  1034    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.761031  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0186  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  99.41 
 
 
506 aa  1034    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0230763  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0218  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  91.09 
 
 
516 aa  972    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0925378 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1905  AMP-dependent synthetase and ligase  55.86 
 
 
512 aa  552  1e-156  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.97218  normal  0.26016 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3266  AMP-dependent synthetase and ligase  56.06 
 
 
511 aa  543  1e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0912  AMP-dependent synthetase and ligase  54.4 
 
 
515 aa  538  9.999999999999999e-153  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.881726 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0848  AMP-dependent synthetase and ligase  53.37 
 
 
517 aa  537  1e-151  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0221  AMP-dependent synthetase and ligase  51.59 
 
 
510 aa  507  9.999999999999999e-143  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3161  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.8 
 
 
516 aa  497  1e-139  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  49.31 
 
 
513 aa  498  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1347  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  52.5 
 
 
512 aa  496  1e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7124  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  49.6 
 
 
512 aa  492  9.999999999999999e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.100628  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1681  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.2 
 
 
514 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1902  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  49.4 
 
 
518 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.889055  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  52.3 
 
 
512 aa  492  9.999999999999999e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2714  AMP-dependent synthetase and ligase  50.89 
 
 
546 aa  494  9.999999999999999e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3605  acyl-CoA synthetase  50.5 
 
 
514 aa  491  1e-137  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.133038  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3399  AMP-dependent synthetase and ligase  52.16 
 
 
522 aa  491  1e-137  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3612  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  49.6 
 
 
514 aa  484  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2397  AMP-dependent synthetase and ligase  50.3 
 
 
516 aa  481  1e-134  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.264456  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2738  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.2 
 
 
522 aa  478  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2695  AMP-dependent synthetase and ligase  49.8 
 
 
516 aa  474  1e-132  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5310  acyl-CoA synthetase  49.5 
 
 
516 aa  474  1e-132  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4700  acyl-CoA synthetase  49.5 
 
 
516 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4410  acyl-CoA synthetase  48.89 
 
 
516 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.648302  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5032  acyl-CoA synthetase  49.8 
 
 
501 aa  463  1e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.672582  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4737  acyl-CoA synthetase  49.8 
 
 
501 aa  462  1e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.987006  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4649  acyl-CoA synthetase  49.8 
 
 
501 aa  462  1e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0681  acyl-CoA synthetase  48.61 
 
 
520 aa  461  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.457647 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1502  acyl-CoA synthetase  47.9 
 
 
515 aa  461  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1525  acyl-CoA synthetase  47.9 
 
 
515 aa  461  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0015  acyl-CoA synthetase  48.41 
 
 
511 aa  457  1e-127  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.323665 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1502  acyl-CoA synthetase  47.49 
 
 
515 aa  457  1e-127  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5158  putative o-succinylbenzoate-CoA ligase  46.37 
 
 
527 aa  448  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.20469 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1124  AMP-dependent synthetase and ligase  47.7 
 
 
509 aa  443  1e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.719867  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2936  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  46.86 
 
 
536 aa  438  1e-121  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.098527  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6056  AMP-dependent synthetase and ligase  45.09 
 
 
515 aa  419  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0104  AMP-dependent synthetase and ligase  45.72 
 
 
524 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.256556 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0121  AMP-dependent synthetase and ligase  45.51 
 
 
522 aa  405  1e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0696  AMP-dependent synthetase and ligase  45.06 
 
 
521 aa  396  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2641  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.64 
 
 
516 aa  372  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.517138  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3984  AMP-dependent synthetase and ligase  42.63 
 
 
521 aa  372  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.446284  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2838  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.33 
 
 
515 aa  364  2e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.153198 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1465  acyl-CoA synthetase  41.27 
 
 
487 aa  359  7e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.845905  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3089  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.74 
 
 
522 aa  352  1e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.196285  normal  0.363977 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6823  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase I  40.16 
 
 
492 aa  350  5e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2707  AMP-dependent synthetase and ligase  42.06 
 
 
519 aa  348  2e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0621527  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1481  AMP-dependent synthetase and ligase  41.52 
 
 
525 aa  347  3e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3874  AMP-dependent synthetase and ligase  40 
 
 
510 aa  344  2e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0918503 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3839  AMP-dependent synthetase and ligase  41.04 
 
 
508 aa  343  5.999999999999999e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2927  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.41 
 
 
509 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.686689  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3597  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.48 
 
 
543 aa  334  2e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2787  AMP-dependent synthetase and ligase  40.98 
 
 
518 aa  331  1e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.296837  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0570  AMP-dependent synthetase and ligase  40 
 
 
525 aa  328  1.0000000000000001e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.356446  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0804  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.48 
 
 
516 aa  327  2.0000000000000001e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.48042 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3166  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.66 
 
 
501 aa  327  5e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130976  hitchhiker  0.0000354644 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0282  AMP-dependent synthetase and ligase  41.54 
 
 
492 aa  326  6e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.376129  normal  0.234171 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3980  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.37 
 
 
497 aa  322  8e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.310048  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4093  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.37 
 
 
497 aa  322  8e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0327517  normal  0.151728 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3057  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40 
 
 
499 aa  320  3e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.847241  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1871  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.65 
 
 
524 aa  319  9e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.394568  normal  0.852293 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1967  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.03 
 
 
514 aa  317  3e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.595404  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5528  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.61 
 
 
509 aa  310  5e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0423  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.35 
 
 
509 aa  304  2.0000000000000002e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3215  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.32 
 
 
500 aa  303  4.0000000000000003e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1368  AMP-dependent synthetase and ligase  36.7 
 
 
515 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.663143  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6480  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.35 
 
 
513 aa  286  8e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1034  AMP-dependent synthetase and ligase  35.52 
 
 
495 aa  278  2e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3247  AMP-dependent synthetase and ligase  37.6 
 
 
497 aa  276  8e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.640388 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01193  acyl-CoA synthase  35.53 
 
 
544 aa  270  2.9999999999999997e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0176178  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1599  AMP-dependent synthetase and ligase  35.02 
 
 
484 aa  254  3e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1029  AMP-dependent synthetase and ligase  33.67 
 
 
499 aa  253  7e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1600  AMP-dependent synthetase and ligase  35.79 
 
 
496 aa  253  7e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0943  AMP-dependent synthetase and ligase  36.11 
 
 
511 aa  248  2e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193061  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1112  putative acyl-CoA ligase  37.53 
 
 
504 aa  247  4e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.29648 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4604  AMP-dependent synthetase and ligase  34.46 
 
 
492 aa  246  6e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.37521 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1025  AMP-dependent synthetase and ligase  32.45 
 
 
498 aa  244  3e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6878  AMP-dependent synthetase and ligase  33.79 
 
 
509 aa  243  6e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615245  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0027  AMP-dependent synthetase and ligase  33.66 
 
 
509 aa  238  3e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.141316  normal  0.236103 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1666  AMP-dependent synthetase and ligase  30.84 
 
 
518 aa  237  4e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.144653  normal  0.373713 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2026  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.13 
 
 
517 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.342397  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6739  AMP-dependent synthetase and ligase  34.59 
 
 
532 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0799452  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3694  AMP-dependent synthetase and ligase  33.53 
 
 
532 aa  235  1.0000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178139  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0351  AMP-dependent synthetase and ligase  34.9 
 
 
507 aa  235  1.0000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4616  AMP-dependent synthetase and ligase  34.06 
 
 
518 aa  234  3e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.892742  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1837  AMP-dependent synthetase and ligase  34.54 
 
 
518 aa  232  1e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.963932  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0102  AMP-dependent synthetase and ligase  35.63 
 
 
520 aa  231  2e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1868  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.09 
 
 
525 aa  229  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.205754 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  34.46 
 
 
520 aa  228  2e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3855  AMP-dependent synthetase and ligase  33.72 
 
 
523 aa  227  4e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.713722 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  34.39 
 
 
503 aa  227  4e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3600  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.98 
 
 
525 aa  226  7e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.887287  normal  0.975846 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1865  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.75 
 
 
519 aa  226  7e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.975513  normal  0.637576 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0252  AMP-dependent synthetase and ligase  33.2 
 
 
484 aa  226  8e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.122402 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4908  AMP-dependent synthetase and ligase  32.68 
 
 
512 aa  226  9e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.96823  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3565  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.98 
 
 
526 aa  225  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.011282  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>