More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3984 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_3984  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 521 aa  1065    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.446284  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1481  AMP-dependent synthetase and ligase  77.17 
 
 		 525 aa  849    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3089  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  64.14 
 
 		 522 aa  675    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.196285  normal  0.363977 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2641  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  53.64 
 
 		 516 aa  551  1e-156  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.517138  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2838  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  53.74 
 
 		 515 aa  550  1e-155  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.153198 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6823  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase I  46.98 
 
 		 492 aa  460  9.999999999999999e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1465  acyl-CoA synthetase  46.9 
 
 		 487 aa  444  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.845905  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0848  AMP-dependent synthetase and ligase  44.7 
 
 		 517 aa  416  9.999999999999999e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2707  AMP-dependent synthetase and ligase  44.25 
 
 		 519 aa  409  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0621527  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1905  AMP-dependent synthetase and ligase  44.75 
 
 		 512 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.97218  normal  0.26016 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3266  AMP-dependent synthetase and ligase  44.94 
 
 		 511 aa  399  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1502  acyl-CoA synthetase  43.71 
 
 		 515 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1525  acyl-CoA synthetase  43.71 
 
 		 515 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4700  acyl-CoA synthetase  44.44 
 
 		 516 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1502  acyl-CoA synthetase  43.51 
 
 		 515 aa  398  1e-109  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0912  AMP-dependent synthetase and ligase  43.71 
 
 		 515 aa  389  1e-107  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.881726 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0570  AMP-dependent synthetase and ligase  44.73 
 
 		 525 aa  390  1e-107  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.356446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1902  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.91 
 
 		 518 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.889055  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4410  acyl-CoA synthetase  43.05 
 
 		 516 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.648302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1347  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.11 
 
 		 512 aa  384  1e-105  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3161  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.16 
 
 		 516 aa  382  1e-105  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.34 
 
 		 513 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5310  acyl-CoA synthetase  42.47 
 
 		 516 aa  383  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2695  AMP-dependent synthetase and ligase  41.6 
 
 		 516 aa  382  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1681  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.1 
 
 		 514 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3612  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.16 
 
 		 514 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7124  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.86 
 
 		 512 aa  378  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.100628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3605  acyl-CoA synthetase  41.88 
 
 		 514 aa  377  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.133038  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0166  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.63 
 
 		 506 aa  378  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5158  putative o-succinylbenzoate-CoA ligase  44.53 
 
 		 527 aa  375  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.20469 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10216  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.06 
 
 		 537 aa  377  1e-103  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0449  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43 
 
 		 516 aa  374  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.93416 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0221  AMP-dependent synthetase and ligase  43.75 
 
 		 510 aa  374  1e-102  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0177  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.25 
 
 		 506 aa  375  1e-102  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.761031  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0186  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.25 
 
 		 506 aa  375  1e-102  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0230763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2397  AMP-dependent synthetase and ligase  40.35 
 
 		 516 aa  370  1e-101  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.264456  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0681  acyl-CoA synthetase  41.3 
 
 		 520 aa  369  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.457647 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0218  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.94 
 
 		 516 aa  371  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0925378 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0015  acyl-CoA synthetase  43.33 
 
 		 511 aa  366  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323665 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4161  acyl-CoA synthetase  42.54 
 
 		 517 aa  364  2e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1124  AMP-dependent synthetase and ligase  41.57 
 
 		 509 aa  361  1e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.719867  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5032  acyl-CoA synthetase  43.62 
 
 		 501 aa  358  9.999999999999999e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.672582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.32 
 
 		 512 aa  358  9.999999999999999e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4649  acyl-CoA synthetase  43.62 
 
 		 501 aa  357  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4737  acyl-CoA synthetase  43.62 
 
 		 501 aa  357  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.987006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2714  AMP-dependent synthetase and ligase  41.43 
 
 		 546 aa  356  5e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2738  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.69 
 
 		 522 aa  354  2e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3399  AMP-dependent synthetase and ligase  40.89 
 
 		 522 aa  352  8e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1871  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.5 
 
 		 524 aa  349  8e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.394568  normal  0.852293 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5528  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.61 
 
 		 509 aa  343  4e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0804  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.6 
 
 		 516 aa  338  1.9999999999999998e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.48042 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2787  AMP-dependent synthetase and ligase  40.29 
 
 		 518 aa  336  7.999999999999999e-91  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.296837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3597  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.79 
 
 		 543 aa  335  1e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1967  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.37 
 
 		 514 aa  335  2e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.595404  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0696  AMP-dependent synthetase and ligase  39.85 
 
 		 521 aa  335  2e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2927  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.04 
 
 		 509 aa  331  2e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.686689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3839  AMP-dependent synthetase and ligase  41.4 
 
 		 508 aa  330  4e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6056  AMP-dependent synthetase and ligase  40.55 
 
 		 515 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2936  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.23 
 
 		 536 aa  326  5e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.098527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0104  AMP-dependent synthetase and ligase  39.02 
 
 		 524 aa  326  5e-88  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.256556 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3166  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.63 
 
 		 501 aa  323  3e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130976  hitchhiker  0.0000354644 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0121  AMP-dependent synthetase and ligase  40.04 
 
 		 522 aa  324  3e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3057  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.12 
 
 		 499 aa  323  4e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.847241  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0423  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.15 
 
 		 509 aa  322  9.999999999999999e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3215  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.71 
 
 		 500 aa  314  2.9999999999999996e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4093  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.12 
 
 		 497 aa  313  5.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0327517  normal  0.151728 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3980  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.12 
 
 		 497 aa  313  5.999999999999999e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.310048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0282  AMP-dependent synthetase and ligase  37.74 
 
 		 492 aa  293  4e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.376129  normal  0.234171 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3874  AMP-dependent synthetase and ligase  35.52 
 
 		 510 aa  293  5e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0918503 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6480  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.16 
 
 		 513 aa  289  7e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1368  AMP-dependent synthetase and ligase  33.71 
 
 		 515 aa  278  1e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.663143  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1868  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.25 
 
 		 525 aa  264  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.205754 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01193  acyl-CoA synthase  31.83 
 
 		 544 aa  261  2e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0176178  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6739  AMP-dependent synthetase and ligase  35.69 
 
 		 532 aa  260  5.0000000000000005e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0799452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3600  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.54 
 
 		 525 aa  259  8e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.887287  normal  0.975846 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3855  AMP-dependent synthetase and ligase  35.19 
 
 		 523 aa  253  5.000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.713722 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1964  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.74 
 
 		 525 aa  246  8e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132088  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3514  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.4 
 
 		 525 aa  244  3e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270509  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1605  AMP-dependent synthetase and ligase  32.57 
 
 		 526 aa  242  1e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2924  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.03 
 
 		 526 aa  240  4e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.42655 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5140  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.71 
 
 		 525 aa  240  5e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.24744  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4604  AMP-dependent synthetase and ligase  35.76 
 
 		 492 aa  239  1e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.37521 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1676  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.2 
 
 		 526 aa  237  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.591328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1211  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.02 
 
 		 527 aa  234  2.0000000000000002e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3975  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.7 
 
 		 530 aa  234  2.0000000000000002e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.251646  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1599  AMP-dependent synthetase and ligase  32.56 
 
 		 484 aa  230  5e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1865  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.4 
 
 		 519 aa  230  5e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.975513  normal  0.637576 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3565  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.32 
 
 		 526 aa  230  6e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.011282  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1666  AMP-dependent synthetase and ligase  33.2 
 
 		 518 aa  229  9e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.144653  normal  0.373713 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1763  AMP-dependent synthetase and ligase  33.06 
 
 		 521 aa  228  2e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.494407 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4472  AMP-dependent synthetase and ligase  33.6 
 
 		 517 aa  228  2e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1660  AMP-dependent synthetase and ligase  32.43 
 
 		 523 aa  227  5.0000000000000005e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104845  normal  0.559317 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0027  AMP-dependent synthetase and ligase  32.06 
 
 		 509 aa  226  6e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.141316  normal  0.236103 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2026  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.86 
 
 		 517 aa  224  3e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.342397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1034  AMP-dependent synthetase and ligase  31.04 
 
 		 495 aa  224  4e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1025  AMP-dependent synthetase and ligase  34.06 
 
 		 498 aa  223  4.9999999999999996e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3694  AMP-dependent synthetase and ligase  31.05 
 
 		 532 aa  223  4.9999999999999996e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1112  putative acyl-CoA ligase  34.59 
 
 		 504 aa  221  3e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.29648 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0943  AMP-dependent synthetase and ligase  32.28 
 
 		 511 aa  220  6e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3247  AMP-dependent synthetase and ligase  31.89 
 
 		 497 aa  219  7e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.640388 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>