More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3855 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_3855  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 523 aa  1068    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.713722 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6739  AMP-dependent synthetase and ligase  48.73 
 
 		 532 aa  496  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0799452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3215  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.7 
 
 		 500 aa  291  2e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3057  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.5 
 
 		 499 aa  289  1e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.847241  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4096  AMP-dependent synthetase and ligase  36.36 
 
 		 508 aa  286  7e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0377217  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3597  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.55 
 
 		 543 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1871  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.69 
 
 		 524 aa  281  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.394568  normal  0.852293 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6618  AMP-dependent synthetase and ligase  37.99 
 
 		 493 aa  278  1e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1967  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.27 
 
 		 514 aa  278  2e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.595404  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3874  AMP-dependent synthetase and ligase  37.18 
 
 		 510 aa  277  4e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0918503 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2927  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.88 
 
 		 509 aa  276  9e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.686689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3975  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.94 
 
 		 530 aa  274  3e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.251646  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0102  AMP-dependent synthetase and ligase  35.7 
 
 		 520 aa  271  2e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0423  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.58 
 
 		 509 aa  270  5e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0804  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.24 
 
 		 516 aa  269  8.999999999999999e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.48042 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0943  AMP-dependent synthetase and ligase  34.7 
 
 		 511 aa  266  8.999999999999999e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0027  AMP-dependent synthetase and ligase  35.63 
 
 		 509 aa  265  1e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.141316  normal  0.236103 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1502  acyl-CoA synthetase  35.43 
 
 		 515 aa  265  1e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3166  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.26 
 
 		 501 aa  265  2e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130976  hitchhiker  0.0000354644 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5158  putative o-succinylbenzoate-CoA ligase  34.36 
 
 		 527 aa  265  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.20469 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0737  AMP-dependent synthetase and ligase  35.78 
 
 		 522 aa  265  2e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188702  normal  0.517642 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6823  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase I  34.73 
 
 		 492 aa  263  6.999999999999999e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1660  AMP-dependent synthetase and ligase  34.44 
 
 		 523 aa  262  1e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104845  normal  0.559317 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3839  AMP-dependent synthetase and ligase  35.11 
 
 		 508 aa  262  1e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1502  acyl-CoA synthetase  34.65 
 
 		 515 aa  261  1e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1525  acyl-CoA synthetase  34.65 
 
 		 515 aa  261  1e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1865  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.95 
 
 		 519 aa  261  2e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.975513  normal  0.637576 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1666  AMP-dependent synthetase and ligase  34.62 
 
 		 518 aa  261  2e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.144653  normal  0.373713 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4871  AMP-dependent synthetase and ligase  35.76 
 
 		 506 aa  260  4e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.324146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  35.35 
 
 		 499 aa  259  6e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.9 
 
 		 513 aa  258  1e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1905  AMP-dependent synthetase and ligase  34.99 
 
 		 512 aa  258  3e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.97218  normal  0.26016 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0743  AMP-dependent synthetase and ligase  35.78 
 
 		 522 aa  255  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.83543  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2787  AMP-dependent synthetase and ligase  36.12 
 
 		 518 aa  256  1.0000000000000001e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.296837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0757  AMP-dependent synthetase and ligase  35.78 
 
 		 522 aa  255  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.147131  normal  0.360345 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7124  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.67 
 
 		 512 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.100628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3565  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35 
 
 		 526 aa  252  9.000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.011282  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1902  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.13 
 
 		 518 aa  252  1e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.889055  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3984  AMP-dependent synthetase and ligase  34.81 
 
 		 521 aa  251  2e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.446284  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1681  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.67 
 
 		 514 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0970  AMP-dependent synthetase and ligase  34.49 
 
 		 520 aa  250  4e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2641  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.18 
 
 		 516 aa  249  6e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.517138  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4700  acyl-CoA synthetase  33.98 
 
 		 516 aa  249  7e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3612  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.47 
 
 		 514 aa  249  7e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5528  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.87 
 
 		 509 aa  248  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1481  AMP-dependent synthetase and ligase  35.27 
 
 		 525 aa  248  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5271  AMP-dependent synthetase and ligase  33.65 
 
 		 541 aa  248  3e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.675059 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.38 
 
 		 513 aa  247  4e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5140  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.59 
 
 		 525 aa  247  4e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.24744  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2397  AMP-dependent synthetase and ligase  33.53 
 
 		 516 aa  247  4e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.264456  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5310  acyl-CoA synthetase  33.79 
 
 		 516 aa  247  4e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3161  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.06 
 
 		 516 aa  246  6e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1095  AMP-dependent synthetase and ligase  35.12 
 
 		 518 aa  246  6.999999999999999e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.997125 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1465  acyl-CoA synthetase  34.79 
 
 		 487 aa  246  9e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.845905  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1605  AMP-dependent synthetase and ligase  32.7 
 
 		 526 aa  246  9.999999999999999e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1676  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.69 
 
 		 526 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.591328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4410  acyl-CoA synthetase  33.4 
 
 		 516 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.648302  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  35.11 
 
 		 506 aa  246  9.999999999999999e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  34.34 
 
 		 520 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3266  AMP-dependent synthetase and ligase  34.11 
 
 		 511 aa  245  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3980  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.47 
 
 		 497 aa  244  3e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.310048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4238  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 527 aa  244  3e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1211  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.2 
 
 		 527 aa  244  3e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4093  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.47 
 
 		 497 aa  244  3e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0327517  normal  0.151728 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1124  AMP-dependent synthetase and ligase  33.93 
 
 		 509 aa  244  3e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.719867  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3089  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.83 
 
 		 522 aa  243  6e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.196285  normal  0.363977 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3600  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.41 
 
 		 525 aa  243  9e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.887287  normal  0.975846 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4379  AMP-dependent synthetase and ligase  34.85 
 
 		 506 aa  243  9e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.177409 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0570  AMP-dependent synthetase and ligase  35.26 
 
 		 525 aa  242  1e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.356446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  32.23 
 
 		 512 aa  242  1e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  36.78 
 
 		 503 aa  242  1e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2924  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.28 
 
 		 526 aa  242  1e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.42655 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2038  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  33.97 
 
 		 565 aa  242  2e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3704  AMP-dependent synthetase and ligase  33.97 
 
 		 515 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0990866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  33.07 
 
 		 521 aa  241  2e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0681  acyl-CoA synthetase  33.33 
 
 		 520 aa  241  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.457647 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4073  AMP-dependent synthetase and ligase  34.77 
 
 		 535 aa  241  2e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0666092  normal  0.751022 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1964  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.48 
 
 		 525 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132088  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2707  AMP-dependent synthetase and ligase  35.56 
 
 		 519 aa  240  4e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0621527  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2695  AMP-dependent synthetase and ligase  35.66 
 
 		 516 aa  240  5e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2032  AMP-dependent synthetase and ligase  36.5 
 
 		 551 aa  240  5.999999999999999e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.367958 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0015  acyl-CoA synthetase  34.6 
 
 		 511 aa  240  5.999999999999999e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323665 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0282  AMP-dependent synthetase and ligase  35.57 
 
 		 492 aa  239  6.999999999999999e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.376129  normal  0.234171 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1763  AMP-dependent synthetase and ligase  34.83 
 
 		 521 aa  239  8e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.494407 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5032  acyl-CoA synthetase  34.39 
 
 		 501 aa  239  8e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.672582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13106  fatty-acid-CoA ligase fadD13  35.71 
 
 		 503 aa  239  9e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  32.53 
 
 		 662 aa  239  9e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0321  AMP-dependent synthetase and ligase  33.53 
 
 		 503 aa  239  9e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.289675  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1868  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.33 
 
 		 525 aa  239  9e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.205754 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0848  AMP-dependent synthetase and ligase  32.39 
 
 		 517 aa  239  1e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3611  AMP-dependent synthetase and ligase  36.09 
 
 		 532 aa  238  2e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0778531  normal  0.0346233 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1884  AMP-dependent synthetase and ligase  33.87 
 
 		 495 aa  238  2e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0661  AMP-binding enzyme family protein  32.29 
 
 		 520 aa  237  4e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2838  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.31 
 
 		 515 aa  236  5.0000000000000005e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.153198 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4649  acyl-CoA synthetase  34.19 
 
 		 501 aa  237  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1347  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.71 
 
 		 512 aa  237  5.0000000000000005e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4737  acyl-CoA synthetase  34.19 
 
 		 501 aa  237  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.987006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5309  AMP-dependent synthetase and ligase  33.85 
 
 		 517 aa  236  6e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0601  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.72 
 
 		 561 aa  236  7e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4758  AMP-dependent synthetase and ligase  34.04 
 
 		 518 aa  236  7e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>