More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0804 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0804  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  100 
 
 		 516 aa  1058    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.48042 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2927  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  53.44 
 
 		 509 aa  561  1e-158  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.686689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1871  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.88 
 
 		 524 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.394568  normal  0.852293 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0423  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  52.92 
 
 		 509 aa  537  1e-151  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3597  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.49 
 
 		 543 aa  531  1e-150  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1967  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.39 
 
 		 514 aa  531  1e-149  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.595404  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3839  AMP-dependent synthetase and ligase  52.34 
 
 		 508 aa  522  1e-147  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5528  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  49.81 
 
 		 509 aa  519  1e-146  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3874  AMP-dependent synthetase and ligase  48.51 
 
 		 510 aa  480  1e-134  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0918503 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6480  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.54 
 
 		 513 aa  451  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3166  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.82 
 
 		 501 aa  432  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130976  hitchhiker  0.0000354644 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3057  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43 
 
 		 499 aa  431  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.847241  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0282  AMP-dependent synthetase and ligase  44.8 
 
 		 492 aa  417  9.999999999999999e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.376129  normal  0.234171 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3215  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.71 
 
 		 500 aa  412  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3980  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.07 
 
 		 497 aa  393  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.310048  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4093  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.07 
 
 		 497 aa  393  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0327517  normal  0.151728 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1368  AMP-dependent synthetase and ligase  39.29 
 
 		 515 aa  369  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.663143  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.96 
 
 		 513 aa  354  2e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2641  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.78 
 
 		 516 aa  354  2e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.517138  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1902  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.67 
 
 		 518 aa  354  2.9999999999999997e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.889055  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2838  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.53 
 
 		 515 aa  353  2.9999999999999997e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.153198 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3089  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.09 
 
 		 522 aa  353  5.9999999999999994e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.196285  normal  0.363977 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1681  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.72 
 
 		 514 aa  350  3e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1502  acyl-CoA synthetase  40.88 
 
 		 515 aa  349  5e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0221  AMP-dependent synthetase and ligase  41.09 
 
 		 510 aa  349  6e-95  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0912  AMP-dependent synthetase and ligase  40.7 
 
 		 515 aa  349  7e-95  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.881726 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1502  acyl-CoA synthetase  40.68 
 
 		 515 aa  347  4e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1525  acyl-CoA synthetase  40.68 
 
 		 515 aa  347  4e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3612  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.56 
 
 		 514 aa  345  2e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6823  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase I  40.37 
 
 		 492 aa  344  2e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7124  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.22 
 
 		 512 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.100628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1481  AMP-dependent synthetase and ligase  41.11 
 
 		 525 aa  343  5e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01193  acyl-CoA synthase  38.24 
 
 		 544 aa  342  8e-93  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0176178  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0449  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.99 
 
 		 516 aa  342  1e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.93416 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1905  AMP-dependent synthetase and ligase  40.35 
 
 		 512 aa  339  5.9999999999999996e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.97218  normal  0.26016 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3984  AMP-dependent synthetase and ligase  39.29 
 
 		 521 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.446284  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2714  AMP-dependent synthetase and ligase  40.71 
 
 		 546 aa  333  5e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5158  putative o-succinylbenzoate-CoA ligase  37.7 
 
 		 527 aa  333  6e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.20469 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3266  AMP-dependent synthetase and ligase  40.66 
 
 		 511 aa  333  6e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0166  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.48 
 
 		 506 aa  333  6e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4161  acyl-CoA synthetase  40.64 
 
 		 517 aa  332  1e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2397  AMP-dependent synthetase and ligase  39.07 
 
 		 516 aa  331  2e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.264456  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.2 
 
 		 512 aa  330  3e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4700  acyl-CoA synthetase  39.17 
 
 		 516 aa  330  3e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5310  acyl-CoA synthetase  39.17 
 
 		 516 aa  330  3e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0177  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.48 
 
 		 506 aa  330  5.0000000000000004e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.761031  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0186  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.48 
 
 		 506 aa  330  5.0000000000000004e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0230763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0218  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.32 
 
 		 516 aa  328  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0925378 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10216  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.81 
 
 		 537 aa  327  3e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1465  acyl-CoA synthetase  38.05 
 
 		 487 aa  325  1e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.845905  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4410  acyl-CoA synthetase  38.39 
 
 		 516 aa  324  3e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.648302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0848  AMP-dependent synthetase and ligase  37.38 
 
 		 517 aa  322  9.999999999999999e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3161  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.86 
 
 		 516 aa  321  1.9999999999999998e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2738  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.73 
 
 		 522 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0681  acyl-CoA synthetase  38.21 
 
 		 520 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.457647 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1124  AMP-dependent synthetase and ligase  40.2 
 
 		 509 aa  321  1.9999999999999998e-86  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.719867  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1347  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.83 
 
 		 512 aa  318  1e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3399  AMP-dependent synthetase and ligase  39.07 
 
 		 522 aa  317  3e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0015  acyl-CoA synthetase  40.48 
 
 		 511 aa  316  6e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323665 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0104  AMP-dependent synthetase and ligase  37.5 
 
 		 524 aa  309  6.999999999999999e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.256556 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0570  AMP-dependent synthetase and ligase  38.77 
 
 		 525 aa  306  8.000000000000001e-82  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.356446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3605  acyl-CoA synthetase  37.52 
 
 		 514 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.133038  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0696  AMP-dependent synthetase and ligase  36.27 
 
 		 521 aa  305  2.0000000000000002e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2695  AMP-dependent synthetase and ligase  36.99 
 
 		 516 aa  304  3.0000000000000004e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2936  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.43 
 
 		 536 aa  301  1e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.098527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2787  AMP-dependent synthetase and ligase  36.31 
 
 		 518 aa  299  7e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.296837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5032  acyl-CoA synthetase  38.66 
 
 		 501 aa  297  4e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.672582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4649  acyl-CoA synthetase  38.46 
 
 		 501 aa  296  8e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4737  acyl-CoA synthetase  38.46 
 
 		 501 aa  296  8e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.987006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6739  AMP-dependent synthetase and ligase  35.01 
 
 		 532 aa  290  6e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0799452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0121  AMP-dependent synthetase and ligase  36.25 
 
 		 522 aa  287  4e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6056  AMP-dependent synthetase and ligase  36.05 
 
 		 515 aa  281  3e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2707  AMP-dependent synthetase and ligase  36.12 
 
 		 519 aa  278  1e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0621527  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3855  AMP-dependent synthetase and ligase  35.16 
 
 		 523 aa  273  5.000000000000001e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.713722 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0943  AMP-dependent synthetase and ligase  33.27 
 
 		 511 aa  268  2e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3247  AMP-dependent synthetase and ligase  33.85 
 
 		 497 aa  256  7e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.640388 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5140  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.3 
 
 		 525 aa  248  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.24744  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0223  AMP-dependent synthetase and ligase  35.43 
 
 		 491 aa  246  6.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.803967  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0233  AMP-dependent synthetase and ligase  35.43 
 
 		 491 aa  246  6.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.318189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0213  AMP-dependent synthetase and ligase  35.12 
 
 		 491 aa  243  7.999999999999999e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.65945 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0027  AMP-dependent synthetase and ligase  32.95 
 
 		 509 aa  241  2e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.141316  normal  0.236103 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10274  acyl-CoA synthetase  33.33 
 
 		 560 aa  241  2e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0406036 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4604  AMP-dependent synthetase and ligase  33.66 
 
 		 492 aa  241  2e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.37521 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1112  putative acyl-CoA ligase  34.22 
 
 		 504 aa  240  4e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.29648 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1029  AMP-dependent synthetase and ligase  32.53 
 
 		 499 aa  238  1e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3600  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.37 
 
 		 525 aa  238  2e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.887287  normal  0.975846 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1367  AMP-dependent synthetase and ligase  33.52 
 
 		 502 aa  238  2e-61  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.439129  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3565  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.37 
 
 		 526 aa  237  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.011282  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0419  AMP-dependent synthetase and ligase  34.12 
 
 		 492 aa  236  9e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0725647  normal  0.0451868 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4096  AMP-dependent synthetase and ligase  31.56 
 
 		 508 aa  236  1.0000000000000001e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0377217  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33 
 
 		 514 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  31.89 
 
 		 499 aa  235  2.0000000000000002e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1211  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.46 
 
 		 527 aa  234  3e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1034  AMP-dependent synthetase and ligase  31.31 
 
 		 495 aa  233  7.000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  32.53 
 
 		 512 aa  233  7.000000000000001e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0252  AMP-dependent synthetase and ligase  34.41 
 
 		 484 aa  232  1e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.122402 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1964  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.73 
 
 		 525 aa  232  1e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132088  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1025  AMP-dependent synthetase and ligase  31.65 
 
 		 498 aa  232  1e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1868  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.69 
 
 		 525 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.205754 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5438  AMP-dependent synthetase and ligase  32.17 
 
 		 515 aa  231  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427259  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>