More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_1502 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_1502  acyl-CoA synthetase  100 
 
 
515 aa  1070    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1502  acyl-CoA synthetase  99.03 
 
 
515 aa  1060    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1525  acyl-CoA synthetase  99.03 
 
 
515 aa  1060    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5310  acyl-CoA synthetase  53.7 
 
 
516 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0681  acyl-CoA synthetase  53.22 
 
 
520 aa  556  1e-157  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.457647 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4700  acyl-CoA synthetase  53.05 
 
 
516 aa  555  1e-156  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4410  acyl-CoA synthetase  52.8 
 
 
516 aa  554  1e-156  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.648302  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1905  AMP-dependent synthetase and ligase  51.47 
 
 
512 aa  511  1e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.97218  normal  0.26016 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0848  AMP-dependent synthetase and ligase  49.61 
 
 
517 aa  499  1e-140  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3266  AMP-dependent synthetase and ligase  49.51 
 
 
511 aa  493  9.999999999999999e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1347  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  49.22 
 
 
512 aa  482  1e-135  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.78 
 
 
513 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1902  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.59 
 
 
518 aa  481  1e-134  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.889055  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3605  acyl-CoA synthetase  49.02 
 
 
514 aa  479  1e-134  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.133038  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3612  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.5 
 
 
514 aa  479  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1681  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  46.91 
 
 
514 aa  476  1e-133  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0912  AMP-dependent synthetase and ligase  48.16 
 
 
515 aa  473  1e-132  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.881726 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7124  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.07 
 
 
512 aa  459  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.100628  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0166  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.49 
 
 
506 aa  457  1e-127  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0177  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.81 
 
 
506 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.761031  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0186  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.81 
 
 
506 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0230763  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0218  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.13 
 
 
516 aa  449  1e-125  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0925378 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10216  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  46.59 
 
 
537 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0449  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  46.76 
 
 
516 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.93416 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3399  AMP-dependent synthetase and ligase  46.8 
 
 
522 aa  442  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3161  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.45 
 
 
516 aa  443  1e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  46.67 
 
 
512 aa  437  1e-121  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4161  acyl-CoA synthetase  45.24 
 
 
517 aa  432  1e-120  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2714  AMP-dependent synthetase and ligase  45.45 
 
 
546 aa  433  1e-120  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2695  AMP-dependent synthetase and ligase  43.84 
 
 
516 aa  432  1e-120  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5158  putative o-succinylbenzoate-CoA ligase  44.6 
 
 
527 aa  427  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.20469 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2738  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.96 
 
 
522 aa  424  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2397  AMP-dependent synthetase and ligase  43.74 
 
 
516 aa  420  1e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.264456  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0015  acyl-CoA synthetase  43.65 
 
 
511 aa  412  1e-114  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.323665 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5032  acyl-CoA synthetase  44.03 
 
 
501 aa  414  1e-114  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.672582  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4649  acyl-CoA synthetase  44.03 
 
 
501 aa  413  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4737  acyl-CoA synthetase  44.03 
 
 
501 aa  413  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.987006  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2936  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.4 
 
 
536 aa  409  1e-113  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.098527  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0221  AMP-dependent synthetase and ligase  41.67 
 
 
510 aa  404  1e-111  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1124  AMP-dependent synthetase and ligase  44.12 
 
 
509 aa  397  1e-109  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.719867  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6056  AMP-dependent synthetase and ligase  40.54 
 
 
515 aa  394  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3984  AMP-dependent synthetase and ligase  43.51 
 
 
521 aa  395  1e-108  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.446284  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0104  AMP-dependent synthetase and ligase  42.94 
 
 
524 aa  379  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.256556 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1465  acyl-CoA synthetase  42.6 
 
 
487 aa  366  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.845905  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2641  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.13 
 
 
516 aa  369  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.517138  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0696  AMP-dependent synthetase and ligase  40.59 
 
 
521 aa  359  8e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0121  AMP-dependent synthetase and ligase  41.98 
 
 
522 aa  358  9.999999999999999e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2838  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.97 
 
 
515 aa  356  5e-97  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.153198 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3089  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.65 
 
 
522 aa  355  8.999999999999999e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.196285  normal  0.363977 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1481  AMP-dependent synthetase and ligase  40.43 
 
 
525 aa  354  2e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6823  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase I  40.56 
 
 
492 aa  348  2e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0804  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.88 
 
 
516 aa  346  7e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.48042 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3874  AMP-dependent synthetase and ligase  38.65 
 
 
510 aa  337  1.9999999999999998e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0918503 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0570  AMP-dependent synthetase and ligase  39.69 
 
 
525 aa  336  7e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.356446  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1871  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.78 
 
 
524 aa  334  2e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.394568  normal  0.852293 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1967  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.13 
 
 
514 aa  331  2e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.595404  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2927  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.78 
 
 
509 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.686689  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3839  AMP-dependent synthetase and ligase  39.72 
 
 
508 aa  325  1e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3597  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.39 
 
 
543 aa  323  3e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0423  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.65 
 
 
509 aa  322  9.000000000000001e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2707  AMP-dependent synthetase and ligase  38.54 
 
 
519 aa  317  4e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0621527  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0282  AMP-dependent synthetase and ligase  38.15 
 
 
492 aa  313  3.9999999999999997e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.376129  normal  0.234171 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5528  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.74 
 
 
509 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2787  AMP-dependent synthetase and ligase  36.61 
 
 
518 aa  300  3e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.296837  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6480  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.86 
 
 
513 aa  300  5e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3215  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.34 
 
 
500 aa  287  2.9999999999999996e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3166  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.82 
 
 
501 aa  285  2.0000000000000002e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130976  hitchhiker  0.0000354644 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3057  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.5 
 
 
499 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.847241  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1368  AMP-dependent synthetase and ligase  34.17 
 
 
515 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.663143  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6739  AMP-dependent synthetase and ligase  35.05 
 
 
532 aa  269  1e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0799452  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01193  acyl-CoA synthase  33.79 
 
 
544 aa  266  7e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0176178  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3855  AMP-dependent synthetase and ligase  35.43 
 
 
523 aa  265  1e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.713722 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6878  AMP-dependent synthetase and ligase  35.84 
 
 
509 aa  257  3e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615245  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4093  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.22 
 
 
497 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0327517  normal  0.151728 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3980  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.22 
 
 
497 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.310048  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1034  AMP-dependent synthetase and ligase  34.12 
 
 
495 aa  255  2.0000000000000002e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0102  AMP-dependent synthetase and ligase  35.27 
 
 
520 aa  253  7e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3247  AMP-dependent synthetase and ligase  34.85 
 
 
497 aa  247  4e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.640388 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4604  AMP-dependent synthetase and ligase  33.79 
 
 
492 aa  246  9e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.37521 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1666  AMP-dependent synthetase and ligase  32.67 
 
 
518 aa  244  3e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.144653  normal  0.373713 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1599  AMP-dependent synthetase and ligase  33.07 
 
 
484 aa  243  7.999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1029  AMP-dependent synthetase and ligase  33.86 
 
 
499 aa  243  7.999999999999999e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3514  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.46 
 
 
525 aa  242  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270509  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2038  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  30.66 
 
 
565 aa  236  8e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3704  AMP-dependent synthetase and ligase  31.65 
 
 
515 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0990866  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4103  AMP-dependent synthetase and ligase  33.79 
 
 
545 aa  234  3e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1025  AMP-dependent synthetase and ligase  34.21 
 
 
498 aa  234  3e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1600  AMP-dependent synthetase and ligase  32.09 
 
 
496 aa  233  4.0000000000000004e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1724  AMP-dependent synthetase and ligase  29.94 
 
 
515 aa  233  9e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0701995  normal  0.167784 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0943  AMP-dependent synthetase and ligase  33.53 
 
 
511 aa  231  2e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193061  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0351  AMP-dependent synthetase and ligase  33.14 
 
 
507 aa  230  5e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2089  AMP-dependent synthetase and ligase  33.72 
 
 
530 aa  229  7e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3600  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.31 
 
 
525 aa  228  2e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.887287  normal  0.975846 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2924  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.31 
 
 
526 aa  228  3e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.42655 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0027  AMP-dependent synthetase and ligase  32.7 
 
 
509 aa  226  6e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.141316  normal  0.236103 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1676  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.38 
 
 
526 aa  226  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.591328  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5309  AMP-dependent synthetase and ligase  31.65 
 
 
517 aa  224  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1964  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.71 
 
 
525 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132088  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1868  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.59 
 
 
525 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.205754 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  31.29 
 
 
525 aa  224  3e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>