More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3089 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3089  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  100 
 
 		 522 aa  1071    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.196285  normal  0.363977 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1481  AMP-dependent synthetase and ligase  61.13 
 
 		 525 aa  659    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3984  AMP-dependent synthetase and ligase  64.14 
 
 		 521 aa  664    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.446284  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2641  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  52.11 
 
 		 516 aa  553  1e-156  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.517138  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2838  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  51.92 
 
 		 515 aa  535  1e-150  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.153198 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6823  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase I  46.12 
 
 		 492 aa  436  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2707  AMP-dependent synthetase and ligase  44.9 
 
 		 519 aa  410  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0621527  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0570  AMP-dependent synthetase and ligase  43.95 
 
 		 525 aa  390  1e-107  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.356446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0848  AMP-dependent synthetase and ligase  43.08 
 
 		 517 aa  388  1e-106  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1465  acyl-CoA synthetase  42.25 
 
 		 487 aa  385  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.845905  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1905  AMP-dependent synthetase and ligase  42.33 
 
 		 512 aa  379  1e-104  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.97218  normal  0.26016 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.27 
 
 		 513 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1902  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.24 
 
 		 518 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.889055  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1681  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.88 
 
 		 514 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3266  AMP-dependent synthetase and ligase  42.05 
 
 		 511 aa  369  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2695  AMP-dependent synthetase and ligase  41.78 
 
 		 516 aa  366  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5310  acyl-CoA synthetase  41.67 
 
 		 516 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2397  AMP-dependent synthetase and ligase  41.76 
 
 		 516 aa  367  1e-100  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.264456  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4700  acyl-CoA synthetase  40.11 
 
 		 516 aa  363  3e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3612  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.42 
 
 		 514 aa  363  3e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0449  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.28 
 
 		 516 aa  363  4e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.93416 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3161  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.33 
 
 		 516 aa  363  6e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4410  acyl-CoA synthetase  39.39 
 
 		 516 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.648302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5158  putative o-succinylbenzoate-CoA ligase  41.46 
 
 		 527 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.20469 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1347  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.58 
 
 		 512 aa  357  2.9999999999999997e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1502  acyl-CoA synthetase  41.85 
 
 		 515 aa  357  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1525  acyl-CoA synthetase  41.85 
 
 		 515 aa  357  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1502  acyl-CoA synthetase  41.65 
 
 		 515 aa  355  8.999999999999999e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3605  acyl-CoA synthetase  40.23 
 
 		 514 aa  354  2e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.133038  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3597  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.55 
 
 		 543 aa  354  2.9999999999999997e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5528  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.38 
 
 		 509 aa  353  2.9999999999999997e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0912  AMP-dependent synthetase and ligase  40.58 
 
 		 515 aa  352  8e-96  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.881726 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0166  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.74 
 
 		 506 aa  352  1e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0681  acyl-CoA synthetase  41.49 
 
 		 520 aa  351  2e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.457647 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2927  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.2 
 
 		 509 aa  351  2e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.686689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7124  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.74 
 
 		 512 aa  350  3e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.100628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4737  acyl-CoA synthetase  42.72 
 
 		 501 aa  350  4e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.987006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4649  acyl-CoA synthetase  42.72 
 
 		 501 aa  350  4e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5032  acyl-CoA synthetase  42.72 
 
 		 501 aa  350  4e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.672582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0177  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.74 
 
 		 506 aa  350  5e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.761031  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0186  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.74 
 
 		 506 aa  350  5e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0230763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1871  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.13 
 
 		 524 aa  349  7e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.394568  normal  0.852293 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0218  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.05 
 
 		 516 aa  348  9e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0925378 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0804  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.2 
 
 		 516 aa  348  1e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.48042 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3057  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.36 
 
 		 499 aa  346  5e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.847241  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10216  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.3 
 
 		 537 aa  345  8e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3399  AMP-dependent synthetase and ligase  39.89 
 
 		 522 aa  344  2.9999999999999997e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3839  AMP-dependent synthetase and ligase  42.32 
 
 		 508 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0015  acyl-CoA synthetase  41.49 
 
 		 511 aa  341  2e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323665 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0221  AMP-dependent synthetase and ligase  39.92 
 
 		 510 aa  340  4e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2738  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.09 
 
 		 522 aa  339  7e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1967  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.24 
 
 		 514 aa  339  9e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.595404  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.25 
 
 		 512 aa  336  5e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1124  AMP-dependent synthetase and ligase  38.99 
 
 		 509 aa  335  1e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.719867  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2714  AMP-dependent synthetase and ligase  38.94 
 
 		 546 aa  332  9e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2787  AMP-dependent synthetase and ligase  40.08 
 
 		 518 aa  331  2e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.296837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0423  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.7 
 
 		 509 aa  330  3e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2936  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.37 
 
 		 536 aa  328  1.0000000000000001e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.098527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0696  AMP-dependent synthetase and ligase  38.43 
 
 		 521 aa  327  3e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3980  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.96 
 
 		 497 aa  327  4.0000000000000003e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.310048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3215  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.1 
 
 		 500 aa  327  4.0000000000000003e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4093  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.96 
 
 		 497 aa  327  4.0000000000000003e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0327517  normal  0.151728 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0282  AMP-dependent synthetase and ligase  39.62 
 
 		 492 aa  326  6e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.376129  normal  0.234171 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4161  acyl-CoA synthetase  40.12 
 
 		 517 aa  325  1e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3166  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.7 
 
 		 501 aa  320  3e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130976  hitchhiker  0.0000354644 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0121  AMP-dependent synthetase and ligase  39.07 
 
 		 522 aa  313  5.999999999999999e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0104  AMP-dependent synthetase and ligase  39.08 
 
 		 524 aa  311  2e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.256556 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6056  AMP-dependent synthetase and ligase  38.51 
 
 		 515 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1368  AMP-dependent synthetase and ligase  35.62 
 
 		 515 aa  299  1e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.663143  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6480  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.35 
 
 		 513 aa  291  2e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3874  AMP-dependent synthetase and ligase  36.11 
 
 		 510 aa  291  2e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0918503 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01193  acyl-CoA synthase  33.52 
 
 		 544 aa  274  3e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0176178  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6739  AMP-dependent synthetase and ligase  35.89 
 
 		 532 aa  259  1e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0799452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1964  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.47 
 
 		 525 aa  249  1e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132088  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3855  AMP-dependent synthetase and ligase  34.83 
 
 		 523 aa  243  6e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.713722 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3600  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.33 
 
 		 525 aa  242  1e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.887287  normal  0.975846 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1763  AMP-dependent synthetase and ligase  33.67 
 
 		 521 aa  241  2.9999999999999997e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.494407 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1666  AMP-dependent synthetase and ligase  33.86 
 
 		 518 aa  240  4e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.144653  normal  0.373713 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6878  AMP-dependent synthetase and ligase  34.69 
 
 		 509 aa  239  9e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1660  AMP-dependent synthetase and ligase  33.97 
 
 		 523 aa  238  2e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104845  normal  0.559317 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1868  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.86 
 
 		 525 aa  238  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.205754 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0102  AMP-dependent synthetase and ligase  34.04 
 
 		 520 aa  234  3e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3694  AMP-dependent synthetase and ligase  31.5 
 
 		 532 aa  231  2e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4604  AMP-dependent synthetase and ligase  34.12 
 
 		 492 aa  228  1e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.37521 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1034  AMP-dependent synthetase and ligase  32.16 
 
 		 495 aa  226  6e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5140  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.59 
 
 		 525 aa  226  6e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.24744  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3247  AMP-dependent synthetase and ligase  32.88 
 
 		 497 aa  226  6e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.640388 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1605  AMP-dependent synthetase and ligase  30.74 
 
 		 526 aa  226  7e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0943  AMP-dependent synthetase and ligase  32.41 
 
 		 511 aa  224  3e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3975  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.84 
 
 		 530 aa  224  4e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.251646  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5309  AMP-dependent synthetase and ligase  31.46 
 
 		 517 aa  222  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2924  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.66 
 
 		 526 aa  222  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.42655 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1025  AMP-dependent synthetase and ligase  32.09 
 
 		 498 aa  221  1.9999999999999999e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3514  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.04 
 
 		 525 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270509  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2038  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  31.71 
 
 		 565 aa  221  3e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1676  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.21 
 
 		 526 aa  221  3e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.591328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3704  AMP-dependent synthetase and ligase  31.71 
 
 		 515 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0990866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4096  AMP-dependent synthetase and ligase  32.38 
 
 		 508 aa  219  1e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0377217  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3565  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.46 
 
 		 526 aa  218  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.011282  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4612  AMP-dependent synthetase and ligase  32 
 
 		 511 aa  217  4e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>