More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2936 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2738  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  69.13 
 
 		 522 aa  721    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2936  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  100 
 
 		 536 aa  1101    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.098527  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1905  AMP-dependent synthetase and ligase  54.53 
 
 		 512 aa  545  1e-154  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.97218  normal  0.26016 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2397  AMP-dependent synthetase and ligase  52.72 
 
 		 516 aa  540  9.999999999999999e-153  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.264456  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0848  AMP-dependent synthetase and ligase  51.29 
 
 		 517 aa  525  1e-148  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3266  AMP-dependent synthetase and ligase  52.93 
 
 		 511 aa  520  1e-146  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3399  AMP-dependent synthetase and ligase  54.47 
 
 		 522 aa  518  1e-146  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2714  AMP-dependent synthetase and ligase  52.75 
 
 		 546 aa  515  1e-144  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5032  acyl-CoA synthetase  53.15 
 
 		 501 aa  512  1e-144  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.672582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4737  acyl-CoA synthetase  53.15 
 
 		 501 aa  509  1e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.987006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4649  acyl-CoA synthetase  53.15 
 
 		 501 aa  509  1e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2695  AMP-dependent synthetase and ligase  51.75 
 
 		 516 aa  505  9.999999999999999e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1124  AMP-dependent synthetase and ligase  50.98 
 
 		 509 aa  508  9.999999999999999e-143  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.719867  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0015  acyl-CoA synthetase  50.78 
 
 		 511 aa  495  1e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323665 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3605  acyl-CoA synthetase  50.8 
 
 		 514 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.133038  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1902  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.2 
 
 		 518 aa  479  1e-134  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.889055  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1681  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.3 
 
 		 514 aa  474  1e-132  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3612  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  49.9 
 
 		 514 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0681  acyl-CoA synthetase  48.55 
 
 		 520 aa  465  9.999999999999999e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.457647 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7124  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.5 
 
 		 512 aa  462  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.100628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3161  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.16 
 
 		 516 aa  458  9.999999999999999e-129  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0221  AMP-dependent synthetase and ligase  48.02 
 
 		 510 aa  460  9.999999999999999e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  49.9 
 
 		 513 aa  457  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4700  acyl-CoA synthetase  48.06 
 
 		 516 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4410  acyl-CoA synthetase  47.48 
 
 		 516 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.648302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0912  AMP-dependent synthetase and ligase  48.33 
 
 		 515 aa  454  1.0000000000000001e-126  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.881726 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1347  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.31 
 
 		 512 aa  452  1.0000000000000001e-126  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5310  acyl-CoA synthetase  48.45 
 
 		 516 aa  451  1e-125  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0166  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  46.88 
 
 		 506 aa  445  1e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0449  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.77 
 
 		 516 aa  443  1e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.93416 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0177  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  46.88 
 
 		 506 aa  444  1e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.761031  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0186  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  46.88 
 
 		 506 aa  444  1e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0230763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.13 
 
 		 512 aa  438  9.999999999999999e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5158  putative o-succinylbenzoate-CoA ligase  46.27 
 
 		 527 aa  436  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.20469 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0218  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.83 
 
 		 516 aa  431  1e-119  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0925378 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10216  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  46.32 
 
 		 537 aa  430  1e-119  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4161  acyl-CoA synthetase  47.01 
 
 		 517 aa  422  1e-117  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1502  acyl-CoA synthetase  45.79 
 
 		 515 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1525  acyl-CoA synthetase  45.79 
 
 		 515 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1502  acyl-CoA synthetase  45.4 
 
 		 515 aa  412  1e-114  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0104  AMP-dependent synthetase and ligase  45.64 
 
 		 524 aa  403  1e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.256556 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0696  AMP-dependent synthetase and ligase  46.88 
 
 		 521 aa  405  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6056  AMP-dependent synthetase and ligase  43.4 
 
 		 515 aa  395  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0121  AMP-dependent synthetase and ligase  45.9 
 
 		 522 aa  381  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2641  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.06 
 
 		 516 aa  373  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.517138  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2838  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.44 
 
 		 515 aa  359  8e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.153198 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3089  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.37 
 
 		 522 aa  331  2e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.196285  normal  0.363977 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6823  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase I  39.52 
 
 		 492 aa  326  8.000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3984  AMP-dependent synthetase and ligase  38.23 
 
 		 521 aa  325  9e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.446284  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0570  AMP-dependent synthetase and ligase  38.76 
 
 		 525 aa  323  4e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.356446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1465  acyl-CoA synthetase  40.94 
 
 		 487 aa  320  5e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.845905  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1481  AMP-dependent synthetase and ligase  39.39 
 
 		 525 aa  319  7.999999999999999e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2787  AMP-dependent synthetase and ligase  39.6 
 
 		 518 aa  306  6e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.296837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3839  AMP-dependent synthetase and ligase  39.84 
 
 		 508 aa  304  3.0000000000000004e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0804  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.24 
 
 		 516 aa  302  1e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.48042 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0423  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.99 
 
 		 509 aa  299  9e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0282  AMP-dependent synthetase and ligase  40.32 
 
 		 492 aa  297  3e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.376129  normal  0.234171 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3597  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.25 
 
 		 543 aa  295  1e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1871  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.4 
 
 		 524 aa  288  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.394568  normal  0.852293 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2927  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.95 
 
 		 509 aa  286  5e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.686689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3057  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.47 
 
 		 499 aa  284  3.0000000000000004e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.847241  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3166  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.68 
 
 		 501 aa  283  4.0000000000000003e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130976  hitchhiker  0.0000354644 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1967  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.39 
 
 		 514 aa  282  1e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.595404  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2707  AMP-dependent synthetase and ligase  36.63 
 
 		 519 aa  280  6e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0621527  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3215  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.17 
 
 		 500 aa  278  2e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6480  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.77 
 
 		 513 aa  276  8e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1368  AMP-dependent synthetase and ligase  36.4 
 
 		 515 aa  272  1e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.663143  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3874  AMP-dependent synthetase and ligase  35.53 
 
 		 510 aa  266  5e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0918503 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4093  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.6 
 
 		 497 aa  263  6e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0327517  normal  0.151728 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3980  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.6 
 
 		 497 aa  263  6e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.310048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3247  AMP-dependent synthetase and ligase  34.91 
 
 		 497 aa  254  4.0000000000000004e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.640388 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1029  AMP-dependent synthetase and ligase  33.67 
 
 		 499 aa  251  2e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5528  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.33 
 
 		 509 aa  249  8e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1034  AMP-dependent synthetase and ligase  33.27 
 
 		 495 aa  248  2e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4604  AMP-dependent synthetase and ligase  34.81 
 
 		 492 aa  241  2e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.37521 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6739  AMP-dependent synthetase and ligase  33.65 
 
 		 532 aa  239  8e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0799452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01193  acyl-CoA synthase  33.33 
 
 		 544 aa  239  8e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0176178  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0027  AMP-dependent synthetase and ligase  34.31 
 
 		 509 aa  238  2e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.141316  normal  0.236103 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6878  AMP-dependent synthetase and ligase  33.2 
 
 		 509 aa  238  3e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.09 
 
 		 514 aa  233  6e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4238  AMP-dependent synthetase and ligase  32.51 
 
 		 527 aa  231  3e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4096  AMP-dependent synthetase and ligase  34.26 
 
 		 508 aa  228  1e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0377217  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5309  AMP-dependent synthetase and ligase  33.58 
 
 		 517 aa  228  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1599  AMP-dependent synthetase and ligase  33.81 
 
 		 484 aa  228  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0943  AMP-dependent synthetase and ligase  34.44 
 
 		 511 aa  227  3e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2026  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.4 
 
 		 517 aa  226  8e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.342397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3565  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.9 
 
 		 526 aa  223  6e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.011282  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1600  AMP-dependent synthetase and ligase  30.47 
 
 		 496 aa  223  7e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2323  AMP-dependent synthetase and ligase  33.4 
 
 		 511 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.59 
 
 		 512 aa  220  3.9999999999999997e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6618  AMP-dependent synthetase and ligase  35.98 
 
 		 493 aa  219  7.999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6394  AMP-dependent synthetase and ligase  32.88 
 
 		 517 aa  219  8.999999999999998e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178832  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0351  AMP-dependent synthetase and ligase  33.4 
 
 		 507 aa  218  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  30.75 
 
 		 662 aa  218  1e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  32.7 
 
 		 525 aa  218  2e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  34.63 
 
 		 503 aa  218  2.9999999999999998e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3855  AMP-dependent synthetase and ligase  32.2 
 
 		 523 aa  217  5e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.713722 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0814  AMP-dependent synthetase and ligase  31.49 
 
 		 508 aa  217  5e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5140  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.87 
 
 		 525 aa  216  8e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.24744  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3514  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.47 
 
 		 525 aa  215  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270509  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>