More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4604 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4604  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 492 aa  992    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.37521 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1599  AMP-dependent synthetase and ligase  56.22 
 
 		 484 aa  530  1e-149  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1029  AMP-dependent synthetase and ligase  53.33 
 
 		 499 aa  522  1e-147  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1034  AMP-dependent synthetase and ligase  51.75 
 
 		 495 aa  508  9.999999999999999e-143  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3247  AMP-dependent synthetase and ligase  52.9 
 
 		 497 aa  502  1e-141  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.640388 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1600  AMP-dependent synthetase and ligase  50.62 
 
 		 496 aa  478  1e-134  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1112  putative acyl-CoA ligase  50.52 
 
 		 504 aa  444  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.29648 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1025  AMP-dependent synthetase and ligase  46.5 
 
 		 498 aa  422  1e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0252  AMP-dependent synthetase and ligase  49.46 
 
 		 484 aa  403  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.122402 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0419  AMP-dependent synthetase and ligase  46.27 
 
 		 492 aa  397  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0725647  normal  0.0451868 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0213  AMP-dependent synthetase and ligase  45.74 
 
 		 491 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.65945 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0223  AMP-dependent synthetase and ligase  45.95 
 
 		 491 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.803967  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0233  AMP-dependent synthetase and ligase  45.95 
 
 		 491 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.318189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0351  AMP-dependent synthetase and ligase  43.71 
 
 		 507 aa  374  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3099  AMP-dependent synthetase and ligase  36.69 
 
 		 513 aa  287  2e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000841335 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0614  AMP-dependent synthetase and ligase  38.43 
 
 		 502 aa  282  1e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6823  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase I  39.5 
 
 		 492 aa  278  1e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4026  AMP-dependent synthetase and ligase  40.04 
 
 		 487 aa  275  1.0000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.863411  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2695  AMP-dependent synthetase and ligase  37.91 
 
 		 516 aa  272  9e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0912  AMP-dependent synthetase and ligase  36.43 
 
 		 515 aa  270  2.9999999999999997e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.881726 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1465  acyl-CoA synthetase  40.61 
 
 		 487 aa  268  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.845905  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2738  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.2 
 
 		 522 aa  267  4e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3161  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.45 
 
 		 516 aa  265  2e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3597  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.62 
 
 		 543 aa  264  3e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4649  acyl-CoA synthetase  36.29 
 
 		 501 aa  264  3e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4737  acyl-CoA synthetase  36.29 
 
 		 501 aa  264  3e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.987006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0681  acyl-CoA synthetase  36.08 
 
 		 520 aa  263  6.999999999999999e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.457647 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.65 
 
 		 513 aa  262  8.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1347  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.5 
 
 		 512 aa  262  1e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5032  acyl-CoA synthetase  36.09 
 
 		 501 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.672582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0221  AMP-dependent synthetase and ligase  34.6 
 
 		 510 aa  259  7e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1681  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.12 
 
 		 514 aa  259  9e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0848  AMP-dependent synthetase and ligase  32.76 
 
 		 517 aa  258  2e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1905  AMP-dependent synthetase and ligase  35.91 
 
 		 512 aa  258  2e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.97218  normal  0.26016 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0015  acyl-CoA synthetase  36.38 
 
 		 511 aa  258  2e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323665 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3399  AMP-dependent synthetase and ligase  36.47 
 
 		 522 aa  256  5e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3605  acyl-CoA synthetase  34.42 
 
 		 514 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.133038  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5310  acyl-CoA synthetase  34.94 
 
 		 516 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2641  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.91 
 
 		 516 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.517138  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4700  acyl-CoA synthetase  34.42 
 
 		 516 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4410  acyl-CoA synthetase  34.56 
 
 		 516 aa  254  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.648302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2927  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.81 
 
 		 509 aa  253  8.000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.686689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1902  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.6 
 
 		 518 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.889055  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3612  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.68 
 
 		 514 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2714  AMP-dependent synthetase and ligase  37.7 
 
 		 546 aa  249  5e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6056  AMP-dependent synthetase and ligase  35.11 
 
 		 515 aa  249  6e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1502  acyl-CoA synthetase  34.12 
 
 		 515 aa  249  8e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1525  acyl-CoA synthetase  34.12 
 
 		 515 aa  249  8e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0218  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.76 
 
 		 516 aa  248  1e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0925378 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0449  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.38 
 
 		 516 aa  248  2e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.93416 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1871  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.8 
 
 		 524 aa  248  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.394568  normal  0.852293 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3266  AMP-dependent synthetase and ligase  36.2 
 
 		 511 aa  247  4e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7124  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.07 
 
 		 512 aa  247  4e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.100628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0166  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.46 
 
 		 506 aa  246  6e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1502  acyl-CoA synthetase  33.79 
 
 		 515 aa  246  8e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2838  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.51 
 
 		 515 aa  246  9e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.153198 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0177  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.46 
 
 		 506 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.761031  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0186  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.46 
 
 		 506 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0230763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1967  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.86 
 
 		 514 aa  243  7e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.595404  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2397  AMP-dependent synthetase and ligase  34.39 
 
 		 516 aa  242  1e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.264456  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10216  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.41 
 
 		 537 aa  241  2e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.59 
 
 		 512 aa  239  6.999999999999999e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4161  acyl-CoA synthetase  35.15 
 
 		 517 aa  239  6.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3166  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.88 
 
 		 501 aa  238  2e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130976  hitchhiker  0.0000354644 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2936  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.44 
 
 		 536 aa  236  5.0000000000000005e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.098527  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1124  AMP-dependent synthetase and ligase  35.86 
 
 		 509 aa  236  8e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.719867  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0804  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.27 
 
 		 516 aa  236  9e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.48042 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3984  AMP-dependent synthetase and ligase  35.54 
 
 		 521 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.446284  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5158  putative o-succinylbenzoate-CoA ligase  33.47 
 
 		 527 aa  233  5e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.20469 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0104  AMP-dependent synthetase and ligase  34.71 
 
 		 524 aa  233  5e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.256556 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3839  AMP-dependent synthetase and ligase  35.38 
 
 		 508 aa  231  3e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0423  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.35 
 
 		 509 aa  230  4e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0696  AMP-dependent synthetase and ligase  34.06 
 
 		 521 aa  230  4e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0570  AMP-dependent synthetase and ligase  33.2 
 
 		 525 aa  229  7e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.356446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3089  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.12 
 
 		 522 aa  228  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.196285  normal  0.363977 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3057  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.06 
 
 		 499 aa  222  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.847241  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0121  AMP-dependent synthetase and ligase  40.62 
 
 		 522 aa  216  5e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1666  AMP-dependent synthetase and ligase  31.03 
 
 		 518 aa  212  1e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.144653  normal  0.373713 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3215  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.9 
 
 		 500 aa  211  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3980  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.52 
 
 		 497 aa  211  3e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.310048  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4093  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.52 
 
 		 497 aa  211  3e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0327517  normal  0.151728 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3874  AMP-dependent synthetase and ligase  32.79 
 
 		 510 aa  210  5e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0918503 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0943  AMP-dependent synthetase and ligase  34.67 
 
 		 511 aa  209  9e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0282  AMP-dependent synthetase and ligase  35.23 
 
 		 492 aa  208  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.376129  normal  0.234171 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0861  AMP-dependent synthetase and ligase  32.41 
 
 		 514 aa  206  9e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10274  acyl-CoA synthetase  30.91 
 
 		 560 aa  206  9e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0406036 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1481  AMP-dependent synthetase and ligase  39.03 
 
 		 525 aa  204  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01193  acyl-CoA synthase  31.6 
 
 		 544 aa  204  4e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0176178  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1368  AMP-dependent synthetase and ligase  31.23 
 
 		 515 aa  202  8e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.663143  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  32.81 
 
 		 520 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1350  AMP-dependent synthetase and ligase  31.51 
 
 		 507 aa  201  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.191133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4908  AMP-dependent synthetase and ligase  30.64 
 
 		 512 aa  201  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.96823  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2787  AMP-dependent synthetase and ligase  33.06 
 
 		 518 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.296837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4081  AMP-dependent synthetase and ligase  30.62 
 
 		 512 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5528  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30 
 
 		 509 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2323  AMP-dependent synthetase and ligase  33.27 
 
 		 511 aa  197  3e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2707  AMP-dependent synthetase and ligase  32.27 
 
 		 519 aa  196  6e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0621527  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0027  AMP-dependent synthetase and ligase  34.67 
 
 		 509 aa  196  7e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.141316  normal  0.236103 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0341  acyl-CoA synthetase  29.18 
 
 		 569 aa  193  6e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0397  acyl-CoA synthetase  28.4 
 
 		 564 aa  193  6e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.835434  normal  0.950858 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>