More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1368 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1368  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 515 aa  1070    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.663143  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01193  acyl-CoA synthase  58.03 
 
 		 544 aa  624  1e-177  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0176178  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5528  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.75 
 
 		 509 aa  384  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1871  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.19 
 
 		 524 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.394568  normal  0.852293 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3057  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.72 
 
 		 499 aa  370  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.847241  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3597  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.38 
 
 		 543 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0804  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.29 
 
 		 516 aa  368  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.48042 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2927  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.95 
 
 		 509 aa  367  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.686689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1967  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.01 
 
 		 514 aa  365  1e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.595404  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3874  AMP-dependent synthetase and ligase  39.96 
 
 		 510 aa  365  1e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0918503 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3166  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41 
 
 		 501 aa  363  4e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130976  hitchhiker  0.0000354644 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3839  AMP-dependent synthetase and ligase  39.96 
 
 		 508 aa  363  5.0000000000000005e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3215  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.6 
 
 		 500 aa  361  2e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0423  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.55 
 
 		 509 aa  360  3e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4093  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39 
 
 		 497 aa  358  9.999999999999999e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0327517  normal  0.151728 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3980  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39 
 
 		 497 aa  358  9.999999999999999e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.310048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6480  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.91 
 
 		 513 aa  329  8e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0282  AMP-dependent synthetase and ligase  35.33 
 
 		 492 aa  317  5e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.376129  normal  0.234171 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0449  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.77 
 
 		 516 aa  313  6.999999999999999e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.93416 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10216  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.42 
 
 		 537 aa  312  1e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0218  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.33 
 
 		 516 aa  311  2e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0925378 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0166  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.7 
 
 		 506 aa  303  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3161  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.15 
 
 		 516 aa  302  9e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0177  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.13 
 
 		 506 aa  302  9e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.761031  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0186  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.13 
 
 		 506 aa  302  9e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0230763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.2 
 
 		 512 aa  301  2e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2695  AMP-dependent synthetase and ligase  37.98 
 
 		 516 aa  301  3e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6823  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase I  35.05 
 
 		 492 aa  300  5e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.88 
 
 		 513 aa  299  6e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3089  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.62 
 
 		 522 aa  299  1e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.196285  normal  0.363977 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1681  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.34 
 
 		 514 aa  295  1e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5310  acyl-CoA synthetase  36.45 
 
 		 516 aa  295  1e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4700  acyl-CoA synthetase  36.82 
 
 		 516 aa  294  2e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2641  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.48 
 
 		 516 aa  293  6e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.517138  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4410  acyl-CoA synthetase  35.45 
 
 		 516 aa  288  1e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.648302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0681  acyl-CoA synthetase  35.09 
 
 		 520 aa  286  8e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.457647 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3612  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.05 
 
 		 514 aa  286  8e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2397  AMP-dependent synthetase and ligase  36.29 
 
 		 516 aa  284  2.0000000000000002e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.264456  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5158  putative o-succinylbenzoate-CoA ligase  34.87 
 
 		 527 aa  285  2.0000000000000002e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.20469 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1902  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.92 
 
 		 518 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.889055  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4161  acyl-CoA synthetase  34.04 
 
 		 517 aa  284  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1465  acyl-CoA synthetase  34.24 
 
 		 487 aa  284  3.0000000000000004e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.845905  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1481  AMP-dependent synthetase and ligase  33.66 
 
 		 525 aa  283  8.000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0015  acyl-CoA synthetase  35.01 
 
 		 511 aa  280  3e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323665 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5032  acyl-CoA synthetase  36.22 
 
 		 501 aa  280  4e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.672582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0848  AMP-dependent synthetase and ligase  33.53 
 
 		 517 aa  280  6e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2707  AMP-dependent synthetase and ligase  34.11 
 
 		 519 aa  278  2e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0621527  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1347  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.53 
 
 		 512 aa  278  2e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4649  acyl-CoA synthetase  35.85 
 
 		 501 aa  277  3e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4737  acyl-CoA synthetase  35.85 
 
 		 501 aa  277  3e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.987006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3984  AMP-dependent synthetase and ligase  33.71 
 
 		 521 aa  277  4e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.446284  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7124  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.92 
 
 		 512 aa  276  6e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.100628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1502  acyl-CoA synthetase  34.58 
 
 		 515 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1525  acyl-CoA synthetase  34.58 
 
 		 515 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1502  acyl-CoA synthetase  34.17 
 
 		 515 aa  273  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3399  AMP-dependent synthetase and ligase  34.76 
 
 		 522 aa  273  4.0000000000000004e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2838  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.44 
 
 		 515 aa  273  7e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.153198 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2787  AMP-dependent synthetase and ligase  33.4 
 
 		 518 aa  273  7e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.296837  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0912  AMP-dependent synthetase and ligase  33.85 
 
 		 515 aa  271  2e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.881726 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0221  AMP-dependent synthetase and ligase  32.75 
 
 		 510 aa  268  2e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1124  AMP-dependent synthetase and ligase  34.64 
 
 		 509 aa  267  4e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.719867  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2936  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.02 
 
 		 536 aa  266  5e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.098527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0696  AMP-dependent synthetase and ligase  34.04 
 
 		 521 aa  265  1e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1905  AMP-dependent synthetase and ligase  32.7 
 
 		 512 aa  263  6e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.97218  normal  0.26016 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2714  AMP-dependent synthetase and ligase  34.88 
 
 		 546 aa  263  8e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0104  AMP-dependent synthetase and ligase  33.53 
 
 		 524 aa  262  1e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.256556 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2738  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.53 
 
 		 522 aa  258  2e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3605  acyl-CoA synthetase  31.33 
 
 		 514 aa  257  3e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.133038  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0570  AMP-dependent synthetase and ligase  32.14 
 
 		 525 aa  257  4e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.356446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0121  AMP-dependent synthetase and ligase  33.98 
 
 		 522 aa  253  7e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3266  AMP-dependent synthetase and ligase  32.88 
 
 		 511 aa  243  6e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1034  AMP-dependent synthetase and ligase  34.18 
 
 		 495 aa  234  2.0000000000000002e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2987  AMP-dependent synthetase and ligase  30.08 
 
 		 534 aa  226  1e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.734432  normal  0.0264415 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4817  AMP-dependent synthetase and ligase  30.02 
 
 		 541 aa  226  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6739  AMP-dependent synthetase and ligase  30.66 
 
 		 532 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0799452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1029  AMP-dependent synthetase and ligase  32.34 
 
 		 499 aa  223  8e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1112  putative acyl-CoA ligase  33.4 
 
 		 504 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.29648 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  32.42 
 
 		 499 aa  217  2.9999999999999998e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3855  AMP-dependent synthetase and ligase  29.82 
 
 		 523 aa  217  4e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.713722 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6878  AMP-dependent synthetase and ligase  29.15 
 
 		 509 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6056  AMP-dependent synthetase and ligase  29.13 
 
 		 515 aa  216  9e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1599  AMP-dependent synthetase and ligase  31.91 
 
 		 484 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1600  AMP-dependent synthetase and ligase  31.16 
 
 		 496 aa  212  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13440  acyl-CoA synthetase  30.22 
 
 		 539 aa  209  9e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0223  AMP-dependent synthetase and ligase  30.99 
 
 		 491 aa  208  2e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.803967  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  30.78 
 
 		 521 aa  208  2e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0233  AMP-dependent synthetase and ligase  30.99 
 
 		 491 aa  208  2e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.318189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1025  AMP-dependent synthetase and ligase  30.62 
 
 		 498 aa  207  3e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3694  AMP-dependent synthetase and ligase  29.46 
 
 		 532 aa  207  3e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0252  AMP-dependent synthetase and ligase  30.97 
 
 		 484 aa  207  5e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.122402 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0213  AMP-dependent synthetase and ligase  31.13 
 
 		 491 aa  205  1e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.65945 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0051  AMP-dependent synthetase and ligase  28.97 
 
 		 546 aa  205  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256371 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0851  acyl-CoA synthetase  29.5 
 
 		 504 aa  204  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0227528 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0419  AMP-dependent synthetase and ligase  31.89 
 
 		 492 aa  204  3e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0725647  normal  0.0451868 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1225  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.89 
 
 		 519 aa  204  4e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.399435  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4604  AMP-dependent synthetase and ligase  31.23 
 
 		 492 aa  202  8e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.37521 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3247  AMP-dependent synthetase and ligase  29.27 
 
 		 497 aa  202  9e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.640388 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3770  acyl-CoA synthetase  30.02 
 
 		 548 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3758  acyl-CoA synthetase  30.02 
 
 		 548 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102214  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3831  acyl-CoA synthetase  30.02 
 
 		 548 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.948087  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>