More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0614 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4026  AMP-dependent synthetase and ligase  75.05 
 
 		 487 aa  729    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.863411  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0614  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 502 aa  1005    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0252  AMP-dependent synthetase and ligase  39.66 
 
 		 484 aa  290  4e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.122402 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1112  putative acyl-CoA ligase  38.93 
 
 		 504 aa  288  1e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.29648 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4604  AMP-dependent synthetase and ligase  38.86 
 
 		 492 aa  286  5.999999999999999e-76  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.37521 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1599  AMP-dependent synthetase and ligase  39.48 
 
 		 484 aa  284  2.0000000000000002e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0419  AMP-dependent synthetase and ligase  37.45 
 
 		 492 aa  281  1e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0725647  normal  0.0451868 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1029  AMP-dependent synthetase and ligase  37.63 
 
 		 499 aa  281  2e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1034  AMP-dependent synthetase and ligase  37.04 
 
 		 495 aa  278  1e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3099  AMP-dependent synthetase and ligase  32.19 
 
 		 513 aa  275  1.0000000000000001e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000841335 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0351  AMP-dependent synthetase and ligase  37.39 
 
 		 507 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3247  AMP-dependent synthetase and ligase  37.71 
 
 		 497 aa  273  6e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.640388 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0213  AMP-dependent synthetase and ligase  38.19 
 
 		 491 aa  271  2e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.65945 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0223  AMP-dependent synthetase and ligase  37.73 
 
 		 491 aa  266  5.999999999999999e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.803967  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0233  AMP-dependent synthetase and ligase  37.73 
 
 		 491 aa  266  5.999999999999999e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.318189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1600  AMP-dependent synthetase and ligase  36.8 
 
 		 496 aa  259  1e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1025  AMP-dependent synthetase and ligase  36.09 
 
 		 498 aa  232  1e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1488  AMP-dependent synthetase and ligase  32.73 
 
 		 525 aa  224  3e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0982209  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1865  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.25 
 
 		 519 aa  223  4.9999999999999996e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.975513  normal  0.637576 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1905  AMP-dependent synthetase and ligase  33.01 
 
 		 512 aa  223  9e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.97218  normal  0.26016 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1465  acyl-CoA synthetase  33.91 
 
 		 487 aa  222  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.845905  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3266  AMP-dependent synthetase and ligase  33.96 
 
 		 511 aa  220  3.9999999999999997e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.87 
 
 		 512 aa  220  5e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3839  AMP-dependent synthetase and ligase  34.41 
 
 		 508 aa  218  1e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0282  AMP-dependent synthetase and ligase  34.73 
 
 		 492 aa  218  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.376129  normal  0.234171 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1211  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.92 
 
 		 527 aa  217  5e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.21 
 
 		 514 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3215  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.47 
 
 		 500 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2695  AMP-dependent synthetase and ligase  33.47 
 
 		 516 aa  213  4.9999999999999996e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1902  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.14 
 
 		 518 aa  213  5.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.889055  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2714  AMP-dependent synthetase and ligase  34.09 
 
 		 546 aa  212  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3597  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32 
 
 		 543 aa  211  3e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6823  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase I  31.13 
 
 		 492 aa  210  4e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0015  acyl-CoA synthetase  34.02 
 
 		 511 aa  210  6e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323665 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2927  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.55 
 
 		 509 aa  209  8e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.686689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2323  AMP-dependent synthetase and ligase  32.37 
 
 		 511 aa  209  1e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2738  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.2 
 
 		 522 aa  209  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0154  AMP-dependent synthetase and ligase  33.4 
 
 		 520 aa  207  3e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2105  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.23 
 
 		 524 aa  207  3e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.81 
 
 		 513 aa  207  5e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1225  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.03 
 
 		 519 aa  205  2e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.399435  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3975  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.03 
 
 		 530 aa  204  3e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.251646  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5309  AMP-dependent synthetase and ligase  32.64 
 
 		 517 aa  203  6e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0027  AMP-dependent synthetase and ligase  31.92 
 
 		 509 aa  203  6e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.141316  normal  0.236103 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1871  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.02 
 
 		 524 aa  203  6e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.394568  normal  0.852293 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4008  AMP-dependent synthetase and ligase  31.43 
 
 		 1043 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3855  AMP-dependent synthetase and ligase  31.45 
 
 		 523 aa  202  9.999999999999999e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.713722 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0861  AMP-dependent synthetase and ligase  30.38 
 
 		 514 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3057  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.52 
 
 		 499 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.847241  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4649  acyl-CoA synthetase  32.87 
 
 		 501 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7124  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.66 
 
 		 512 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.100628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4737  acyl-CoA synthetase  32.87 
 
 		 501 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.987006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5032  acyl-CoA synthetase  32.61 
 
 		 501 aa  201  3e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.672582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0102  AMP-dependent synthetase and ligase  31.03 
 
 		 520 aa  201  3e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5310  acyl-CoA synthetase  31.48 
 
 		 516 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3166  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.87 
 
 		 501 aa  200  3.9999999999999996e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130976  hitchhiker  0.0000354644 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2641  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.97 
 
 		 516 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.517138  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4161  acyl-CoA synthetase  37.39 
 
 		 517 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0423  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.25 
 
 		 509 aa  198  2.0000000000000003e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0218  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.69 
 
 		 516 aa  198  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0925378 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3565  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.43 
 
 		 526 aa  197  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.011282  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  29.15 
 
 		 499 aa  197  3e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1868  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.27 
 
 		 525 aa  197  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.205754 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1159  O-succinylbenzoate-CoA ligase  34.18 
 
 		 486 aa  197  3e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498459  hitchhiker  0.000208098 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2924  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.77 
 
 		 526 aa  197  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.42655 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1967  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.02 
 
 		 514 aa  197  3e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.595404  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3980  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.86 
 
 		 497 aa  197  4.0000000000000005e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.310048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3161  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30 
 
 		 516 aa  197  4.0000000000000005e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1133  AMP-dependent synthetase and ligase  30.54 
 
 		 518 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.508244  normal  0.50206 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4093  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.86 
 
 		 497 aa  197  4.0000000000000005e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0327517  normal  0.151728 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1666  AMP-dependent synthetase and ligase  29.25 
 
 		 518 aa  197  4.0000000000000005e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.144653  normal  0.373713 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0166  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.3 
 
 		 506 aa  197  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4410  acyl-CoA synthetase  30.96 
 
 		 516 aa  197  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.648302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1964  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.56 
 
 		 525 aa  196  6e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132088  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  29.9 
 
 		 525 aa  196  6e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5140  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.45 
 
 		 525 aa  196  7e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.24744  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6739  AMP-dependent synthetase and ligase  32.87 
 
 		 532 aa  196  9e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0799452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3720  AMP-dependent synthetase and ligase  32.71 
 
 		 518 aa  196  9e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.189603  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3984  AMP-dependent synthetase and ligase  39.67 
 
 		 521 aa  195  1e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.446284  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0912  AMP-dependent synthetase and ligase  37.1 
 
 		 515 aa  195  1e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.881726 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  28.63 
 
 		 520 aa  195  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3600  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.65 
 
 		 525 aa  195  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.887287  normal  0.975846 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1660  AMP-dependent synthetase and ligase  30.27 
 
 		 523 aa  195  2e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104845  normal  0.559317 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0177  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.11 
 
 		 506 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.761031  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0186  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.11 
 
 		 506 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0230763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0449  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.24 
 
 		 516 aa  194  3e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.93416 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1095  AMP-dependent synthetase and ligase  31.85 
 
 		 518 aa  193  5e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.997125 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1515  AMP-dependent synthetase and ligase  33.88 
 
 		 515 aa  193  6e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00288915  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1538  AMP-dependent synthetase and ligase  33.88 
 
 		 515 aa  193  6e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1367  AMP-dependent synthetase and ligase  32.99 
 
 		 502 aa  193  7e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.439129  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0661  AMP-binding enzyme family protein  29.1 
 
 		 520 aa  192  9e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.93 
 
 		 512 aa  192  1e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3767  AMP-dependent synthetase and ligase  31.98 
 
 		 512 aa  191  2e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0143855  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1681  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.5 
 
 		 514 aa  192  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4080  AMP-dependent synthetase and ligase  31.95 
 
 		 518 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.656205  normal  0.161644 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0943  AMP-dependent synthetase and ligase  31.7 
 
 		 511 aa  191  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3816  AMP-dependent synthetase and ligase  32.78 
 
 		 518 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0163789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2525  AMP-dependent synthetase and ligase  29.96 
 
 		 516 aa  191  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.695888 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  32.14 
 
 		 503 aa  190  4e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4902  AMP-dependent synthetase and ligase  33.06 
 
 		 501 aa  190  5.999999999999999e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>