More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_4161 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10216  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  72.18 
 
 
537 aa  769    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0449  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  70.02 
 
 
516 aa  744    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.93416 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0166  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  71.2 
 
 
506 aa  748    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0177  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  71.01 
 
 
506 aa  746    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.761031  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4161  acyl-CoA synthetase  100 
 
 
517 aa  1058    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0186  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  71.01 
 
 
506 aa  746    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0230763  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0218  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  70.6 
 
 
516 aa  752    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0925378 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1905  AMP-dependent synthetase and ligase  55 
 
 
512 aa  537  1e-151  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.97218  normal  0.26016 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3266  AMP-dependent synthetase and ligase  53.28 
 
 
511 aa  519  1e-146  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3161  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  52.23 
 
 
516 aa  503  1e-141  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0912  AMP-dependent synthetase and ligase  52.71 
 
 
515 aa  493  9.999999999999999e-139  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.881726 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0848  AMP-dependent synthetase and ligase  49.5 
 
 
517 aa  494  9.999999999999999e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1902  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  49.8 
 
 
518 aa  490  1e-137  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.889055  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1681  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  49.5 
 
 
514 aa  488  1e-137  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0221  AMP-dependent synthetase and ligase  50.4 
 
 
510 aa  489  1e-137  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  49.2 
 
 
513 aa  483  1e-135  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1347  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.31 
 
 
512 aa  480  1e-134  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3612  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.3 
 
 
514 aa  477  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.2 
 
 
512 aa  477  1e-133  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2695  AMP-dependent synthetase and ligase  48.91 
 
 
516 aa  469  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7124  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.54 
 
 
512 aa  466  9.999999999999999e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.100628  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0681  acyl-CoA synthetase  48.7 
 
 
520 aa  464  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.457647 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2738  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.5 
 
 
522 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2714  AMP-dependent synthetase and ligase  49 
 
 
546 aa  456  1e-127  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4700  acyl-CoA synthetase  47.59 
 
 
516 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3399  AMP-dependent synthetase and ligase  51.2 
 
 
522 aa  455  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2397  AMP-dependent synthetase and ligase  46.71 
 
 
516 aa  453  1.0000000000000001e-126  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.264456  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3605  acyl-CoA synthetase  46.28 
 
 
514 aa  449  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.133038  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5310  acyl-CoA synthetase  46.98 
 
 
516 aa  442  1e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1502  acyl-CoA synthetase  45.15 
 
 
515 aa  441  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4410  acyl-CoA synthetase  46.37 
 
 
516 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.648302  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1502  acyl-CoA synthetase  44.95 
 
 
515 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1525  acyl-CoA synthetase  44.95 
 
 
515 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0015  acyl-CoA synthetase  47.69 
 
 
511 aa  435  1e-121  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.323665 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5032  acyl-CoA synthetase  48 
 
 
501 aa  435  1e-120  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.672582  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4649  acyl-CoA synthetase  47.6 
 
 
501 aa  431  1e-119  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4737  acyl-CoA synthetase  47.6 
 
 
501 aa  431  1e-119  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.987006  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1124  AMP-dependent synthetase and ligase  47.69 
 
 
509 aa  429  1e-119  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.719867  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2936  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.41 
 
 
536 aa  427  1e-118  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.098527  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5158  putative o-succinylbenzoate-CoA ligase  44.89 
 
 
527 aa  424  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.20469 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6056  AMP-dependent synthetase and ligase  43.65 
 
 
515 aa  399  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0104  AMP-dependent synthetase and ligase  43.98 
 
 
524 aa  393  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.256556 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0121  AMP-dependent synthetase and ligase  44.7 
 
 
522 aa  386  1e-106  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0696  AMP-dependent synthetase and ligase  42.91 
 
 
521 aa  378  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2641  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.94 
 
 
516 aa  370  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.517138  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3984  AMP-dependent synthetase and ligase  42.54 
 
 
521 aa  359  8e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.446284  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2838  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.22 
 
 
515 aa  357  2.9999999999999997e-97  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.153198 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1481  AMP-dependent synthetase and ligase  42.4 
 
 
525 aa  352  1e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6823  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase I  41.04 
 
 
492 aa  349  6e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1465  acyl-CoA synthetase  42.28 
 
 
487 aa  348  2e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.845905  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3839  AMP-dependent synthetase and ligase  42.25 
 
 
508 aa  340  4e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2707  AMP-dependent synthetase and ligase  41.08 
 
 
519 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0621527  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0804  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.8 
 
 
516 aa  335  1e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.48042 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3089  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.64 
 
 
522 aa  333  3e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.196285  normal  0.363977 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3874  AMP-dependent synthetase and ligase  38.87 
 
 
510 aa  333  6e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0918503 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3057  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.31 
 
 
499 aa  323  5e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.847241  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2787  AMP-dependent synthetase and ligase  39 
 
 
518 aa  321  1.9999999999999998e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.296837  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3980  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.13 
 
 
497 aa  317  3e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.310048  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4093  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.13 
 
 
497 aa  317  3e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0327517  normal  0.151728 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3597  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.85 
 
 
543 aa  316  6e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3215  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40 
 
 
500 aa  316  6e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3166  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.5 
 
 
501 aa  316  7e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130976  hitchhiker  0.0000354644 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1871  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.1 
 
 
524 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.394568  normal  0.852293 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0282  AMP-dependent synthetase and ligase  40.9 
 
 
492 aa  310  2.9999999999999997e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.376129  normal  0.234171 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2927  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.57 
 
 
509 aa  309  9e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.686689  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0423  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.57 
 
 
509 aa  305  1.0000000000000001e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1967  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.7 
 
 
514 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.595404  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0570  AMP-dependent synthetase and ligase  38.76 
 
 
525 aa  304  2.0000000000000002e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.356446  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5528  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.56 
 
 
509 aa  298  2e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1368  AMP-dependent synthetase and ligase  34.6 
 
 
515 aa  291  1e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.663143  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1034  AMP-dependent synthetase and ligase  36.71 
 
 
495 aa  274  3e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1600  AMP-dependent synthetase and ligase  37.14 
 
 
496 aa  268  2e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01193  acyl-CoA synthase  34.96 
 
 
544 aa  267  2.9999999999999995e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0176178  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6480  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.85 
 
 
513 aa  266  5.999999999999999e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3247  AMP-dependent synthetase and ligase  37.5 
 
 
497 aa  263  4.999999999999999e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.640388 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1029  AMP-dependent synthetase and ligase  35.53 
 
 
499 aa  258  1e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1025  AMP-dependent synthetase and ligase  33.13 
 
 
498 aa  246  8e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4604  AMP-dependent synthetase and ligase  35.98 
 
 
492 aa  244  3e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.37521 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1599  AMP-dependent synthetase and ligase  35.54 
 
 
484 aa  240  5e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6878  AMP-dependent synthetase and ligase  34.55 
 
 
509 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615245  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0943  AMP-dependent synthetase and ligase  35.35 
 
 
511 aa  238  2e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193061  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1666  AMP-dependent synthetase and ligase  31.38 
 
 
518 aa  237  3e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.144653  normal  0.373713 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3694  AMP-dependent synthetase and ligase  33 
 
 
532 aa  236  9e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178139  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10274  acyl-CoA synthetase  32.82 
 
 
560 aa  236  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0406036 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0351  AMP-dependent synthetase and ligase  36.04 
 
 
507 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1112  putative acyl-CoA ligase  35.7 
 
 
504 aa  228  2e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.29648 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2323  AMP-dependent synthetase and ligase  33.87 
 
 
511 aa  228  3e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13440  acyl-CoA synthetase  32.65 
 
 
539 aa  227  4e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6739  AMP-dependent synthetase and ligase  33.72 
 
 
532 aa  226  6e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0799452  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  32.36 
 
 
512 aa  226  7e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0341  acyl-CoA synthetase  32.92 
 
 
569 aa  226  8e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  32.94 
 
 
521 aa  225  1e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1865  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.73 
 
 
519 aa  224  2e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.975513  normal  0.637576 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0734  AMP-dependent synthetase and ligase  32.67 
 
 
511 aa  223  7e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0350  acyl-CoA synthetase  31.55 
 
 
574 aa  221  3e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1605  AMP-dependent synthetase and ligase  31.68 
 
 
526 aa  220  5e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4103  AMP-dependent synthetase and ligase  32.72 
 
 
545 aa  220  6e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1868  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.19 
 
 
525 aa  219  7e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.205754 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3855  AMP-dependent synthetase and ligase  33.47 
 
 
523 aa  219  8.999999999999998e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.713722 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4616  AMP-dependent synthetase and ligase  30.77 
 
 
518 aa  219  1e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.892742  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>