More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1112 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1112  putative acyl-CoA ligase  100 
 
 		 504 aa  1029    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.29648 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1025  AMP-dependent synthetase and ligase  49.59 
 
 		 498 aa  463  1e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4604  AMP-dependent synthetase and ligase  50.52 
 
 		 492 aa  460  9.999999999999999e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.37521 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1034  AMP-dependent synthetase and ligase  48.45 
 
 		 495 aa  457  1e-127  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1599  AMP-dependent synthetase and ligase  50.1 
 
 		 484 aa  455  1e-127  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3247  AMP-dependent synthetase and ligase  50.62 
 
 		 497 aa  451  1e-125  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.640388 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1029  AMP-dependent synthetase and ligase  46.6 
 
 		 499 aa  448  1.0000000000000001e-124  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1600  AMP-dependent synthetase and ligase  48.77 
 
 		 496 aa  442  1e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0213  AMP-dependent synthetase and ligase  44.37 
 
 		 491 aa  359  5e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.65945 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0223  AMP-dependent synthetase and ligase  44.37 
 
 		 491 aa  358  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.803967  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0252  AMP-dependent synthetase and ligase  44.81 
 
 		 484 aa  357  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.122402 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0233  AMP-dependent synthetase and ligase  44.37 
 
 		 491 aa  358  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.318189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0419  AMP-dependent synthetase and ligase  43.34 
 
 		 492 aa  353  5e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0725647  normal  0.0451868 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0351  AMP-dependent synthetase and ligase  42.43 
 
 		 507 aa  332  7.000000000000001e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0614  AMP-dependent synthetase and ligase  38.6 
 
 		 502 aa  300  4e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4026  AMP-dependent synthetase and ligase  38.27 
 
 		 487 aa  278  2e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.863411  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1465  acyl-CoA synthetase  37.71 
 
 		 487 aa  276  4e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.845905  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0912  AMP-dependent synthetase and ligase  35.27 
 
 		 515 aa  269  1e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.881726 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1347  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.26 
 
 		 512 aa  266  8e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2714  AMP-dependent synthetase and ligase  35.73 
 
 		 546 aa  264  4e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3099  AMP-dependent synthetase and ligase  36.32 
 
 		 513 aa  263  6.999999999999999e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000841335 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10216  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.01 
 
 		 537 aa  263  8e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0218  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.58 
 
 		 516 aa  262  8.999999999999999e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0925378 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3605  acyl-CoA synthetase  34.12 
 
 		 514 aa  259  6e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.133038  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0166  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.02 
 
 		 506 aa  258  1e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0177  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.02 
 
 		 506 aa  258  2e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.761031  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0186  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.02 
 
 		 506 aa  258  2e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0230763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1681  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.52 
 
 		 514 aa  258  3e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7124  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.79 
 
 		 512 aa  257  3e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.100628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3612  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.38 
 
 		 514 aa  256  7e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1871  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.76 
 
 		 524 aa  256  9e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.394568  normal  0.852293 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0848  AMP-dependent synthetase and ligase  34.89 
 
 		 517 aa  255  1.0000000000000001e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1902  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.93 
 
 		 518 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.889055  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0449  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.2 
 
 		 516 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.93416 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2738  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.29 
 
 		 522 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.73 
 
 		 512 aa  253  6e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3161  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.71 
 
 		 516 aa  253  7e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1905  AMP-dependent synthetase and ligase  34.06 
 
 		 512 aa  251  2e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.97218  normal  0.26016 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2695  AMP-dependent synthetase and ligase  34.56 
 
 		 516 aa  250  5e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2927  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.33 
 
 		 509 aa  249  7e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.686689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3597  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.52 
 
 		 543 aa  248  2e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1967  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.19 
 
 		 514 aa  248  3e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.595404  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.27 
 
 		 513 aa  247  3e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0804  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.91 
 
 		 516 aa  244  1.9999999999999999e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.48042 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3399  AMP-dependent synthetase and ligase  35.26 
 
 		 522 aa  243  3.9999999999999997e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3266  AMP-dependent synthetase and ligase  33.86 
 
 		 511 aa  244  3.9999999999999997e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2641  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.3 
 
 		 516 aa  240  5e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.517138  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0221  AMP-dependent synthetase and ligase  34.24 
 
 		 510 aa  238  2e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4161  acyl-CoA synthetase  35.5 
 
 		 517 aa  238  2e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1502  acyl-CoA synthetase  32.93 
 
 		 515 aa  235  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0423  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.74 
 
 		 509 aa  234  2.0000000000000002e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1502  acyl-CoA synthetase  33 
 
 		 515 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1525  acyl-CoA synthetase  33 
 
 		 515 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0121  AMP-dependent synthetase and ligase  34.7 
 
 		 522 aa  234  4.0000000000000004e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3839  AMP-dependent synthetase and ligase  34.62 
 
 		 508 aa  233  7.000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0282  AMP-dependent synthetase and ligase  36.04 
 
 		 492 aa  233  9e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.376129  normal  0.234171 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3874  AMP-dependent synthetase and ligase  32.43 
 
 		 510 aa  231  3e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0918503 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0015  acyl-CoA synthetase  32.42 
 
 		 511 aa  230  5e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323665 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2838  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.92 
 
 		 515 aa  229  1e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.153198 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0104  AMP-dependent synthetase and ligase  33.87 
 
 		 524 aa  228  1e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.256556 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5310  acyl-CoA synthetase  33.72 
 
 		 516 aa  229  1e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5158  putative o-succinylbenzoate-CoA ligase  31.2 
 
 		 527 aa  228  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.20469 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3984  AMP-dependent synthetase and ligase  34.56 
 
 		 521 aa  226  8e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.446284  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0696  AMP-dependent synthetase and ligase  31.65 
 
 		 521 aa  225  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4700  acyl-CoA synthetase  33.13 
 
 		 516 aa  224  3e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0681  acyl-CoA synthetase  33.27 
 
 		 520 aa  223  6e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.457647 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5528  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.65 
 
 		 509 aa  223  9e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5032  acyl-CoA synthetase  32.23 
 
 		 501 aa  222  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.672582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6823  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase I  33.33 
 
 		 492 aa  222  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6056  AMP-dependent synthetase and ligase  32.41 
 
 		 515 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4649  acyl-CoA synthetase  32.23 
 
 		 501 aa  221  3e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4737  acyl-CoA synthetase  32.23 
 
 		 501 aa  221  3e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.987006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2787  AMP-dependent synthetase and ligase  32.81 
 
 		 518 aa  220  3.9999999999999997e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.296837  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1124  AMP-dependent synthetase and ligase  32.24 
 
 		 509 aa  220  3.9999999999999997e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.719867  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1368  AMP-dependent synthetase and ligase  33.01 
 
 		 515 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.663143  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2397  AMP-dependent synthetase and ligase  31.11 
 
 		 516 aa  219  8.999999999999998e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.264456  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0570  AMP-dependent synthetase and ligase  33.53 
 
 		 525 aa  219  1e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.356446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2936  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.42 
 
 		 536 aa  218  2e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.098527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4410  acyl-CoA synthetase  31.16 
 
 		 516 aa  218  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.648302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3215  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.8 
 
 		 500 aa  218  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6480  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.8 
 
 		 513 aa  215  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4093  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.88 
 
 		 497 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0327517  normal  0.151728 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3980  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.88 
 
 		 497 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.310048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3057  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.53 
 
 		 499 aa  213  7e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.847241  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3166  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33 
 
 		 501 aa  212  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130976  hitchhiker  0.0000354644 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3089  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.95 
 
 		 522 aa  211  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.196285  normal  0.363977 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2707  AMP-dependent synthetase and ligase  31.67 
 
 		 519 aa  204  3e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0621527  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01193  acyl-CoA synthase  29.7 
 
 		 544 aa  200  3.9999999999999996e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0176178  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0851  acyl-CoA synthetase  31.61 
 
 		 504 aa  195  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0227528 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1481  AMP-dependent synthetase and ligase  32.82 
 
 		 525 aa  196  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13440  acyl-CoA synthetase  30.28 
 
 		 539 aa  194  3e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1995  AMP-dependent synthetase and ligase  31.19 
 
 		 541 aa  188  2e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0057  AMP-dependent synthetase and ligase  32.08 
 
 		 487 aa  185  2.0000000000000003e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0861  AMP-dependent synthetase and ligase  30.87 
 
 		 514 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4181  AMP-dependent synthetase and ligase  30.38 
 
 		 527 aa  183  7e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2105  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.59 
 
 		 524 aa  182  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0154  AMP-dependent synthetase and ligase  30.8 
 
 		 520 aa  182  1e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0321  AMP-dependent synthetase and ligase  32.31 
 
 		 503 aa  181  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.289675  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1225  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.16 
 
 		 519 aa  180  5.999999999999999e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.399435  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6739  AMP-dependent synthetase and ligase  30.22 
 
 		 532 aa  179  7e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0799452  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>