More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0221 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0848  AMP-dependent synthetase and ligase  60.27 
 
 		 517 aa  635    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1347  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  60.47 
 
 		 512 aa  648    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0221  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 510 aa  1049    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3161  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  61.78 
 
 		 516 aa  627  1e-178  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3266  AMP-dependent synthetase and ligase  58.94 
 
 		 511 aa  606  9.999999999999999e-173  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1905  AMP-dependent synthetase and ligase  56.14 
 
 		 512 aa  592  1e-168  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.97218  normal  0.26016 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  56.25 
 
 		 513 aa  579  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  56.02 
 
 		 512 aa  578  1.0000000000000001e-163  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7124  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  55.97 
 
 		 512 aa  574  1.0000000000000001e-162  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.100628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1681  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  55.97 
 
 		 514 aa  566  1e-160  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3612  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  55.19 
 
 		 514 aa  560  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1902  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  54.09 
 
 		 518 aa  554  1e-156  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.889055  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3605  acyl-CoA synthetase  53.24 
 
 		 514 aa  540  9.999999999999999e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.133038  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0912  AMP-dependent synthetase and ligase  52.13 
 
 		 515 aa  516  1.0000000000000001e-145  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.881726 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0166  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  51.59 
 
 		 506 aa  507  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0177  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  51.59 
 
 		 506 aa  505  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.761031  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0186  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  51.59 
 
 		 506 aa  505  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0230763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0218  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  51.37 
 
 		 516 aa  499  1e-140  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0925378 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0449  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.2 
 
 		 516 aa  501  1e-140  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.93416 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10216  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  52.11 
 
 		 537 aa  496  1e-139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3399  AMP-dependent synthetase and ligase  50.97 
 
 		 522 aa  491  1e-137  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0015  acyl-CoA synthetase  50.1 
 
 		 511 aa  487  1e-136  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323665 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4161  acyl-CoA synthetase  50.2 
 
 		 517 aa  485  1e-136  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4737  acyl-CoA synthetase  50.6 
 
 		 501 aa  486  1e-136  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.987006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2714  AMP-dependent synthetase and ligase  49.61 
 
 		 546 aa  485  1e-136  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2397  AMP-dependent synthetase and ligase  48.35 
 
 		 516 aa  487  1e-136  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.264456  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5032  acyl-CoA synthetase  50.79 
 
 		 501 aa  487  1e-136  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.672582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4649  acyl-CoA synthetase  50.6 
 
 		 501 aa  486  1e-136  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4700  acyl-CoA synthetase  49.41 
 
 		 516 aa  478  1e-134  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4410  acyl-CoA synthetase  47.96 
 
 		 516 aa  481  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.648302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0681  acyl-CoA synthetase  48.64 
 
 		 520 aa  479  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.457647 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5310  acyl-CoA synthetase  48.82 
 
 		 516 aa  478  1e-133  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2695  AMP-dependent synthetase and ligase  49.32 
 
 		 516 aa  473  1e-132  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2738  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.94 
 
 		 522 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6056  AMP-dependent synthetase and ligase  47.81 
 
 		 515 aa  458  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1124  AMP-dependent synthetase and ligase  47.93 
 
 		 509 aa  456  1e-127  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.719867  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2936  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.02 
 
 		 536 aa  449  1e-125  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.098527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5158  putative o-succinylbenzoate-CoA ligase  46.76 
 
 		 527 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.20469 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0121  AMP-dependent synthetase and ligase  46.44 
 
 		 522 aa  414  1e-114  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0104  AMP-dependent synthetase and ligase  44.12 
 
 		 524 aa  412  1e-113  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.256556 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1502  acyl-CoA synthetase  41.67 
 
 		 515 aa  404  1e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1502  acyl-CoA synthetase  41.47 
 
 		 515 aa  404  1e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0696  AMP-dependent synthetase and ligase  44.69 
 
 		 521 aa  404  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1525  acyl-CoA synthetase  41.47 
 
 		 515 aa  404  1e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2641  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.25 
 
 		 516 aa  372  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.517138  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3984  AMP-dependent synthetase and ligase  43.33 
 
 		 521 aa  367  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.446284  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1481  AMP-dependent synthetase and ligase  44.77 
 
 		 525 aa  363  4e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2838  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.57 
 
 		 515 aa  346  6e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.153198 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0804  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.09 
 
 		 516 aa  345  1e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.48042 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3089  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.92 
 
 		 522 aa  340  2.9999999999999998e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.196285  normal  0.363977 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1465  acyl-CoA synthetase  40.12 
 
 		 487 aa  332  7.000000000000001e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.845905  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0570  AMP-dependent synthetase and ligase  39.53 
 
 		 525 aa  332  9e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.356446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6823  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase I  40.4 
 
 		 492 aa  320  3.9999999999999996e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2707  AMP-dependent synthetase and ligase  40.28 
 
 		 519 aa  318  2e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0621527  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3839  AMP-dependent synthetase and ligase  38.9 
 
 		 508 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2927  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.58 
 
 		 509 aa  311  2e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.686689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3166  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.05 
 
 		 501 aa  308  2.0000000000000002e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130976  hitchhiker  0.0000354644 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1871  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.22 
 
 		 524 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.394568  normal  0.852293 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4093  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.04 
 
 		 497 aa  306  4.0000000000000004e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0327517  normal  0.151728 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3980  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.04 
 
 		 497 aa  306  4.0000000000000004e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.310048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3057  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.96 
 
 		 499 aa  305  1.0000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.847241  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3597  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.06 
 
 		 543 aa  303  5.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2787  AMP-dependent synthetase and ligase  36.34 
 
 		 518 aa  300  3e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.296837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0282  AMP-dependent synthetase and ligase  40.17 
 
 		 492 aa  294  3e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.376129  normal  0.234171 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0423  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.96 
 
 		 509 aa  292  9e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3874  AMP-dependent synthetase and ligase  37.72 
 
 		 510 aa  288  2e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0918503 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3215  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.08 
 
 		 500 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1967  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.78 
 
 		 514 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.595404  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5528  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.8 
 
 		 509 aa  283  4.0000000000000003e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1368  AMP-dependent synthetase and ligase  32.75 
 
 		 515 aa  268  2e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.663143  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6480  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.51 
 
 		 513 aa  263  4e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3247  AMP-dependent synthetase and ligase  35.84 
 
 		 497 aa  260  4e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.640388 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4604  AMP-dependent synthetase and ligase  34.6 
 
 		 492 aa  259  7e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.37521 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1034  AMP-dependent synthetase and ligase  35.86 
 
 		 495 aa  258  2e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01193  acyl-CoA synthase  33.08 
 
 		 544 aa  253  4.0000000000000004e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0176178  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0943  AMP-dependent synthetase and ligase  34.5 
 
 		 511 aa  252  9.000000000000001e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1600  AMP-dependent synthetase and ligase  32.35 
 
 		 496 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1029  AMP-dependent synthetase and ligase  33.8 
 
 		 499 aa  244  1.9999999999999999e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0027  AMP-dependent synthetase and ligase  33.6 
 
 		 509 aa  245  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.141316  normal  0.236103 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1599  AMP-dependent synthetase and ligase  33.2 
 
 		 484 aa  244  3e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1666  AMP-dependent synthetase and ligase  32.36 
 
 		 518 aa  237  4e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.144653  normal  0.373713 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6618  AMP-dependent synthetase and ligase  36.34 
 
 		 493 aa  236  8e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  34.25 
 
 		 503 aa  232  1e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1025  AMP-dependent synthetase and ligase  32.93 
 
 		 498 aa  232  1e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5140  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.28 
 
 		 525 aa  231  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.24744  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4096  AMP-dependent synthetase and ligase  34.19 
 
 		 508 aa  230  5e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0377217  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  33.27 
 
 		 520 aa  229  6e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1112  putative acyl-CoA ligase  34.24 
 
 		 504 aa  229  8e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.29648 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  32.29 
 
 		 521 aa  228  2e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3855  AMP-dependent synthetase and ligase  31.9 
 
 		 523 aa  225  2e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.713722 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3818  AMP-dependent synthetase and ligase  31.34 
 
 		 501 aa  224  3e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  31.4 
 
 		 512 aa  223  4.9999999999999996e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3565  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.77 
 
 		 526 aa  222  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.011282  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0119  AMP-dependent synthetase and ligase  33.47 
 
 		 506 aa  222  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.976048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0102  AMP-dependent synthetase and ligase  34.48 
 
 		 520 aa  221  3e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5034  AMP-dependent synthetase and ligase  33.46 
 
 		 517 aa  219  6e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5826  AMP-dependent synthetase and ligase  33.46 
 
 		 517 aa  219  6e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4353  AMP-dependent synthetase and ligase  33.65 
 
 		 517 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3296  AMP-dependent synthetase and ligase  32.36 
 
 		 502 aa  218  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0486472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0411  acyl-CoA synthetase  34.46 
 
 		 522 aa  218  2e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>