More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2397 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2397  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 516 aa  1060    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.264456  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1124  AMP-dependent synthetase and ligase  68.99 
 
 		 509 aa  726    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.719867  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0015  acyl-CoA synthetase  58.24 
 
 		 511 aa  600  1e-170  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323665 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5032  acyl-CoA synthetase  57.79 
 
 		 501 aa  588  1e-167  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.672582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4649  acyl-CoA synthetase  57.79 
 
 		 501 aa  588  1e-166  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4737  acyl-CoA synthetase  57.79 
 
 		 501 aa  588  1e-166  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.987006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0848  AMP-dependent synthetase and ligase  54.01 
 
 		 517 aa  573  1.0000000000000001e-162  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1905  AMP-dependent synthetase and ligase  54.84 
 
 		 512 aa  564  1.0000000000000001e-159  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.97218  normal  0.26016 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2738  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  54.42 
 
 		 522 aa  548  1e-154  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2714  AMP-dependent synthetase and ligase  52.84 
 
 		 546 aa  540  9.999999999999999e-153  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2936  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  53.22 
 
 		 536 aa  537  1e-151  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.098527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2695  AMP-dependent synthetase and ligase  50.87 
 
 		 516 aa  536  1e-151  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3266  AMP-dependent synthetase and ligase  52.14 
 
 		 511 aa  531  1e-150  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3399  AMP-dependent synthetase and ligase  52.59 
 
 		 522 aa  521  1e-146  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1902  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  51.56 
 
 		 518 aa  512  1e-144  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.889055  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1681  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  51.26 
 
 		 514 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0912  AMP-dependent synthetase and ligase  50.19 
 
 		 515 aa  498  1e-140  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.881726 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3612  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  49.32 
 
 		 514 aa  497  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5158  putative o-succinylbenzoate-CoA ligase  50 
 
 		 527 aa  497  1e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.20469 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0221  AMP-dependent synthetase and ligase  48.35 
 
 		 510 aa  498  1e-139  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1347  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.78 
 
 		 512 aa  496  1e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3605  acyl-CoA synthetase  49.51 
 
 		 514 aa  491  1e-137  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.133038  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0166  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.3 
 
 		 506 aa  491  1e-137  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0177  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.1 
 
 		 506 aa  488  1e-136  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.761031  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0186  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.1 
 
 		 506 aa  488  1e-136  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0230763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7124  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  49.42 
 
 		 512 aa  484  1e-135  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.100628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  49.13 
 
 		 512 aa  483  1e-135  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0449  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  49.12 
 
 		 516 aa  484  1e-135  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.93416 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3161  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  49.21 
 
 		 516 aa  478  1e-134  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.88 
 
 		 513 aa  479  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0218  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.34 
 
 		 516 aa  480  1e-134  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0925378 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4410  acyl-CoA synthetase  49.13 
 
 		 516 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.648302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5310  acyl-CoA synthetase  49.71 
 
 		 516 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4161  acyl-CoA synthetase  46.71 
 
 		 517 aa  456  1e-127  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4700  acyl-CoA synthetase  47.79 
 
 		 516 aa  458  1e-127  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0681  acyl-CoA synthetase  46.91 
 
 		 520 aa  450  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.457647 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10216  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.29 
 
 		 537 aa  444  1e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0696  AMP-dependent synthetase and ligase  46.31 
 
 		 521 aa  437  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1502  acyl-CoA synthetase  43.91 
 
 		 515 aa  430  1e-119  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1525  acyl-CoA synthetase  43.91 
 
 		 515 aa  430  1e-119  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1502  acyl-CoA synthetase  43.71 
 
 		 515 aa  425  1e-117  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0104  AMP-dependent synthetase and ligase  44.02 
 
 		 524 aa  421  1e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.256556 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0121  AMP-dependent synthetase and ligase  43.93 
 
 		 522 aa  413  1e-114  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6056  AMP-dependent synthetase and ligase  43.56 
 
 		 515 aa  411  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2641  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.97 
 
 		 516 aa  384  1e-105  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.517138  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2838  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.88 
 
 		 515 aa  380  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.153198 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3089  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.93 
 
 		 522 aa  377  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.196285  normal  0.363977 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3984  AMP-dependent synthetase and ligase  40.86 
 
 		 521 aa  372  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.446284  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3597  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.65 
 
 		 543 aa  355  7.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1871  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.9 
 
 		 524 aa  350  5e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.394568  normal  0.852293 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2927  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.21 
 
 		 509 aa  347  3e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.686689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1967  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.1 
 
 		 514 aa  344  2.9999999999999997e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.595404  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1465  acyl-CoA synthetase  40.2 
 
 		 487 aa  342  1e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.845905  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1481  AMP-dependent synthetase and ligase  38.49 
 
 		 525 aa  341  2e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6823  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase I  40.78 
 
 		 492 aa  339  7e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0282  AMP-dependent synthetase and ligase  40.04 
 
 		 492 aa  337  2.9999999999999997e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.376129  normal  0.234171 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0570  AMP-dependent synthetase and ligase  38.94 
 
 		 525 aa  334  2e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.356446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2707  AMP-dependent synthetase and ligase  38.17 
 
 		 519 aa  334  2e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0621527  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0804  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.19 
 
 		 516 aa  333  5e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.48042 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3166  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.08 
 
 		 501 aa  332  1e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130976  hitchhiker  0.0000354644 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3057  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.04 
 
 		 499 aa  323  4e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.847241  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2787  AMP-dependent synthetase and ligase  38.7 
 
 		 518 aa  322  9.000000000000001e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.296837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0423  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.55 
 
 		 509 aa  318  2e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3874  AMP-dependent synthetase and ligase  37.43 
 
 		 510 aa  311  2e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0918503 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3839  AMP-dependent synthetase and ligase  37.77 
 
 		 508 aa  306  5.0000000000000004e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5528  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.8 
 
 		 509 aa  306  7e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3215  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.58 
 
 		 500 aa  298  1e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4093  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.25 
 
 		 497 aa  297  3e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0327517  normal  0.151728 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3980  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.25 
 
 		 497 aa  297  3e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.310048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1368  AMP-dependent synthetase and ligase  36.59 
 
 		 515 aa  291  1e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.663143  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6739  AMP-dependent synthetase and ligase  36.38 
 
 		 532 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0799452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6480  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.19 
 
 		 513 aa  265  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01193  acyl-CoA synthase  33.98 
 
 		 544 aa  263  4.999999999999999e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0176178  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0027  AMP-dependent synthetase and ligase  35.5 
 
 		 509 aa  261  2e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.141316  normal  0.236103 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3247  AMP-dependent synthetase and ligase  37.23 
 
 		 497 aa  259  6e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.640388 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1034  AMP-dependent synthetase and ligase  35.12 
 
 		 495 aa  259  8e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2323  AMP-dependent synthetase and ligase  36.22 
 
 		 511 aa  259  1e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4096  AMP-dependent synthetase and ligase  35.45 
 
 		 508 aa  255  1.0000000000000001e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0377217  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  34.82 
 
 		 520 aa  252  1e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  34.31 
 
 		 512 aa  252  1e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0943  AMP-dependent synthetase and ligase  35.29 
 
 		 511 aa  251  2e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  34.18 
 
 		 521 aa  251  2e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3855  AMP-dependent synthetase and ligase  33.53 
 
 		 523 aa  251  3e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.713722 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1133  AMP-dependent synthetase and ligase  35.02 
 
 		 518 aa  249  8e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.508244  normal  0.50206 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1029  AMP-dependent synthetase and ligase  35.6 
 
 		 499 aa  248  2e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6878  AMP-dependent synthetase and ligase  35 
 
 		 509 aa  247  3e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4604  AMP-dependent synthetase and ligase  35.52 
 
 		 492 aa  247  4e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.37521 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  35.73 
 
 		 503 aa  246  6.999999999999999e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1666  AMP-dependent synthetase and ligase  32.88 
 
 		 518 aa  242  1e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.144653  normal  0.373713 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4238  AMP-dependent synthetase and ligase  33.59 
 
 		 527 aa  242  1e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1660  AMP-dependent synthetase and ligase  32.94 
 
 		 523 aa  241  2e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104845  normal  0.559317 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1605  AMP-dependent synthetase and ligase  32 
 
 		 526 aa  241  2.9999999999999997e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  32.57 
 
 		 499 aa  241  2.9999999999999997e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5309  AMP-dependent synthetase and ligase  34.09 
 
 		 517 aa  240  4e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0102  AMP-dependent synthetase and ligase  36.19 
 
 		 520 aa  240  5e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2485  AMP-dependent synthetase and ligase  34.61 
 
 		 534 aa  238  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1837  AMP-dependent synthetase and ligase  35.78 
 
 		 518 aa  237  3e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.963932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3890  AMP-dependent synthetase and ligase  34.46 
 
 		 517 aa  238  3e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0529507  normal  0.227811 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1600  AMP-dependent synthetase and ligase  32.29 
 
 		 496 aa  237  4e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3565  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.4 
 
 		 526 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.011282  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>