More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01193 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01193  acyl-CoA synthase  100 
 
 		 544 aa  1126    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0176178  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1368  AMP-dependent synthetase and ligase  58.03 
 
 		 515 aa  624  1e-177  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.663143  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5528  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.87 
 
 		 509 aa  357  3.9999999999999996e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3597  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.24 
 
 		 543 aa  352  8.999999999999999e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3166  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.88 
 
 		 501 aa  351  2e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130976  hitchhiker  0.0000354644 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1871  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.24 
 
 		 524 aa  350  3e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.394568  normal  0.852293 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2927  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.57 
 
 		 509 aa  347  3e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.686689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0423  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.09 
 
 		 509 aa  347  3e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1967  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.62 
 
 		 514 aa  342  7e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.595404  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0804  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.24 
 
 		 516 aa  341  2e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.48042 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3839  AMP-dependent synthetase and ligase  37.87 
 
 		 508 aa  334  2e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3980  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.1 
 
 		 497 aa  333  5e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.310048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3874  AMP-dependent synthetase and ligase  38.32 
 
 		 510 aa  333  5e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0918503 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4093  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.1 
 
 		 497 aa  333  5e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0327517  normal  0.151728 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3215  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.52 
 
 		 500 aa  329  1.0000000000000001e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6480  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.96 
 
 		 513 aa  328  2.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3057  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.01 
 
 		 499 aa  325  1e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.847241  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0282  AMP-dependent synthetase and ligase  36.67 
 
 		 492 aa  317  4e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.376129  normal  0.234171 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6823  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase I  34.71 
 
 		 492 aa  300  4e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10216  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.49 
 
 		 537 aa  284  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1465  acyl-CoA synthetase  33.33 
 
 		 487 aa  283  4.0000000000000003e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.845905  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0449  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.76 
 
 		 516 aa  278  2e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.93416 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3089  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.52 
 
 		 522 aa  274  3e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.196285  normal  0.363977 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0218  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.44 
 
 		 516 aa  271  2e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0925378 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1902  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.1 
 
 		 518 aa  271  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.889055  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0166  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.53 
 
 		 506 aa  270  4e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0848  AMP-dependent synthetase and ligase  33.46 
 
 		 517 aa  268  2e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.15 
 
 		 513 aa  268  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0177  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.34 
 
 		 506 aa  266  5e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.761031  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0186  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.34 
 
 		 506 aa  266  5e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0230763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1502  acyl-CoA synthetase  33.79 
 
 		 515 aa  266  7e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2641  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.33 
 
 		 516 aa  266  7e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.517138  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1681  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.77 
 
 		 514 aa  265  1e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1502  acyl-CoA synthetase  33.92 
 
 		 515 aa  265  1e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1525  acyl-CoA synthetase  33.92 
 
 		 515 aa  265  1e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5158  putative o-succinylbenzoate-CoA ligase  34.05 
 
 		 527 aa  265  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.20469 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.15 
 
 		 512 aa  265  2e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1124  AMP-dependent synthetase and ligase  33.86 
 
 		 509 aa  263  6e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.719867  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3612  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.16 
 
 		 514 aa  263  6e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2838  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.64 
 
 		 515 aa  263  6.999999999999999e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.153198 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4161  acyl-CoA synthetase  34.12 
 
 		 517 aa  262  8.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0570  AMP-dependent synthetase and ligase  33.07 
 
 		 525 aa  262  1e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.356446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4700  acyl-CoA synthetase  34.71 
 
 		 516 aa  262  1e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3984  AMP-dependent synthetase and ligase  31.95 
 
 		 521 aa  260  4e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.446284  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2397  AMP-dependent synthetase and ligase  33.9 
 
 		 516 aa  258  1e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.264456  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4410  acyl-CoA synthetase  35.21 
 
 		 516 aa  258  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.648302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0696  AMP-dependent synthetase and ligase  33.97 
 
 		 521 aa  258  2e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2695  AMP-dependent synthetase and ligase  34.44 
 
 		 516 aa  257  4e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0015  acyl-CoA synthetase  33.46 
 
 		 511 aa  256  6e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323665 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0681  acyl-CoA synthetase  34.16 
 
 		 520 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.457647 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7124  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.76 
 
 		 512 aa  254  3e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.100628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0221  AMP-dependent synthetase and ligase  33.08 
 
 		 510 aa  253  5.000000000000001e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5310  acyl-CoA synthetase  35.03 
 
 		 516 aa  252  1e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3161  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.78 
 
 		 516 aa  252  1e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1481  AMP-dependent synthetase and ligase  31.87 
 
 		 525 aa  251  3e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3399  AMP-dependent synthetase and ligase  34.69 
 
 		 522 aa  250  4e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5032  acyl-CoA synthetase  34.46 
 
 		 501 aa  249  1e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.672582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0104  AMP-dependent synthetase and ligase  33.53 
 
 		 524 aa  248  2e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.256556 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4649  acyl-CoA synthetase  34.27 
 
 		 501 aa  247  3e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4737  acyl-CoA synthetase  34.27 
 
 		 501 aa  247  3e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.987006  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1905  AMP-dependent synthetase and ligase  32.47 
 
 		 512 aa  247  4e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.97218  normal  0.26016 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2738  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.02 
 
 		 522 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0121  AMP-dependent synthetase and ligase  33.01 
 
 		 522 aa  245  1.9999999999999999e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2714  AMP-dependent synthetase and ligase  35.08 
 
 		 546 aa  244  3e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3605  acyl-CoA synthetase  31.24 
 
 		 514 aa  241  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.133038  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2707  AMP-dependent synthetase and ligase  32.67 
 
 		 519 aa  241  4e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0621527  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1347  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.2 
 
 		 512 aa  241  4e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1029  AMP-dependent synthetase and ligase  32.94 
 
 		 499 aa  238  3e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0912  AMP-dependent synthetase and ligase  32.13 
 
 		 515 aa  233  8.000000000000001e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.881726 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1034  AMP-dependent synthetase and ligase  33.53 
 
 		 495 aa  232  1e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2936  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.58 
 
 		 536 aa  231  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.098527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3266  AMP-dependent synthetase and ligase  31.61 
 
 		 511 aa  231  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2787  AMP-dependent synthetase and ligase  30.16 
 
 		 518 aa  229  1e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.296837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2987  AMP-dependent synthetase and ligase  30.52 
 
 		 534 aa  225  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.734432  normal  0.0264415 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6739  AMP-dependent synthetase and ligase  36.31 
 
 		 532 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0799452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6056  AMP-dependent synthetase and ligase  31.57 
 
 		 515 aa  221  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4817  AMP-dependent synthetase and ligase  30.82 
 
 		 541 aa  220  6e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10274  acyl-CoA synthetase  30.48 
 
 		 560 aa  219  1e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0406036 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1599  AMP-dependent synthetase and ligase  31.1 
 
 		 484 aa  219  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0361  acyl-CoA synthetase  30.24 
 
 		 577 aa  215  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.171367  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0371  acyl-CoA synthetase  30.24 
 
 		 577 aa  215  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0350  acyl-CoA synthetase  30.24 
 
 		 574 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1025  AMP-dependent synthetase and ligase  30.16 
 
 		 498 aa  212  2e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0851  acyl-CoA synthetase  32.42 
 
 		 504 aa  212  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0227528 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3758  acyl-CoA synthetase  30.27 
 
 		 548 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102214  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3831  acyl-CoA synthetase  30.27 
 
 		 548 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.948087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3770  acyl-CoA synthetase  30.27 
 
 		 548 aa  211  3e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4678  AMP-dependent synthetase and ligase  29.03 
 
 		 539 aa  211  3e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4225  acyl-CoA synthetase  28.47 
 
 		 530 aa  209  8e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2427  acyl-CoA synthetase  28.23 
 
 		 535 aa  209  8e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.206901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11456  acyl-CoA synthetase  29.17 
 
 		 535 aa  209  9e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0248769 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3694  AMP-dependent synthetase and ligase  27.8 
 
 		 532 aa  208  2e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0397  acyl-CoA synthetase  30.51 
 
 		 564 aa  209  2e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.835434  normal  0.950858 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0341  acyl-CoA synthetase  31.05 
 
 		 569 aa  207  6e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3247  AMP-dependent synthetase and ligase  30.62 
 
 		 497 aa  205  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.640388 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4604  AMP-dependent synthetase and ligase  31.6 
 
 		 492 aa  204  4e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.37521 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6878  AMP-dependent synthetase and ligase  29.22 
 
 		 509 aa  202  9e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1600  AMP-dependent synthetase and ligase  29.56 
 
 		 496 aa  198  3e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13440  acyl-CoA synthetase  27.94 
 
 		 539 aa  198  3e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0435  acyl-CoA synthetase  31.61 
 
 		 544 aa  197  5.000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.232692 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>