More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4225 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_3770  acyl-CoA synthetase  78.83 
 
 		 548 aa  844    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11456  acyl-CoA synthetase  73.16 
 
 		 535 aa  765    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0248769 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4127  acyl-CoA synthetase  72.05 
 
 		 540 aa  774    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2427  acyl-CoA synthetase  87.74 
 
 		 535 aa  944    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.206901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3758  acyl-CoA synthetase  79.02 
 
 		 548 aa  845    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102214  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0435  acyl-CoA synthetase  70.52 
 
 		 544 aa  750    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.232692 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4225  acyl-CoA synthetase  100 
 
 		 530 aa  1068    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3831  acyl-CoA synthetase  79.02 
 
 		 548 aa  845    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.948087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0232  acyl-CoA synthetase  71.24 
 
 		 544 aa  741    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.253384  normal  0.171828 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3854  AMP-dependent synthetase and ligase  56.76 
 
 		 550 aa  558  1e-158  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3694  AMP-dependent synthetase and ligase  50 
 
 		 532 aa  485  1e-136  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13440  acyl-CoA synthetase  46.87 
 
 		 539 aa  426  1e-118  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1995  AMP-dependent synthetase and ligase  48.2 
 
 		 541 aa  428  1e-118  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0051  AMP-dependent synthetase and ligase  42.45 
 
 		 546 aa  403  1e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256371 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4678  AMP-dependent synthetase and ligase  45 
 
 		 539 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10274  acyl-CoA synthetase  44.81 
 
 		 560 aa  396  1e-109  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0406036 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2987  AMP-dependent synthetase and ligase  43.08 
 
 		 534 aa  398  1e-109  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.734432  normal  0.0264415 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0553  AMP-dependent synthetase and ligase  45.68 
 
 		 527 aa  391  1e-107  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1993  acyl-CoA synthetase  44.95 
 
 		 550 aa  385  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0397  acyl-CoA synthetase  43.37 
 
 		 564 aa  386  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.835434  normal  0.950858 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0341  acyl-CoA synthetase  43.2 
 
 		 569 aa  384  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0339  AMP-dependent synthetase and ligase  45.02 
 
 		 542 aa  384  1e-105  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00517119  normal  0.13941 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4817  AMP-dependent synthetase and ligase  43.4 
 
 		 541 aa  380  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0350  acyl-CoA synthetase  42.77 
 
 		 574 aa  381  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0361  acyl-CoA synthetase  42.77 
 
 		 577 aa  381  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.171367  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0371  acyl-CoA synthetase  42.77 
 
 		 577 aa  381  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4103  AMP-dependent synthetase and ligase  42.4 
 
 		 545 aa  378  1e-103  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4816  AMP-dependent synthetase and ligase  41.22 
 
 		 562 aa  363  5.0000000000000005e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4630  AMP-dependent synthetase and ligase  41.12 
 
 		 544 aa  350  3e-95  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2344  acyl-CoA synthetase  38.89 
 
 		 531 aa  313  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.657578  decreased coverage  0.0026015 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1066  AMP-dependent synthetase and ligase  37.94 
 
 		 560 aa  310  5.9999999999999995e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1257  AMP-dependent synthetase and ligase  29.94 
 
 		 518 aa  262  8.999999999999999e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3057  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.6 
 
 		 499 aa  259  8e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.847241  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3874  AMP-dependent synthetase and ligase  34.21 
 
 		 510 aa  253  6e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0918503 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3215  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.1 
 
 		 500 aa  245  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3597  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.52 
 
 		 543 aa  244  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3839  AMP-dependent synthetase and ligase  33.05 
 
 		 508 aa  243  5e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1871  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.61 
 
 		 524 aa  243  9e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.394568  normal  0.852293 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1967  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.8 
 
 		 514 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.595404  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6898  AMP-dependent synthetase and ligase  32.48 
 
 		 536 aa  234  3e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4454  long-chain-fatty-acid-CoA ligase  33.77 
 
 		 555 aa  233  6e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.100007 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0001  AMP-dependent synthetase and ligase  29.24 
 
 		 516 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.743652 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2867  AMP-dependent synthetase and ligase  33.02 
 
 		 552 aa  230  4e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.533017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2927  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.62 
 
 		 509 aa  229  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.686689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6823  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase I  36.84 
 
 		 492 aa  228  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6739  AMP-dependent synthetase and ligase  32.86 
 
 		 532 aa  226  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0799452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3166  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.32 
 
 		 501 aa  225  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130976  hitchhiker  0.0000354644 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1660  AMP-dependent synthetase and ligase  31.93 
 
 		 523 aa  224  2e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104845  normal  0.559317 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  33.2 
 
 		 520 aa  223  6e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0282  AMP-dependent synthetase and ligase  32.82 
 
 		 492 aa  223  7e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.376129  normal  0.234171 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1465  acyl-CoA synthetase  32.43 
 
 		 487 aa  221  3.9999999999999997e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.845905  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4921  acyl-CoA synthetase  32.02 
 
 		 531 aa  219  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2787  AMP-dependent synthetase and ligase  31.66 
 
 		 518 aa  217  4e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.296837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5528  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.88 
 
 		 509 aa  217  5e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2714  AMP-dependent synthetase and ligase  31.89 
 
 		 546 aa  216  7e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2371  acyl-CoA synthetase  33.27 
 
 		 532 aa  216  9e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2695  AMP-dependent synthetase and ligase  31.57 
 
 		 516 aa  212  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  30.29 
 
 		 521 aa  212  1e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4616  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 518 aa  212  1e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.892742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1159  O-succinylbenzoate-CoA ligase  32.53 
 
 		 486 aa  212  1e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498459  hitchhiker  0.000208098 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0662  AMP-dependent synthetase and ligase  32.89 
 
 		 548 aa  211  2e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.27921  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4096  AMP-dependent synthetase and ligase  32.48 
 
 		 508 aa  211  2e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0377217  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3855  AMP-dependent synthetase and ligase  30.8 
 
 		 523 aa  210  4e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.713722 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4093  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.9 
 
 		 497 aa  210  5e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0327517  normal  0.151728 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3980  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.9 
 
 		 497 aa  210  5e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.310048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01193  acyl-CoA synthase  28.47 
 
 		 544 aa  209  8e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0176178  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  30.29 
 
 		 512 aa  209  1e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.9 
 
 		 513 aa  209  1e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1902  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.15 
 
 		 518 aa  208  2e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.889055  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3767  AMP-dependent synthetase and ligase  33.4 
 
 		 512 aa  208  2e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0143855  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0928  AMP-dependent synthetase and ligase  31.95 
 
 		 553 aa  208  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0804  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.92 
 
 		 516 aa  207  3e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.48042 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3605  acyl-CoA synthetase  31.14 
 
 		 514 aa  207  5e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.133038  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  30.04 
 
 		 499 aa  206  8e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.92 
 
 		 514 aa  206  1e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5309  AMP-dependent synthetase and ligase  31.31 
 
 		 517 aa  205  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1605  AMP-dependent synthetase and ligase  30.04 
 
 		 526 aa  206  1e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2707  AMP-dependent synthetase and ligase  31.15 
 
 		 519 aa  205  1e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0621527  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6618  AMP-dependent synthetase and ligase  34.77 
 
 		 493 aa  206  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5310  acyl-CoA synthetase  31.46 
 
 		 516 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1569  long-chain fatty-acid-CoA ligase, putative  30.26 
 
 		 510 aa  204  3e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.890411  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.54 
 
 		 512 aa  204  3e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4160  AMP-dependent synthetase and ligase  37.65 
 
 		 499 aa  203  5e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.365856  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1905  AMP-dependent synthetase and ligase  29.34 
 
 		 512 aa  203  5e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.97218  normal  0.26016 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0423  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.01 
 
 		 509 aa  204  5e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5669  acyl-CoA synthetase  31.39 
 
 		 529 aa  203  6e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4700  acyl-CoA synthetase  29.68 
 
 		 516 aa  203  8e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1821  AMP-dependent synthetase and ligase  32.28 
 
 		 550 aa  202  9e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3215  O-succinylbenzoate-CoA ligase  33.74 
 
 		 517 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0554015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3204  O-succinylbenzoate-CoA ligase  33.74 
 
 		 517 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.716175  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3266  O-succinylbenzoate-CoA ligase  33.74 
 
 		 517 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.10141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4840  AMP-dependent synthetase and ligase  29.94 
 
 		 522 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0208185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2806  acyl-CoA synthetase  30.34 
 
 		 556 aa  201  3e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.688057 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2248  O-succinylbenzoate-CoA ligase  33.33 
 
 		 513 aa  201  3e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.2585 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0570  AMP-dependent synthetase and ligase  30.33 
 
 		 525 aa  200  5e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.356446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3704  AMP-dependent synthetase and ligase  30.2 
 
 		 515 aa  200  6e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0990866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3747  AMP-dependent synthetase and ligase  32.02 
 
 		 514 aa  200  6e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2525  AMP-dependent synthetase and ligase  30.92 
 
 		 516 aa  200  6e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.695888 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2447  AMP-dependent synthetase and ligase  32.69 
 
 		 505 aa  199  7e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1666  AMP-dependent synthetase and ligase  30.63 
 
 		 518 aa  199  9e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.144653  normal  0.373713 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>