More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11456 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_11456  acyl-CoA synthetase  100 
 
 		 535 aa  1083    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0248769 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4127  acyl-CoA synthetase  74.53 
 
 		 540 aa  812    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0435  acyl-CoA synthetase  74.39 
 
 		 544 aa  819    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.232692 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3770  acyl-CoA synthetase  72.63 
 
 		 548 aa  791    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2427  acyl-CoA synthetase  72.02 
 
 		 535 aa  773    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.206901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3758  acyl-CoA synthetase  72.81 
 
 		 548 aa  792    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102214  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3831  acyl-CoA synthetase  72.81 
 
 		 548 aa  792    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.948087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0232  acyl-CoA synthetase  74.95 
 
 		 544 aa  810    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.253384  normal  0.171828 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4225  acyl-CoA synthetase  73.16 
 
 		 530 aa  778    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3854  AMP-dependent synthetase and ligase  55.73 
 
 		 550 aa  549  1e-155  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3694  AMP-dependent synthetase and ligase  49.91 
 
 		 532 aa  494  9.999999999999999e-139  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1995  AMP-dependent synthetase and ligase  48.11 
 
 		 541 aa  444  1e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13440  acyl-CoA synthetase  45.4 
 
 		 539 aa  430  1e-119  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10274  acyl-CoA synthetase  45.95 
 
 		 560 aa  415  1e-114  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0406036 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0051  AMP-dependent synthetase and ligase  43.45 
 
 		 546 aa  413  1e-114  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256371 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2987  AMP-dependent synthetase and ligase  43.71 
 
 		 534 aa  414  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.734432  normal  0.0264415 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0553  AMP-dependent synthetase and ligase  45.57 
 
 		 527 aa  412  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0339  AMP-dependent synthetase and ligase  45.54 
 
 		 542 aa  409  1.0000000000000001e-112  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00517119  normal  0.13941 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4678  AMP-dependent synthetase and ligase  43.44 
 
 		 539 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1993  acyl-CoA synthetase  43.53 
 
 		 550 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0397  acyl-CoA synthetase  42.61 
 
 		 564 aa  402  9.999999999999999e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.835434  normal  0.950858 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0341  acyl-CoA synthetase  42.56 
 
 		 569 aa  398  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4817  AMP-dependent synthetase and ligase  42.56 
 
 		 541 aa  384  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4103  AMP-dependent synthetase and ligase  42.16 
 
 		 545 aa  383  1e-105  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0350  acyl-CoA synthetase  42.5 
 
 		 574 aa  381  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0361  acyl-CoA synthetase  42.5 
 
 		 577 aa  381  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.171367  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0371  acyl-CoA synthetase  42.5 
 
 		 577 aa  381  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4816  AMP-dependent synthetase and ligase  40.3 
 
 		 562 aa  372  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4630  AMP-dependent synthetase and ligase  41.31 
 
 		 544 aa  370  1e-101  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2344  acyl-CoA synthetase  41.78 
 
 		 531 aa  332  1e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.657578  decreased coverage  0.0026015 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1066  AMP-dependent synthetase and ligase  37.48 
 
 		 560 aa  316  6e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1257  AMP-dependent synthetase and ligase  30.71 
 
 		 518 aa  272  9e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3166  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.04 
 
 		 501 aa  248  3e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130976  hitchhiker  0.0000354644 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3057  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.19 
 
 		 499 aa  242  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.847241  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3874  AMP-dependent synthetase and ligase  33.95 
 
 		 510 aa  241  2.9999999999999997e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0918503 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3215  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.03 
 
 		 500 aa  241  2.9999999999999997e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6823  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase I  33.53 
 
 		 492 aa  239  6.999999999999999e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2867  AMP-dependent synthetase and ligase  34.41 
 
 		 552 aa  238  1e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.533017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6739  AMP-dependent synthetase and ligase  32.59 
 
 		 532 aa  233  9e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0799452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1871  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.63 
 
 		 524 aa  232  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.394568  normal  0.852293 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6898  AMP-dependent synthetase and ligase  33.65 
 
 		 536 aa  229  7e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1465  acyl-CoA synthetase  32.26 
 
 		 487 aa  229  7e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.845905  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4921  acyl-CoA synthetase  31.04 
 
 		 531 aa  228  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0001  AMP-dependent synthetase and ligase  28.62 
 
 		 516 aa  226  7e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.743652 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2371  acyl-CoA synthetase  32.61 
 
 		 532 aa  226  7e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1967  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.04 
 
 		 514 aa  226  1e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.595404  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1905  AMP-dependent synthetase and ligase  31.93 
 
 		 512 aa  224  2e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.97218  normal  0.26016 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3597  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.94 
 
 		 543 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4093  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.29 
 
 		 497 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0327517  normal  0.151728 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3980  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.29 
 
 		 497 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.310048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  31.49 
 
 		 512 aa  221  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0282  AMP-dependent synthetase and ligase  32.54 
 
 		 492 aa  221  3e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.376129  normal  0.234171 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  31.31 
 
 		 499 aa  221  3e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3855  AMP-dependent synthetase and ligase  30.36 
 
 		 523 aa  219  7.999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.713722 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3839  AMP-dependent synthetase and ligase  30.67 
 
 		 508 aa  219  1e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  31.1 
 
 		 521 aa  218  2e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3215  O-succinylbenzoate-CoA ligase  34.96 
 
 		 517 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0554015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3204  O-succinylbenzoate-CoA ligase  34.96 
 
 		 517 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.716175  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1724  AMP-dependent synthetase and ligase  31.31 
 
 		 515 aa  218  2e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0701995  normal  0.167784 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3266  O-succinylbenzoate-CoA ligase  34.96 
 
 		 517 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.10141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.68 
 
 		 513 aa  218  2.9999999999999998e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2248  O-succinylbenzoate-CoA ligase  34.88 
 
 		 513 aa  216  5.9999999999999996e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.2585 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0027  AMP-dependent synthetase and ligase  32.79 
 
 		 509 aa  216  8e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.141316  normal  0.236103 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2714  AMP-dependent synthetase and ligase  31.77 
 
 		 546 aa  216  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4454  long-chain-fatty-acid-CoA ligase  32 
 
 		 555 aa  215  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.100007 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01193  acyl-CoA synthase  29.17 
 
 		 544 aa  214  1.9999999999999998e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0176178  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2787  AMP-dependent synthetase and ligase  31.26 
 
 		 518 aa  214  2.9999999999999995e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.296837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0804  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.66 
 
 		 516 aa  213  4.9999999999999996e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.48042 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1660  AMP-dependent synthetase and ligase  31.39 
 
 		 523 aa  213  5.999999999999999e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104845  normal  0.559317 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5032  acyl-CoA synthetase  31.75 
 
 		 501 aa  213  7e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.672582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4238  AMP-dependent synthetase and ligase  31.85 
 
 		 527 aa  213  9e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3767  AMP-dependent synthetase and ligase  33.13 
 
 		 512 aa  212  2e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0143855  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1502  acyl-CoA synthetase  31.94 
 
 		 515 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4649  acyl-CoA synthetase  31.75 
 
 		 501 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1525  acyl-CoA synthetase  31.94 
 
 		 515 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4737  acyl-CoA synthetase  31.75 
 
 		 501 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.987006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2707  AMP-dependent synthetase and ligase  30.85 
 
 		 519 aa  211  2e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0621527  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3704  AMP-dependent synthetase and ligase  31.19 
 
 		 515 aa  211  3e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0990866  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2038  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  31.19 
 
 		 565 aa  210  5e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4616  AMP-dependent synthetase and ligase  33.47 
 
 		 518 aa  210  6e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.892742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4096  AMP-dependent synthetase and ligase  31.72 
 
 		 508 aa  210  6e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0377217  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1502  acyl-CoA synthetase  31.94 
 
 		 515 aa  209  7e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2397  AMP-dependent synthetase and ligase  31.16 
 
 		 516 aa  209  7e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.264456  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2447  AMP-dependent synthetase and ligase  34.05 
 
 		 505 aa  209  9e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  32.47 
 
 		 520 aa  209  1e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.56 
 
 		 514 aa  208  2e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5309  AMP-dependent synthetase and ligase  30.83 
 
 		 517 aa  208  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2927  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.67 
 
 		 509 aa  207  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.686689  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5669  acyl-CoA synthetase  29.32 
 
 		 529 aa  207  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1902  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.5 
 
 		 518 aa  207  3e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.889055  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2699  AMP-binding enzyme, putative long chain fatty acid Co-A ligase, acetyl-CoA synthetase  28.88 
 
 		 514 aa  207  3e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4160  AMP-dependent synthetase and ligase  36.92 
 
 		 499 aa  207  5e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.365856  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5528  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.44 
 
 		 509 aa  206  6e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3266  AMP-dependent synthetase and ligase  30.52 
 
 		 511 aa  206  8e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0015  acyl-CoA synthetase  31.05 
 
 		 511 aa  206  8e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323665 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  27.54 
 
 		 490 aa  204  2e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2525  AMP-dependent synthetase and ligase  30.27 
 
 		 516 aa  205  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.695888 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4758  AMP-dependent synthetase and ligase  30.53 
 
 		 518 aa  204  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1605  AMP-dependent synthetase and ligase  30.18 
 
 		 526 aa  204  3e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0943  AMP-dependent synthetase and ligase  31.39 
 
 		 511 aa  204  4e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193061  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>