More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10274 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_0397  acyl-CoA synthetase  75.89 
 
 
564 aa  891    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.835434  normal  0.950858 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0350  acyl-CoA synthetase  75 
 
 
574 aa  852    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10274  acyl-CoA synthetase  100 
 
 
560 aa  1122    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0406036 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0341  acyl-CoA synthetase  75.35 
 
 
569 aa  880    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0361  acyl-CoA synthetase  75.18 
 
 
577 aa  854    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.171367  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0371  acyl-CoA synthetase  75.18 
 
 
577 aa  854    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0339  AMP-dependent synthetase and ligase  55.81 
 
 
542 aa  570  1e-161  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00517119  normal  0.13941 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3694  AMP-dependent synthetase and ligase  48.88 
 
 
532 aa  475  1e-133  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178139  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1995  AMP-dependent synthetase and ligase  48.44 
 
 
541 aa  443  1e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13440  acyl-CoA synthetase  46.32 
 
 
539 aa  437  1e-121  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3758  acyl-CoA synthetase  43.48 
 
 
548 aa  423  1e-117  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102214  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3770  acyl-CoA synthetase  43.48 
 
 
548 aa  422  1e-117  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3831  acyl-CoA synthetase  43.48 
 
 
548 aa  423  1e-117  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.948087  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0553  AMP-dependent synthetase and ligase  44.13 
 
 
527 aa  421  1e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4678  AMP-dependent synthetase and ligase  43.5 
 
 
539 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11456  acyl-CoA synthetase  46.04 
 
 
535 aa  408  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0248769 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1993  acyl-CoA synthetase  40.78 
 
 
550 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4103  AMP-dependent synthetase and ligase  44.51 
 
 
545 aa  399  9.999999999999999e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4817  AMP-dependent synthetase and ligase  43.33 
 
 
541 aa  400  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4225  acyl-CoA synthetase  44.81 
 
 
530 aa  396  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2427  acyl-CoA synthetase  43.27 
 
 
535 aa  395  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.206901  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0232  acyl-CoA synthetase  41.8 
 
 
544 aa  391  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.253384  normal  0.171828 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4127  acyl-CoA synthetase  42.58 
 
 
540 aa  392  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0435  acyl-CoA synthetase  43.37 
 
 
544 aa  386  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.232692 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4630  AMP-dependent synthetase and ligase  42.69 
 
 
544 aa  383  1e-105  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2987  AMP-dependent synthetase and ligase  44.06 
 
 
534 aa  374  1e-102  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.734432  normal  0.0264415 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3854  AMP-dependent synthetase and ligase  40.37 
 
 
550 aa  375  1e-102  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0051  AMP-dependent synthetase and ligase  39.43 
 
 
546 aa  356  5e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00256371 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2344  acyl-CoA synthetase  42.6 
 
 
531 aa  352  1e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.657578  decreased coverage  0.0026015 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1066  AMP-dependent synthetase and ligase  40.84 
 
 
560 aa  346  5e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4816  AMP-dependent synthetase and ligase  38.56 
 
 
562 aa  346  8e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1257  AMP-dependent synthetase and ligase  31.86 
 
 
518 aa  279  9e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6739  AMP-dependent synthetase and ligase  34.58 
 
 
532 aa  270  5e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0799452  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0001  AMP-dependent synthetase and ligase  31.71 
 
 
516 aa  249  1e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.743652 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4238  AMP-dependent synthetase and ligase  34.87 
 
 
527 aa  248  3e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3597  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.62 
 
 
543 aa  244  3e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3874  AMP-dependent synthetase and ligase  32.99 
 
 
510 aa  243  6e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0918503 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1967  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.2 
 
 
514 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.595404  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1871  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.4 
 
 
524 aa  239  9e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.394568  normal  0.852293 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0804  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.33 
 
 
516 aa  239  1e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.48042 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0943  AMP-dependent synthetase and ligase  31.55 
 
 
511 aa  238  2e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193061  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.28 
 
 
512 aa  238  2e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3980  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.33 
 
 
497 aa  237  4e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.310048  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4093  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.33 
 
 
497 aa  237  4e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0327517  normal  0.151728 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1821  AMP-binding protein  32.26 
 
 
500 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.133341 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.53 
 
 
514 aa  233  6e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3426  AMP-binding protein  31.99 
 
 
500 aa  233  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.473482  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3839  AMP-dependent synthetase and ligase  33.95 
 
 
508 aa  231  2e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6823  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase I  31.47 
 
 
492 aa  231  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3266  AMP-dependent synthetase and ligase  33.91 
 
 
511 aa  231  3e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2927  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.96 
 
 
509 aa  230  6e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.686689  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1905  AMP-dependent synthetase and ligase  32.82 
 
 
512 aa  230  6e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.97218  normal  0.26016 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3220  AMP-binding protein  32.28 
 
 
500 aa  229  7e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.530837  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1465  acyl-CoA synthetase  31.25 
 
 
487 aa  229  7e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.845905  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3439  AMP-binding protein  32.28 
 
 
500 aa  229  7e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4096  AMP-dependent synthetase and ligase  31.79 
 
 
508 aa  230  7e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0377217  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3127  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.59 
 
 
500 aa  229  1e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3473  AMP-binding protein  32.33 
 
 
488 aa  228  2e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3767  AMP-dependent synthetase and ligase  32.87 
 
 
512 aa  228  2e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0143855  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0423  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.2 
 
 
509 aa  228  2e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3436  AMP-binding protein  31.74 
 
 
499 aa  228  3e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  31.53 
 
 
521 aa  228  3e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3117  AMP-dependent synthetase and ligase  31.65 
 
 
500 aa  227  4e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.012438  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2699  AMP-binding enzyme, putative long chain fatty acid Co-A ligase, acetyl-CoA synthetase  29.86 
 
 
514 aa  227  5.0000000000000005e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3198  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32 
 
 
497 aa  226  6e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.335021  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2867  AMP-dependent synthetase and ligase  33.27 
 
 
552 aa  225  1e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.533017  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4161  acyl-CoA synthetase  32.1 
 
 
517 aa  225  1e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0015  acyl-CoA synthetase  31.59 
 
 
511 aa  226  1e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.323665 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  33.07 
 
 
503 aa  225  2e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1502  acyl-CoA synthetase  32.3 
 
 
515 aa  225  2e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3166  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.22 
 
 
501 aa  224  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130976  hitchhiker  0.0000354644 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1525  acyl-CoA synthetase  32.3 
 
 
515 aa  225  2e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3453  AMP-binding protein  31.14 
 
 
500 aa  224  3e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1502  acyl-CoA synthetase  32.1 
 
 
515 aa  223  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1604  AMP-dependent synthetase and ligase  33.73 
 
 
540 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3550  AMP-dependent synthetase and ligase  32.74 
 
 
520 aa  222  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2397  AMP-dependent synthetase and ligase  30.9 
 
 
516 aa  221  1.9999999999999999e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.264456  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2641  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.1 
 
 
516 aa  221  3e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.517138  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  30.75 
 
 
512 aa  220  5e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0027  AMP-dependent synthetase and ligase  30.6 
 
 
509 aa  218  2e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.141316  normal  0.236103 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3057  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.3 
 
 
499 aa  219  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.847241  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  32.02 
 
 
662 aa  219  2e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01193  acyl-CoA synthase  30.48 
 
 
544 aa  219  2e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0176178  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1600  AMP-dependent synthetase and ligase  32.73 
 
 
496 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5528  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.06 
 
 
509 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3565  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.78 
 
 
526 aa  216  7e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.011282  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1865  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.89 
 
 
519 aa  216  8e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.975513  normal  0.637576 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4700  acyl-CoA synthetase  30.53 
 
 
516 aa  216  9e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3161  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.98 
 
 
516 aa  216  9.999999999999999e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3855  AMP-dependent synthetase and ligase  31.95 
 
 
523 aa  214  1.9999999999999998e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.713722 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.28 
 
 
513 aa  215  1.9999999999999998e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5140  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.78 
 
 
525 aa  215  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.24744  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1650  AMP-binding domain protein  30.21 
 
 
549 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1124  AMP-dependent synthetase and ligase  32.68 
 
 
509 aa  215  1.9999999999999998e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.719867  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0449  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.12 
 
 
516 aa  215  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.93416 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5944  AMP-dependent synthetase and ligase  31.71 
 
 
532 aa  214  2.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420174  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2738  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.18 
 
 
522 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6898  AMP-dependent synthetase and ligase  31.49 
 
 
536 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4075  AMP-dependent synthetase and ligase  33.99 
 
 
521 aa  214  3.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0282  AMP-dependent synthetase and ligase  32.68 
 
 
492 aa  213  5.999999999999999e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.376129  normal  0.234171 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>