More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3605 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0848  AMP-dependent synthetase and ligase  59.96 
 
 		 517 aa  659    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3605  acyl-CoA synthetase  100 
 
 		 514 aa  1070    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.133038  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1905  AMP-dependent synthetase and ligase  57.17 
 
 		 512 aa  613  9.999999999999999e-175  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.97218  normal  0.26016 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3266  AMP-dependent synthetase and ligase  57.14 
 
 		 511 aa  599  1e-170  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1902  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  56.61 
 
 		 518 aa  585  1e-166  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.889055  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1681  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  55.82 
 
 		 514 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  55.82 
 
 		 513 aa  578  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1347  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  56.1 
 
 		 512 aa  580  1e-164  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3612  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  55.62 
 
 		 514 aa  580  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7124  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  55.82 
 
 		 512 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.100628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3161  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  54.44 
 
 		 516 aa  556  1e-157  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0221  AMP-dependent synthetase and ligase  53.24 
 
 		 510 aa  540  9.999999999999999e-153  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0912  AMP-dependent synthetase and ligase  52.44 
 
 		 515 aa  538  9.999999999999999e-153  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.881726 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  53.33 
 
 		 512 aa  537  1e-151  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5310  acyl-CoA synthetase  52.22 
 
 		 516 aa  520  1e-146  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3399  AMP-dependent synthetase and ligase  51.35 
 
 		 522 aa  512  1e-144  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2714  AMP-dependent synthetase and ligase  50.29 
 
 		 546 aa  505  9.999999999999999e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0681  acyl-CoA synthetase  49.71 
 
 		 520 aa  504  1e-141  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.457647 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4410  acyl-CoA synthetase  50.29 
 
 		 516 aa  504  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.648302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4700  acyl-CoA synthetase  50.1 
 
 		 516 aa  501  1e-140  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2695  AMP-dependent synthetase and ligase  48.72 
 
 		 516 aa  496  1e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0218  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.1 
 
 		 516 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0925378 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0166  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.5 
 
 		 506 aa  491  1e-137  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0449  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  49.71 
 
 		 516 aa  490  1e-137  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.93416 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2738  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.1 
 
 		 522 aa  490  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0177  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.5 
 
 		 506 aa  490  1e-137  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.761031  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0186  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.5 
 
 		 506 aa  490  1e-137  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0230763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2397  AMP-dependent synthetase and ligase  49.51 
 
 		 516 aa  485  1e-136  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.264456  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2936  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.8 
 
 		 536 aa  486  1e-136  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.098527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1502  acyl-CoA synthetase  49.41 
 
 		 515 aa  484  1e-135  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0015  acyl-CoA synthetase  49.02 
 
 		 511 aa  484  1e-135  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323665 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1525  acyl-CoA synthetase  49.41 
 
 		 515 aa  484  1e-135  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1502  acyl-CoA synthetase  49.02 
 
 		 515 aa  479  1e-134  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10216  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  49.41 
 
 		 537 aa  474  1e-132  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4737  acyl-CoA synthetase  48.51 
 
 		 501 aa  460  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.987006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4649  acyl-CoA synthetase  48.51 
 
 		 501 aa  460  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5032  acyl-CoA synthetase  48.32 
 
 		 501 aa  458  1e-127  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.672582  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1124  AMP-dependent synthetase and ligase  46.94 
 
 		 509 aa  443  1e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.719867  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6056  AMP-dependent synthetase and ligase  46.73 
 
 		 515 aa  441  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4161  acyl-CoA synthetase  46.08 
 
 		 517 aa  438  1e-121  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5158  putative o-succinylbenzoate-CoA ligase  45.58 
 
 		 527 aa  433  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.20469 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0696  AMP-dependent synthetase and ligase  45.62 
 
 		 521 aa  404  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0121  AMP-dependent synthetase and ligase  44.96 
 
 		 522 aa  396  1e-109  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0104  AMP-dependent synthetase and ligase  43.46 
 
 		 524 aa  398  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.256556 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2641  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.66 
 
 		 516 aa  398  1e-109  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.517138  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2838  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.87 
 
 		 515 aa  386  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.153198 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0570  AMP-dependent synthetase and ligase  43.44 
 
 		 525 aa  380  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.356446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3984  AMP-dependent synthetase and ligase  42.11 
 
 		 521 aa  368  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.446284  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1481  AMP-dependent synthetase and ligase  42.05 
 
 		 525 aa  360  3e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3089  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.23 
 
 		 522 aa  354  2e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.196285  normal  0.363977 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6823  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase I  40.23 
 
 		 492 aa  341  2e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1465  acyl-CoA synthetase  39.8 
 
 		 487 aa  335  7.999999999999999e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.845905  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3839  AMP-dependent synthetase and ligase  38.26 
 
 		 508 aa  335  9e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2787  AMP-dependent synthetase and ligase  39.88 
 
 		 518 aa  321  1.9999999999999998e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.296837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2707  AMP-dependent synthetase and ligase  39.56 
 
 		 519 aa  318  2e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0621527  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1967  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.72 
 
 		 514 aa  317  3e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.595404  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3597  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.67 
 
 		 543 aa  316  6e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3057  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.54 
 
 		 499 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.847241  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2927  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.05 
 
 		 509 aa  311  2e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.686689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1871  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.94 
 
 		 524 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.394568  normal  0.852293 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3874  AMP-dependent synthetase and ligase  37.23 
 
 		 510 aa  310  4e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0918503 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3215  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.61 
 
 		 500 aa  299  6e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0282  AMP-dependent synthetase and ligase  37.23 
 
 		 492 aa  298  2e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.376129  normal  0.234171 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0804  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.52 
 
 		 516 aa  296  7e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.48042 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0423  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.24 
 
 		 509 aa  293  4e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3166  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.22 
 
 		 501 aa  288  1e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130976  hitchhiker  0.0000354644 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6480  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.53 
 
 		 513 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3980  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.63 
 
 		 497 aa  281  2e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.310048  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4093  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.63 
 
 		 497 aa  281  2e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0327517  normal  0.151728 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5528  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.98 
 
 		 509 aa  279  7e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3247  AMP-dependent synthetase and ligase  37.33 
 
 		 497 aa  279  8e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.640388 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6878  AMP-dependent synthetase and ligase  33.85 
 
 		 509 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1034  AMP-dependent synthetase and ligase  34.3 
 
 		 495 aa  258  2e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1368  AMP-dependent synthetase and ligase  31.33 
 
 		 515 aa  257  3e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.663143  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1666  AMP-dependent synthetase and ligase  33.02 
 
 		 518 aa  256  8e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.144653  normal  0.373713 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4604  AMP-dependent synthetase and ligase  34.42 
 
 		 492 aa  255  1.0000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.37521 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0943  AMP-dependent synthetase and ligase  35.48 
 
 		 511 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0027  AMP-dependent synthetase and ligase  34.96 
 
 		 509 aa  253  5.000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.141316  normal  0.236103 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1112  putative acyl-CoA ligase  34.12 
 
 		 504 aa  251  3e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.29648 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1605  AMP-dependent synthetase and ligase  30.23 
 
 		 526 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4616  AMP-dependent synthetase and ligase  36.52 
 
 		 518 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.892742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6618  AMP-dependent synthetase and ligase  37.35 
 
 		 493 aa  244  3e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4096  AMP-dependent synthetase and ligase  33.66 
 
 		 508 aa  244  3.9999999999999997e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0377217  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0154  AMP-dependent synthetase and ligase  32.74 
 
 		 520 aa  243  7e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1600  AMP-dependent synthetase and ligase  32.31 
 
 		 496 aa  241  2e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01193  acyl-CoA synthase  31.24 
 
 		 544 aa  241  2e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0176178  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1868  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.35 
 
 		 525 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.205754 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1964  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.78 
 
 		 525 aa  240  4e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132088  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3600  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.59 
 
 		 525 aa  240  5e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.887287  normal  0.975846 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1025  AMP-dependent synthetase and ligase  32.68 
 
 		 498 aa  237  4e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3975  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.56 
 
 		 530 aa  237  4e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.251646  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1676  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.64 
 
 		 526 aa  237  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.591328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3514  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.54 
 
 		 525 aa  236  9e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270509  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3855  AMP-dependent synthetase and ligase  33.59 
 
 		 523 aa  236  1.0000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.713722 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1029  AMP-dependent synthetase and ligase  32.09 
 
 		 499 aa  235  1.0000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4081  AMP-dependent synthetase and ligase  33.27 
 
 		 512 aa  234  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5309  AMP-dependent synthetase and ligase  33.65 
 
 		 517 aa  233  6e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0102  AMP-dependent synthetase and ligase  34.3 
 
 		 520 aa  232  1e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  32.23 
 
 		 521 aa  231  3e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0351  AMP-dependent synthetase and ligase  31.76 
 
 		 507 aa  231  3e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>