More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1029 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1029  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 499 aa  1031    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1034  AMP-dependent synthetase and ligase  74.59 
 
 		 495 aa  777    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3247  AMP-dependent synthetase and ligase  59.63 
 
 		 497 aa  601  1e-170  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.640388 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1600  AMP-dependent synthetase and ligase  55.67 
 
 		 496 aa  573  1.0000000000000001e-162  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1599  AMP-dependent synthetase and ligase  57.38 
 
 		 484 aa  559  1e-158  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4604  AMP-dependent synthetase and ligase  53.33 
 
 		 492 aa  522  1e-147  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.37521 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1025  AMP-dependent synthetase and ligase  48.98 
 
 		 498 aa  455  1e-127  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1112  putative acyl-CoA ligase  46.6 
 
 		 504 aa  434  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.29648 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0419  AMP-dependent synthetase and ligase  46.39 
 
 		 492 aa  423  1e-117  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0725647  normal  0.0451868 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0351  AMP-dependent synthetase and ligase  46.57 
 
 		 507 aa  419  1e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0252  AMP-dependent synthetase and ligase  46.34 
 
 		 484 aa  415  1e-114  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.122402 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0213  AMP-dependent synthetase and ligase  46.49 
 
 		 491 aa  412  1e-114  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.65945 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0223  AMP-dependent synthetase and ligase  46.36 
 
 		 491 aa  409  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.803967  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0233  AMP-dependent synthetase and ligase  46.36 
 
 		 491 aa  409  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.318189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3099  AMP-dependent synthetase and ligase  37.58 
 
 		 513 aa  281  2e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000841335 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0614  AMP-dependent synthetase and ligase  37.63 
 
 		 502 aa  278  2e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1347  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.91 
 
 		 512 aa  265  1e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2738  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.04 
 
 		 522 aa  261  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3161  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.04 
 
 		 516 aa  261  3e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2714  AMP-dependent synthetase and ligase  36.08 
 
 		 546 aa  261  3e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4026  AMP-dependent synthetase and ligase  36.7 
 
 		 487 aa  260  4e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.863411  normal  0.734858 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4161  acyl-CoA synthetase  35.53 
 
 		 517 aa  259  8e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.71 
 
 		 512 aa  259  9e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1905  AMP-dependent synthetase and ligase  35.11 
 
 		 512 aa  258  2e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.97218  normal  0.26016 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0015  acyl-CoA synthetase  35.47 
 
 		 511 aa  253  5.000000000000001e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323665 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0166  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.67 
 
 		 506 aa  253  7e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0449  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.31 
 
 		 516 aa  252  9.000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.93416 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1465  acyl-CoA synthetase  36.94 
 
 		 487 aa  252  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.845905  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0696  AMP-dependent synthetase and ligase  34.75 
 
 		 521 aa  251  2e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5158  putative o-succinylbenzoate-CoA ligase  33.53 
 
 		 527 aa  251  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.20469 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1681  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.55 
 
 		 514 aa  249  6e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5032  acyl-CoA synthetase  34.92 
 
 		 501 aa  249  6e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.672582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0177  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.47 
 
 		 506 aa  249  6e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.761031  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2695  AMP-dependent synthetase and ligase  33.66 
 
 		 516 aa  249  6e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0186  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.47 
 
 		 506 aa  249  6e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0230763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6823  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase I  34.57 
 
 		 492 aa  249  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1902  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.33 
 
 		 518 aa  248  2e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.889055  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4700  acyl-CoA synthetase  34.18 
 
 		 516 aa  248  2e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4410  acyl-CoA synthetase  34.62 
 
 		 516 aa  248  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.648302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0848  AMP-dependent synthetase and ligase  33.53 
 
 		 517 aa  247  3e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2936  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.67 
 
 		 536 aa  247  3e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.098527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4737  acyl-CoA synthetase  34.72 
 
 		 501 aa  247  4e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.987006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4649  acyl-CoA synthetase  34.72 
 
 		 501 aa  247  4e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0681  acyl-CoA synthetase  33.85 
 
 		 520 aa  246  8e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.457647 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3597  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.39 
 
 		 543 aa  246  8e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0912  AMP-dependent synthetase and ligase  34.5 
 
 		 515 aa  246  8e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.881726 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2397  AMP-dependent synthetase and ligase  35.33 
 
 		 516 aa  246  9e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.264456  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2927  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.97 
 
 		 509 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.686689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0221  AMP-dependent synthetase and ligase  33.8 
 
 		 510 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1502  acyl-CoA synthetase  33.72 
 
 		 515 aa  244  3e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1525  acyl-CoA synthetase  33.72 
 
 		 515 aa  244  3e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0218  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.42 
 
 		 516 aa  243  7e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0925378 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1502  acyl-CoA synthetase  33.86 
 
 		 515 aa  243  7.999999999999999e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3612  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33 
 
 		 514 aa  242  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5310  acyl-CoA synthetase  34.87 
 
 		 516 aa  242  1e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3839  AMP-dependent synthetase and ligase  34.4 
 
 		 508 aa  238  1e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01193  acyl-CoA synthase  32.94 
 
 		 544 aa  238  2e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0176178  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3874  AMP-dependent synthetase and ligase  31.65 
 
 		 510 aa  237  3e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0918503 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3266  AMP-dependent synthetase and ligase  32.81 
 
 		 511 aa  237  3e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0804  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.53 
 
 		 516 aa  236  6e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.48042 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2641  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.93 
 
 		 516 aa  236  9e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.517138  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1871  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.92 
 
 		 524 aa  236  9e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.394568  normal  0.852293 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3605  acyl-CoA synthetase  32.09 
 
 		 514 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.133038  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1967  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.84 
 
 		 514 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.595404  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7124  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.09 
 
 		 512 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.100628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10216  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.33 
 
 		 537 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3166  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.61 
 
 		 501 aa  235  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130976  hitchhiker  0.0000354644 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6056  AMP-dependent synthetase and ligase  34.42 
 
 		 515 aa  233  5e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0282  AMP-dependent synthetase and ligase  36.18 
 
 		 492 aa  232  1e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.376129  normal  0.234171 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3215  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.21 
 
 		 500 aa  232  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0104  AMP-dependent synthetase and ligase  33.87 
 
 		 524 aa  231  2e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.256556 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0121  AMP-dependent synthetase and ligase  33.07 
 
 		 522 aa  230  4e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.6 
 
 		 513 aa  230  4e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0570  AMP-dependent synthetase and ligase  31.26 
 
 		 525 aa  230  4e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.356446  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4093  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.72 
 
 		 497 aa  230  5e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0327517  normal  0.151728 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3980  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.72 
 
 		 497 aa  230  5e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.310048  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1124  AMP-dependent synthetase and ligase  35.64 
 
 		 509 aa  229  7e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.719867  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2838  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.54 
 
 		 515 aa  229  1e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.153198 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0423  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.46 
 
 		 509 aa  229  1e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3399  AMP-dependent synthetase and ligase  34.26 
 
 		 522 aa  228  3e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5528  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.46 
 
 		 509 aa  223  8e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1368  AMP-dependent synthetase and ligase  32.34 
 
 		 515 aa  223  8e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.663143  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6480  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.63 
 
 		 513 aa  218  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3984  AMP-dependent synthetase and ligase  32.48 
 
 		 521 aa  213  5.999999999999999e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.446284  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2787  AMP-dependent synthetase and ligase  32.14 
 
 		 518 aa  211  4e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.296837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3057  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.94 
 
 		 499 aa  209  7e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.847241  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0397  acyl-CoA synthetase  31.78 
 
 		 564 aa  208  2e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.835434  normal  0.950858 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0341  acyl-CoA synthetase  31.12 
 
 		 569 aa  203  6e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0361  acyl-CoA synthetase  30.56 
 
 		 577 aa  203  6e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.171367  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0371  acyl-CoA synthetase  30.56 
 
 		 577 aa  203  6e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0350  acyl-CoA synthetase  30.56 
 
 		 574 aa  203  7e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3089  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.45 
 
 		 522 aa  203  8e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.196285  normal  0.363977 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10274  acyl-CoA synthetase  30.28 
 
 		 560 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0406036 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2707  AMP-dependent synthetase and ligase  30.55 
 
 		 519 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0621527  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6739  AMP-dependent synthetase and ligase  31.71 
 
 		 532 aa  200  5e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0799452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4096  AMP-dependent synthetase and ligase  32.17 
 
 		 508 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0377217  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1481  AMP-dependent synthetase and ligase  31.37 
 
 		 525 aa  198  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13440  acyl-CoA synthetase  31.29 
 
 		 539 aa  197  3e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1225  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.98 
 
 		 519 aa  196  7e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.399435  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2105  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.77 
 
 		 524 aa  194  4e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>