More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1763 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1347  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  60.64 
 
 		 512 aa  660    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  100 
 
 		 512 aa  1056    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0848  AMP-dependent synthetase and ligase  58.07 
 
 		 517 aa  616  1e-175  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3161  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  58.86 
 
 		 516 aa  607  9.999999999999999e-173  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0221  AMP-dependent synthetase and ligase  55.95 
 
 		 510 aa  581  1.0000000000000001e-165  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  54.79 
 
 		 513 aa  578  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1905  AMP-dependent synthetase and ligase  55.47 
 
 		 512 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.97218  normal  0.26016 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1902  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  53.49 
 
 		 518 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.889055  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3266  AMP-dependent synthetase and ligase  53.95 
 
 		 511 aa  556  1e-157  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7124  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  53.97 
 
 		 512 aa  553  1e-156  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.100628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1681  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  52.73 
 
 		 514 aa  548  1e-155  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3612  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  51.76 
 
 		 514 aa  542  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3605  acyl-CoA synthetase  53.33 
 
 		 514 aa  537  1e-151  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.133038  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5310  acyl-CoA synthetase  51.68 
 
 		 516 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4700  acyl-CoA synthetase  50.3 
 
 		 516 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4410  acyl-CoA synthetase  50.1 
 
 		 516 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.648302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10216  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  52.62 
 
 		 537 aa  502  1e-141  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0681  acyl-CoA synthetase  51.08 
 
 		 520 aa  501  1e-140  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.457647 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0912  AMP-dependent synthetase and ligase  52.55 
 
 		 515 aa  496  1e-139  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.881726 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0166  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  52.3 
 
 		 506 aa  492  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0177  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  52.3 
 
 		 506 aa  491  1e-137  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.761031  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0186  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  52.3 
 
 		 506 aa  491  1e-137  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0230763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0218  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  52.08 
 
 		 516 aa  490  1e-137  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0925378 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0449  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.98 
 
 		 516 aa  485  1e-136  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.93416 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2714  AMP-dependent synthetase and ligase  49.71 
 
 		 546 aa  485  1e-136  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2397  AMP-dependent synthetase and ligase  48.94 
 
 		 516 aa  473  1e-132  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.264456  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5032  acyl-CoA synthetase  51.27 
 
 		 501 aa  473  1e-132  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.672582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0015  acyl-CoA synthetase  49.32 
 
 		 511 aa  473  1e-132  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.323665 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2738  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  51.08 
 
 		 522 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4649  acyl-CoA synthetase  51.08 
 
 		 501 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4737  acyl-CoA synthetase  51.08 
 
 		 501 aa  471  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.987006  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1124  AMP-dependent synthetase and ligase  49.51 
 
 		 509 aa  467  9.999999999999999e-131  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.719867  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4161  acyl-CoA synthetase  48.71 
 
 		 517 aa  467  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2695  AMP-dependent synthetase and ligase  49.03 
 
 		 516 aa  459  9.999999999999999e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5158  putative o-succinylbenzoate-CoA ligase  46.91 
 
 		 527 aa  457  1e-127  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.20469 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3399  AMP-dependent synthetase and ligase  49.14 
 
 		 522 aa  453  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1502  acyl-CoA synthetase  46.67 
 
 		 515 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2936  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.86 
 
 		 536 aa  438  1e-121  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.098527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1502  acyl-CoA synthetase  46.27 
 
 		 515 aa  435  1e-120  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1525  acyl-CoA synthetase  46.27 
 
 		 515 aa  435  1e-120  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6056  AMP-dependent synthetase and ligase  45.13 
 
 		 515 aa  432  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0696  AMP-dependent synthetase and ligase  44.01 
 
 		 521 aa  398  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0104  AMP-dependent synthetase and ligase  43.39 
 
 		 524 aa  389  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.256556 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0121  AMP-dependent synthetase and ligase  43.39 
 
 		 522 aa  382  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2641  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.68 
 
 		 516 aa  360  5e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.517138  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2707  AMP-dependent synthetase and ligase  42.48 
 
 		 519 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0621527  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1481  AMP-dependent synthetase and ligase  41.85 
 
 		 525 aa  357  2.9999999999999997e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3984  AMP-dependent synthetase and ligase  42.51 
 
 		 521 aa  353  4e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.446284  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1465  acyl-CoA synthetase  42.28 
 
 		 487 aa  350  4e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.845905  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2838  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.06 
 
 		 515 aa  344  2e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.153198 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6823  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase I  41.03 
 
 		 492 aa  342  1e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0570  AMP-dependent synthetase and ligase  42.13 
 
 		 525 aa  340  2.9999999999999998e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.356446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3089  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.25 
 
 		 522 aa  337  2.9999999999999997e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.196285  normal  0.363977 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1871  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.31 
 
 		 524 aa  332  1e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.394568  normal  0.852293 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2927  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.07 
 
 		 509 aa  330  5.0000000000000004e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.686689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3057  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.2 
 
 		 499 aa  325  2e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.847241  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0804  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.61 
 
 		 516 aa  325  2e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.48042 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3597  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.18 
 
 		 543 aa  324  2e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1967  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.42 
 
 		 514 aa  324  3e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.595404  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2787  AMP-dependent synthetase and ligase  38.93 
 
 		 518 aa  319  9e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.296837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3839  AMP-dependent synthetase and ligase  39.84 
 
 		 508 aa  317  2e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3874  AMP-dependent synthetase and ligase  38.27 
 
 		 510 aa  308  2.0000000000000002e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0918503 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0423  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.45 
 
 		 509 aa  307  3e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0282  AMP-dependent synthetase and ligase  40.59 
 
 		 492 aa  306  4.0000000000000004e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.376129  normal  0.234171 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3166  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.16 
 
 		 501 aa  306  6e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130976  hitchhiker  0.0000354644 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3215  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.74 
 
 		 500 aa  303  6.000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1368  AMP-dependent synthetase and ligase  36.2 
 
 		 515 aa  302  1e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.663143  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5528  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.15 
 
 		 509 aa  288  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4093  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.38 
 
 		 497 aa  280  6e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0327517  normal  0.151728 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3980  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.38 
 
 		 497 aa  280  6e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.310048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6480  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.77 
 
 		 513 aa  278  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01193  acyl-CoA synthase  33.15 
 
 		 544 aa  265  2e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0176178  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1029  AMP-dependent synthetase and ligase  36.79 
 
 		 499 aa  259  7e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3247  AMP-dependent synthetase and ligase  36.31 
 
 		 497 aa  259  1e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.640388 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1600  AMP-dependent synthetase and ligase  35.32 
 
 		 496 aa  258  2e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1034  AMP-dependent synthetase and ligase  36.2 
 
 		 495 aa  257  3e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1599  AMP-dependent synthetase and ligase  35.67 
 
 		 484 aa  249  9e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1025  AMP-dependent synthetase and ligase  37.14 
 
 		 498 aa  242  1e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1112  putative acyl-CoA ligase  36.73 
 
 		 504 aa  240  5e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.29648 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4604  AMP-dependent synthetase and ligase  35.59 
 
 		 492 aa  239  5.999999999999999e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.37521 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1666  AMP-dependent synthetase and ligase  32.38 
 
 		 518 aa  235  2.0000000000000002e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.144653  normal  0.373713 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0943  AMP-dependent synthetase and ligase  33.78 
 
 		 511 aa  234  3e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  35.04 
 
 		 503 aa  234  3e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  34.22 
 
 		 520 aa  233  5e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0861  AMP-dependent synthetase and ligase  32.88 
 
 		 514 aa  233  6e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  33.6 
 
 		 525 aa  233  6e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0027  AMP-dependent synthetase and ligase  34.12 
 
 		 509 aa  231  2e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.141316  normal  0.236103 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6739  AMP-dependent synthetase and ligase  34.13 
 
 		 532 aa  231  3e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0799452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  32.76 
 
 		 534 aa  229  8e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.55948  normal  0.800046 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0927  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.71 
 
 		 518 aa  228  2e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6618  AMP-dependent synthetase and ligase  36.55 
 
 		 493 aa  228  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4096  AMP-dependent synthetase and ligase  34 
 
 		 508 aa  227  5.0000000000000005e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0377217  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6878  AMP-dependent synthetase and ligase  32.49 
 
 		 509 aa  226  9e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615245  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0965  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.1 
 
 		 518 aa  225  1e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0707  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33 
 
 		 518 aa  225  1e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.413153  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0252  AMP-dependent synthetase and ligase  34.02 
 
 		 484 aa  225  2e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.122402 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  33.6 
 
 		 520 aa  224  2e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2323  AMP-dependent synthetase and ligase  34.18 
 
 		 511 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0351  AMP-dependent synthetase and ligase  33.59 
 
 		 507 aa  223  4.9999999999999996e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1052  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.71 
 
 		 518 aa  223  8e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>