More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2522 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2522  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 534 aa  1092    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3129  AMP-dependent synthetase and ligase  76.82 
 
 		 534 aa  865    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0714  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  57.3 
 
 		 579 aa  619  1e-176  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0105  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  58.3 
 
 		 556 aa  613  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.356608  normal  0.265858 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0115  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  58.35 
 
 		 556 aa  612  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0124  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  58.35 
 
 		 556 aa  612  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.514213  normal  0.109541 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0131  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  57.12 
 
 		 570 aa  610  1e-173  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10167  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  56.12 
 
 		 554 aa  588  1e-167  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4181  AMP-dependent synthetase and ligase  56.31 
 
 		 527 aa  581  1e-164  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1488  AMP-dependent synthetase and ligase  55.45 
 
 		 525 aa  555  1e-157  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0982209  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4684  AMP-dependent synthetase and ligase  53.91 
 
 		 526 aa  545  1e-154  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4008  AMP-dependent synthetase and ligase  47.63 
 
 		 1043 aa  444  1e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  44.96 
 
 		 520 aa  394  1e-108  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  40.52 
 
 		 503 aa  345  1e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5944  AMP-dependent synthetase and ligase  39.88 
 
 		 532 aa  335  1e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420174  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4616  AMP-dependent synthetase and ligase  40.58 
 
 		 518 aa  330  5.0000000000000004e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.892742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3215  O-succinylbenzoate-CoA ligase  41.37 
 
 		 517 aa  328  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0554015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3204  O-succinylbenzoate-CoA ligase  41.37 
 
 		 517 aa  328  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.716175  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3266  O-succinylbenzoate-CoA ligase  41.37 
 
 		 517 aa  328  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.10141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0814  AMP-dependent synthetase and ligase  40.43 
 
 		 508 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2525  AMP-dependent synthetase and ligase  36.99 
 
 		 516 aa  313  2.9999999999999996e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.695888 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1614  AMP-dependent synthetase and ligase  38.23 
 
 		 509 aa  313  6.999999999999999e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5438  AMP-dependent synthetase and ligase  36.67 
 
 		 515 aa  307  3e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  38.72 
 
 		 499 aa  303  4.0000000000000003e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1604  AMP-dependent synthetase and ligase  36.87 
 
 		 540 aa  303  8.000000000000001e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4072  AMP-dependent synthetase and ligase  38.31 
 
 		 508 aa  300  3e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0894  acyl-CoA synthetase  36.91 
 
 		 520 aa  298  1e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.493906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4758  AMP-dependent synthetase and ligase  37.72 
 
 		 518 aa  295  2e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0843  acyl-CoA synthetase  36.27 
 
 		 513 aa  294  3e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.333452  normal  0.193709 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  37.45 
 
 		 490 aa  293  7e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3808  AMP-dependent synthetase and ligase  37.48 
 
 		 508 aa  292  1e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.762435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0102  AMP-dependent synthetase and ligase  37.38 
 
 		 520 aa  291  2e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1964  acyl-CoA synthetase  34.63 
 
 		 496 aa  291  2e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000141031 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2377  AMP-dependent synthetase and ligase  37.33 
 
 		 530 aa  291  3e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.581612  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.31 
 
 		 514 aa  290  3e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4826  AMP-dependent synthetase and ligase  37.55 
 
 		 520 aa  290  3e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0178748  normal  0.551416 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5827  AMP-dependent synthetase and ligase  36.35 
 
 		 518 aa  290  5.0000000000000004e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.671788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08640  acyl-CoA synthetase  36.87 
 
 		 516 aa  290  5.0000000000000004e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.310549  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1789  acyl-CoA synthetase  34.82 
 
 		 496 aa  289  7e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0554946  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1928  acyl-CoA synthetase  34.82 
 
 		 496 aa  289  7e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.132163  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7494  acyl-CoA synthetase  36.38 
 
 		 521 aa  288  2e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.489378  normal  0.204527 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3747  AMP-dependent synthetase and ligase  36.25 
 
 		 514 aa  288  2e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3819  O-succinylbenzoate-CoA ligase  36.95 
 
 		 529 aa  288  2e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2032  AMP-dependent synthetase and ligase  38.26 
 
 		 551 aa  287  4e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.367958 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1367  AMP-dependent synthetase and ligase  36.51 
 
 		 502 aa  286  7e-76  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.439129  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2924  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.95 
 
 		 526 aa  286  7e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.42655 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1225  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.93 
 
 		 519 aa  286  7e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.399435  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1746  acyl-CoA synthetase  34.05 
 
 		 496 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0027  AMP-dependent synthetase and ligase  36.36 
 
 		 509 aa  281  2e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.141316  normal  0.236103 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4202  acyl-CoA synthetase  37.18 
 
 		 534 aa  281  2e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.269622  hitchhiker  0.00584314 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0970  AMP-dependent synthetase and ligase  37.5 
 
 		 520 aa  280  3e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2089  AMP-dependent synthetase and ligase  36.22 
 
 		 530 aa  280  4e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3816  AMP-dependent synthetase and ligase  36.02 
 
 		 518 aa  280  4e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0163789  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2406  AMP-dependent synthetase and ligase  36.65 
 
 		 509 aa  279  8e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0466191 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0411  acyl-CoA synthetase  34.77 
 
 		 522 aa  279  1e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4902  AMP-dependent synthetase and ligase  35.98 
 
 		 501 aa  279  1e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2105  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36 
 
 		 524 aa  279  1e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2351  acyl-CoA synthetase  34.36 
 
 		 517 aa  278  2e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.197387  normal  0.399216 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2038  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  34.32 
 
 		 565 aa  278  3e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6878  AMP-dependent synthetase and ligase  33.27 
 
 		 509 aa  276  5e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0737  AMP-dependent synthetase and ligase  36.31 
 
 		 522 aa  276  6e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188702  normal  0.517642 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6078  AMP-dependent synthetase and ligase  35.31 
 
 		 553 aa  276  7e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.225727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0667  putative O-succinylbenzoate--CoA ligase  37.14 
 
 		 516 aa  276  9e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.604577  normal  0.0579833 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3704  AMP-dependent synthetase and ligase  34.12 
 
 		 515 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0990866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1676  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.98 
 
 		 526 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.591328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5271  AMP-dependent synthetase and ligase  36.38 
 
 		 541 aa  274  3e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.675059 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4691  AMP-dependent synthetase and ligase  35.56 
 
 		 502 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3600  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.04 
 
 		 525 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.887287  normal  0.975846 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0943  AMP-dependent synthetase and ligase  37.25 
 
 		 511 aa  273  5.000000000000001e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2371  acyl-CoA synthetase  36.08 
 
 		 532 aa  272  1e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1593  AMP-dependent synthetase and ligase  35.86 
 
 		 559 aa  272  1e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0495218 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5576  acyl-CoA synthetase  37.83 
 
 		 519 aa  272  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.628229  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4891  AMP-dependent synthetase and ligase  35.06 
 
 		 520 aa  272  1e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.862065  normal  0.74496 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0642  acyl-CoA synthetase  35.92 
 
 		 529 aa  272  1e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.95301  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0965  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.65 
 
 		 518 aa  271  2e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1052  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.25 
 
 		 518 aa  271  2e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3565  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.11 
 
 		 526 aa  271  2.9999999999999997e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.011282  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1515  AMP-dependent synthetase and ligase  35.81 
 
 		 515 aa  270  5e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00288915  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1538  AMP-dependent synthetase and ligase  35.81 
 
 		 515 aa  270  5e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1823  AMP-dependent synthetase and ligase  36.94 
 
 		 590 aa  269  8e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340501  normal  0.0118022 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1660  AMP-dependent synthetase and ligase  36.62 
 
 		 523 aa  269  1e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104845  normal  0.559317 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0558  AMP-dependent synthetase and ligase  36.94 
 
 		 584 aa  268  1e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4080  AMP-dependent synthetase and ligase  33.86 
 
 		 518 aa  269  1e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.656205  normal  0.161644 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1868  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.25 
 
 		 525 aa  268  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.205754 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.99 
 
 		 512 aa  268  2e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3720  AMP-dependent synthetase and ligase  34.99 
 
 		 518 aa  268  2e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.189603  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1964  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.12 
 
 		 525 aa  268  2e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132088  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3124  AMP-dependent synthetase and ligase  33.68 
 
 		 545 aa  267  2.9999999999999995e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4559  acyl-CoA synthetase  34.58 
 
 		 529 aa  267  4e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.134713  normal  0.114816 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4921  acyl-CoA synthetase  34.74 
 
 		 531 aa  267  4e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1008  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.6 
 
 		 510 aa  266  5.999999999999999e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3993  AMP-dependent synthetase and ligase  34.94 
 
 		 524 aa  266  7e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.968795  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4096  AMP-dependent synthetase and ligase  37.03 
 
 		 508 aa  266  8e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0377217  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0503  AMP-dependent synthetase and ligase  35.99 
 
 		 492 aa  265  1e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.86 
 
 		 510 aa  265  1e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5763  AMP-dependent synthetase and ligase  35.55 
 
 		 500 aa  265  1e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4181  acyl-CoA synthetase  35.36 
 
 		 522 aa  265  1e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.273498 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.86 
 
 		 510 aa  265  2e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0682  AMP-dependent synthetase and ligase  32.46 
 
 		 530 aa  264  2e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0743  AMP-dependent synthetase and ligase  36.5 
 
 		 522 aa  265  2e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.83543  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>