More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2870 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1082  AMP-dependent synthetase and ligase  61.74 
 
 		 526 aa  640    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3179  AMP-dependent synthetase and ligase  62.13 
 
 		 520 aa  641    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2870  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 520 aa  1077    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1249  AMP-dependent synthetase and ligase  37.23 
 
 		 530 aa  325  1e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3158  AMP-dependent synthetase and ligase  36.06 
 
 		 490 aa  312  7.999999999999999e-84  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2866  AMP-dependent synthetase and ligase  35.6 
 
 		 523 aa  312  1e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2958  AMP-dependent synthetase and ligase  35.8 
 
 		 523 aa  305  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1742  AMP-dependent synthetase and ligase  33.27 
 
 		 497 aa  292  1e-77  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.441923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1956  AMP-dependent synthetase and ligase  34.17 
 
 		 538 aa  289  9e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.536259  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0490  AMP-dependent synthetase and ligase  35.21 
 
 		 512 aa  288  1e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2785  AMP-dependent synthetase and ligase  34.82 
 
 		 534 aa  288  2e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634484  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3648  AMP-dependent synthetase and ligase  35.22 
 
 		 519 aa  279  8e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2882  AMP-dependent synthetase and ligase  34.68 
 
 		 514 aa  277  4e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3111  AMP-dependent synthetase and ligase  37.11 
 
 		 418 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0188419 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4336  AMP-dependent synthetase and ligase  32.76 
 
 		 515 aa  271  2e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0623029  hitchhiker  0.00463044 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2670  AMP-dependent synthetase and ligase  34.23 
 
 		 531 aa  271  2e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4497  AMP-dependent synthetase and ligase  35.28 
 
 		 517 aa  270  5e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2434  AMP-dependent synthetase and ligase  32.82 
 
 		 553 aa  268  1e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2529  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  32.18 
 
 		 532 aa  267  4e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0437982 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1393  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  32.02 
 
 		 530 aa  261  3e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0696312  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2384  long chain acyl-CoA synthetase  32.5 
 
 		 522 aa  259  1e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.838987  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0125  AMP-dependent synthetase and ligase  32.12 
 
 		 533 aa  254  3e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0699  AMP-dependent synthetase and ligase  30.57 
 
 		 545 aa  250  4e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4273  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  31.12 
 
 		 536 aa  250  5e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000408842 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.3 
 
 		 514 aa  248  1e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  30.72 
 
 		 662 aa  248  3e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  31.26 
 
 		 521 aa  244  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7014  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  31.43 
 
 		 529 aa  243  5e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00188129 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1564  AMP-dependent synthetase and ligase  31.49 
 
 		 529 aa  243  7e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.29 
 
 		 512 aa  242  1e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0616  AMP-binding domain-containing protein  31.18 
 
 		 608 aa  240  5e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.117672  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1574  AMP-binding domain-containing protein  31.18 
 
 		 535 aa  240  5.999999999999999e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.575944  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2211  AMP-binding domain-containing protein  31.18 
 
 		 691 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2026  AMP-binding domain-containing protein  31.18 
 
 		 535 aa  240  5.999999999999999e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2124  AMP-binding domain-containing protein  31.18 
 
 		 535 aa  240  5.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0705  AMP-binding domain-containing protein  31.18 
 
 		 535 aa  240  5.999999999999999e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1884  AMP-dependent synthetase and ligase  29.88 
 
 		 495 aa  239  8e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2020  AMP-dependent synthetase and ligase  28.85 
 
 		 523 aa  238  2e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.256098 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5320  AMP-dependent synthetase and ligase  33.4 
 
 		 521 aa  236  7e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.93 
 
 		 510 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0422  putative AMP-dependent synthetase and ligase  30.32 
 
 		 538 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.838411  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1003  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.93 
 
 		 510 aa  234  3e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3839  AMP-dependent synthetase and ligase  31.42 
 
 		 506 aa  234  3e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.223442  normal  0.234006 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  30.68 
 
 		 512 aa  234  3e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1123  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.93 
 
 		 510 aa  234  3e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.93 
 
 		 510 aa  234  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1019  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.93 
 
 		 510 aa  234  4.0000000000000004e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1091  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.93 
 
 		 510 aa  234  4.0000000000000004e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.74 
 
 		 510 aa  233  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1169  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.74 
 
 		 510 aa  233  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0840  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.91 
 
 		 510 aa  232  1e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1008  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.13 
 
 		 510 aa  232  1e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0137  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  30.61 
 
 		 539 aa  232  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.08 
 
 		 510 aa  231  2e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5944  AMP-dependent synthetase and ligase  31.85 
 
 		 532 aa  231  3e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420174  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3426  AMP-dependent synthetase and ligase  31.67 
 
 		 505 aa  229  1e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.872115 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0116  AMP-dependent synthetase and ligase  32.23 
 
 		 528 aa  229  1e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3735  AMP-dependent synthetase and ligase  31.8 
 
 		 505 aa  228  2e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2407  AMP-dependent synthetase and ligase  28.74 
 
 		 498 aa  228  3e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.676828  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3621  AMP-dependent synthetase and ligase  32.05 
 
 		 505 aa  227  3e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531462  normal  0.0257473 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  32.22 
 
 		 490 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4379  AMP-dependent synthetase and ligase  33.13 
 
 		 506 aa  226  7e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.177409 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0109  AMP-dependent synthetase and ligase  31.52 
 
 		 528 aa  225  2e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4684  AMP-dependent synthetase and ligase  30.83 
 
 		 526 aa  224  3e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2048  AMP-dependent synthetase and ligase  31.33 
 
 		 516 aa  223  7e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1292  AMP-dependent synthetase and ligase  31.46 
 
 		 523 aa  222  9.999999999999999e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  31.64 
 
 		 506 aa  222  1.9999999999999999e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0267  long-chain fatty-acid-CoA ligase  30.89 
 
 		 492 aa  219  1e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.250834 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1604  AMP-dependent synthetase and ligase  30.75 
 
 		 540 aa  218  2e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6138  AMP-dependent synthetase and ligase  30.7 
 
 		 524 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.623044  normal  0.113053 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0894  acyl-CoA synthetase  28.76 
 
 		 520 aa  217  4e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.493906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3804  AMP-dependent synthetase and ligase  29.49 
 
 		 529 aa  217  4e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0096  AMP-dependent synthetase and ligase  28.24 
 
 		 527 aa  216  9e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2323  AMP-dependent synthetase and ligase  29.2 
 
 		 511 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1070  AMP-dependent synthetase and ligase  30.9 
 
 		 565 aa  215  1.9999999999999998e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0635723  normal  0.557335 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  28.12 
 
 		 553 aa  215  1.9999999999999998e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2158  putative long-chain-fatty-acid-CoA ligase  30.06 
 
 		 515 aa  214  3.9999999999999995e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1725  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.68 
 
 		 585 aa  214  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00134138  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1746  acyl-CoA synthetase  29.04 
 
 		 496 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  29.13 
 
 		 499 aa  213  4.9999999999999996e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0734  AMP-dependent synthetase and ligase  30.25 
 
 		 511 aa  213  5.999999999999999e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0300  acyl-CoA synthetase  29.37 
 
 		 537 aa  213  7e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0309  acyl-CoA synthetase  29.37 
 
 		 537 aa  213  7e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0319  acyl-CoA synthetase  29.37 
 
 		 537 aa  213  7e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.43856 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1057  AMP-dependent synthetase and ligase  29.22 
 
 		 545 aa  213  7.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3226  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31 
 
 		 561 aa  213  7.999999999999999e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0111  AMP-dependent synthetase and ligase  28.4 
 
 		 526 aa  213  9e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.471366  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0642  acyl-CoA synthetase  28.91 
 
 		 529 aa  213  9e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.95301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3261  AMP-dependent synthetase and ligase  28.46 
 
 		 534 aa  212  1e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2474  AMP-dependent synthetase and ligase  29.23 
 
 		 522 aa  211  2e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1789  acyl-CoA synthetase  28.93 
 
 		 496 aa  212  2e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0554946  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1756  AMP-dependent synthetase and ligase  28.52 
 
 		 564 aa  211  2e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.598576 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1928  acyl-CoA synthetase  28.93 
 
 		 496 aa  212  2e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.132163  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2709  AMP-dependent synthetase and ligase  30.28 
 
 		 531 aa  212  2e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0786644  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4559  acyl-CoA synthetase  29.07 
 
 		 529 aa  212  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.134713  normal  0.114816 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1964  acyl-CoA synthetase  29.04 
 
 		 496 aa  212  2e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000141031 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7494  acyl-CoA synthetase  28.77 
 
 		 521 aa  211  3e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.489378  normal  0.204527 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  29.5 
 
 		 503 aa  210  5e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  28.84 
 
 		 525 aa  210  5e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2245  AMP-dependent synthetase and ligase  31.36 
 
 		 519 aa  210  6e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00923204  normal  0.0183444 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>