More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_A0128 on replicon NC_008785
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008785  BMASAVP1_A0128  AMP-binding domain-containing protein  100 
 
 
522 aa  1042    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3158  AMP-binding domain-containing protein  100 
 
 
522 aa  1042    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0707  AMP-binding domain-containing protein  99.04 
 
 
522 aa  1031    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.160608  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0541  AMP-binding domain-containing protein  99.04 
 
 
522 aa  1031    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0523  AMP-binding domain-containing protein  99.23 
 
 
522 aa  1031    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1460  AMP-binding domain-containing protein  100 
 
 
522 aa  1042    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2888  AMP-binding domain-containing protein  100 
 
 
522 aa  1042    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6138  AMP-dependent synthetase and ligase  63.44 
 
 
524 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.623044  normal  0.113053 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7423  AMP-dependent synthetase and ligase  63.95 
 
 
524 aa  599  1e-170  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.113615  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6505  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  62.55 
 
 
527 aa  586  1e-166  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.679628 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5649  AMP-dependent synthetase and ligase  62.45 
 
 
531 aa  585  1e-166  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0472962  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6014  AMP-dependent synthetase and ligase  62.45 
 
 
531 aa  585  1e-166  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.010036  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1564  AMP-dependent synthetase and ligase  47.91 
 
 
529 aa  461  9.999999999999999e-129  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0699  AMP-dependent synthetase and ligase  48.7 
 
 
545 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0137  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  51.15 
 
 
539 aa  449  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0422  putative AMP-dependent synthetase and ligase  50.1 
 
 
538 aa  444  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.838411  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1956  AMP-dependent synthetase and ligase  48.37 
 
 
538 aa  439  9.999999999999999e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.536259  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0125  AMP-dependent synthetase and ligase  48.19 
 
 
533 aa  438  1e-121  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2434  AMP-dependent synthetase and ligase  47.01 
 
 
553 aa  432  1e-120  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4273  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  48.76 
 
 
536 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000408842 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0616  AMP-binding domain-containing protein  49.52 
 
 
608 aa  429  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.117672  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2211  AMP-binding domain-containing protein  49.52 
 
 
691 aa  429  1e-119  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2124  AMP-binding domain-containing protein  49.52 
 
 
535 aa  428  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1574  AMP-binding domain-containing protein  49.52 
 
 
535 aa  428  1e-118  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.575944  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2529  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  48.62 
 
 
532 aa  426  1e-118  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0437982 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7014  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  49.91 
 
 
529 aa  426  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00188129 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0705  AMP-binding domain-containing protein  49.52 
 
 
535 aa  428  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1393  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  49.06 
 
 
530 aa  427  1e-118  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0696312  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2026  AMP-binding domain-containing protein  49.52 
 
 
535 aa  428  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2670  AMP-dependent synthetase and ligase  46.51 
 
 
531 aa  423  1e-117  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3804  AMP-dependent synthetase and ligase  50.39 
 
 
529 aa  421  1e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3134  AMP-dependent synthetase and ligase  46.64 
 
 
538 aa  375  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.324571  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2020  AMP-dependent synthetase and ligase  39.29 
 
 
523 aa  368  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.256098 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1930  AMP-dependent synthetase and ligase  47.75 
 
 
510 aa  368  1e-100  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.426512  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4029  AMP-dependent synthetase and ligase  48.8 
 
 
509 aa  342  8e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.302171  normal  0.718731 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1292  AMP-dependent synthetase and ligase  43.31 
 
 
523 aa  334  2e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2338  AMP-dependent synthetase and ligase  45.78 
 
 
509 aa  319  6e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3621  AMP-dependent synthetase and ligase  41.88 
 
 
505 aa  309  6.999999999999999e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531462  normal  0.0257473 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3426  AMP-dependent synthetase and ligase  42.23 
 
 
505 aa  299  7e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.872115 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3735  AMP-dependent synthetase and ligase  41.67 
 
 
505 aa  296  8e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0096  AMP-dependent synthetase and ligase  35.48 
 
 
527 aa  283  4.0000000000000003e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0111  AMP-dependent synthetase and ligase  35.81 
 
 
526 aa  278  2e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.471366  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4336  AMP-dependent synthetase and ligase  35.88 
 
 
515 aa  274  3e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0623029  hitchhiker  0.00463044 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1834  AMP-dependent synthetase and ligase  39.12 
 
 
529 aa  268  2e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2882  AMP-dependent synthetase and ligase  34.87 
 
 
514 aa  265  2e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2384  long chain acyl-CoA synthetase  33.97 
 
 
522 aa  263  6.999999999999999e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.838987  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0490  AMP-dependent synthetase and ligase  35.43 
 
 
512 aa  262  1e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3648  AMP-dependent synthetase and ligase  35.95 
 
 
519 aa  258  2e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5320  AMP-dependent synthetase and ligase  35.48 
 
 
521 aa  234  2.0000000000000002e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1249  AMP-dependent synthetase and ligase  34.47 
 
 
530 aa  230  4e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3179  AMP-dependent synthetase and ligase  33.46 
 
 
520 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1082  AMP-dependent synthetase and ligase  33.52 
 
 
526 aa  220  6e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3884  AMP-dependent synthetase and ligase  35.36 
 
 
497 aa  218  2e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.445629  normal  0.108787 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1011  TetR family transcriptional regulator  33.27 
 
 
770 aa  217  4e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2958  AMP-dependent synthetase and ligase  34.78 
 
 
523 aa  216  8e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2866  AMP-dependent synthetase and ligase  34.64 
 
 
523 aa  216  8e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2048  AMP-dependent synthetase and ligase  31.78 
 
 
516 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5944  AMP-dependent synthetase and ligase  32.96 
 
 
532 aa  207  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420174  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2785  AMP-dependent synthetase and ligase  33.46 
 
 
534 aa  207  3e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634484  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.57 
 
 
514 aa  205  2e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08640  acyl-CoA synthetase  33.27 
 
 
516 aa  204  4e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.310549  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2351  amino acid adenylation domain-containing protein  29.33 
 
 
541 aa  204  4e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2870  AMP-dependent synthetase and ligase  29.43 
 
 
520 aa  204  4e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1423  AMP-dependent synthetase and ligase  34.79 
 
 
510 aa  201  3e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1742  AMP-dependent synthetase and ligase  30.93 
 
 
497 aa  201  3e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.441923  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1189  AMP-dependent synthetase and ligase  32.33 
 
 
548 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  30.41 
 
 
490 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0331  AMP-dependent synthetase and ligase  32.11 
 
 
513 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.194455 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1123  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.45 
 
 
510 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1019  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.45 
 
 
510 aa  195  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.6 
 
 
512 aa  195  1e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.12 
 
 
510 aa  195  1e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1091  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.45 
 
 
510 aa  195  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.12 
 
 
510 aa  196  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.12 
 
 
510 aa  195  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1003  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.12 
 
 
510 aa  195  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1169  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.12 
 
 
510 aa  195  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3158  AMP-dependent synthetase and ligase  32.71 
 
 
490 aa  194  2e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1057  AMP-dependent synthetase and ligase  31.94 
 
 
545 aa  194  3e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0680  AMP-dependent synthetase and ligase  34.39 
 
 
499 aa  194  3e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.93 
 
 
510 aa  193  5e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1195  AMP-dependent synthetase and ligase  30.86 
 
 
544 aa  193  5e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0503  AMP-dependent synthetase and ligase  31.65 
 
 
492 aa  193  6e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  28.52 
 
 
520 aa  192  8e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4181  acyl-CoA synthetase  33.06 
 
 
522 aa  192  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.273498 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4008  AMP-dependent synthetase and ligase  31.11 
 
 
1043 aa  192  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1008  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.76 
 
 
510 aa  192  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0840  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.47 
 
 
510 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3808  AMP-dependent synthetase and ligase  31.05 
 
 
508 aa  190  5e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.762435  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4497  AMP-dependent synthetase and ligase  32.71 
 
 
517 aa  189  8e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0300  acyl-CoA synthetase  31.63 
 
 
537 aa  189  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0309  acyl-CoA synthetase  31.63 
 
 
537 aa  189  1e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  29.84 
 
 
525 aa  189  1e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0319  acyl-CoA synthetase  31.63 
 
 
537 aa  189  1e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.43856 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4891  AMP-dependent synthetase and ligase  29.65 
 
 
520 aa  189  1e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.862065  normal  0.74496 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  29.63 
 
 
521 aa  188  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1488  AMP-dependent synthetase and ligase  32.38 
 
 
525 aa  188  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0982209  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3097  AMP-dependent synthetase and ligase  29.51 
 
 
536 aa  188  2e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.329407  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19550  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  31.81 
 
 
533 aa  187  3e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  31.06 
 
 
662 aa  187  3e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>