More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0490 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3648  AMP-dependent synthetase and ligase  89.39 
 
 		 519 aa  916    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0490  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 512 aa  1044    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4336  AMP-dependent synthetase and ligase  55.31 
 
 		 515 aa  535  1e-150  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0623029  hitchhiker  0.00463044 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2882  AMP-dependent synthetase and ligase  53.24 
 
 		 514 aa  514  1e-144  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2384  long chain acyl-CoA synthetase  49.13 
 
 		 522 aa  462  1e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.838987  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5320  AMP-dependent synthetase and ligase  48.25 
 
 		 521 aa  410  1e-113  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0111  AMP-dependent synthetase and ligase  43.65 
 
 		 526 aa  379  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.471366  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0096  AMP-dependent synthetase and ligase  41.3 
 
 		 527 aa  365  1e-99  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1956  AMP-dependent synthetase and ligase  39.11 
 
 		 538 aa  347  2e-94  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.536259  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2529  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  38.3 
 
 		 532 aa  338  9.999999999999999e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0437982 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0125  AMP-dependent synthetase and ligase  39.16 
 
 		 533 aa  336  5.999999999999999e-91  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1564  AMP-dependent synthetase and ligase  38.22 
 
 		 529 aa  320  5e-86  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2670  AMP-dependent synthetase and ligase  38.55 
 
 		 531 aa  318  2e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2434  AMP-dependent synthetase and ligase  37.4 
 
 		 553 aa  317  3e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2020  AMP-dependent synthetase and ligase  37.48 
 
 		 523 aa  316  7e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.256098 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1393  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  38.96 
 
 		 530 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0696312  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3804  AMP-dependent synthetase and ligase  39.24 
 
 		 529 aa  306  5.0000000000000004e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0699  AMP-dependent synthetase and ligase  36.45 
 
 		 545 aa  303  5.000000000000001e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6138  AMP-dependent synthetase and ligase  37.94 
 
 		 524 aa  298  1e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.623044  normal  0.113053 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2870  AMP-dependent synthetase and ligase  35.21 
 
 		 520 aa  299  1e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4273  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  34.93 
 
 		 536 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000408842 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1574  AMP-binding domain-containing protein  36.71 
 
 		 535 aa  291  1e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.575944  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0616  AMP-binding domain-containing protein  36.71 
 
 		 608 aa  291  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.117672  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2124  AMP-binding domain-containing protein  36.71 
 
 		 535 aa  291  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2211  AMP-binding domain-containing protein  36.73 
 
 		 691 aa  292  1e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0422  putative AMP-dependent synthetase and ligase  37.48 
 
 		 538 aa  292  1e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.838411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0705  AMP-binding domain-containing protein  36.71 
 
 		 535 aa  291  1e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2026  AMP-binding domain-containing protein  36.71 
 
 		 535 aa  291  1e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.02 
 
 		 514 aa  291  2e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1082  AMP-dependent synthetase and ligase  36.06 
 
 		 526 aa  287  2.9999999999999996e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3735  AMP-dependent synthetase and ligase  36.5 
 
 		 505 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0137  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  35.76 
 
 		 539 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3426  AMP-dependent synthetase and ligase  36.5 
 
 		 505 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.872115 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7423  AMP-dependent synthetase and ligase  38 
 
 		 524 aa  281  2e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.113615  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.42 
 
 		 512 aa  281  2e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3179  AMP-dependent synthetase and ligase  35.27 
 
 		 520 aa  280  3e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3621  AMP-dependent synthetase and ligase  35.92 
 
 		 505 aa  280  3e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531462  normal  0.0257473 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  37.5 
 
 		 662 aa  280  5e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3134  AMP-dependent synthetase and ligase  35.66 
 
 		 538 aa  278  1e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.324571  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0680  AMP-dependent synthetase and ligase  37.3 
 
 		 499 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  36.58 
 
 		 525 aa  274  2.0000000000000002e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6505  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  37.16 
 
 		 527 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.679628 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  37.16 
 
 		 520 aa  273  4.0000000000000004e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1292  AMP-dependent synthetase and ligase  36.04 
 
 		 523 aa  273  6e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2048  AMP-dependent synthetase and ligase  34.91 
 
 		 516 aa  271  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5649  AMP-dependent synthetase and ligase  37.04 
 
 		 531 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0472962  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6014  AMP-dependent synthetase and ligase  37.04 
 
 		 531 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.010036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7014  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  35.83 
 
 		 529 aa  268  2e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00188129 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4634  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.58 
 
 		 582 aa  267  4e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1249  AMP-dependent synthetase and ligase  36.17 
 
 		 530 aa  266  5e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3059  AMP-dependent synthetase and ligase  36.72 
 
 		 491 aa  266  5e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000983491 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0331  AMP-dependent synthetase and ligase  33.21 
 
 		 513 aa  265  1e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.194455 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3884  AMP-dependent synthetase and ligase  38.06 
 
 		 497 aa  265  1e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.445629  normal  0.108787 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0601  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.14 
 
 		 561 aa  265  1e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0108  AMP-dependent synthetase and ligase  36.07 
 
 		 569 aa  265  2e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.824706  normal  0.320607 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4653  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.96 
 
 		 561 aa  264  3e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5944  AMP-dependent synthetase and ligase  38.82 
 
 		 532 aa  264  3e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420174  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.47 
 
 		 510 aa  263  4e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1019  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.47 
 
 		 510 aa  263  4e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4261  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.96 
 
 		 563 aa  264  4e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4654  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.77 
 
 		 561 aa  264  4e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1091  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.47 
 
 		 510 aa  263  4e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.47 
 
 		 510 aa  263  4e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1123  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.47 
 
 		 510 aa  263  4e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1003  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.47 
 
 		 510 aa  263  6e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5028  AMP-dependent synthetase and ligase  35.44 
 
 		 507 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4273  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.96 
 
 		 563 aa  263  8e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1169  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.27 
 
 		 510 aa  261  1e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.27 
 
 		 510 aa  261  1e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  34.18 
 
 		 521 aa  261  1e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4422  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.96 
 
 		 563 aa  261  2e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841946  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.96 
 
 		 563 aa  261  2e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491645  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4638  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.96 
 
 		 582 aa  261  2e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2963  AMP-dependent synthetase and ligase  34.4 
 
 		 551 aa  261  3e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000191926  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0707  AMP-binding domain-containing protein  35.82 
 
 		 522 aa  260  3e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.160608  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.27 
 
 		 510 aa  261  3e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1070  AMP-dependent synthetase and ligase  34.59 
 
 		 565 aa  261  3e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0635723  normal  0.557335 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1756  AMP-dependent synthetase and ligase  32.71 
 
 		 564 aa  261  3e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.598576 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  33.53 
 
 		 512 aa  259  5.0000000000000005e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0523  AMP-binding domain-containing protein  35.6 
 
 		 522 aa  260  5.0000000000000005e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0541  AMP-binding domain-containing protein  35.6 
 
 		 522 aa  259  6e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  34.42 
 
 		 539 aa  259  8e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1738  AMP-dependent synthetase and ligase  36.11 
 
 		 549 aa  259  1e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0121059  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2866  AMP-dependent synthetase and ligase  34.8 
 
 		 523 aa  258  2e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1597  AMP-dependent synthetase and ligase  36.01 
 
 		 549 aa  258  2e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000318079  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1008  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.33 
 
 		 510 aa  257  3e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1742  AMP-dependent synthetase and ligase  32.35 
 
 		 497 aa  257  3e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.441923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3226  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.4 
 
 		 561 aa  257  3e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2283  AMP-dependent synthetase and ligase  34.82 
 
 		 513 aa  256  6e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1725  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.15 
 
 		 585 aa  256  8e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00134138  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0827  AMP-dependent synthetase and ligase  34.39 
 
 		 566 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0840  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.27 
 
 		 510 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3158  AMP-binding domain-containing protein  35.36 
 
 		 522 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2888  AMP-binding domain-containing protein  35.36 
 
 		 522 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1460  AMP-binding domain-containing protein  35.36 
 
 		 522 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1884  AMP-dependent synthetase and ligase  34.39 
 
 		 495 aa  255  2.0000000000000002e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0128  AMP-binding domain-containing protein  35.36 
 
 		 522 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4497  AMP-dependent synthetase and ligase  37.13 
 
 		 517 aa  254  3e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2323  AMP-dependent synthetase and ligase  33.85 
 
 		 511 aa  253  5.000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  34.63 
 
 		 520 aa  253  5.000000000000001e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>