More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1744 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2155  peptide synthase  61.75 
 
 		 598 aa  719    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.287616  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1744  peptide synthase  100 
 
 		 614 aa  1277    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2734  peptide synthase  69.35 
 
 		 573 aa  797    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.608034  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1582  peptide synthase  77.41 
 
 		 628 aa  952    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.125823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2798  peptide synthase  76.47 
 
 		 629 aa  951    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1548  peptide synthase  77.76 
 
 		 624 aa  953    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1552  peptide synthase  77.93 
 
 		 624 aa  957    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1371  peptide synthase  65.25 
 
 		 571 aa  756    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3157  peptide synthase  67.06 
 
 		 574 aa  773    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.950706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1512  peptide synthase  66.39 
 
 		 585 aa  785    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1447  peptide synthase  78.51 
 
 		 608 aa  949    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.888245  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2546  peptide synthase  87.02 
 
 		 613 aa  1105    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2613  peptide synthase  88.21 
 
 		 608 aa  1117    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1367  peptide synthase  67.29 
 
 		 564 aa  780    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2713  peptide synthase  88.69 
 
 		 608 aa  1118    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1184  peptide synthase  61.16 
 
 		 564 aa  696    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1999  peptide synthase  60.82 
 
 		 554 aa  684    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1715  peptide synthase  66.44 
 
 		 563 aa  768    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2008  peptide synthase  48.01 
 
 		 545 aa  533  1e-150  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2100  peptide synthase  47.68 
 
 		 546 aa  533  1e-150  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2118  peptide synthase  48.19 
 
 		 546 aa  535  1e-150  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2271  peptide synthase  48.2 
 
 		 542 aa  530  1e-149  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3117  peptide synthase  46.7 
 
 		 544 aa  498  1e-140  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0052425  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3597  AMP-dependent synthetase and ligase  44.35 
 
 		 564 aa  471  1.0000000000000001e-131  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2010  peptide synthase  42.69 
 
 		 564 aa  464  1e-129  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0170  peptide synthase  41.54 
 
 		 552 aa  424  1e-117  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1395  peptide synthase  42.54 
 
 		 548 aa  409  1e-113  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03950  peptide synthase  41.12 
 
 		 556 aa  408  1.0000000000000001e-112  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1468  peptide synthase  42.16 
 
 		 548 aa  409  1.0000000000000001e-112  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.153396  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0550  peptide synthase  38.74 
 
 		 564 aa  396  1e-109  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0858  peptide synthase  37.17 
 
 		 555 aa  345  2e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1080  peptide synthase  31.83 
 
 		 581 aa  267  5e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0447  AMP-dependent synthetase and ligase  29.91 
 
 		 927 aa  207  5e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17450  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  30.57 
 
 		 899 aa  200  6e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.17047  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07150  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  30.6 
 
 		 922 aa  198  2.0000000000000003e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0417779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4241  AMP-dependent synthetase and ligase  29.37 
 
 		 875 aa  190  8e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.727325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36600  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  30.11 
 
 		 922 aa  186  9e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.478291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1681  AMP-dependent synthetase and ligase  30.84 
 
 		 915 aa  182  1e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0151795  normal  0.841697 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13240  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  27.45 
 
 		 978 aa  181  2.9999999999999997e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2462  AMP-dependent synthetase and ligase  27.89 
 
 		 861 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.199446  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1953  AMP-dependent synthetase and ligase  26.32 
 
 		 525 aa  167  8e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1569  long-chain fatty-acid-CoA ligase, putative  24.1 
 
 		 510 aa  106  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.890411  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  24.2 
 
 		 520 aa  106  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  24.75 
 
 		 662 aa  104  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  25.46 
 
 		 553 aa  101  4e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  26.61 
 
 		 518 aa  100  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  24.95 
 
 		 525 aa  100  9e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3775  AMP-dependent synthetase and ligase  25.09 
 
 		 564 aa  99.4  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0928  AMP-dependent synthetase and ligase  24.42 
 
 		 553 aa  99  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  24.68 
 
 		 506 aa  98.6  3e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2867  AMP-dependent synthetase and ligase  24 
 
 		 552 aa  98.6  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.533017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0839  AMP-dependent synthetase and ligase  22.11 
 
 		 577 aa  98.2  4e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1238  AMP-dependent synthetase and ligase  23.51 
 
 		 555 aa  95.9  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1980  AMP-dependent synthetase and ligase  27.41 
 
 		 532 aa  95.5  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0106234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3490  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  28.89 
 
 		 481 aa  94.7  4e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0662  AMP-dependent synthetase and ligase  23.73 
 
 		 548 aa  94.7  4e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.27921  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  25.36 
 
 		 512 aa  95.1  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1774  O-succinylbenzoate-CoA ligase  27.98 
 
 		 528 aa  94.4  5e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6394  AMP-dependent synthetase and ligase  25.83 
 
 		 517 aa  94.4  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178832  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0255  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  23.02 
 
 		 482 aa  94  7e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000679638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1904  AMP-binding domain protein  24.71 
 
 		 573 aa  94  7e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4454  long-chain-fatty-acid-CoA ligase  22.67 
 
 		 555 aa  93.6  8e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.100007 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2407  AMP-dependent synthetase and ligase  24.16 
 
 		 498 aa  93.6  9e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.676828  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4993  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  23.32 
 
 		 481 aa  93.2  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4982  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  23.79 
 
 		 482 aa  92.8  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  24.53 
 
 		 513 aa  92.8  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1515  AMP-dependent synthetase and ligase  28.34 
 
 		 515 aa  92.8  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00288915  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1538  AMP-dependent synthetase and ligase  28.34 
 
 		 515 aa  92.8  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4965  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  23.21 
 
 		 482 aa  92.4  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1837  AMP-dependent synthetase and ligase  27.44 
 
 		 518 aa  92.4  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.963932  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5012  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  22.95 
 
 		 481 aa  92  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1435  AMP-dependent synthetase and ligase  24.69 
 
 		 577 aa  92  3e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0654989  normal  0.0257553 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1943  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  23.62 
 
 		 560 aa  92  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  23.47 
 
 		 514 aa  91.7  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2202  putative O-succinylbenzoate--CoA ligase  28.83 
 
 		 483 aa  91.3  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3555  AMP-dependent synthetase and ligase  25.4 
 
 		 561 aa  91.3  5e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.779432  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5071  AMP-dependent synthetase and ligase  26.75 
 
 		 496 aa  90.9  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0267103  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3179  AMP-dependent synthetase and ligase  23.43 
 
 		 520 aa  90.9  6e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1611  AMP-dependent synthetase and ligase  24.56 
 
 		 584 aa  90.5  7e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.187495  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1750  amino acid adenylation domain protein  21.92 
 
 		 3337 aa  90.5  8e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0447353 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1225  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.27 
 
 		 519 aa  90.5  8e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.399435  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4585  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  23.17 
 
 		 482 aa  90.5  9e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6175  AMP-dependent synthetase and ligase  28 
 
 		 537 aa  90.5  9e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2745  AMP-dependent synthetase and ligase  29.05 
 
 		 519 aa  90.5  9e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000193004  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4747  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  23.02 
 
 		 482 aa  90.1  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5108  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  23.17 
 
 		 481 aa  90.1  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4616  AMP-dependent synthetase and ligase  22.59 
 
 		 518 aa  89.7  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.892742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4379  AMP-dependent synthetase and ligase  26.88 
 
 		 506 aa  90.1  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.177409 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4691  AMP-dependent synthetase and ligase  24.61 
 
 		 502 aa  89.7  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5034  AMP-dependent synthetase and ligase  28.61 
 
 		 517 aa  89  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1082  AMP-dependent synthetase and ligase  23.2 
 
 		 526 aa  89  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1867  AMP-dependent synthetase and ligase  24.22 
 
 		 507 aa  89.4  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0734  AMP-dependent synthetase and ligase  23.88 
 
 		 511 aa  89.4  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  26.43 
 
 		 519 aa  89.4  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5826  AMP-dependent synthetase and ligase  28.61 
 
 		 517 aa  89  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3401  AMP-dependent synthetase and ligase  23.41 
 
 		 1084 aa  89.4  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.369364 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1399  short chain acyl-CoA synthetase  24.19 
 
 		 555 aa  88.6  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0216639  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3917  AMP-dependent synthetase and ligase  24.54 
 
 		 521 aa  89  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.287192  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2371  acyl-CoA synthetase  25.05 
 
 		 532 aa  88.6  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0747  putative AMP-dependent synthetase and ligase  24.4 
 
 		 506 aa  88.2  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.303674  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>