More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0550 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_0550  peptide synthase  100 
 
 
564 aa  1136    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2010  peptide synthase  47.98 
 
 
564 aa  509  1e-143  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2271  peptide synthase  48.99 
 
 
542 aa  501  1e-140  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2118  peptide synthase  49.54 
 
 
546 aa  489  1e-137  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2100  peptide synthase  48.99 
 
 
546 aa  490  1e-137  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2008  peptide synthase  48.62 
 
 
545 aa  486  1e-136  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3117  peptide synthase  49.82 
 
 
544 aa  487  1e-136  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0052425  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0858  peptide synthase  48.99 
 
 
555 aa  456  1e-127  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3597  AMP-dependent synthetase and ligase  44.7 
 
 
564 aa  437  1e-121  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3157  peptide synthase  41.78 
 
 
574 aa  432  1e-120  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.950706  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2734  peptide synthase  41.92 
 
 
573 aa  433  1e-120  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.608034  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1184  peptide synthase  43.47 
 
 
564 aa  434  1e-120  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1367  peptide synthase  41.35 
 
 
564 aa  432  1e-119  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1999  peptide synthase  43.17 
 
 
554 aa  431  1e-119  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2155  peptide synthase  39.67 
 
 
598 aa  422  1e-117  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.287616  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03950  peptide synthase  45.6 
 
 
556 aa  422  1e-117  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0170  peptide synthase  47.91 
 
 
552 aa  423  1e-117  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1512  peptide synthase  40.75 
 
 
585 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1715  peptide synthase  41.56 
 
 
563 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1447  peptide synthase  38.95 
 
 
608 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.888245  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1744  peptide synthase  38.74 
 
 
614 aa  396  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1395  peptide synthase  45.01 
 
 
548 aa  398  1e-109  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1468  peptide synthase  45.01 
 
 
548 aa  395  1e-109  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.153396  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2546  peptide synthase  37.25 
 
 
613 aa  389  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2613  peptide synthase  37.23 
 
 
608 aa  389  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2713  peptide synthase  37.56 
 
 
608 aa  388  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1371  peptide synthase  38.72 
 
 
571 aa  384  1e-105  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1548  peptide synthase  37.46 
 
 
624 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1552  peptide synthase  37.42 
 
 
624 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2798  peptide synthase  37.15 
 
 
629 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1582  peptide synthase  36.84 
 
 
628 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.125823  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1080  peptide synthase  36.41 
 
 
581 aa  308  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07150  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  33.62 
 
 
922 aa  216  9.999999999999999e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0417779  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0447  AMP-dependent synthetase and ligase  33.27 
 
 
927 aa  209  7e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1681  AMP-dependent synthetase and ligase  36.78 
 
 
915 aa  203  8e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0151795  normal  0.841697 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1953  AMP-dependent synthetase and ligase  26.78 
 
 
525 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2462  AMP-dependent synthetase and ligase  34.42 
 
 
861 aa  196  1e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.199446  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4241  AMP-dependent synthetase and ligase  33.84 
 
 
875 aa  195  2e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.727325  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13240  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  31.65 
 
 
978 aa  192  1e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36600  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  34.86 
 
 
922 aa  190  5.999999999999999e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.478291  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17450  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  31.71 
 
 
899 aa  190  7e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.17047  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3097  AMP-dependent synthetase and ligase  27.17 
 
 
536 aa  139  1e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.329407  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2752  malonyl-CoA synthase  30.15 
 
 
547 aa  132  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0433908 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2371  acyl-CoA synthetase  27.5 
 
 
532 aa  132  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1609  AMP-dependent synthetase and ligase  26.28 
 
 
527 aa  131  4.0000000000000003e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2771  malonyl-CoA synthase  26.22 
 
 
536 aa  130  7.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.594073  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3917  AMP-dependent synthetase and ligase  27.2 
 
 
521 aa  129  2.0000000000000002e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.287192  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  28.38 
 
 
520 aa  128  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.05 
 
 
514 aa  128  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  28.3 
 
 
525 aa  127  6e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4559  acyl-CoA synthetase  27.79 
 
 
529 aa  126  8.000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.134713  normal  0.114816 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1676  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.08 
 
 
526 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.591328  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1070  AMP-dependent synthetase and ligase  26.79 
 
 
565 aa  126  1e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0635723  normal  0.557335 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0996  malonyl-CoA synthase  26.69 
 
 
519 aa  125  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2768  AMP-dependent synthetase and ligase  27.35 
 
 
558 aa  125  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000354199 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1488  AMP-dependent synthetase and ligase  27.4 
 
 
525 aa  124  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0982209  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2963  AMP-dependent synthetase and ligase  24.49 
 
 
551 aa  124  4e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000191926  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1593  AMP-dependent synthetase and ligase  25.64 
 
 
559 aa  124  5e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0495218 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0224  AMP-dependent synthetase and ligase  25.05 
 
 
549 aa  124  5e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0391267  normal  0.0314439 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1238  AMP-dependent synthetase and ligase  25.97 
 
 
555 aa  124  5e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4820  acyl-CoA synthetase  28.4 
 
 
533 aa  124  6e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.755365  normal  0.560915 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4872  AMP-binding domain protein  28.38 
 
 
549 aa  123  7e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3008  acyl-CoA synthetase  28.21 
 
 
545 aa  123  8e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.311019  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01070  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  25.73 
 
 
516 aa  123  9.999999999999999e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  25.27 
 
 
553 aa  123  9.999999999999999e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1080  malonyl-CoA synthase  26.48 
 
 
519 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.261639  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  28.15 
 
 
539 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  25.1 
 
 
521 aa  121  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  24.29 
 
 
662 aa  120  4.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2941  acyl-CoA synthetase  27.23 
 
 
557 aa  120  6e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.581775  normal  0.0544542 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4075  AMP-dependent synthetase and ligase  26.57 
 
 
521 aa  120  7.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5364  acyl-CoA synthetase  27.14 
 
 
536 aa  120  9e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.868662  normal  0.0358165 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1133  AMP-dependent synthetase and ligase  27.15 
 
 
518 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.508244  normal  0.50206 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2407  AMP-dependent synthetase and ligase  26.05 
 
 
498 aa  119  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.676828  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2335  AMP-dependent synthetase and ligase  28.02 
 
 
509 aa  119  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1241  acyl-CoA synthetase  25.89 
 
 
572 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2088  AMP-dependent synthetase and ligase  26.79 
 
 
807 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1604  AMP-dependent synthetase and ligase  25.78 
 
 
540 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2531  AMP-dependent synthetase and ligase  29.89 
 
 
537 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1964  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  24.64 
 
 
525 aa  118  3e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132088  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2083  AMP-dependent synthetase and ligase  27.56 
 
 
544 aa  118  3.9999999999999997e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1660  AMP-dependent synthetase and ligase  23.18 
 
 
523 aa  117  5e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104845  normal  0.559317 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3066  AMP-dependent synthetase and ligase  25.05 
 
 
558 aa  117  5e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.479156  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  25.58 
 
 
512 aa  117  6e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12527  AMP-binding domain protein  26.89 
 
 
547 aa  117  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0503764 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4073  AMP-dependent synthetase and ligase  27.18 
 
 
535 aa  117  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0666092  normal  0.751022 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2519  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.97 
 
 
562 aa  116  7.999999999999999e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2283  AMP-dependent synthetase and ligase  25.81 
 
 
513 aa  116  8.999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0403  AMP-binding domain protein  25.49 
 
 
550 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.493287  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0415  AMP-dependent synthetase and ligase  26.17 
 
 
515 aa  116  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.866195  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1756  AMP-dependent synthetase and ligase  23.78 
 
 
564 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.598576 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1757  AMP-dependent synthetase and ligase  25.59 
 
 
554 aa  115  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.384408  normal  0.62754 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3600  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  25.55 
 
 
525 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.887287  normal  0.975846 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2089  AMP-dependent synthetase and ligase  26 
 
 
530 aa  116  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4238  AMP-dependent synthetase and ligase  25.28 
 
 
527 aa  115  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2693  AMP-dependent synthetase and ligase  25.65 
 
 
562 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0814  AMP-dependent synthetase and ligase  25.65 
 
 
508 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5134  AMP-binding domain protein  27.23 
 
 
518 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0657606  normal  0.735688 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2867  AMP-dependent synthetase and ligase  27.96 
 
 
552 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.533017  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0839  AMP-dependent synthetase and ligase  25.2 
 
 
577 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>