More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0996 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0996  malonyl-CoA synthase  100 
 
 		 519 aa  1064    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2752  malonyl-CoA synthase  79.23 
 
 		 547 aa  864    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0433908 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0648  malonyl-CoA synthase  65.77 
 
 		 517 aa  671    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2538  malonyl-CoA synthase  76.79 
 
 		 511 aa  813    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1293  malonyl-CoA synthase  71.9 
 
 		 510 aa  755    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112545 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1925  malonyl-CoA synthase  73.18 
 
 		 500 aa  757    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2094  malonyl-CoA synthase  79.22 
 
 		 506 aa  844    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0754737  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2771  malonyl-CoA synthase  79.84 
 
 		 536 aa  873    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.594073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2794  malonyl-CoA synthase  65.01 
 
 		 517 aa  683    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.71549  normal  0.398408 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1101  malonyl-CoA synthase  68.87 
 
 		 530 aa  737    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0631  malonyl-CoA synthase  64.92 
 
 		 507 aa  687    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1515  malonyl-CoA synthase  85.69 
 
 		 539 aa  912    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.624521  normal  0.177064 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2870  malonyl-CoA synthase  79.65 
 
 		 506 aa  822    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.689672  normal  0.236454 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1080  malonyl-CoA synthase  99.42 
 
 		 519 aa  1058    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.261639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0422  malonyl-CoA synthase  56.03 
 
 		 526 aa  580  1e-164  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.149212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5138  malonyl-CoA synthase  55.98 
 
 		 510 aa  563  1.0000000000000001e-159  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.809655  normal  0.695279 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0483  malonyl-CoA synthase  56.92 
 
 		 503 aa  557  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0574  malonyl-CoA synthase  55.34 
 
 		 504 aa  551  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0226  malonyl-CoA synthase  58.51 
 
 		 508 aa  551  1e-156  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0526846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0329  malonyl-CoA synthase  55.6 
 
 		 511 aa  555  1e-156  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0616  malonyl-CoA synthase  55.73 
 
 		 504 aa  550  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.562715  normal  0.268093 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0876  malonyl-CoA synthase  55.53 
 
 		 510 aa  545  1e-154  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0768548 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0802  malonyl-CoA synthase  54.91 
 
 		 510 aa  548  1e-154  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.756606  normal  0.0286315 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7251  malonyl-CoA synthase  55.53 
 
 		 507 aa  546  1e-154  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0836  malonyl-CoA synthase  55.34 
 
 		 510 aa  545  1e-154  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.141452  normal  0.0577882 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6034  malonyl-CoA synthase  54.84 
 
 		 507 aa  542  1e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.224104  normal  0.165563 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0518  malonyl-CoA synthase  55.62 
 
 		 509 aa  540  9.999999999999999e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5371  malonyl-CoA synthase  54.65 
 
 		 504 aa  541  9.999999999999999e-153  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132829  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0220  malonyl-CoA synthase  55.34 
 
 		 503 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.601636  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1719  malonyl-CoA synthase  56.12 
 
 		 503 aa  541  9.999999999999999e-153  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.982236 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2999  malonyl-CoA synthase  57.05 
 
 		 506 aa  536  1e-151  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3408  malonyl-CoA synthase  54.64 
 
 		 504 aa  531  1e-149  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.787784 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1586  malonyl-CoA synthase  55.65 
 
 		 506 aa  526  1e-148  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2790  malonyl-CoA synthase  53.4 
 
 		 512 aa  526  1e-148  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000139685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3600  malonyl-CoA synthase  56.22 
 
 		 505 aa  519  1e-146  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1480  malonyl-CoA synthase  55.17 
 
 		 509 aa  521  1e-146  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000189244 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2702  malonyl-CoA synthase  55.46 
 
 		 501 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0670195 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1041  malonyl-CoA synthase  55.46 
 
 		 501 aa  514  1e-144  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.200492  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2492  malonyl-CoA synthase  52.43 
 
 		 504 aa  509  1e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.318474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0245  malonyl-CoA synthase  55.07 
 
 		 504 aa  510  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0395238 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2797  malonyl-CoA synthase  53.01 
 
 		 518 aa  508  9.999999999999999e-143  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.676577 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3834  malonyl-CoA synthase  53.42 
 
 		 504 aa  494  9.999999999999999e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.610168  normal  0.151644 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3566  malonyl-CoA synthase  57.39 
 
 		 503 aa  495  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.676985  normal  0.895128 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0770  AMP-dependent synthetase and ligase  50.72 
 
 		 501 aa  462  1e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3119  malonyl-CoA synthase  53.2 
 
 		 485 aa  440  9.999999999999999e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.646837  normal  0.278949 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  43.19 
 
 		 502 aa  371  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.597037  normal  0.34641 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0559  AMP-dependent synthetase and ligase  41.39 
 
 		 507 aa  350  5e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3859  AMP-dependent synthetase and ligase  40.79 
 
 		 504 aa  342  1e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.447607  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1867  AMP-dependent synthetase and ligase  38 
 
 		 507 aa  312  6.999999999999999e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3969  AMP-dependent synthetase and ligase  35.9 
 
 		 500 aa  291  1e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.130763  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0814  AMP-dependent synthetase and ligase  36.01 
 
 		 508 aa  288  1e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3808  AMP-dependent synthetase and ligase  34.64 
 
 		 508 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.762435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4072  AMP-dependent synthetase and ligase  34.76 
 
 		 508 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.35 
 
 		 514 aa  284  3.0000000000000004e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1581  AMP-dependent synthetase and ligase  37.78 
 
 		 518 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0255292  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  34.14 
 
 		 525 aa  281  2e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4160  AMP-dependent synthetase and ligase  35.98 
 
 		 499 aa  281  2e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.365856  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0079  AMP-dependent synthetase and ligase  36.38 
 
 		 553 aa  281  2e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.737985 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  34.06 
 
 		 520 aa  281  2e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1569  long-chain fatty-acid-CoA ligase, putative  39.47 
 
 		 510 aa  280  3e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.890411  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1884  AMP-dependent synthetase and ligase  34.3 
 
 		 495 aa  281  3e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1330  AMP-dependent synthetase and ligase  34.5 
 
 		 502 aa  278  1e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.982491 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  35.26 
 
 		 662 aa  277  3e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  32.86 
 
 		 518 aa  277  3e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.75 
 
 		 512 aa  277  3e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0297  AMP-dependent synthetase and ligase  36.71 
 
 		 498 aa  276  4e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.292337 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2184  AMP-dependent synthetase and ligase  35.74 
 
 		 493 aa  276  5e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.944129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2136  AMP-dependent synthetase and ligase  35.05 
 
 		 493 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  35.79 
 
 		 506 aa  275  2.0000000000000002e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4335  AMP-dependent synthetase and ligase  34.77 
 
 		 521 aa  272  1e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.153441  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.84 
 
 		 513 aa  271  2e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2447  AMP-dependent synthetase and ligase  36.21 
 
 		 505 aa  269  7e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  33.06 
 
 		 539 aa  269  8e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0840  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.01 
 
 		 510 aa  269  1e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0827  AMP-dependent synthetase and ligase  32.1 
 
 		 566 aa  269  1e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  33.74 
 
 		 521 aa  268  1e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2432  AMP-dependent synthetase and ligase  36.04 
 
 		 508 aa  268  2e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2699  AMP-binding enzyme, putative long chain fatty acid Co-A ligase, acetyl-CoA synthetase  32.8 
 
 		 514 aa  267  4e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2629  AMP-dependent synthetase and ligase  30.68 
 
 		 557 aa  266  5e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0494506  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1423  AMP-dependent synthetase and ligase  36.06 
 
 		 510 aa  266  1e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3306  AMP-dependent synthetase and ligase  36.88 
 
 		 511 aa  265  1e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000435597 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4238  AMP-dependent synthetase and ligase  34.26 
 
 		 527 aa  265  2e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  33.74 
 
 		 512 aa  265  2e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4354  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.77 
 
 		 561 aa  264  3e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5309  AMP-dependent synthetase and ligase  33.88 
 
 		 517 aa  263  4e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1169  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.43 
 
 		 510 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5079  AMP-dependent synthetase and ligase  35.32 
 
 		 511 aa  263  6e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.11462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5806  AMP-dependent synthetase and ligase  33.6 
 
 		 562 aa  263  6e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154251  normal  0.312131 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0667  putative O-succinylbenzoate--CoA ligase  33.33 
 
 		 516 aa  263  6e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.604577  normal  0.0579833 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3097  AMP-dependent synthetase and ligase  34.61 
 
 		 536 aa  263  6.999999999999999e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.329407  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  33.82 
 
 		 490 aa  263  6.999999999999999e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1585  AMP-binding domain protein  32.09 
 
 		 549 aa  263  6.999999999999999e-69  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.23 
 
 		 510 aa  262  8.999999999999999e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1019  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.23 
 
 		 510 aa  262  1e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1003  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.23 
 
 		 510 aa  262  1e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5859  AMP-dependent synthetase and ligase  34.94 
 
 		 567 aa  262  1e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1091  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.23 
 
 		 510 aa  262  1e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1041  AMP-binding domain protein  32.09 
 
 		 549 aa  261  1e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4634  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.84 
 
 		 582 aa  261  1e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0601  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.19 
 
 		 561 aa  262  1e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>