More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2335 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2335  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 509 aa  1029    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6769  AMP-dependent synthetase and ligase  65.29 
 
 		 507 aa  628  1e-179  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.147424  normal  0.533441 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1998  putative acyl-CoA synthetase, long-chain fatty acid:CoA ligase  58.19 
 
 		 508 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.222529  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4702  AMP-dependent synthetase and ligase  54.74 
 
 		 506 aa  517  1.0000000000000001e-145  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0411  AMP-dependent synthetase and ligase  55.66 
 
 		 513 aa  476  1e-133  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.812394  normal  0.47815 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  47.16 
 
 		 521 aa  435  1e-121  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2474  AMP-dependent synthetase and ligase  45.74 
 
 		 522 aa  422  1e-117  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  45.21 
 
 		 512 aa  421  1e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2432  AMP-dependent synthetase and ligase  45.42 
 
 		 508 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7147  AMP-dependent synthetase and ligase  45.72 
 
 		 511 aa  405  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0152334 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.08 
 
 		 513 aa  400  9.999999999999999e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4238  AMP-dependent synthetase and ligase  43.48 
 
 		 527 aa  402  9.999999999999999e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2675  AMP-dependent synthetase and ligase  46.25 
 
 		 501 aa  393  1e-108  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.493637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1581  AMP-dependent synthetase and ligase  43.16 
 
 		 518 aa  389  1e-107  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0255292  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1423  AMP-dependent synthetase and ligase  45.71 
 
 		 510 aa  387  1e-106  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5079  AMP-dependent synthetase and ligase  42.88 
 
 		 511 aa  383  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.11462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2158  putative long-chain-fatty-acid-CoA ligase  43.45 
 
 		 515 aa  380  1e-104  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4335  AMP-dependent synthetase and ligase  43.89 
 
 		 521 aa  381  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.153441  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3333  AMP-dependent synthetase and ligase  44.19 
 
 		 519 aa  377  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01070  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  42.96 
 
 		 516 aa  371  1e-101  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3506  AMP-dependent synthetase and ligase  46.93 
 
 		 505 aa  372  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0661851  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  44.99 
 
 		 506 aa  365  1e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4160  AMP-dependent synthetase and ligase  44.11 
 
 		 499 aa  362  1e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.365856  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2699  AMP-binding enzyme, putative long chain fatty acid Co-A ligase, acetyl-CoA synthetase  38.31 
 
 		 514 aa  354  2e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4379  AMP-dependent synthetase and ligase  45.1 
 
 		 506 aa  352  1e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.177409 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3969  AMP-dependent synthetase and ligase  42.39 
 
 		 500 aa  350  4e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.130763  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22810  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  42.06 
 
 		 500 aa  343  5e-93  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.73 
 
 		 514 aa  333  6e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1569  long-chain fatty-acid-CoA ligase, putative  41.39 
 
 		 510 aa  327  3e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.890411  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  38.61 
 
 		 539 aa  327  3e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.54 
 
 		 510 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1019  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.54 
 
 		 510 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1003  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.54 
 
 		 510 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.22 
 
 		 510 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1091  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.54 
 
 		 510 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1169  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.54 
 
 		 510 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  39.04 
 
 		 662 aa  320  3.9999999999999996e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1008  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.24 
 
 		 510 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1123  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.63 
 
 		 510 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.03 
 
 		 510 aa  320  5e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0840  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.52 
 
 		 510 aa  319  7.999999999999999e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1592  AMP-dependent synthetase and ligase  36.94 
 
 		 561 aa  318  2e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185317  normal  0.745369 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3097  AMP-dependent synthetase and ligase  37.55 
 
 		 536 aa  317  3e-85  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.329407  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1593  AMP-dependent synthetase and ligase  37.76 
 
 		 559 aa  317  3e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0495218 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.05 
 
 		 510 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2905  AMP-dependent synthetase and ligase  39.53 
 
 		 502 aa  313  6.999999999999999e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.587257 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0503  AMP-dependent synthetase and ligase  38.57 
 
 		 492 aa  311  1e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.31 
 
 		 512 aa  307  3e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4616  AMP-dependent synthetase and ligase  39.16 
 
 		 518 aa  307  3e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.892742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1609  AMP-dependent synthetase and ligase  37.62 
 
 		 527 aa  304  2.0000000000000002e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  36.71 
 
 		 490 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1070  AMP-dependent synthetase and ligase  37.9 
 
 		 565 aa  302  7.000000000000001e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0635723  normal  0.557335 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0734  AMP-dependent synthetase and ligase  38.7 
 
 		 511 aa  302  9e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0827  AMP-dependent synthetase and ligase  37.43 
 
 		 566 aa  302  1e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3215  O-succinylbenzoate-CoA ligase  41.8 
 
 		 517 aa  302  1e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0554015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3204  O-succinylbenzoate-CoA ligase  41.8 
 
 		 517 aa  302  1e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.716175  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3266  O-succinylbenzoate-CoA ligase  41.8 
 
 		 517 aa  302  1e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.10141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3839  AMP-dependent synthetase and ligase  37.35 
 
 		 506 aa  300  4e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.223442  normal  0.234006 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3226  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.03 
 
 		 561 aa  298  1e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4654  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.99 
 
 		 561 aa  297  3e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4354  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.8 
 
 		 561 aa  296  6e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4261  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.02 
 
 		 563 aa  295  1e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4273  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.02 
 
 		 563 aa  295  1e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2629  AMP-dependent synthetase and ligase  35.16 
 
 		 557 aa  295  1e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0494506  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  36.38 
 
 		 520 aa  295  2e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4653  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.81 
 
 		 561 aa  294  3e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0601  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.6 
 
 		 561 aa  294  3e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4634  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.4 
 
 		 582 aa  293  4e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0142  AMP-dependent synthetase and ligase  39.19 
 
 		 508 aa  292  1e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2963  AMP-dependent synthetase and ligase  35.89 
 
 		 551 aa  291  2e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000191926  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1884  AMP-dependent synthetase and ligase  37.07 
 
 		 495 aa  291  3e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4638  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.82 
 
 		 582 aa  290  4e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2407  AMP-dependent synthetase and ligase  35.52 
 
 		 498 aa  290  4e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.676828  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4422  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.82 
 
 		 563 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841946  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.82 
 
 		 563 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491645  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  37.99 
 
 		 499 aa  288  1e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1738  AMP-dependent synthetase and ligase  38.09 
 
 		 549 aa  288  2e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0121059  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  36.5 
 
 		 525 aa  286  9e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0108  AMP-dependent synthetase and ligase  35.76 
 
 		 569 aa  283  5.000000000000001e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.824706  normal  0.320607 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0337  AMP-dependent synthetase and ligase  34.9 
 
 		 577 aa  282  9e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.238028  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1614  AMP-dependent synthetase and ligase  37.72 
 
 		 509 aa  281  2e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0136  AMP-dependent synthetase and ligase  34.82 
 
 		 520 aa  281  2e-74  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1719  malonyl-CoA synthase  39.96 
 
 		 503 aa  281  2e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.982236 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0559  AMP-dependent synthetase and ligase  39.37 
 
 		 507 aa  280  3e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3455  AMP-dependent synthetase and ligase  34.78 
 
 		 583 aa  280  6e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0371  AMP-dependent synthetase and ligase  37.94 
 
 		 544 aa  279  8e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00566676  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7687  long-chain-fatty-acid-CoA-ligase  36.27 
 
 		 500 aa  279  1e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6078  AMP-dependent synthetase and ligase  40.54 
 
 		 553 aa  278  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.225727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1756  AMP-dependent synthetase and ligase  33.96 
 
 		 564 aa  278  2e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.598576 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1611  AMP-dependent synthetase and ligase  33.65 
 
 		 584 aa  277  3e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.187495  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  35.42 
 
 		 503 aa  277  3e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3115  AMP-dependent synthetase and ligase  34.59 
 
 		 584 aa  276  5e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3638  AMP-dependent synthetase and ligase  36.03 
 
 		 543 aa  276  6e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0455  AMP-dependent synthetase and ligase  35.46 
 
 		 579 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1936  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.07 
 
 		 572 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.451048  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0959  AMP-dependent synthetase and ligase  36.05 
 
 		 558 aa  275  2.0000000000000002e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.336851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2323  AMP-dependent synthetase and ligase  35.42 
 
 		 511 aa  274  3e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1510  AMP-dependent synthetase and ligase  34.87 
 
 		 584 aa  274  3e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.79948  hitchhiker  0.00072846 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1054  AMP-dependent synthetase and ligase  34.69 
 
 		 584 aa  274  3e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.63665  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0904  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.95 
 
 		 559 aa  274  3e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>