More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2752 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0996  malonyl-CoA synthase  79.23 
 
 		 519 aa  853    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2771  malonyl-CoA synthase  73.03 
 
 		 536 aa  787    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.594073  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2538  malonyl-CoA synthase  70.93 
 
 		 511 aa  732    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0631  malonyl-CoA synthase  62.5 
 
 		 507 aa  649    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1925  malonyl-CoA synthase  69.28 
 
 		 500 aa  698    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1293  malonyl-CoA synthase  68.58 
 
 		 510 aa  694    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112545 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2094  malonyl-CoA synthase  72.73 
 
 		 506 aa  769    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0754737  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2794  malonyl-CoA synthase  62.43 
 
 		 517 aa  642    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.71549  normal  0.398408 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1515  malonyl-CoA synthase  78.81 
 
 		 539 aa  851    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.624521  normal  0.177064 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2870  malonyl-CoA synthase  73.22 
 
 		 506 aa  748    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.689672  normal  0.236454 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1080  malonyl-CoA synthase  79.23 
 
 		 519 aa  853    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.261639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2752  malonyl-CoA synthase  100 
 
 		 547 aa  1124    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0433908 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1101  malonyl-CoA synthase  64.56 
 
 		 530 aa  675    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0648  malonyl-CoA synthase  62.6 
 
 		 517 aa  622  1e-177  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5138  malonyl-CoA synthase  54.05 
 
 		 510 aa  531  1e-149  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.809655  normal  0.695279 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0422  malonyl-CoA synthase  53.22 
 
 		 526 aa  526  1e-148  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.149212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0329  malonyl-CoA synthase  54.16 
 
 		 511 aa  523  1e-147  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0616  malonyl-CoA synthase  53.86 
 
 		 504 aa  521  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.562715  normal  0.268093 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0483  malonyl-CoA synthase  54.55 
 
 		 503 aa  523  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0876  malonyl-CoA synthase  54.63 
 
 		 510 aa  523  1e-147  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0768548 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0574  malonyl-CoA synthase  53.28 
 
 		 504 aa  523  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0518  malonyl-CoA synthase  55.38 
 
 		 509 aa  520  1e-146  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0802  malonyl-CoA synthase  54.39 
 
 		 510 aa  521  1e-146  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.756606  normal  0.0286315 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7251  malonyl-CoA synthase  54.53 
 
 		 507 aa  519  1e-146  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0220  malonyl-CoA synthase  53.77 
 
 		 503 aa  519  1e-146  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.601636  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1719  malonyl-CoA synthase  54.74 
 
 		 503 aa  515  1.0000000000000001e-145  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.982236 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0836  malonyl-CoA synthase  54.34 
 
 		 510 aa  518  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.141452  normal  0.0577882 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5371  malonyl-CoA synthase  52.9 
 
 		 504 aa  514  1e-144  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132829  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0226  malonyl-CoA synthase  52.98 
 
 		 508 aa  514  1e-144  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0526846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6034  malonyl-CoA synthase  53.86 
 
 		 507 aa  514  1e-144  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.224104  normal  0.165563 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3408  malonyl-CoA synthase  53.55 
 
 		 504 aa  498  1e-140  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.787784 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2790  malonyl-CoA synthase  56.42 
 
 		 512 aa  500  1e-140  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000139685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2999  malonyl-CoA synthase  54.81 
 
 		 506 aa  494  9.999999999999999e-139  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0245  malonyl-CoA synthase  52.99 
 
 		 504 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0395238 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3600  malonyl-CoA synthase  52.22 
 
 		 505 aa  489  1e-137  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1480  malonyl-CoA synthase  53.71 
 
 		 509 aa  491  1e-137  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000189244 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2492  malonyl-CoA synthase  52.03 
 
 		 504 aa  489  1e-137  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.318474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1586  malonyl-CoA synthase  52.23 
 
 		 506 aa  488  1e-136  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2797  malonyl-CoA synthase  51.64 
 
 		 518 aa  481  1e-134  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.676577 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3834  malonyl-CoA synthase  51.42 
 
 		 504 aa  468  9.999999999999999e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.610168  normal  0.151644 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1041  malonyl-CoA synthase  51.89 
 
 		 501 aa  462  1e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.200492  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2702  malonyl-CoA synthase  51.68 
 
 		 501 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0670195 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3566  malonyl-CoA synthase  54.76 
 
 		 503 aa  455  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.676985  normal  0.895128 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0770  AMP-dependent synthetase and ligase  51.01 
 
 		 501 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3119  malonyl-CoA synthase  49.9 
 
 		 485 aa  429  1e-119  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.646837  normal  0.278949 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0559  AMP-dependent synthetase and ligase  42.24 
 
 		 507 aa  339  9e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  42.29 
 
 		 502 aa  338  9.999999999999999e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.597037  normal  0.34641 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3859  AMP-dependent synthetase and ligase  42.3 
 
 		 504 aa  328  1.0000000000000001e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.447607  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  36.6 
 
 		 525 aa  291  3e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  36.61 
 
 		 520 aa  286  8e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1867  AMP-dependent synthetase and ligase  36.57 
 
 		 507 aa  278  2e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.6 
 
 		 514 aa  274  4.0000000000000004e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  31.43 
 
 		 518 aa  270  5e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3969  AMP-dependent synthetase and ligase  35.6 
 
 		 500 aa  267  2.9999999999999995e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.130763  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  34.92 
 
 		 539 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0079  AMP-dependent synthetase and ligase  36.67 
 
 		 553 aa  267  4e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.737985 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0814  AMP-dependent synthetase and ligase  34.29 
 
 		 508 aa  266  8.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3808  AMP-dependent synthetase and ligase  33.6 
 
 		 508 aa  264  3e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.762435  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  35.86 
 
 		 506 aa  264  3e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4160  AMP-dependent synthetase and ligase  34.95 
 
 		 499 aa  262  1e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.365856  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.79 
 
 		 513 aa  261  2e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1884  AMP-dependent synthetase and ligase  35.46 
 
 		 495 aa  261  2e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1423  AMP-dependent synthetase and ligase  35.9 
 
 		 510 aa  261  3e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1581  AMP-dependent synthetase and ligase  34.98 
 
 		 518 aa  260  4e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0255292  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0297  AMP-dependent synthetase and ligase  35.54 
 
 		 498 aa  260  4e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.292337 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  33.81 
 
 		 490 aa  260  5.0000000000000005e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4335  AMP-dependent synthetase and ligase  35.32 
 
 		 521 aa  259  9e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.153441  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4072  AMP-dependent synthetase and ligase  32.99 
 
 		 508 aa  258  3e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.06 
 
 		 512 aa  256  7e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  32.27 
 
 		 521 aa  256  8e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  32.39 
 
 		 512 aa  255  1.0000000000000001e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1330  AMP-dependent synthetase and ligase  33.93 
 
 		 502 aa  256  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.982491 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0827  AMP-dependent synthetase and ligase  30.77 
 
 		 566 aa  256  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4080  AMP-dependent synthetase and ligase  34.23 
 
 		 518 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.656205  normal  0.161644 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2136  AMP-dependent synthetase and ligase  33.27 
 
 		 493 aa  254  3e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2858  AMP-dependent synthetase and ligase  39.83 
 
 		 485 aa  254  3e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4379  AMP-dependent synthetase and ligase  36.92 
 
 		 506 aa  254  4.0000000000000004e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.177409 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  32.85 
 
 		 662 aa  254  4.0000000000000004e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2699  AMP-binding enzyme, putative long chain fatty acid Co-A ligase, acetyl-CoA synthetase  30.8 
 
 		 514 aa  253  4.0000000000000004e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4238  AMP-dependent synthetase and ligase  33.73 
 
 		 527 aa  254  4.0000000000000004e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2283  AMP-dependent synthetase and ligase  32.3 
 
 		 513 aa  253  6e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3506  AMP-dependent synthetase and ligase  37.6 
 
 		 505 aa  253  8.000000000000001e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0661851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2184  AMP-dependent synthetase and ligase  33.67 
 
 		 493 aa  253  8.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.944129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3097  AMP-dependent synthetase and ligase  32.4 
 
 		 536 aa  251  2e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.329407  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1133  AMP-dependent synthetase and ligase  34.99 
 
 		 518 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.508244  normal  0.50206 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1238  AMP-dependent synthetase and ligase  32.54 
 
 		 555 aa  252  2e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5309  AMP-dependent synthetase and ligase  34.14 
 
 		 517 aa  250  4e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2407  AMP-dependent synthetase and ligase  35.8 
 
 		 498 aa  250  4e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.676828  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3819  O-succinylbenzoate-CoA ligase  35.13 
 
 		 529 aa  250  4e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1865  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.33 
 
 		 519 aa  250  6e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.975513  normal  0.637576 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1592  AMP-dependent synthetase and ligase  32.38 
 
 		 561 aa  249  7e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185317  normal  0.745369 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2629  AMP-dependent synthetase and ligase  30.69 
 
 		 557 aa  249  9e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0494506  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1569  long-chain fatty-acid-CoA ligase, putative  37.5 
 
 		 510 aa  249  1e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.890411  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1593  AMP-dependent synthetase and ligase  32.43 
 
 		 559 aa  249  1e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0495218 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4872  AMP-binding domain protein  33.53 
 
 		 549 aa  248  3e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  35.11 
 
 		 503 aa  247  4.9999999999999997e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0667  putative O-succinylbenzoate--CoA ligase  32.73 
 
 		 516 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.604577  normal  0.0579833 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4261  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.06 
 
 		 563 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2474  AMP-dependent synthetase and ligase  35.13 
 
 		 522 aa  246  9.999999999999999e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1070  AMP-dependent synthetase and ligase  32.95 
 
 		 565 aa  246  9.999999999999999e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0635723  normal  0.557335 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>