More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2088 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_2088  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
807 aa  1565    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9272  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II-like protein  52.78 
 
 
647 aa  444  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2951  AMP-dependent synthetase and ligase  44.13 
 
 
575 aa  379  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9270  glycosyltransferase-like protein  67.09 
 
 
243 aa  312  2e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.444008 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3652  glycosyl transferase family 2  61.2 
 
 
246 aa  293  1e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0575879  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2953  glycosyl transferase family protein  56.54 
 
 
268 aa  257  5e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.666852  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3230  AMP-dependent synthetase and ligase  29.1 
 
 
526 aa  144  7e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1998  putative acyl-CoA synthetase, long-chain fatty acid:CoA ligase  30.65 
 
 
508 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.222529  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2822  AMP-dependent synthetase and ligase  36.89 
 
 
430 aa  140  7e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1592  AMP-dependent synthetase and ligase  29.11 
 
 
561 aa  139  2e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185317  normal  0.745369 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1070  AMP-dependent synthetase and ligase  29.4 
 
 
565 aa  139  3.0000000000000003e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0635723  normal  0.557335 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6769  AMP-dependent synthetase and ligase  30.06 
 
 
507 aa  136  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.147424  normal  0.533441 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6618  AMP-dependent synthetase and ligase  31.55 
 
 
493 aa  134  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  26.97 
 
 
490 aa  134  9e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0752  AMP-binding domain protein  27.76 
 
 
576 aa  133  1.0000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1211  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.94 
 
 
527 aa  133  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2407  AMP-dependent synthetase and ligase  26.08 
 
 
498 aa  132  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.676828  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1593  AMP-dependent synthetase and ligase  27.31 
 
 
559 aa  131  5.0000000000000004e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0495218 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2660  AMP-dependent synthetase and ligase  32.15 
 
 
510 aa  130  1.0000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.846562  normal  0.161262 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4694  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  27.2 
 
 
481 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2861  AMP-dependent synthetase and ligase  32.46 
 
 
508 aa  129  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.213595 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4982  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  27.33 
 
 
482 aa  128  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5438  AMP-dependent synthetase and ligase  27.83 
 
 
515 aa  128  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427259  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0142  AMP-dependent synthetase and ligase  29.8 
 
 
508 aa  128  4.0000000000000003e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0255  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  27.25 
 
 
482 aa  128  5e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000679638  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2396  AMP-dependent synthetase and ligase  26.36 
 
 
552 aa  127  6e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0861  AMP-dependent synthetase and ligase  29.05 
 
 
514 aa  127  7e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1253  AMP-dependent synthetase and ligase  24.95 
 
 
585 aa  127  7e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5309  AMP-dependent synthetase and ligase  30.84 
 
 
517 aa  127  8.000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4607  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  26.86 
 
 
482 aa  127  9e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1238  AMP-dependent synthetase and ligase  28.02 
 
 
555 aa  127  9e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4993  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  26.93 
 
 
481 aa  127  9e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5012  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  27.06 
 
 
481 aa  127  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  24.5 
 
 
662 aa  127  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5286  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.71 
 
 
523 aa  126  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.680641  normal  0.33628 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4372  AMP-dependent synthetase and ligase  28.86 
 
 
539 aa  126  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4585  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  27.06 
 
 
482 aa  126  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  28.85 
 
 
534 aa  125  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.55948  normal  0.800046 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0503  AMP-dependent synthetase and ligase  27 
 
 
492 aa  125  3e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0256  AMP-dependent synthetase and ligase  25.91 
 
 
583 aa  125  3e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0139167 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4891  AMP-dependent synthetase and ligase  28.38 
 
 
520 aa  125  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.862065  normal  0.74496 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4965  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  25.79 
 
 
482 aa  125  4e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1884  AMP-dependent synthetase and ligase  26.45 
 
 
495 aa  124  5e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4747  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  26.47 
 
 
482 aa  124  8e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5108  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  26.67 
 
 
481 aa  124  8e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4107  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  29.51 
 
 
550 aa  123  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3918  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  29.73 
 
 
549 aa  123  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.570213  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4311  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.63 
 
 
477 aa  123  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.569405 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2335  AMP-dependent synthetase and ligase  30.14 
 
 
509 aa  124  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1756  AMP-dependent synthetase and ligase  25.42 
 
 
564 aa  124  9.999999999999999e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.598576 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0115  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.46 
 
 
556 aa  123  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3655  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.21 
 
 
483 aa  123  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.334351  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0124  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.46 
 
 
556 aa  123  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.514213  normal  0.109541 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3728  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.21 
 
 
483 aa  123  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.38736 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0105  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.46 
 
 
556 aa  123  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.356608  normal  0.265858 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3668  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.21 
 
 
483 aa  123  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188298  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0116  AMP-dependent synthetase and ligase  30.33 
 
 
528 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4410  AMP-dependent synthetase and ligase  30.1 
 
 
500 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4497  AMP-dependent synthetase and ligase  30.1 
 
 
500 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.62299  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2485  AMP-dependent synthetase and ligase  30.1 
 
 
534 aa  122  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4005  AMP-dependent synthetase and ligase  30.43 
 
 
522 aa  122  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3146  AMP-dependent synthetase and ligase  29.32 
 
 
533 aa  122  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.683024  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4437  AMP-binding domain protein  27.58 
 
 
540 aa  121  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4524  AMP-binding domain protein  27.58 
 
 
540 aa  121  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0876  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  28.65 
 
 
543 aa  121  6e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0109  AMP-dependent synthetase and ligase  30.33 
 
 
528 aa  121  6e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4818  AMP-binding domain protein  27.52 
 
 
540 aa  120  7e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0734  AMP-dependent synthetase and ligase  28.7 
 
 
511 aa  120  7e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4181  AMP-dependent synthetase and ligase  29.14 
 
 
527 aa  120  7e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  27.36 
 
 
520 aa  120  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  27.15 
 
 
525 aa  120  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5827  AMP-dependent synthetase and ligase  26.59 
 
 
518 aa  120  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.671788  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3455  AMP-dependent synthetase and ligase  25.49 
 
 
583 aa  120  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1719  malonyl-CoA synthase  27.5 
 
 
503 aa  120  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.982236 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.16 
 
 
512 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4075  AMP-dependent synthetase and ligase  28.41 
 
 
521 aa  119  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0550  peptide synthase  26.79 
 
 
564 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0914  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  27.79 
 
 
552 aa  119  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.963611  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  25.76 
 
 
512 aa  119  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0136  AMP-dependent synthetase and ligase  24.59 
 
 
520 aa  118  3e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5079  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.98 
 
 
506 aa  119  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.216799 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4791  AMP-dependent synthetase and ligase  29.22 
 
 
500 aa  119  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.743818 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4694  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.98 
 
 
506 aa  119  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.107104  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2866  AMP-dependent synthetase and ligase  31.19 
 
 
523 aa  119  3e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0415  AMP-dependent synthetase and ligase  28.44 
 
 
515 aa  119  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.866195  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4780  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.98 
 
 
506 aa  119  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0728  AMP-dependent synthetase and ligase  29.84 
 
 
507 aa  119  3e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4529  AMP-dependent synthetase and ligase  29.44 
 
 
529 aa  118  5e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  24.67 
 
 
521 aa  118  6e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0330  AMP-dependent synthetase and ligase  24.09 
 
 
559 aa  117  6.9999999999999995e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.648816  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8762  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.88 
 
 
510 aa  117  6.9999999999999995e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.225168 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0039  acetate--CoA ligase  25.96 
 
 
629 aa  117  6.9999999999999995e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0367  AMP-dependent synthetase and ligase  27.34 
 
 
513 aa  117  7.999999999999999e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.379931 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4674  acyl-CoA synthetase  29.05 
 
 
531 aa  117  7.999999999999999e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2515  AMP-dependent synthetase and ligase  28.65 
 
 
527 aa  117  8.999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.921526 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1006  acyltransferase family protein  29.41 
 
 
811 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0827  AMP-dependent synthetase and ligase  26.22 
 
 
566 aa  117  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1865  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.95 
 
 
519 aa  117  1.0000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.975513  normal  0.637576 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5942  AMP-dependent synthetase and ligase  28.76 
 
 
516 aa  117  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.050377 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0131  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.15 
 
 
570 aa  117  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>