More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_4005 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_4005  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 522 aa  1025    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2202  AMP-dependent synthetase and ligase  55 
 
 		 525 aa  509  1e-143  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0293  AMP-dependent synthetase and ligase  47.82 
 
 		 533 aa  449  1e-125  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.406694  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6754  AMP-dependent synthetase and ligase  50.29 
 
 		 517 aa  444  1e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2110  AMP-dependent synthetase and ligase  45.9 
 
 		 549 aa  423  1e-117  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.333319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0253  putative Acyl-CoA synthetases (AMP-forming)/AMP-acid ligases II  47.2 
 
 		 519 aa  420  1e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4024  AMP-dependent synthetase and ligase  46.31 
 
 		 530 aa  417  9.999999999999999e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4115  AMP-dependent synthetase and ligase  48.36 
 
 		 517 aa  413  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4250  AMP-dependent synthetase and ligase  45 
 
 		 542 aa  411  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0992  AMP-dependent synthetase and ligase  45.79 
 
 		 535 aa  408  1.0000000000000001e-112  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.162534  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1151  AMP-dependent synthetase and ligase  45.37 
 
 		 516 aa  401  9.999999999999999e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.493371 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1879  AMP-dependent synthetase and ligase  46.08 
 
 		 535 aa  396  1e-109  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1925  AMP-dependent synthetase and ligase  46.08 
 
 		 535 aa  396  1e-109  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0636684  normal  0.805492 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1859  AMP-dependent synthetase and ligase  45.9 
 
 		 535 aa  395  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698404  normal  0.41558 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05990  phenylacetyl-CoA ligase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10160)  39.74 
 
 		 562 aa  334  2e-90  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.255662 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01570  AMP binding protein, putative  39.11 
 
 		 577 aa  333  5e-90  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0667  AMP-dependent synthetase and ligase  41.63 
 
 		 536 aa  319  7e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1435  AMP-dependent synthetase and ligase  35.96 
 
 		 577 aa  318  2e-85  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0654989  normal  0.0257553 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9896  coumaryl-coa ligase  40.51 
 
 		 523 aa  317  3e-85  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0839  AMP-dependent synthetase and ligase  35.53 
 
 		 577 aa  316  7e-85  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0455  AMP-dependent synthetase and ligase  35.91 
 
 		 579 aa  310  5e-83  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4638  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.42 
 
 		 582 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4422  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.42 
 
 		 563 aa  303  6.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841946  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.42 
 
 		 563 aa  303  6.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491645  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4261  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.23 
 
 		 563 aa  300  3e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4273  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.23 
 
 		 563 aa  300  3e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1592  AMP-dependent synthetase and ligase  37.84 
 
 		 561 aa  300  5e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185317  normal  0.745369 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0108  AMP-dependent synthetase and ligase  36.7 
 
 		 569 aa  300  5e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.824706  normal  0.320607 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4654  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.23 
 
 		 561 aa  300  6e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  36.67 
 
 		 539 aa  299  8e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4634  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.03 
 
 		 582 aa  298  1e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00398  phenylacetyl-CoA ligase, putative (JCVI)  38.46 
 
 		 569 aa  297  3e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0601  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.83 
 
 		 561 aa  297  4e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3122  AMP-dependent synthetase and ligase  36.93 
 
 		 573 aa  296  5e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183253  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4653  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.16 
 
 		 561 aa  296  6e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1593  AMP-dependent synthetase and ligase  37.26 
 
 		 559 aa  296  6e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0495218 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4354  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.03 
 
 		 561 aa  295  1e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1597  AMP-dependent synthetase and ligase  37.61 
 
 		 549 aa  293  4e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000318079  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09216  conserved hypothetical protein  37.54 
 
 		 567 aa  293  6e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.945488  normal  0.813048 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3226  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.72 
 
 		 561 aa  293  6e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0827  AMP-dependent synthetase and ligase  35.33 
 
 		 566 aa  292  9e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3097  AMP-dependent synthetase and ligase  36.4 
 
 		 536 aa  291  3e-77  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.329407  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2629  AMP-dependent synthetase and ligase  33.45 
 
 		 557 aa  288  1e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0494506  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5079  AMP-dependent synthetase and ligase  38.52 
 
 		 511 aa  288  2e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.11462  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  40.61 
 
 		 506 aa  284  2.0000000000000002e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0371  AMP-dependent synthetase and ligase  37.64 
 
 		 544 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00566676  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1725  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.59 
 
 		 585 aa  281  1e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00134138  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1626  AMP-dependent synthetase and ligase  34.65 
 
 		 573 aa  280  3e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2158  putative long-chain-fatty-acid-CoA ligase  37.85 
 
 		 515 aa  279  8e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1756  AMP-dependent synthetase and ligase  35.17 
 
 		 564 aa  279  8e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.598576 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1738  AMP-dependent synthetase and ligase  37.15 
 
 		 549 aa  279  8e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0121059  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00649  4-coumarate-CoA ligase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G13110)  36.58 
 
 		 560 aa  278  1e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4160  AMP-dependent synthetase and ligase  40.32 
 
 		 499 aa  278  2e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.365856  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2963  AMP-dependent synthetase and ligase  34.02 
 
 		 551 aa  278  2e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000191926  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0256  AMP-dependent synthetase and ligase  34.79 
 
 		 583 aa  277  3e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0139167 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11034  conserved hypothetical protein  32.97 
 
 		 536 aa  276  4e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.734558 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2675  AMP-dependent synthetase and ligase  40.83 
 
 		 501 aa  277  4e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.493637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1611  AMP-dependent synthetase and ligase  34.64 
 
 		 584 aa  276  7e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.187495  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1609  AMP-dependent synthetase and ligase  35.29 
 
 		 527 aa  275  1.0000000000000001e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7147  AMP-dependent synthetase and ligase  36.48 
 
 		 511 aa  274  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0152334 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1581  AMP-dependent synthetase and ligase  36.57 
 
 		 518 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0255292  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.69 
 
 		 514 aa  274  3e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10657  conserved hypothetical protein  32.84 
 
 		 550 aa  272  9e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00945329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  35.66 
 
 		 512 aa  271  2e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  36.16 
 
 		 521 aa  269  7e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.36 
 
 		 513 aa  270  7e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2339  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.4 
 
 		 553 aa  269  7e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1312  AMP-dependent synthetase and ligase  35.99 
 
 		 564 aa  269  8e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.384847  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3969  AMP-dependent synthetase and ligase  36.9 
 
 		 500 aa  268  1e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.130763  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3845  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.1 
 
 		 562 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0424  AMP-dependent synthetase and ligase  35.31 
 
 		 561 aa  268  2e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1070  AMP-dependent synthetase and ligase  37.07 
 
 		 565 aa  268  2.9999999999999995e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0635723  normal  0.557335 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4098  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.36 
 
 		 562 aa  267  4e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0559  AMP-dependent synthetase and ligase  35.1 
 
 		 584 aa  265  1e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.128568  normal  0.0101093 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  36.51 
 
 		 662 aa  265  1e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2432  AMP-dependent synthetase and ligase  36.57 
 
 		 508 aa  266  1e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3115  AMP-dependent synthetase and ligase  34.55 
 
 		 584 aa  265  1e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3836  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.52 
 
 		 562 aa  265  2e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.934306 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4354  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.14 
 
 		 562 aa  264  2e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3148  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.45 
 
 		 560 aa  265  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2994  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.15 
 
 		 560 aa  263  4e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.562113  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4871  AMP-dependent synthetase and ligase  33.66 
 
 		 506 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.324146  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2010  AMP-dependent synthetase and ligase  34.81 
 
 		 569 aa  263  8e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.982062  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4379  AMP-dependent synthetase and ligase  38.02 
 
 		 506 aa  262  8.999999999999999e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.177409 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1253  AMP-dependent synthetase and ligase  33.08 
 
 		 585 aa  263  8.999999999999999e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1943  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.96 
 
 		 560 aa  261  2e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1495  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.17 
 
 		 562 aa  261  3e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.246606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3633  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.1 
 
 		 557 aa  261  3e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.956552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06050  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  37.52 
 
 		 546 aa  261  3e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0872557 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1672  AMP-dependent synthetase and ligase  33.53 
 
 		 601 aa  260  4e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.455088 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4057  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.87 
 
 		 562 aa  260  4e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2474  AMP-dependent synthetase and ligase  35.85 
 
 		 522 aa  260  4e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3345  AMP-dependent synthetase and ligase  33.14 
 
 		 577 aa  260  4e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.305311  hitchhiker  0.00000703503 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0200  AMP-dependent synthetase and ligase  37.3 
 
 		 566 aa  259  6e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.366303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0064  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.73 
 
 		 557 aa  259  9e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0546  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.73 
 
 		 557 aa  259  9e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2857  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.87 
 
 		 569 aa  259  1e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.52 
 
 		 510 aa  259  1e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2778  putative long chain fatty-acid CoA ligase(long- chain acyl-CoA synthetase)  33.72 
 
 		 604 aa  259  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.422591  normal  0.203216 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.53 
 
 		 512 aa  258  1e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>