More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0914 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_4107  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  61.83 
 
 		 550 aa  690    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1188  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  62.57 
 
 		 547 aa  703    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3918  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  61.36 
 
 		 549 aa  674    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.570213  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0718  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  60.51 
 
 		 547 aa  669    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1035  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  59.82 
 
 		 547 aa  665    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0914  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  100 
 
 		 552 aa  1134    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.963611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1544  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  59.82 
 
 		 547 aa  668    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2126  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  61.76 
 
 		 547 aa  685    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.191102  decreased coverage  0.00946818 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1766  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  56.67 
 
 		 546 aa  624  1e-177  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.810333  normal  0.381602 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5256  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  50 
 
 		 549 aa  515  1e-144  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.242586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4296  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  47.88 
 
 		 539 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0876  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  43.59 
 
 		 543 aa  420  1e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2400  AMP-dependent synthetase and ligase  41.73 
 
 		 534 aa  393  1e-108  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0669706  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1192  3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  43.33 
 
 		 1004 aa  392  1e-108  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0238022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3934  AMP-dependent synthetase and ligase  41.48 
 
 		 541 aa  358  9.999999999999999e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1462  short chain acyl-CoA synthetase  39.78 
 
 		 546 aa  356  5e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1822  short chain acyl-CoA synthetase  39.78 
 
 		 546 aa  355  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1994  short chain acyl-CoA synthetase  39.78 
 
 		 546 aa  355  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.194812  normal  0.059614 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1480  short chain acyl-CoA synthetase  39.59 
 
 		 546 aa  353  4e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.712128  normal  0.130818 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1446  short chain acyl-CoA synthetase  39.59 
 
 		 546 aa  353  5.9999999999999994e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.191096 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1494  short chain acyl-CoA synthetase  38.35 
 
 		 546 aa  348  2e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.433242 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1399  short chain acyl-CoA synthetase  36.4 
 
 		 555 aa  346  5e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0216639  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1904  short chain acyl-CoA synthetase  39.07 
 
 		 548 aa  346  5e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.850786  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01670  hypothetical protein  39.07 
 
 		 566 aa  346  6e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01659  hypothetical protein  39.07 
 
 		 566 aa  346  6e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1918  short chain acyl-CoA synthetase  39.07 
 
 		 548 aa  346  7e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1930  short chain acyl-CoA synthetase  38.88 
 
 		 548 aa  344  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0789974 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1941  AMP-dependent synthetase and ligase  38.69 
 
 		 548 aa  342  1e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.889751  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2287  AMP-dependent synthetase and ligase  38.1 
 
 		 517 aa  313  4.999999999999999e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1853  short chain acyl-CoA synthetase  33.09 
 
 		 543 aa  291  2e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.342081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3489  AMP-dependent synthetase and ligase  34.32 
 
 		 540 aa  281  3e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2335  AMP-dependent synthetase and ligase  38.21 
 
 		 567 aa  280  3e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0704794  normal  0.0458127 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2396  AMP-dependent synthetase and ligase  32.56 
 
 		 552 aa  273  6e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08690  short chain acyl-CoA synthetase  31.4 
 
 		 550 aa  266  8.999999999999999e-70  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0212832  normal  0.531653 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09310  short chain acyl-CoA synthetase  30.47 
 
 		 549 aa  263  8e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.280056  normal  0.513679 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4791  AMP-dependent synthetase and ligase  35.27 
 
 		 500 aa  261  2e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.743818 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4410  AMP-dependent synthetase and ligase  35.12 
 
 		 500 aa  258  2e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4497  AMP-dependent synthetase and ligase  35.12 
 
 		 500 aa  258  2e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.62299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4966  AMP-dependent synthetase and ligase  35.43 
 
 		 503 aa  258  2e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436432  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3211  AMP-dependent synthetase and ligase  30.62 
 
 		 534 aa  249  1e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.155051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6815  AMP-dependent synthetase and ligase  35.76 
 
 		 526 aa  249  1e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2816  AMP-dependent synthetase and ligase  33.09 
 
 		 566 aa  239  6.999999999999999e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.269281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1784  AMP-dependent synthetase and ligase  33.68 
 
 		 498 aa  239  8e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.599535  normal  0.650207 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0473  AMP-binding domain protein  32.08 
 
 		 568 aa  238  3e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  30.49 
 
 		 518 aa  236  7e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6445  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 542 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.607182  hitchhiker  3.41608e-16 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2693  AMP-dependent synthetase and ligase  31.25 
 
 		 562 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0171  AMP-dependent synthetase and ligase  32.45 
 
 		 630 aa  234  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  31.5 
 
 		 520 aa  233  9e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0582  AMP-binding domain protein  28.97 
 
 		 587 aa  232  1e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.44238  normal  0.647319 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2440  AMP-binding domain protein  33.2 
 
 		 544 aa  229  8e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8740  AMP-dependent synthetase and ligase  31.85 
 
 		 512 aa  228  3e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.402683  normal  0.341368 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3316  AMP-dependent synthetase and ligase  33.46 
 
 		 541 aa  228  3e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2319  AMP-binding domain protein  32.29 
 
 		 565 aa  227  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.770298  normal  0.0254377 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2283  AMP-dependent synthetase and ligase  30.6 
 
 		 513 aa  226  8e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1693  AMP-binding domain protein  31.64 
 
 		 543 aa  226  8e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.301435  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  30.14 
 
 		 525 aa  225  1e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1103  AMP-binding domain protein  32.15 
 
 		 552 aa  225  2e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0663  AMP-binding domain protein  30.89 
 
 		 547 aa  224  3e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.390649  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1650  AMP-binding domain protein  32.58 
 
 		 549 aa  223  6e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0288  AMP-binding domain protein  31.69 
 
 		 564 aa  223  6e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0229323  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0752  AMP-binding domain protein  30.43 
 
 		 576 aa  223  7e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2361  AMP-dependent synthetase and ligase  32.2 
 
 		 550 aa  223  7e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.727031  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0462  AMP-binding domain protein  32.48 
 
 		 564 aa  223  9e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0869  AMP-dependent synthetase and ligase  35.45 
 
 		 503 aa  222  9.999999999999999e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.184154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0344  AMP-binding domain protein  31.23 
 
 		 562 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.100012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1389  AMP-binding domain protein  31.09 
 
 		 549 aa  219  1e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000722424  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54940  putative siderophore biosynthesis enzyme  31.34 
 
 		 994 aa  219  1e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000391308  unclonable  2.75623e-20 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2563  AMP-binding domain protein  32.4 
 
 		 549 aa  218  2e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45341e-16 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4872  AMP-binding domain protein  31.41 
 
 		 549 aa  218  2e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2335  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  30.9 
 
 		 538 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.138928  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4723  AMP-binding domain protein  30.43 
 
 		 560 aa  217  5.9999999999999996e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.712671  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1803  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  32.51 
 
 		 542 aa  216  8e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4372  AMP-dependent synthetase and ligase  31.02 
 
 		 539 aa  216  9e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4867  AMP-binding domain protein  30.66 
 
 		 538 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.223701  normal  0.186874 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2400  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  30.71 
 
 		 538 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.584614  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2206  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  31.16 
 
 		 538 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2692  AMP-binding domain protein  30.3 
 
 		 552 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.262026  normal  0.421392 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2370  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  31.16 
 
 		 538 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2990  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  30.71 
 
 		 538 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.830414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3767  AMP-dependent synthetase and ligase  31.64 
 
 		 512 aa  215  1.9999999999999998e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0143855  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2821  AMP-binding domain protein  29.64 
 
 		 552 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.187557 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4037  AMP-dependent synthetase and ligase  27.53 
 
 		 558 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0518356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1442  AMP-binding domain protein  29.5 
 
 		 550 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.684137  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1563  AMP-binding domain protein  30.67 
 
 		 538 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716975 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4086  AMP-dependent synthetase and ligase  33.03 
 
 		 527 aa  214  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.432912  normal  0.782905 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3103  AMP-dependent synthetase and ligase  31.55 
 
 		 550 aa  213  9e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3774  (2,3-dihydroxybenzoyl)adenylate synthase  34.15 
 
 		 537 aa  213  9e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.212838 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0610  AMP-binding domain protein  29.96 
 
 		 570 aa  212  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.920315  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2470  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  30.34 
 
 		 538 aa  212  1e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00193535  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4313  AMP-dependent synthetase and ligase  32.54 
 
 		 531 aa  212  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2145  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  30.97 
 
 		 538 aa  212  2e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  29.72 
 
 		 553 aa  211  2e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3306  AMP-dependent synthetase and ligase  31.63 
 
 		 511 aa  212  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000435597 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1818  AMP-dependent synthetase and ligase  29.52 
 
 		 563 aa  211  2e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.122494  normal  0.361334 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2068  AMP-binding domain protein  29.33 
 
 		 596 aa  212  2e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.95 
 
 		 514 aa  211  2e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2388  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  30.97 
 
 		 538 aa  211  2e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0365  AMP-dependent synthetase and ligase  31.31 
 
 		 524 aa  212  2e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1573  AMP-binding domain protein  30.87 
 
 		 552 aa  211  3e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116566  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>